Silabus de Bioquimica

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UNIVERSIDAD (Universida FACULTAD D DEPARTAMENTO ESCUELA ACA SEM CONTENIDO: 1. Sumilla 2. Objetivos 3. Personal Docente 4. Metodología 5. Organización 6. Sistema de Evaluació 7. Bibliografía 8. Programa Calendariz Ciu NACIONAL MAYOR DE SAN MAR ad del Perú, DECANA DE AMÉRIC DE QUÍMICA E INGENIERÍA QUÍM ACADÉMICO DE DE QUÍMICA O ADÉMICO PROFESIONAL DE QU SYLLABUS DE BIOQUÍMICA Código: QO7338 MESTRE ACADÉMICO 2013-II ón zado udad Universitaria, Agosto 2013 ARCOS CA) MICA ORGÁNICA UÍMICA

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UUNNIIVVEERRSSIIDDAADD(Universidad del Perú, DECANA DE AMÉRICA)

FACULTAD DE QUÍMICA E INGENIERÍA QUÍMICA

DEPARTAMENTO ACADÉMI

ESCUELA ACADÉMICO PROFESIONAL DE QUÍMICA

SEMESTRE ACADÉMICO 2013

CONTENIDO:

1. Sumilla

2. Objetivos

3. Personal Docente

4. Metodología

5. Organización

6. Sistema de Evaluación

7. Bibliografía

8. Programa Calendarizado

Ciudad Universitaria,

NNAACCIIOONNAALL MMAAYYOORR DE SAN MARCOS(Universidad del Perú, DECANA DE AMÉRICA)

FACULTAD DE QUÍMICA E INGENIERÍA QUÍMICA

DEPARTAMENTO ACADÉMICO DE DE QUÍMICA ORGÁNICA

ESCUELA ACADÉMICO PROFESIONAL DE QUÍMICA

SYLLABUS

DE

BIOQUÍMICA

Código: QO7338

SEMESTRE ACADÉMICO 2013-II

6. Sistema de Evaluación

Calendarizado

Ciudad Universitaria, Agosto 2013

DE SAN MARCOS(Universidad del Perú, DECANA DE AMÉRICA)

FACULTAD DE QUÍMICA E INGENIERÍA QUÍMICA

DE QUÍMICA ORGÁNICA

ESCUELA ACADÉMICO PROFESIONAL DE QUÍMICA

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1. SUMILLA DEL CURSO

Es un curso obligatorio perteneciente al Área Curricular formativa. Tiene como propósito principal, estudiar la estructura, aislamiento, caracterización y función de las macromoléculas que componen los seres vivos, las transformaciones de las sustancias en el proceso de la actividad vital catalizadas y reguladas por enzimas, las principales vías catabólicas utilizadas por los seres vivos para obtener energía a partir de la degradación de las diferentes moléculas energéticas, aplicar los conocimientos teóricos y prácticos en la resolución de problemas en el campo de la medicina, biotecnología e investigación. El eje principal del curso está dado por el estudio del metabolismo de carbohidratos, lípidos, proteínas y los compuestos nitrogenados y permite tener una visión integradora del metabolismo intermediario con todas sus interconexiones y relaciones.

Para cumplir con dicho propósito, el curso está dividido en las unidades temáticas:

UNIDAD 1: CARACTERÍSTICA BIOQUÍMICA DE LOS ORGANISMOS VIVOSUNIDAD 2: AMINOÁCIDOS, PÉPTIDOS Y PROTEÍNAS UNIDAD 3: ENZIMAS, VITAMINASUNIDAD 4: CARBOHIDRATOSUNIDAD 5: OXIDACIÓN BIOLÓGICA Y BIOENERGÉTICAUNIDAD 6: LÍPIDOS, BIOMEMBRANASUNIDAD 7. METABOLISMO NITROGENADOUNIDAD 8. ÁCIDOS NUCLEICOS

2. OBJETIVOSAl término de sus estudios en el curso el alumno será capaz de:

2.1. Tener una clara concepción de la composición molecular de los organismos vivos, de estructuras y mecanismos metabólicos que sustentan la vida.

2.2. Demostrar, basándose en las vías anabólicas y catabólicas, el funcionamiento de los diversos mecanismos reguladores a través de los cuales una célula o un organismo controla sus propias actividades.

2.3. Identificar y explicar las estructuras, clasificación y las diversas funciones que cumplen los aminoácidos, proteínas, carbohidratos, lípidos, ácidos nucleicos en los seres vivos.

2.4. Valorar, utilizando ejemplos de enfermedades moleculares, el papel de los descubrimientos en el campo de la bioquímica para el desarrollo de la medicina.

2.5. Apreciar y valorar la importancia del método experimental en la adquisición de conocimientos sobre metabolismo intermediario.

2.6. Conocer, comprender y analizar los principios básicos de la Enzimología y su aplicación en la investigación científica y tecnológica.

2.7. Ejecutar experimentos bioquímicos con rigor analítico y científico y reconocer la importancia de la aplicación de esta disciplina en su profesión.

3. PERSONAL DOCENTE:Profesor Responsable : TEORÍA : FRED GARCÍA ALAYO, Ph.D.

: Mg. JUAN CARLOS WOOLCOTT HURTADO LABORATORIO : FRED GARCÍA ALAYO, Ph.D.

: Mg. JUAN CARLOS WOOLCOTT HURTADO

4. METODOLOGÍA DE ENSEÑANZAEl curso se desarrollará a través de los siguientes métodos de enseñanza:a) Exposiciones teóricas a cargo del docente.b) Presentación de Informe de cada práctica.c) Exposición de seminarios a cargo de los alumnos y presentación de monografía.d) Evaluaciones escritas.

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5. ORGANIZACIÓN5.1. Duración del Curso : 17 Semanas5.2. Número de Créditos : 045.3. Fecha de inicio : 23 de Agosto del 20135.4. Fecha de término : 19 de Diciembre del 20135.5. Nº de horas/semana : Teoría: 02 Horas

: Laboratorio: 04 Horas5.6. Horario: Teoría : Sábado de 09:00 - 11:00 horas

Laboratorio : 5.7. Requisito : Química Orgánica IV

6. SISTEMA DE EVALUACIÓN Se evaluará la puntualidad, asistencia y participación en clases. El 30% de inasistencias a

clases teóricas inhabilita al alumno. La inasistencia a dos prácticas de laboratorio inhabilita al alumno.

Número de Exámenes Total Teoría Práctica

3 2 5El examen sustitutorio sustituye la nota más baja. Comprende todo el curso. No hay postergación de exámenes.

Promedio Final del Curso (PF)

Promedio Exámenes Teóricos E1 + E2 + E3

Promedio Exámenes Prácticos NE + NI + NP+DL = NLNL= NE = Prom. Exámenes; NI = Prom. Informes; NP = Prom. Pasos; DL= Desempeño en Laboratorio

PF =

La nota final será obtenida del promedio de los cuatro rubros. La escala de notas es vigesimal, se aprueba el curso con la nota de ONCE (11). La fracción mayor o igual a 0,5 se computa como la unidad a favor del alumno, sólo para el caso del promedio de la nota final. Se tomará en cuenta la asistencia a las clases teóricas y prácticas. De acuerdo al Reglamento, la inasistencia a tres (03) clases de Laboratorio se considera como nota desaprobada. No hay recuperación de las clases de laboratorio. El examen sustitutorio sustituye la nota más baja de los exámenes parciales y comprende todo el curso.

7. BIBLIOGRAFÍA

7.1 Bohinsky, R. 1995. Bioquímica. Addison- Wesley Iberoamericana. 5ta Edición. México.7.2 Horton, R, Moran, L, Scrinigeour, G, Perry, M, Rawn, D. 2008. Principios de Bioquímica.

4taEdic. Printice Hall. 844 pp.7.3 Lehninger,A. David L. Nelson. 2009. Principles of Biochemistry. Fifth Edition. 7.4 Nelson, D and Cox. 2004. Principles of Biochemistry. 4th Ed. 825 pag.7.5 Mc Kee, T y Mc Kee, J. 2003. La base Molecular de la vida. 3era Edición. Editorial Mc Graw

Hill Interamericana Editores S.A. México DF. 773 pp.7.6 Murray, R, Granner, D, Rodwell, V. 2009. Harper Bioquímica ilustrada. 17maEdic. Manual

Moderno. México. 692 pp.7.7 Stryer, L. 2004. Bioquímica. Editorial Reverté. (Tomo I y II) España.2004.7.8 Villavicencio, M.1993. Bioquímica. (TOM: I y II). CONCYTEC, Perú.7.9 Voet, Donald and Voet, Judith G. 2004. Bioquímica. 3rd. Edition. 2004. by John Wiley &

Sons, Inc.http://www.porquebiotecnologia.com.ar/?action=cuaderno&opt=5&tipo=1&note=54 (12/09/2013)http://ittbioquimicos.activebb.net/t7-importancia-de-las-enzimas-en-la-industria (11/09/2013)http://abcbiotech.blogspot.com/2010/05/enzimas-en-la-industria.html (12/09/2013)

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Revistas de consulta: Nature Journal Biological Chemistry Journal of Biochemistry, Annual review of Biochemistry Biophysical and Biochemistry Acta (BBA) Trends in Biochemical Sciences.

8. PROGRAMA CALENDARIZADO

SEMANA CONTENIDO

1Clase Inaugural. Introducción a la Bioquímica. Composición química de los organismos vivos. Células Procarióticas y Eucarióticas. Fraccionamiento Celular.

2El Agua. Propiedades biológicas. Poder disolvente del agua. Producto iónico del agua. pH, pK. Sistema buffer

3Aminoácidos y Péptidos. Propiedades físico-químicas. Clasificación de los aminoácidos. Enlace peptídico. Péptidos de importancia biológica. Síntesis.

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Proteínas. Propiedades físico-químicas Estructura Primaria, Secundaria, terciaria y Cuaternaria. Proteínas como efectores biológicas: factores de crecimiento, con función endocrina, proteínas de defensa. Uso de Proteínas en la biotecnología, medicina, agricultura e industria.

5Técnicas de Estudio de las Proteínas. Aislamiento y Purificación de proteínas. Las mutaciones en la molécula de proteína. Proteoma - un retrato de la proteína celular

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Enzimas: Clasificación, Catálisis, mecanismos, cinética enzimática. Centro catalítico. Modelo de Michaelis-Menten. Inhibición enzimática. Regulación enzimática. Alosterismo Inmovilización de Enzimas. Métodos de inmovilización. Vitaminas Hidrosolubles y Liposolubles. Funciones biológicas. Síntesis

7 PRIMERA EVALUACIÓN

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Carbohidratos. Propiedades. Estructura y función de monosacáridos, oligosacáridos y polisacáridos. Glicoproteínas. Glicanos. Metabolismo de carbohidratos. Procesos de fermentación a nivel celular y fuentes de energía. Glucólisis. Fermentación láctica y fermentación alcohólica. Metabolismo del glucógeno. Glucogenólisis. Ciclo de las pentosas, relaciones con otros procesos. Metabolismo de carbohidratos como centro del metabolismo celular.

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Principios de bioenergética. Reacciones de óxido-reducción. Teoría de la oxidación biológica. Biomoléculas de alta energía. Enzimas reductoras y transporte de electrones. Fosforilación oxidativa. Oxigenasas e hidroxilasas. Ciclo de Krebs. Funciones El acetil coenzima A. Cloroplastos. Fotosíntesis. Fases luminosa y oscura. El ciclo de Calvin-Benson. Fotoquímica

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Lípidos. Clasificación. Procesos de degradación y síntesis de lípidos Las proteínas de membrana. Características de la estructura. Transporte de membrana. Los canales iónicos y bombas. Estudio de las estructuras de lípidos y membranas lipídicas. Transporte a través de las membranas. Receptores. Oxidación de ácidos grasos saturados y no saturados. Formación de cuerpos cetónicos y su oxidación. Complejo polienzimático en la síntesis de los ácidos grasos. Biosíntesis de grasas neutras y fosfolípidos. Biosíntesis de esfingolípidos. Degradación enzimática de fosfátidos. Estudio del colesterol y función biológica. Biosíntesis de Colesterol, de hormonas esteroidales y ácidos biliares.

11 SEGUNDA EVALUACIÓN

12La estructura de los ácidos nucleicos. Los ácidos nucleicos, alto peso molecular, biopolímeros lineales, polares. La estructura primaria de la cadena de ADN polímero. La estructura secundaria de doble espiral ADN. Isogeometricidad pares de bases, el

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apilamiento. La topología del ADN - superenrrollamiento.La estructura primaria de ARN de cadena sencilla. Las diferencias con el ADNEl ARN monocatenario estructura secundaria. La estructura terciaria de ARN.La imitación de la estructura espacial de ARN y proteínas. Las enzimas de ARN –ribozimas. Funciones de los ácidos nucleicos. Biosíntesis de mononucleotidos UMP y IMP. Biosíntesis de UTP, CTP, GTP y ATP. Catabolismo de purinas y pirimidinas. Síntesis y transformaciones de los ácidos nucleicos. Ingeniería genética. Conceptos básicos.

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La biosíntesis de proteínas. Post-traduccional formación de la estructura de proteínas. Catabolismo y anabolismo de compuestos nitrogenados. Función biológica del nitrógeno. Metabolismo de aminoácidos. Degradación y biosíntesis. Transaminación y desaminación. Ciclo de la Urea.. Regulación de la biosíntesis de proteínas.Metabolismo de otros compuestos nitrogenados no proteicos.

14

El concepto de la traducción. El principal "dogma" de la biología molecular.El código genético y sus propiedades. Decodificación. La activación de los aminoácidos. Aminoacil-ciclasa. Ribosoma - nanorobot para la biosíntesis de los ribosomas proteína. Estructura. El ciclo del ribosoma. Esquema del enlace peptídico. Antibióticos. Polisomas.

15

Genoma, plásmidos, virus. La ingeniería genética. Clonación. Entre los ejemplos de la clonación terapéutica. Construcción de ADN recombinante.Ingeniería genética - cuatro etapas principales. Vector de ADN, la introducción de ADN en las células, la clonación, la identificación de clones.Los organismos transgénicos

16 TERCERA EVALUACIÓN17 SUSTITUTORIO

9. RELACIÓN DE PRÁCTICAS

Laboratorio No 1 Reacciones cualitativas (de coloración) de proteínas y aminoácidos

Laboratorio No 2. Preparación de soluciones proteicas del material biológico

Laboratorio No 3. Reacciones de precipitación de proteínas

Laboratorio No 4. Determinación del punto isoeléctrico: caseína y gelatina

Laboratorio No 5. Acción comparativa de catalizadores biológicos y no biológicos

Laboratorio No 6. Determinación de diferentes clases de enzimas

Laboratorio No 7. Determinación de óxido-reductasas en material biológico

Laboratorio No 8. Demostración de la especificidad de enzimas al sustrato

Laboratorio No 9. Cinética de las reacciones enzimáticas

Laboratorio No 10. Reacciones cualitativas sobre las vitaminas

Laboratorio No 11. Reacciones cualitativas sobre pigmentos de plantas

Laboratorio No 12. Fermentación de carbohidratos

Laboratorio No 13. Obtención de colesterol de material biológico reacciones cualitativas.