Taxonomía bacteriana

• Ciencia de la clasificación en tanto que agrupa y separa a las bacterias en base a características fenotípicas y genéticas.

• CLASIFICACIÓN: es la ordenación o reestructuración de los organismos en grupos o taxones (dominio o imperio, clase, orden, familia, genero o especie) en función de semejanzas mutuas o de parentesco evolutivo.

• NOMENCLATURA: parte de la taxonomía que trata de asignar un nombre científico a los grupos taxonómicos de acuerdo con criterios y normas preestablecidas y admitidas internacionalmente.

• IDENTIFICACIÓN: parte práctica de la taxonomía en tanto que permite encuadrar un determinado organismo en un grupo taxonómico previamente establecido.



• El objetivo de la Taxonomía bacteriana es dar un ordenamiento de las unidades taxonómicas básicas (especies).

• Especie bacteriana: Es un conjunto de poblaciones clonales que presentan un elevado grado de similitud fenotípica entre sí y que a su vez difieren de otros conjuntos de poblaciones clonales.


• Las agrupaciones de individuos de la misma especie se denominan en microbiología cepas ó clones.

• Una cepa es un cultivo puro derivado de un solo aislamiento.

• Clon es un cultivo puro formado por los descendientes de una sola bacteria.

• En la ordenación taxonómica las distintas especies se van agrupando sucesivamente en una serie de categorías de orden superior género, familia, orden, clase y división (ó phylum).

• Esta es la llamada ordenación jerárquica porque cada categoría, en la serie descendente, agrupa un número cada vez mayor de unidades taxonómicas, basándose en un número cada vez menor de propiedades compartidas.



• El GÉNERO está formado por un grupo de especies relacionadas .Un grupo de géneros estrechamente relacionados constituyen una FAMILIA.

• Las categorías taxonómicas superiores se definen de igual manera y son las siguientes: ORDEN, CLASE, DIVISIÓN Y REINO.

Órdenes 1. Las eubacteriales, esféricas o vacilares, que comprenden casi todas las bacterias patógenas y las formas fotótrofas.

2. Las pseudomonadales, orden dividido en 10 familias entre las que cabe citar las Pseudomonae y las Spirillacae.

3. Las espiroquetales (treponemas, leptospiras).

4. Las actinomicetales (mico bacterias, actinomicetes).

5. Las rickettsiales.

6. Las micoplasmales.

7. Las clamidobacteriales.

8. Las hifomicrobiales.

9. Las beggiatoales.

10. Las cariofanales.

11. Las mixobacterias.


• En ocasiones existen sub-clasificaciones de estas categorías taxonómicas básicas como por ejemplo: subfamilia o suborden.

• En taxonomía bacteriana, cuando se da nombre a una nueva especie, una cepa concreta se designa como cepa tipo.

• Las cepas tipo se conservan en colecciones de cultivos y es importante con fines de nomenclatura, ya que el nombre específico va ligado a ella.

1. Actinobacteria

2. Aquificae

3. Bacteroidetes/Chlorobi grupo

4. Chlamydiae/Verrucomicrobia grupo

5. Chloroflexi

6. Chloroxybacteria

7. Chrysiogenetes

8. Cyanobacteria

9. Deferribacteres

10. Deinococcus-Thermus

11. Dictyoglomi

12. Fibrobacteres/Acidobacteria grupo

13. Firmicutes

14. Fusobacteria

15. Gemmatimonadetes

16. Nitrospirae

17. Omnibacteria

18. Planctomycetes

19. Proteobacteria

20. Spirochaetes

21. Thermodesulfobacteria

22. Thermomicrobia

23. Thermotogae

Filo/Divisiones

Árbol filogenético de los principales linajes de Bacteria basado en la comparación de secuencias de ARNr 16S

Grupos taxonómicos • El nombre del grupo taxonómico entre el orden

y el género se forma añadiendo el sufijo correspondiente a la raíz del nombre del género tipo.

• Grupo taxonómico Sufijo Ejemplo

• Orden -ALES Pseudomonadales

• Familia -ACEAE Pseudomonadaceae

• Tribu -EAE Pseudomonadeae

• Género Pseudomonas

Grupos taxonómicos

Nomenclatura • Asignar a los microorganismos un nombre científico

concreto y admitido internacionalmente. – Informal – Científica o taxonómica Reglas – Nomenclatura binomial – Nombre género y especie latinizados (Linnaeus, 1753). – Inicial denominación genérica: mayúscula – Género y especie cursiva o itálica, o en su defecto subrayados (Staphylococcus aureus o Staphylococcus aureus). – Denominación de especie (ej. S. aureus)

• No es arbitraria (The Internatinal Code of Nomenclature of Bacteria).

• Referencia a alguna característica del organismo, tales como su apariencia, procedencia, alguna propiedad característica, el investigador que la descubrió:

• Corynebacterium mastitidis, productor de mastitis

• Sanguibacter inulinus, aislados a partir de sangre y fermentador de la inulina

• Sanguibacter suarezii, Guillermo Suárez, microbiólogo veterinario español.

• Uruburuella suis, Federico Uruburu, microbiólogo español, aislada de cerdo.

• Helcococcus ovis, asilado de ganado ovino.

• Pasteurella, de Louis Pasteur.

• Jonesia, Dorothy Jones, microbióloga inglesa.

• Listeria ivanovii subps. londoniensis, de Londres.

Nomenclatura

Denominación

Identificación bacteriana


• Como metodología habitual se utilizan criterios de fácil denominación como los morfológicos, por su practicidad.

– Forma – Tamaño – Movilidad – Reproducción – Tinción a colorantes como la de Gram – Presencia o ausencia de estructuras como esporas,

cápsulas o flagelos. – Crecimiento en medios gelificados en los que se puede

observar forma, tamaño, color y aspecto de las colonias producidas.


• Sin embargo este criterio ofrece elementos de juicio insuficientes para la caracterización definitiva y por lo tanto se tienen en cuenta otros criterios como son: – Mecanismos fisiológicos y bioquímicos

• Crecimiento. • Muerte. • Supervivencia a diferentes condiciones de cultivo

(temperatura de crecimiento, pH, concentración de sales) • Ausencia o presencia de enzimas (catalasa, amilasa, etc.) • Cómo toman y/o almacenan la energía.

Manuales y claves de identificación y clasificación

• Para la clasificación, identificación y nomenclatura de las bacterias, la mejor referencia que existe es el Bergey's Manual of Sistematic Bacteriology, conocido como el Manual Bergey.

• La edición más reciente está siendo publicada progresivamente, y estará constituida por 5 volúmenes, en ella estarán incluidas todas las especies de bacterias conocidas para la fecha de su publicación y a diferencia de la anterior que tenía un enfoque que enfatizaba en las características fenotípicas, esta edición tiene un análisis filogenético basado en la secuenciación del ARN r, del ADN y de las proteínas.

• El Manual Bergey establece que el Reino Procariotae está formado por microorganismos caracterizados por carecer de membrana nuclear y por tener ribosomas 70S.

Manuales y claves de identificación y clasificación

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