El ERBra, o cómo nos preparamos para el futuro

de la selección genética del Brangus latinoamericano

Rodolfo J. C. CantetDepartamento de Producción Animal, Fac.de Agronomía UBA

y CONICET

Asociaciones de criadores MGA = información

“Los criadores producen toros para sentirse mejor, para lucir mejor, o para ganar plata”

Scott Newman

Introducción

EG = información, … allá

Y acá: EG = información!

Toro sin información

“Toro vacío” = toro sin información es comprar a ciegas! ¿Porqué pagar por genética no impredecible?

Los criadores y la evaluación genética ERBra

o A diferencia del ganado lechero donde la evaluación genética y la investigación son muy activas, existe hoy escasa investigación en evaluación genética convencional en el vacuno de carne en el mundo.

o EG suelen seguir lineamientos de la BIF.

o Requieren información completa: todas las vacas con edad conocida; receptoras identificadas; GC pequeños; pedigree completo, etc.

Pedigree Brangus ERBra 2006

o Brangus: raza compuesta más reciente y con política abierta => pedigree suele ser incompleto

o En el ERBra, muchos criadores colectan información responsable y profesionalmente, pero algunos tienen serios problemas para la toma de información.

o En consecuencia: el ERBra genera necesidades de investigación ligadas a 1) información incompleta; 2) errores de medición. Usando los modelos sugeridos por BIF dejarían fuera de la evaluación muchos animales.

2004

El ERBra: una EG participativao AAB–UBA: en 1992 y trabajo continuo desde 1999.

o FA UBA: investigación + docencia posgrado (3 Doctores formados, 11 MS + 5 becarios doctorales: 2 argentinos, 3 colombianos) y grado + extensión (EG para Brangus, Braford y Brahman).

o Investigación en modelos de EG y soluciones para problemas de evaluación planteadas por criadores.

o Balance sesgo – varianza (inversa de exactitud).

Vigor híbrido y DEPs

Primera cruza o F1

Si no ajustamos por VH, la DEP puede cambiar mucho!! Los animales de generaciones iniciales se mostrarán mucho mejores que los de generaciones avanzadas.

Transplantes embrionarios

Animales de TE

o Importancia central; 6% de los animales evaluados en el ERBra.

o Vital contar con EG imparcial sobre estos animales.

o BIF: propone el “modelo de tres padres”, agregando a la madre receptora a las soluciones.

o Discontinuidad de la información sobre receptoras.

Datos de trasplantes embrionarioso Los datos de terneros TE hasta 2003: o sin asignar la aptitud materna a la vaca

donante, ni a ninguna otra vaca.o grupos específicos de terneros ET, o Edad de la Madre (EM) ajustada en una

categoría especial.

oClaudio Fioretti informó que terneros TE tenían, generalmente, DEPs negativas: grupos pequeños y sobre-ajustados por EM.

Tratamiento de los terneros TEo Seguimos sin asignar laaptitud materna a la vaca donante, ni a ninguna otravaca.

o Grupos combinando terneros ET o no, pero manejados de igual modo.

o Edad de la Madre (EM) ajustada a la categoría EM desconocida junto con vacas de IA o servicio natural, metodología para observaciones con ‘errores de medición’ (Cantet, 2007; Suárez, 2012).

Grupos de Contemporáneos

En Argentina, Colombia y Uruguay se pueden armar GC más grandes que en muchas zonas de USA: así se consigue menor varianza, mayor conectividad y mayor exactitud. Procedimientos estadísticos de formación y revisión de GC.

Grupo de animales manejados conjuntamente durante el período de evaluación.

Patrón mensual del peso a 210 días

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

Argentina

Colombia

Uruguay

Mes

Patrón mensual del peso a 550 días

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

Argentina

Colombia

Uruguay

Mes

Vaquillas de zonas más difícileso Víctor Navajas me informó oportunamente que sus

toros jóvenes solían mostrarse con DEPs negativas.

o Toros jóvenes eran probados sobre vaquillas, las cuales eran ajustadas por edad, con el resto de las vaquillas en ERBra.

o ¿Las vaquillas de zonas más difíciles , se comportaban de modo similar a las de zonas más favorecidas en cuanto a forraje?

o Se creó una categoría nueva EM que difiere en unos 8 kg en relación con sus contemporáneas.

Fijación de la base

DEPs de Relmún en el tiempo

Año Crías DEP NACER

DEP DESTETE

DEP APTITUD

MATERNA

DEP PESO FINAL

DEP CIRC.

ESCROTAL

2000 991 0.2 4.1 2.2 13.4 0.52001 1065 0.2 4.2 2.4 12.5 0.42002 1079 0.2 4.5 2.4 11.9 0.42003 1114 0.2 5.3 3.4 13.3 0.52004 1167 0.3 6.2 4.5 13.4 0.42005 1355 0.4 2.6 3.2 10.9 0.32006 1483 0.6 3.4 1.7 9.6 0.3

Valor de cría = análisis retrospectivo

½ valor de cría

+ Residuo de segregación

½ valor de cría

El valor de cría va hacia la base vía el pedigree ( información ancestral )

Vaca Base

Vaca Base

Vaca Base Toro Base

Vaca BaseToro Base

Toro Base

Conexiones y toros de conexión

La conectividad mide la precisión de las comparaciones entre establecimientos: las DEPs de rodeos desconectados no son comparables con las del grupo de establecimientos conectados.

Índice de Conectividad del ERBra.

Evaluación conectada \ ToroRodeo

A B C D E

1 — —

2 — —

3 — —

La comparación del toro A (en el rodeo 1) con el D (en rodeo 2) es sólo posible dado que el toro C los “conecta”: A se compara con C en el rodeo 1 y D con C en el rodeo 2.

Evaluación desconectada

\ ToroRodeo

A B C D E

1 — — —

2 — — — —

3 — — —

Este toro no está comparado con ningún

otro !! ¿Es bueno?

Variación en las comparaciones entre algunos toros Brangus de 10 establecimientos en el

resumen de padres 2006

Relmún Yastá Naranjo Don Ernesto

Cardenal Gaucho Ñatito X Faraón Trabuco

2.88 15.54 16.82 16.81 7.22 11.42 11.58 32.38 15.74 15.95

13.59 27.40 27.51 18.33 21.69 21.98 43.65 26.37 26.65

14.27 27.77 18.72 22.84 23.00 40.01 27.20 27.40

14.16 18.39 22.85 23.11 44.62 27.14 26.88

5.12 13.60 14.05 35.27 18.02 17.99

8.90 17.82 38.86 21.82 22.07

9.31 39.64 21.83 21.58

30.76 43.48 43.80

13.11 26.14

13.35

Índice de conectividad  Rodeo Índice de conectividad 

A 18.4B 7.9C 9.0D 6.8E 6.0F 16.0G 5.5H 10.3I 5.4J 4.2

Estimación de heredabilidades

y correlaciones genéticas y ambientales

Heredabilidades y Correlaciones genéticas y ambientales: Caracteres de res - Brangus

Carácter AOB GD GC %GI

AOB 0.22 -0.10 -0.01 0.02

GD 0.23 0.16 0.48 0.08

GC 0.22 0.58 0.12 0.09

%GI 0.03 0.01 0.01 0.21

Características técnicas del ERBrao Modelos animales multi-carácter (crec. y res) y uni-carácter.

o Parámetros genéticos estimados con datos del ERBRA.

o Inclusión en el modelo de los efectos del vigor híbrido (dominancia), empleando marcadores para la fracción de genes Cebu - Angus.

o Definición de los GC sobre la base de procedimientos estadísticos.

o Inclusión de registros de animales de transplante embrionario (TE) y corrección de los registros de TE y edad de la madre incierta mediante técnicas estadísticas para observaciones con ‘errores de medición’.

o Índice de conectividad.

ADN y ERBra

ADN y terneza en novillos Brangus Soria y otros (2009) observaron tres SNP

(marcadores moleculares) que conjuntamente (haplotipo) se diferenciaban en casi 1 kg de terneza.

Miquel y otros (2009) encontraron que un marcador para CAPN1 316 se asoció con 0.880 kg (1 kg en USA) más terneza por cada alelo C, en novillos Brangus de la AAB.

Link: http://www.nindooinbah.com.au/blog/41-development/58-postcard-from-argentina.htmlPostcard from ArgentinaWritten by Nick Cameron Monday, 19 March 2012 16:25

“The percentage content is cleverly tracked through their genetic evaluation program (ErBra).”

Composición genética de los 48 toros más usados en 2010

Genes Brahman = 0.323 ± 0.118 V.Esperado = 0.375 (3/8)

Impacto de la fracción de genes Brahman

Heterosis estimada sobre progenie de 50 toros con fracción de genes estimada

Datos Peso al Destete Peso Final20800 2.68 kg 10.37 kg

Dominancia directa (heterosis)

Año Peso al destete (kg) Peso final (kg)

N Braford Brangus N Braford Brangus

2006 6021 9.50

4.34 2994 18.54 16.51

2007 16981 7.89 7.18 7048 43.20 18.64

2008 24138 4.50 8.03 10813 32.72 18.43

2009 35211 1.86 8.55 15279 8.38 18.44

EG conjunta

EG Conjunta multinacional • Evaluación de vacas y terneros (los toros son

también evaluados) puede ser nacional o centralizada.

• Toros: EG centralizada tipo Interbull (leche), con supervisión colectiva.

• Datos: desviaciones de promedio fenotípicos ajustados (DYD) por toro y país.

• Preferencialmente genómica pero, al menos ajustada por heterosis sobre la base de la fracción de genes detectada por marcados moleculares.

Muchas gracias

Patrón mensual de peso al nacer

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

Argentina

Colombia

Uruguay

Mes

Selección genómica en el ERBra

Pedigree convencional

Abuelo paterno

Padre

Abuela paterna

Animal

Abuelo materno

Madre

Abuela materna

Hermanos enteros

Relación esperada = 0.5

Pedigree genómico

1) SEGREGACIÓN: pasar el genoma paterno o el materno;

2) RECOMBINACIÓN (cross-over).

Relaciones genómicas por cromosoma

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 290.00

0.10

0.20

0.30

0.40

0.50

0.60

relación aditiva ibd genómicaCromosoma

Rel

ació

n de

par

ente

sco

Gladiador - Martín Fierro:r aditiva = 0.125 r Genómica = 0.246

Selección convencional y selección genómica en un solo paso

Evaluación actual:ˆ

ˆ

1

βu

X'X X'Z X'yZ'X Z'Z + A Z'y

Evaluacion genómica en un solo paso:ˆ

ˆ

βu

X'X X'Z X'yZ'X Z'Z + G Z'y

A – relaciones calculadas usando información tradicional del pedigreeG – relaciones calculadas usando información genómica

G

Relaciones aditivas y genómicasÑato

GladiadorÑatito

Martín Fierro

ArangáÑatito Glad. M.Fierro Arangá

Ñatito 0.351 0.500 0.500

Gladiador 0.250 0.246 0.213

M.Fierro 0.500 0.125 0.243

Arangá 0.500 0.125 0.250

DEPs convencionales y genómicas

XXX

AAA BBB CCC DDD

Relación por Pedigree 0.031 0.125 0.070 0.040

DEP aptitud materna 2.11 4.34 7.74 10.61

Relación Genómica 0.125 0.246 0.125 0.110

DEP materna

Exactitud

Convencional 6.53 0.59

Genómica 5.83 0.65

Número de animales con peso al destete

Hijos325

Nietos mat.4