Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad de ... · Biodiversidad • Creada en 1992, es...
Transcript of Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad de ... · Biodiversidad • Creada en 1992, es...
SistemaNacionaldeInformaciónsobreBiodiversidaddeMéxico
(SNIB)
Diciembre,2017
ComisiónNacionalparaelConocimientoyUsodela
Biodiversidad• Creadaen1992,esintersecretarialyestápresididaporelPresidentedelaRepública
• PromueveycoordinaelconocimientoacercadelCapitalNatural;notieneatribucionesparanormaroejerceractosdeautoridad
• Obtiene,organiza,analiza,generaydaaccesoadatoseinformaciónsobrelariquezabiológicadelpaís
• Esunpuenteentrelaacademia,elgobiernoylasociedadcivil
• deinvestigaciónaplicadapararesolverproblemasconcretos ycomopromotoradeinvestigaciónbásicaalaqueapoya
• especializadaeneláreadeinformáticadelabiodiversidad
• queesfuentepublicadeinformaciónyconocimientoacercadelCapitalNaturalparatodalasociedad
Fueconcebidacomounaorganización:
• Bases de datos de registros de ejemplares
«columna vertebral» • Catálogos y archivos de autoridad• Información ecológica y de uso
• Imágenes de satélite• Cartografía digital (vegetación, climas, regiones prioritarias, etc.)• Monitoreo de biodiversidad
• Herramientas estadísticas de análisis
• Desarrollos bioinformáticos
• Redes de expertos nacionales e internacionales
SNIB
Jerarquíadelentendimiento
Ambiente
Información
Conocimiento
Sistemasdegestióndedatos
Latecnologíadegestióndedatospermitequenuestroesfuerzocognitivoserealiceensintetizarinformación Sintecnologíadegestiónde
datosnuestroesfuerzocognitivoesatrapadoenprocesosdeexploracióndedatosprimarios
Datos
Medición
Reglas
Modelos
Clasificación de problemas
Holling
Delconocimientotácito alconocimientoexplícito
Regiones prioritarias terrestres
Metas de conservación
Optimización
Factoresdepresión
Sitiosprioritariosparalaconservación
Filtrosfinos(Modelosdenichoecológico)
Filtrosgruesos(vegetación,mapasderiqueza
potencialdeespecies)
Identificacióndeprioridadesparalaconservacióndelabiodiversidad
SitiosprioritariosparalaconservaciónTerrestre,marinoyepicontinental
Conlaparticipacióndemásde260especialistas,organizacionesdelasociedadcivilygobierno
Accesible Losdatosdebenestaradisposicióndelpúblicoycontarconunmecanismodeaccesoexplicadocontodaclaridad.
Transparente
Elconjuntodedatosdebeserdescritoensuformatoycontenidomediantediccionariosymecanismosdeintegración,asícomoconcitasdelasfuentesdelosdatos,detalformaque—ademásdedarelcréditocorrespondientealosautores— permitaalosusuariosresolverdudas,profundizarenuntemaespecífico.
Interoperable Losdatosdebenpodercompartirseconotrossistemasinformáticosobancosdedatosapartirdeestándaresinternacionalesdecomunicación.
RelevanteLosdatosintegradosenelSNIBdebenserrelevantesparaelconocimientoadecuadosegúnlaspreguntasqueseplanteen.LarelevanciadelosdatoscontenidosenelSNIBfueysiguesiendoobjetodediscusiones.
ConfiableParaelSNIBsehandesarrolladomúltiplesmecanismosdeevaluacióndelosdatos.Tambiénsehatrabajadoparaelaborarinstructivosdemétodosymejoresprácticasdepresentacióndelainformación.
Verificable
Lageneracióndelosdatosydelainformacióndebeposeerelrigordelainvestigacióncientífica.Lasopinionespuedenconsiderarseválidas,perosinoestánsustentadasendatosfactuales,nosonincorporadasautomáticamenteenelsistema.
Principales características del SNIB
0
2,000,000
4,000,000
6,000,000
8,000,000
10,000,000
12,000,000
14,000,000Re
gistrosd
eejem
plares
Año
MéxicoE.U.A.Otros
13.2millones deejemplares+2000/943 basesdedatos+1200/835 proyectos
Paísdelacolección
Tipodedatos• Imágenesópticas• Fotografíaaéreaanáloga ydigital• Ortofotos• Fotografíahemisférica• ImágenesdeRADAR,datosLIDAR
DatosqueserecibenenlaantenadelaCONABIO:AVHRR,MODIS,VIIRS
0
100,000
200,000
300,000
400,000
500,000
600,000
1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Datosd
esensoresre
motos
SistemaderecepcióndelaCONABIO
Otrasfuentes
553,461
Domardatos
Integrardatosà informaciónEstandarizar,limpiarycompletar
http://www.flickr.com/photos/lizardwisdom/2462711805/
Obtencióndedatos:Duro. Trabajopeligrosoquerequierecasco
@Roland Bouman
http://www.flickr.com/photos/wendycrockett/2647516433/
ControldecalidadSedebesermeticuloso
@Roland Bouman
Controldecalidad …
https://www.pinterest.com.mx/pin/264727284323542969/
Informaciónunplatobienpreparado
HuachinangoalaVeracruzana
Procesodeestandarizar,limpiarycompletar
• Portaxonomíaynomenclatura(95%delosejemplares
validadosal100%).
• Porgeografía(país,estado,municipioylocalidad).{validos/novalidos a:país99.84%/0.16%,estado90.47%/1.76%;municipio22.63%/3.81%}
• Porambientedelorganismo.Noprocesado(35.11%);Novalido(0.48%);Validos(64.40%)
ProcesodevalidacióngeográficaIntersección de los sitios con diferentes mapas
§ Comparación de la información original del registro del ejemplar con la obtenida de los mapas
División política, islas,ZEE, cuerpos de agua
Uso de suelo y vegetación
Áreas Naturales Protegidas
Modelo digital de elevación
MEXICOBAJA CALIFORNIA SURMULEGE
MATORRALXEROFILO
El Vizcaíno16.0 m
Información del mapa Información del ejemplar Resultado de la validación
País MEXICO MEXICO VALIDO
Estado BAJA CALIFORNIA SUR BAJA CALIFORNIA NO VALIDO
Municipio MULEGE NO DISPONIBLE SIN INFORMACION
Localidad y rasgo geográfico NATIVIDAD, ISLA HABITADA Isla Natividad VALIDO
Limpieza de datos
• Errores de escritura
• Errores de contexto
Valor agregado
• Estatus taxonómico
• Taxonomía superior estandarizada
Validacióntaxonómicaynomenclaturalü Abronia deppiix Abronia deppi
Género AbroniaFamilia:Anguidae (Reptiles)Nyctaginaceae (Plantas)
CraniataChordataVertebrata
VálidoSinónimo
Validacióntaxonómicadenombresdeejemplares
*CatálogosdeAutoridadesTaxonómicasEspecies
válidasenCAT*
4,995
4,47928,915
55,568
2,864
400
9571,136579
0
99,893
grupo nombresoriginales
Taxonesoriginales
Taxonesvalidados
Nombresválidosdeespecies
Bacteriasyalgas 11,714 10,058 5,869 3,561
Hongos 9,504 8,336 4,405 3,410Plantas 157,554 110,518 88,392 34,388
Invertebrados 110,148 86,292 46,998 28,122
Peces 12,338 7,714 5,237 2,713
Anfibios 2,550 1,457 933 398
Reptiles 6,639 4,785 3,213 938Aves 13,227 9,368 3,727 1,135Mamíferos 6,863 4,314 3,013 591
Nodisponible 11,469 6,396 0 0
TOTAL 342,006 249,238 161,787 75,256
Otrasfuentesdevalidación:
Categoríastaxonómicasdelosnombresvalidados
+150taxónomos+50instituciones+70proyectos2postdoctorados
Dípteros(moscasymosquitos)
*Morón&Valenzuela.1993.Rev.Soc.Mex.Hist.Nat.1993,44,303-312.**Ibáñez.2017.ActualizacióndelCatálogodeAutoridadesTaxonómicasdelosDípteros(Diptera:Insecta)
deMéxico.ProyectoJE006CONABIO.http://www.enciclovida.mx/especies/9000015
20,000
6,154
1,757
0
5,000
10,000
15,000
20,000
25,000
México* SNIB-CAT** SNIB-ejemplares
Especiesválidasdedípteros
http://www.flickr.com/photos/anjuli_ayer/3320839877/
Puestaenescena:almacenandoparafuturosprocesos
@Roland Bouman
http://www.flickr.com/photos/anjuli_ayer/3320848365/
Transformación:cambiandolaestructura
@Roland Bouman
http://www.flickr.com/photos/mcav0y/2696641615/
Utilización:depositarenunalmacéndedatos
@Roland Bouman
Enriquecimientoyejemplo
Valoragregadoalosdatos
• Validacióndelaubicacióngeográficadelejemplar• UsodesueloyvegetaciónserieIaVdelINEGI• ÁreasNaturalesProtegidas• Grupobiológico,subgrupobiológico• Taxonesvalidos:Reino,división,clase,orden,familia,genero,especie• Nombrecomún• Endemismo• Formadecrecimiento• Especieprioritaria• Especieexótica• Categoríasderiesgo:NOM-059,IUCN,CITES• Residencia–Aves-• Localidadprobablenodecampo
Enriquecerlosdatos– paramejorarlautilidad
Ubicacióndelproyectominero“LosCardones”,conreferenciaalaANP“SierradelaLaguna”ylosregistrosdelSNIB
Casosdeuso
ANP“SierradelaLaguna”
ANP“SierradelaLaguna”
ANP“SierradelaLaguna”
Áreadelamina“LosCardones”BufferalproyectomineroANPSierradelaLagunaPolígonodeestudioN.GENRegistrosSNIB
Casosdeuso…
ConsultasalSNIB
Consultaaporreferenciageográficageoportal.conabio.gob.mx
Losejemplaressepodránsobreponercon4,950capasdeinformacióngeográficayelaborarconsultasespacialesconlassiguientescapas:
ü ÁreasNaturalesProtegidasü Cuencas
ü Ecorregionesü RegionesMarinas
ü Estadosü Municipios
Consultaaporreferenciataxonómica,nombrecomún:www.enciclovida.mx
Consultatodolosejemplares:www.snib.mx
http://www.conabio.gob.mx/web/proyectos/proyectos_financiados.html
ConsultasalosproyectosfinanciadosporlaCONABIO
vInformefinalvBD
ConsultasalSNIB
Ø Porreferenciageográfica:Ø http://geoportal.gonabio.gob.mx
Ø Porreferenciataxonómica:Ø http://www.enciclovida.mx
Ø TodoØ http://www.snib.mx
Ø SubcoordinacióndeenlaceytransparenciaØ [email protected]
NuevosretosSNIBsinfronteras
~120- 200millonesderegistros
Nuevosretos…Nuevoscamposdeconocimiento- Datosgenéticos
• Plataformaparaintercambiodeinformacióngenética• Conexiónconrepositoriosgenéticosyaexistentes(e.g.NCBI)• Modelosdedatosestándar,flexiblesymatemáticamentedefinidos
• Repositoriodedatosyplataformadetrabajo
Posiblesaplicaciones• SaberenquépartesdeMéxicolasespeciestiendenatenermayordiversidadgenética
• Sabercuálesladiversidadgenéticaendiferentesambientes
• Utilizaresadiversidadgenéticaporejemploparaadaptarnuestroscultivosalcambioclimático
LimitantesderepositoriosdedatosgenéticosactualesParaMéxico• Noestánasociadosasitiosdecolecta• Nopodemosbuscarquéinformaciónhayparaelpaís• NosesistematizanestadísticosderesumenGrandesvolúmenesdedatos• Genomascompletos,trasncriptomas,páneles demilesdeSNPs• CientosamilesdeespeciesReproducibilidad• Sealmacenansolodatossemicrudos ofinales• Pérdidadatosintermedios,scriptsyprotocolosdelaboratorio• Diversidaddeformatosyfaltadeestándares• Difícilcoordinarelcontroldeversiones
Nuevosretos…Nuevoscamposdeconocimiento- Datosgenéticos
SPECIES: Sistema Para la ExploraCión de Información ESpacial
Descubrir información (escondida en los datos)
Datos
SNIB,WorldClim 1.4.
Motordecómputoestadístico
Cómputo
Visualizacióninteractiva
Nuevosretos-Modelado
SPECIES: Exploración de nicho ecológico
Especie:Jaguar(Panthera onca)
GruposdeCovariables:WorldClim 1.4MagnoliopsidaMammalia
SPECIES: Redes ecológicasEjemplo: Chiroptera vs Agavaceae
Nodo:Espadín
DistribuciónderegistrosdeAgaveangustifolia
CorrelacionesdeAgaveangustifolia (Magueyespadín)yespeciesdeChiroptera (Murciélagos)
Graciaswww.biodiversidad.gob.mx