Teoria de los acidoos Nucleicos
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PPiirimidinrimidinaas s yy PurinPurinaassPPiirimidinrimidinaas s yy PurinPurinaass
PPiirimidinrimidinaas s yy PurinPurinaass
Para comprender la estructura y Para comprender la estructura y propiedades de propiedades de DNA DNA yy RNA, RNA, se se requiere conocer sus componentes requiere conocer sus componentes q pq pestructuralesestructurales..Es importante recordar ciertos Es importante recordar ciertos heterocheterociiclclosos aromaromááticticos conocidos os conocidos como como ppiirimidinrimidinaas s yy purinpurinaas.s.
PPiirimidinrimidinaas s yy PurinPurinaass
PPiirimidinrimidinaa yy purinpurinaa son los nombres de son los nombres de los siguientes compuestos los siguientes compuestos heterohetero--cíclicoscíclicos..
PPiirimidinrimidinaa PurinPurinaa
N
N
PPiirimidinrimidinaass de Importancia Biológicade Importancia Biológica
Las piLas pirimidinrimidinaas s que se encuentran en que se encuentran en DNA DNA sonson cciitosintosinaa yy ttiiminminaa. C. Ciitosintosinaa yy uraciluracilooson lasson las pipiririmidinmidinaas s presentes en presentes en RNA.RNA.
O
UracilUraciloo TTiiminminaa CCiitosintosinaa
HN
NOH
CH3
PPurinasurinas de Importancia Biológicade Importancia Biológica
AdeninAdeninaa yy guaninguaninaa son lasson las principalprincipalesespurinpurinaas s tanto detanto de DNA DNA como decomo de RNA.RNA.
NH2 O
AdeninAdeninaa GuaninGuaninaa
N
N N
N
H
HN
N N
N
HH2N
CafeCafeíínnaa yy TeobrominTeobrominaa
CafeCafeíínnaa (c(caféafé) ) yy teobrominteobrominaa (c(caféafé y téy té) ) sonsonpurinpurinaass naturalesnaturales..
N
OCH3
CafeCafeíínnaa TeobrominTeobrominaa
HN
N N
N
O
CH3
NucleNucleóósidsidoossNucleNucleóósidsidooss
NucleNucleóósidsidoossLaLa definicióndefinición clásicaclásica estructuralestructural dede ununnuclenucleóósidsidoo eses queque eses NN--glicósidoglicósido dedeppiirimidinrimidinaa oo purinpurinaa dede DD--ribofuranosribofuranosaa óó 22--dedessoxoxii--DD--ribofuranosribofuranosaa..ActualmenteActualmente estaesta definicióndefinición sese hahaextendextendiiddoo aa cualquiercualquier NN--glgliiccóósidsidoo purínicopurínico óópirimidínicopirimidínico dede casicasi cualquiercualquier azúcarazúcar..ElEl heterocícloheterocíclo purpuríínnicoico óó pirimidínicopirimidínico dede ununnuclenucleóósidsidoo sese conoceconoce comocomo lala basebase purpuríínnicaicaóó ppiirimidrimidíínnicaica..
UridinUridinaa yy AdenosinAdenosinaaUridinUridinaa yy adenosinadenosinaa sonson nuclenucleóósidsidoos ps piirimidrimidínicosínicos yypurpurínicosínicos,, respectivrespectivamenteamente de de DD--ribofuranosribofuranosaa..
UridinUridinaa((un un nuclenucleóósidsidoo ppiirimidrimidínicoínico))
AdenosinAdenosinaa((un un nuclenucleóósidsidoo ppuurrínicoínico))
NucleNucleóótidtidoossNucleNucleóótidtidooss
NucleNucleóótidtidooss
Los Los NucleNucleóótidtidooss son son ésteresésteres de ácido de ácido ffososfórfóricico de o de nuclenucleóósidsidoos.s.
AdenosinAdenosinaa 5'5'--MonoMonoffososffatatoo (AMP)(AMP)
AdenosinAdenosinaa 5'5'--monomonoffososffatatoo (AMP) (AMP) se denomina se denomina también átambién ácidcido o 5'5'--adenadenííliclicoo..
AdenosinAdenosinaa 5'5'--MonoMonoffososffatatoo (AMP)(AMP)
AdenosinAdenosinaa 5'5'--monomonoffososffatatoo (AMP) (AMP) se denomina se denomina también átambién ácidcido o 5'5'--adenadenííliclicoo..
N N
NH2
N
N NO
OHHOHH
OPO
OH
HO
1'
2'3'
4'
5'
AdenosinAdenosinaa DiDiffososffatatoo (ADP)(ADP)
N N
NH2
OON NO
OHHOHH
OPO
OH
OPOH
HOO
AdenosinAdenosinaa TriTriffososffatatoo (ATP)(ATP) ATP ATP ReservaReserva EnergEnergíaía
ATPATP Cada paso esCada paso es endotendotéérmicrmicoo..La La EnergEnergíaía para cada paso para cada paso proviene delproviene del metabolismmetabolismoocarbohcarbohiidratdratosos ((glgliiccóólliisis)sis)
AMPAMP
ADPADP carbohcarbohiidratdratosos ((glgliiccóólliisis).sis).El El procesproceso inverso eo inverso es s exotexotéérmicrmicoo yy ees s la fuente la fuente de de energenergíaía en sistemas en sistemas vivosvivos..ΔΔGG°° hhiidrdróólliisis sis dede ATP ATP aaADP ADP ees s ––35 kJ/mol.35 kJ/mol.
AdenosinAdenosinaa 3‘3‘,,5'5'--MonoMonoffososffatatoo CCííclicclicoo((cAMPcAMP))
AMP cAMP cííclicclicoo ees s uun n regulareguladdor importantor importantee dedenumerosos numerosos procesprocesoos s biolbiolóógicgicosos..
N N
NH2
N
N NO
OHOHH
O
PO
HO
AcidAcidosos NucleicNucleicososAcidAcidosos NucleicNucleicosos
AcidAcidosos NucleicNucleicosos
Los Los AcidAcidosos NucleicNucleicosos son son polpolíímermeros deos denuclenucleóótidtidoos (s (polpoliinuclenucleóótidtidoos).s).El oEl oxxíígengenoo 5' 5' de ude un n nuclenucleóótidtido está o está El oEl oxxíígengenoo 5 5 de ude un n nuclenucleóótidtido está o está unido al oxígenounido al oxígeno 3' 3' de otrode otro..
Una Una secseccciióón n de de una cadena de ununa cadena de un
N
NN
N
O
OHOHH
O
NH2
PO
OH
HO
N
NH2
Opolpoliinuclenucleóótidtidoo.. O
OHOHH
OP
OH
O
O
OHHOHH
OP
OH
O
HN
N
O
O
NO
EsEstructurtructuraa yy ReplicaReplicacciióón n dede DNA:DNA:LL D blD bl HHééliliLaLa DobleDoble HHéélilicece
ComposiComposicciióón n dede DNADNAErwin Chargaff (Columbia Univ.) Erwin Chargaff (Columbia Univ.) eestudistudióóDNAs DNAs de distintas fuentesde distintas fuentes yy analanalizóizó laladistribudistribucciióón n dede purinpurinaas s yy ppiirimidinrimidinaas s en en ellosellos..h h dd óó d l d l dd ( ) ( ) The The distribudistribucciióón n de las de las bases bases adeninadeninaa (A), (A),
guaninguaninaa (G), t(G), tiiminminaa (T), (T), yy cciitosintosinaa (C) (C) varivariabaaba entre distintas eentre distintas especies.species.Sin Sin embargo,elembargo,el totaltotal dede purinpurinaas (A s (A yy G) G) yyelel total total de de ppiirimidinrimidinaas (T s (T yy C) C) era siempre era siempre el mismoel mismo..AdemásAdemás: %A = %T, : %A = %T, yy %G = %C%G = %C
ComposiComposicciióón n de de DNADNA HumanHumanoo
AdeninAdeninaa (A) 30.3%(A) 30.3% TTiiminminaa (T) 30.3%(T) 30.3%
Por ejemploPor ejemplo::
PurinPurinaa PPiirimidinrimidinaa
GuaninGuaninaa (G) 19.5%(G) 19.5% CCiitosintosinaa (C) 19.9%(C) 19.9%Total Total purinpurinaas: 49.8%s: 49.8% Total pTotal piirimidinrimidinaas: 50.1%s: 50.1%
ComplementarComplementaridadidad de de BaseBase
WatsonWatson yy CrickCrick proppropusieronusieron queque AA yy TTestabanestaban enen iguigualal proporciónproporción debidodebido aacomplementarcomplementaridadidad dede unionesuniones hidrógenohidrógeno..
AA TT
ComplementarComplementaridadidad de de BaseBase
DelDel mismomismo modomodo,, laslas cantidadescantidades dede GG yy CCeraneran igualesiguales porpor ccomplementaromplementaridadidad uniónuniónhidrógenohidrógeno..
GG CC
El El DuplexDuplex DNADNA
WatsonWatson yy CrickCrick proppropusieronusieron unauna dobledoblecadenacadena parapara lala estructuraestructura dede DNADNA,, enen lalacualcual unauna basebase purpuríínnicaica óó ppiirimidrimidíínnicaica enen unaunacadenacadena estabaestaba unidaunida porpor unauna uniónuniónhidrógenohidrógeno aa susu basebase complementariacomplementaria enen lalaotraotra..
O
ŠOO
OO
P O
OO
O
O
OŠ
OŠ
O
O
O
O PO
OPO
C G
AT
3'
5'
5' 5'
5'
3'
3'
3'
Dos hebras Dos hebras antiparalelantiparalelasas dedeDNA DNA están están
d d
O
O
ŠO
ŠO
O
O
O
OPO
OP O
O
OŠ
O
OO
PO
OO
AT
CG
5'
5' 5'
5'
3' 3
3'3'
3'
apareadas por apareadas por uniones uniones hidrógenohidrógeno entreentrepurinpurinasas yyppiirimidinrimidinasas..
EsEstructurtructuraahhelicelicoidaloidal dedeDNA. DNA. Las Las bases bases
íí ii purpuríínnicasicas y y ppiirimidrimidíínnicasicasestán dentroestán dentro, , los los azúcares yazúcares yffososffatatoos s afueraafuera..
Replicación de DNA
C
G
T
AMientras la doble hélice se abre, cada hebra actúa como un molde sobre el cual se construye su complemento.
Replicación de DNA
C
A'
A
G
T
T'
G'
C'
BiosíntesisBiosíntesis de de ProteínasProteínasDi i idDi i id DNADNADirigidaDirigida porpor DNADNA
DNA y DNA y BiosíntesisBiosíntesis de de ProteínasProteínas
"DNA produce RNA "DNA produce RNA queque produce produce proteínasproteínas."."
TresTres tipostipos de RNA de RNA estánestán involucradosinvolucrados..RNARNA mensajeromensajero (mRNA)(mRNA)RNARNA mensajeromensajero (mRNA)(mRNA)RNA deRNA de transferenciatransferencia ((tRNAtRNA))RNARNA ribosomal (ribosomal (rRNArRNA))
ExistenExisten dos dos estadosestados principalesprincipales..transcripcióntranscripcióntranslacióntranslación
TranscripciónTranscripciónTranscripciónTranscripción eses la la formaciónformación de de unaunacadenacadena de mRNA de mRNA usandousando unauna cadenacadena de de DNA DNA comocomo moldemolde..La La secuenciasecuencia de de nucleótidosnucleótidos de mRNA de mRNA esesLa La secuenciasecuencia de de nucleótidosnucleótidos de mRNA de mRNA esescomplementariacomplementaria a la a la secuenciasecuencia de de nucleótidosnucleótidos del del moldemolde de DNA.de DNA.La La transcripcióntranscripción comienzacomienza en el Cen el C--5' 5' terminal de DNA terminal de DNA catalizadocatalizado porpor la la enzimaenzimaRNA RNA polimerasapolimerasa..
TranscripciónTranscripción
A G G T C A C T G TG
T
TC
C
C
AA
A
GA
G
5'5'
T C C A G T G A C A C T TT
TC
C
A
AG
G
G
MientrasMientras la la dobledoble cadenacadena de de DNA se DNA se separasepara, , unauna cadenacadenacomplementariacomplementaria de mRNA se de mRNA se forma en el Cforma en el C--5' terminal.5' terminal. 3'3'
TranscripciónTranscripción
A G G T C A C T G TG
T
TC
C
C
AA
A
GA
G
A
A G
GUC
5'5'
T C C A G T G A C A C T TT
TC
C
A
AG
G
G 3'3'
UraciloUracilo se se incorporaincorpora a a RNA en RNA en lugarlugar de de timinatimina..
TranslaciónTranslaciónLa La secuenciasecuencia de de nucleótidosnucleótidos de mRNA de mRNA codificacodifica parapara los los diferentesdiferentes amino amino ácidosácidosqueque se se encuentranencuentran en en proteínasproteínas..ExistenExisten trestres nucleótidosnucleótidos porpor codóncodónExistenExisten trestres nucleótidosnucleótidos porpor codóncodón..ExistenExisten 64 64 combinacionescombinaciones posiblesposibles de A, U, de A, U, G, y C.G, y C.El El códigocódigo genéticogenético eses redundanteredundante. . AlgunasAlgunasproteínasproteínas estánestán codificadascodificadas porpor másmás de un de un codóncodón..
CodonesCodones de mRNAde mRNAAlaninaAlanina ArgininaArginina AsparaginaAsparagina AcidoAcido AspárticoAspártico CisteínaCisteína
GCUGCU GCAGCA CGUCGU CGA CGA AAUAAU GAU GAU UGUUGUGCCGCC GCGGCG AGAAGA CGC CGC AACAAC GACGAC UGC UGC
CGGCGG AGG AGG
ácidoácido glutámicoglutámico GlutaminaGlutamina GlicinaGlicina HistidinaHistidina IsoleucinaIsoleucinaGAAGAA CAACAA GGUGGU GGAGGA CAUCAU AUUAUU AUAAUAGAGGAG CAGCAG GGCGGC GGGGGG CACCAC AUCAUCGAGGAG CAGCAG GGCGGC GGGGGG CACCAC AUCAUC
LeucinaLeucina LisinaLisina MetioninaMetionina FenilalaninaFenilalanina ProlinaProlinaUUAUUA CUUCUU AAAAAA AUGAUG UUUUUU CCUCCU CCA CCA CUACUA UUGUUG AAGAAG UUCUUC CCC CCC CGCGCUCCUC CUGCUG
SerinaSerina TreoninaTreonina TriptofanoTriptofano TirosinaTirosina ValinaValinaUCUUCU UCA UCA ACUACU ACAACA UGGUGG UAUUAU GUUGUU GUAGUAAGUAGU UCC UCC ACCACC ACGACG UACUAC GUC GUC GUGGUGUCGUCG AGC AGC
tRNAtRNA de de TransferenciaTransferenciaExistenExisten 20 20 tRNAstRNAs diferentesdiferentes, , unouno porpor cadacadaamino amino ácidoácido..cadacada tRNAtRNA eses unauna hebrahebra simple con un simple con un tripletetriplete CCA en CCA en susu CC--3' terminal3' terminaltripletetriplete CCA en CCA en susu CC 3 terminal.3 terminal.Un amino Un amino ácidoácido particular se particular se uneune a a tRNAtRNAporpor unauna uniónunión ésteréster entre el entre el grupogrupocarboxylocarboxylo del amino del amino ácidoácido y el oxígenoy el oxígeno--3' 3' de de tRNAtRNA..
Fenilalanina tRNAFenilalanina tRNA OCCHCHOCCHCH22CC66HH55
NHNH33++
OO
A
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AA
A
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C C
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U
U U
UUU
U
GG
G
G GG
GG
G
G
UG G
G
This AAA triplet is This AAA triplet is complementary to a complementary to a UUU tripletUUU tripletof mRNA; it is an of mRNA; it is an anticodonanticodon..
SecuenciadoSecuenciado de DNAde DNASecuenciadoSecuenciado de DNAde DNA
SecuenciadoSecuenciado de DNAde DNALas Las enzimasenzimas de de restricciónrestricción clivanclivan los los polinucleótidospolinucleótidos a a fragmentosfragmentos másmás pequeñospequeños..EstosEstos fragmentosfragmentos másmás chicoschicos (100(100--200 200 pares de bases) son pares de bases) son secuenciadossecuenciadospares de bases) son pares de bases) son secuenciadossecuenciados..Las dos Las dos hebrashebras se se separanseparan..
3T2
1E 4E
3E2E
1T00T4
3T41T2
O BHOO
BHONorte
max
0º
10º
20º
30º
40º
O
BHO
360º0º 2'
3'
2T3
0E0E
4E 1E
2E3E
0T1
2T14T3
4T0
Sur
0
O
HOH2C B
90º270º
180º2'
3'