RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO

“XIUHCOATL“

• El pasado 25 de enero del 2012 la Coordinación General de Servicios de Tecnologías de la Información y Comunicaciones (CGSTIC) del CINVESTAV a cargo del Dr. Marino Gamboa Zúñiga, realizó el lanzamiento del Clúster Xiuhcoatl.

• El nombre “XIUHCOATL” significa Serpiente de Fuego y su característica de ser Híbrido se debe a que incorpora tres diferentes tecnologías de procesamiento, las cuales son:– Tecnología de CPU INTEL Xeon X5675 (six-core).– Tecnología de CPU AMD Opteron 6274 (16-core).– Tecnología de GPGPU NVIDA Fermi (448-cudacores).

LANCAD Nodo Cinvestav: CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO “XIUHCOATL”

LANCADClúster XIUHCOATL:“Serpiente de Fuego”

NODO ROBUSTO CLÚSTER TECNOLOGÍA CORES CPU

CUDA CORES PERFORMANCE

REAL (CPU) PERFORMANCE TEORICO

CINVESTAV Xiuhcoatl HIBRIDA

•3480 (CPU)2304 (AMD)

1056 (INTEL) •8960 (GPGPU-FERMI)

[20 Tarjetas]

24.97 TF

AMD (20.28 TF)INTEL (12.93 TF)GPU (10.3 TF)

Total 43.50TF

UAM Aitzaloa INTEL 2160 CPU 18.49 TF 25.44 TF

UNAM Kanbalam AMD 1368 CPU 5.09 TF 7.07 TF

1 TERAFLOP = 1012 OPERACIÓNes de punto flotante por segundo

LANCADNodos Robustos.

Cada institución aporta 1000 cores de procesamiento sobre una red de fibra óptica de 10Gb/s de mas de 100km de longitud.

Nodo Cinvestav

Nodo UNAM Nodo UAM

Ofrecer y desarrollar servicios de cómputo de alto desempeño a las comunidades de usuarios de Supercómputo del CINVESTAV, UNAM, UAM y en general al sector académico, empresarial y gobierno, con el fin de impulsar el desarrollo científico, la formación de recursos humanos especializados en cómputo de alto desempeño así como el desarrollo tecnológico para realizar proyectos de alto impacto social y económico.

LANCAD Nodo Cinvestav: Misión

LANCADNodo Cinvestav: Capacidad de cómputo

HORAS DE PROCESAMIENTO (Cores/Cuda-Cores)EN EL CLUSTER XIUHCOATL AL AÑO.

INTEL

9,250,560

AMD

20,183,040

GPGPU

78,489,600

LFS (OSS)

LFS (OSS)

LFS (MDS/OSS)

N.C.GN.M.

N.L. SW InfiniBan

dN.C.A. N.C.A. N.C.I. N.C.I. N.C.I.

LANCADNodo Cinvestav: Distribución

ABREVIATURA SIGNIFICADON.C.I. Nodo de Computo INTEL

N.C.G Nodo de Computo GPGPU

N.M. Nodo Maestro (Intel)

N.L. Nodo de Login (Intel)

ABREVIATURA SIGNIFICADON.C.A Nodo de Computo AMD

LFS Lustre File System (Intel)

OSS Object Storage Server (Intel)

MDS Meta Data Server (Intel)

CPU

3480 Cores

*AMD (Interlagos 6274)

(2304)

*INTEL (Xeon® Processor X5675)

(1056)

LANCADNodo Cinvestav: Tecnologías

HARDWARE

SISTEMA OPERATIVOLinux x86_64 CentOS ver. 6.2.

COMPILADORESGNU (gcc, fortran) Intel Clúster Studio XE 2012 Open64 ACML (AMD) CUDA SDK 4.1.

No. De Servidores

Tipo de Servidor

Tecnología de Procesamiento

Tarjetas GPUs

#Cores CPU

Cuda-Cores GPU

Memória RAM

(GB)

STORAGELocal

(GB)

STORAGELustre

(TB)

Comunicaciones (Gb/s)

Performance Rmax

(TF)

Consumo eléctrico

estimado

(KW)

Peso Total

(Ton)

88 N.C. CPUINTEL 0 1056 0 2112 22000

65

(USABLES)

1

Ethernet

(admón.)

1

Ethernet (admón.) Escritorio Remoto

40

InfiniBandQDR

24.97 70 4.59 N.C.G.

*4 GPUCPU/GPU

INTEL/NVIDIA 36 108 *16128 432 4650

1 N.V. CPU/GPUINTEL /AMD 4 12 0 48 1200

72 N.C. CPUAMD 0 2304 0 4608 18000

TOTALES

170 36 3480 *16128 7200 45350

*=Capacidad Máxima Soportada.N.C. = Nodos de Cómputo.

N.C.G = Nodos de Cómputo GPU.N.V. = Nodo de Visualización.

LANCADNodo Cinvestav: Numeralia

LANCADNodo Cinvestav: Servicios

 

 

ACADEMICO

• Cómputo en Paralelo• Administración • Seguridad• Soporte• Capacitación en

Supercómputo

GUBERNAMENTAL

• Hospedaje de Aplicaciones.

• Almacenamiento de Datos.

• Desarrollo de Aplicaciones

• Capacitación Virtual.• Cloud.

EMPRESARIAL

• Renta de Servidores• Desarrollo de

Aplicaciones• Capacitación Virtual.• Cloud.

RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO

“XIUHCOATL“

PRIMERA CONVOCATORIA

REQUISITOS PARA SOLICITUD DE RECURSOS• Ser investigador del Cinvestav.• Tener un proyecto que requiera de Supercómputo.• Se da preferencia a proyectos donde se involucren alumnos del Cinvestav.• Mandar Formato y Anexos firmados con los datos solicitados a: xiuhcoatl@cinvestav.mx

LANCADNodo Cinvestav: Primera Convocatoria

FORMATOS ANEXOS

•Datos del solicitante•Requerimientos de procesamiento

Horas de CPU. Horas de GPU. Número de JOBS.

•Requerimientos de hardware Ram. Espacio en home. Espacio en scratch.

•Requerimientos de software.

ANEXO A: DESCRIPCION DEL PROYECTO• Nombre del proyecto• Objetivos• Resumen del proyecto• Lista de participantes:

Otros investigadores Estudiantes Auxiliares Etc.

• Plataformas y recursos utilizadas anteriormente para correr la aplicación• Beneficios esperados:

Publicaciones Participaciones en congresos Formación de recursos humanos Otros: patentes, etc.

ANEXO B: EXPERIENCIA DEL SOLICITANTE•El solicitante deberá anexar su Currículum Vitae en el que al menos incluya:

Descripción breve de su línea de trabajo Producción académica Experiencia en el uso de equipos de supercómputo.

LANCADNodo Cinvestav: Primera Convocatoria

DICTAMENESEl día 12 de marzo se dio a conocer a los

solicitantes el dictamen emitido por el Comité Multidisciplinario de Supercómputo de la

CGSTIC.-23 RECIBIDAS

-22 ACEPTADAS

SOLICTUDES PROVENIENTES DE 5 UNIDADES • ZACATENCO (13)• MERIDA (5)• MONTERREY (1)• IRAPUATO (1)• TAMAULIPAS (2)

CUENTAS/SUBCUENTAS CREADAS• 44

HORAS TOTALES APROBADAS

• 3,060,000 (APROBADAS en CPU)• 13,910,400 (APROBADAS en GPU)

HORAS TOTALES USADAS• CPU• 1,419,248 (AMD)• 982,855 (INTEL)

• GPU• 10,549 (FERMI)

INVESTIGADOR DEPARTAMENTO UNIDAD NOMBRE DEL PROYECTO

ALBERTO MARCIAL VELA AMIEVA QUIMICA ZACATENCO ESTRUCTURA ELECTRÓNICA Y MOLECULAR DE SISTEMAS DE INTERÉS BIOLÓGICO Y DESARROLLO, IMPLEMENTACIÓN Y VALIDACIÓN DE FUNCIONALES DE INTERCAMBIO-CORRELACIÓN.

ANDREAS KÖSTER QUIMICA ZACATENCO DEVELOPMENT OF THE LCGTO-DFT CODE DEMON2KPATRIZIA CLAMINICI QUIMICA ZACATENCO MOLECULAR DYNAMIC SIMULATION OF COMPLEX SYSTEMS

LILIANA QUINTANAR VERA QUIMICA ZACATENCO ESTUDIO DE LA QUÍMICA REDOX DE LOS COMPLEJOS DE COBRE CON EL FRAGMENTO 106- 115 DE LA PROTEÍNA ‐PRION HUMANA

FELIÚ DAVINO SAGOLS TRONCOSO MATEMATICAS ZACATENCO CONSTRUCCIÓN DE DISEÑOS COMBINATORIOS, EVALUACIÓN DEL POLINOMIO TUTTE Y EL PROBLEMA DEL CUADRADO INSCRITO.

GABRIEL GUARNEROS PEÑA GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR ZACATENCO GENÓMICA ESTRUCTURAL DE BACTERIÓFAGOS DE PSEUDOMONAS

JAIME GARCIA MENA GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR ZACATENCO LABORATORIO DE REFERENCIA Y APOYO PARA LA CARACTERIZACIÓN DE GENOMAS, TRANSCRIPTOMAS Y MICROBIOMAS.

RAFAEL MONTIEL DUARTE LANGEBIO LANGEBIO ENSAMBLADO Y ANÁLISIS DE GENOMAS EUCARIOTES Y PROCARIOTES ANTIGUOS Y CONTEMPORÁNEOS

JOSE TORRES JIMENEZ LAB. TECNOLOGIAS DE LA INFORMACION TAMAULIPAS CÁLCULO DE COVERING ARRAYS

ARTURO DIAZ PEREZ LAB. TECNOLOGIAS DE LA INFORMACION TAMAULIPAS ESTRATEGIAS DE CÓMPUTO PARALELO EN MULTI/MANY-CORES PARA EL PROCESAMIENTO EFICIENTE DE REDES COMPLEJAS.

FELIPE ALEJANDRO CRUZ PEREZ INGENIERIA ELECTRICA ZACATENCO ANÁLISIS DE ESTRATEGIAS DE MANEJO DE RECURSOS ENSISTEMAS CON TRÁFICO DE VOIP

TONATIUH MATOS FISICA ZACATENCO OBJETOS COMPACTOS Y MATERIA OBSCURA

JESÚS CARLOS RUIZ SUAREZ FISICA MONTERREY SIMULACIÓN DE DINÁMICA MOLECULAR DE UNA MEMBRANA CELULAR MODELO EN PRESENCIA DE FÁRMACOS POLARES Y NO POLARES EN DIVERSAS CONDICIONES FISIOLÓGICAS.

CRISTIAN FERNANDO MOUKARZEL FISICA MÉRIDA DISCOS GRANULARES SUAVEMENTE VIBRADOS

CRISTIAN FERNANDO MOUKARZEL FISICA MÉRIDA DINÁMICA DE SISTEMAS ECONÓMICOS INTERACTUANTES

RITO DANIEL OLGUIN MELO FISICA ZACATENCO ESTUDIO DE LAS PROPIEDADES ÓPTICAS, ESTRUCTURALES Y ELECTRÓNICAS DE LOS COMPUESTOSSEMICONDUCTORES III-VI

JAIME SANTOYO SALAZAR FISICA ZACATENCO ESTUDIO DE PROPIEDADES GEOMÉTRICAS, ENERGÉTICAS Y MAGNÉTICAS DE NANOPARTÍCULAS METÁLICAS UTILIZADAS PARA EL TRATAMIENTO DE CÁNCER

GABRIEL GUILLERMO PEREZ ANGEL FISICA MÉRIDA SIMULACIÓN COMPUTACIONAL DE FUERZAS DE VACIAMIENTO ENTRÓPICO EN MEZCLAS COLOIDALES.

MARÍA CRISTINA VARGAS GONZALEZ FISICA MÉRIDA PARAMETRIZACIÓN DE UN CAMPO DE FUERZAS PARA EL ANTIFÚNGICO ANFOTERICINA B POR MÉTODOS ABINITIO

MARÍA CRISTINA VARGAS GONZALEZ FISICA MÉRIDA SELECTIVIDAD IÓNICA DE NANOPOROSY CANALES EN MEMBRANAS BIOLÓGICAS

RAFAEL BAQUERO PARRA FISICA ZACATENCO ESTUDIO DE PROPIEDADES ESTRUCTURALES, ELECTRÓNICAS Y MAGNÉTICAS EN COMPUESTOS, SUPERFICIES E INTERFACES DE ESTRUCTURAS METÁLICAS, SEMICONDUCTORAS Y SUPERCONDUCTORAS.

MAURICIO DEMETRIO CARBAJAL TINOCO FISICA ZACATENCO ESTUDIO DE MATERIALES BIOLÓGICOS Y POLIMÉRICOS POR MEDIO DE SIMULACIONES NUMÉRICAS

LANCADNodo Cinvestav: Primera Convocatoria (Proyectos)

LANCADNodo Cinvestav: Primera Convocatoria (USO)

40%

32%

28%0%

USO DE CPU POR DEPARTAMENTOLABORATORIO DE TECNLOGIAS DE INFORMACION

QUIMICA

FISICA

MATEMATICA

INGENIERIA ELECTRICA

LANGEBIO

GENETICA Y BIOLOGIA MOLE-CULAR

2%

98%

USO DE GPU POR DEPARTAMENTOLABORATORIO DE TECNLOGIAS DE INFORMACION

QUIMICA

FISICA

MATEMATICA

INGENIERIA ELECTRICA

LANGEBIO

GENETICA Y BIOLOGIA MOLE-CULAR

31%

0%8%

1%

61%

USO DE CPU POR UNIDAD

CIUDAD VICTORIALANGEBIOMERIDAMONTERREYZACATENCO

2%

98%

USO DE GPU POR UNIDAD

CIUDAD VICTORIALANGEBIOMERIDAMONTERREYZACATENCO

LANCADNodo Cinvestav: SISTEMA DE ALMACENAMIENTO LUSTRE

96%

4%

USO DEL HOME

LIBRE USADO

81%

19%

USO DEL SCRATCH

LIBRE USADO

LANCADNodo Cinvestav: MUESTRA REPRESENTATIVA DE USO DE CPU.

14 15 16 17 18 19 20 210

200400600800

1000120014001600

USO CPU XIUHCOATL (SEM14-SEM21)

RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO

“XIUHCOATL“

SEGUNDA CONVOCATORIA

REQUISITOS PARA SOLICITUD DE RECURSOS• Requisitos adicionales a la primera convocatoria:

LANCADNodo Cinvestav: Segunda Convocatoria

FORMATOS•Datos de hasta dos cuentas adicionales•Requerimientos de procesamiento para todo el proyecto

Se agregó el modo de calcular el tiempo solicitado.

LANCADNodo Cinvestav: Segunda Convocatoria

LANZAMIENTO DE LA 2da

CONVOCATORIA EN XIUHCOATL

El día 5 de Junio.

SOLICITUDES/PROYECTOS -27 RECIBIDAS-27 ACEPTADAS

SOLICTUDES PROVENIENTES DE 4 UNIDADES• ZACATENCO (12)• MERIDA (11)• TAMAULIPAS (2)• IRAPUATO (2)

SOLICTUDES POR DEPARTAMENTOS

• FISICA ---------------------------------------------- (16)

• QUIMICA ------------------------------------------ (4)• L.T.I. ------------------------------------------------ (2)• GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR ------ (1)• LANGEBIO --------------------------------------- (1)• LABORATORIO DE GEOMICA EVOLUTIVA - (1)• FISIOLOGIA ,BIOFISICA Y NEUROCIENCIAS (1)• CGSTIC -------------------------------------------- (1)

DICTAMEN

• El 16 de Julio se dio a conocer a los solicitantes, el resultado del dictamen.

CUENTAS/SUBCUENTAS CREADAS

• 35

HORAS TOTALES5,200,000.00 (APROBADAS)

INVESTIGADOR DEPARTAMENTO UNIDAD NOMBRE DEL PROYECTO

RAFAEL BAQUERO PARRA FISICA ZACATENCO ESTUDIO DE PROPIEDADES ESTRUCTURALES, ELECTRÓNICAS Y MAGNÉTICAS EN COMPUESTOS, SUPERFICIALES E INTERFACES DE ESTRUCTURAS METÁLICAS, SEMICONDUCTORAS Y SUPERCONDUCTORAS.

PATRIZIA CALAMINICI QUIMICA ZACATENCO GEOMETRY OPTIMIZATION AND PROPERTY CALCULATIONS OF COMPLEX SYSTEMS.CASTRO HERNANDEZ FISICA ZACATENCO NANOESTRUCTURAS Y SUS PROPIEDADES FISICAS EN PROCESOS AMBIENTALES.ROMERO DE COSS GÓMEZ FISICA APLICADA MERIDA ESTUDIO DE PRIMEROS PRINCIPIOS DEL MAGNETISMO DE BORDE Y DE VACANCIAS EN NANOFLAKES DE GRAFENO.

ROMERO DE COSS GÓMEZ FISICA APLICADA MERIDA ESTUDIO DE PRIMEROS PRINCIPIOS DE SOBRE PROPIEDADES ELECTRÓNICAS Y ÓPTICAS DE NANOESTRUCTURAS DE GRAFENO Y NITRURO DE BORO.

ROMERO DE COSS GÓMEZ FISICA APLICADA MERIDA ESTRUCTURA ELECTRÓNICA DE LA TRICAPA BN/GRAFENO/BN BAJO PRESIÓN.MAURICIO DEMETRIO CARBAJAL TINOCO FISICA ZACATENCO ESTUDIO DE MATERIALES BIOLÓGICOS Y POLIMÉRICOS POR MEDIO DE SIMULACIONES NUMÉRICAS.

LUIS JOSÉ DELAYE ARREDONDO LABORATORIO DE GENÓMICA EVOLUTIVA TAMAULIPAS DISEÑO E IMPLEMENTACIÓN DE UN MÉTODO PARA ALINEAMIENTO MÚLTIPLE DE SECUENCIAS GENÉTICAS A TRAVÉS DEL USO

DE TÉCNICAS DE PROGRAMACIÓN PARALELA, MÉTODOS HEURÍSTICOS Y PROGRAMACIÓN DINAMICA.

ARTURO DÍAZ PÉREZ L..T.I TAMAULIPAS ESTRATEGIAS DE CÓMPUTO PARALELO EN MULTI/MANY-CORES PARA EL PROCESAMIENTO EFICIENTE DE REDES COMPLEJAS

ANGELINA FLORES PARRA QUIMICA ZACATENCO ESTUDIO TEÓRICO DE LA NATURALEZA DE ENLACES DÉBILES EN MOLÉCULAS DE INTERÉS BIOLÓGICO Y COMPLEJOS METÁLICOS DEL GRUPO REPRESENTATIVO.

GABRIEL GUARNEROS PEÑA GENÉTICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR ZACATENCO GENÓMICA ESTRUCTURAL DE BACTERIÓFAGOS DE PSEUDOMONAS AERUGINOSA.

GERARDO HERRERA CORRAL FISICA ZACATENCO RECONOCIMIENTO Y CLASIFICACIÓN DE MICRO CALCIFICACIONES, EN MAMOGRAFÍAS MEDIANTE TÉCNICAS DE RP Y PROCESAMIENTO DIGITAL DE IMÁGENES.

MARIANO GAMBOA ZUÑIGA CGSTIC ZACATENCO COMPUTO DE ALTO DESEMPEÑO Y CALCULO DE ESTRUCTURA ELECTRONICA DE NANOTUBOS DE CARBONOTONATIUH MATOS FISICA ZACATENCO COSMOLOGÍA Y ASTROFISICA RELATIVISTA: OBJETOS COMPACTOS Y MATERIA OBSCURA_2.GABRIEL MERINO FISICA MERIDA AROMATICIDAD Y EL DISEÑO DE NUEVOS CÚMULOS METÁLICOS.CRISTIAN MOUKARZEL FISICA MERIDA MERIDA DINAMICA DE SISTEMAS ECONOMICOS INTERACTUANTES.CRISTIAN MOUKARZEL FISICA MERIDA MERIDA DISCOS GRANULARES SUAVEMENTE VIBRADOS.

LUCIEN PETROVA VELEVA FISICA MERIDA MERIDA ASPECTOS FISICOQUIMICOS DE PROTECCION DE METALES CON AZOLES COMO INHIBIDORES VOLATILES DE CORROSION - SILUACION MOLECULAR COMPUTACIONAL.

GEONEL RODRIGUEZ GATTORNO FISICA MERIDA MERIDA CATALIZADORES PARA GENERACION DE HIDROGENO POR FOSILES DE AGUA.

LILIANA QUINTANAR VERA QUIMICA ZACATENCO ESTUDIO DE LA INTERACCION DE COBRE CON PROTEINAS AMILOIDOGENICAS ASOCIADAS A ENFERMEDADES NEURODEGERATIVAS.

PABLO RUDOMIN NEUROFISIOLOGIA NEOROCOMPUTACION ZACATENCO TALLER MULTIDISCIPLARION EN EL CINVESTAV No. ORD.4/2011 Conacyt.

JOSE TORRES JIMENEZ L.T.I. TAMAULIPAS CALCULO DE COVERINGS ARRAYS.MAURICIO CARRILLO TRIPP LANGEBIO IRAPUATO ANALISIS MOLECULAR DE LOS MECANISMOS DE ACCION DE ANTIBIOTICOSMARIA CRISTINA VARGAS FISICA MERIDA MERIDA TIEMPOS DE CRISTALIZACION Y POLIDISPERSIDAD EN UN FLUIDO DE ESFERAS DURAS.MARIA CRISTINA VARGAS FISICA MERIDA MERIDA PARAMETRIZACION DE UN CAMPO DE FUERZAS PARA EL ANTIFUNGICO ANFOTERICINA B POR METODOS AB-INITIO.MARIA CRISTINA VARGAS FISICA MERIDA MERIDA SELECTIVIDAD IONICA DE NANOPOROS Y CANALES EN MEMBRANAS BIOLOGICAS.

ALBERTO VELA AMIEVA QUIMICA ZACATENCO ESTRUCTURA ELECTRONICA Y MOLECULAR DE SISTEMAS DE INTERES BIOLOGICO Y DESARROLLO, IMPLEMENTACION Y VALIDACION DE FUNCIONALES DE INTERCAMBIO-CORRELACION

LANCADNodo Cinvestav: Segunda Convocatoria (Proyectos)

LANCADNodo Cinvestav: Segunda Convocatoria (USO)

59%

30%

10%

USO DE CPU POR UNIDAD

TAMAULIPAS

ZACATENCO

MERIDA60%

34%

0%7%

USO DE CPU POR DEPARTAMENTO

LABORATORIO DE TEC-NLOGIAS DE INFORMA-CION

FISICA

GENETICA y BIOLOGIA MOLECULAR

QUIMICA

LANCADNodo Cinvestav: MUESTRA REPRESENTATIVA DE USO DE CPU.

08/0

8/20

12

09/0

8/20

12

10/0

8/20

12

11/0

8/20

12

12/0

8/20

12

13/0

8/20

12

14/0

8/20

12

15/0

8/20

12

16/0

8/20

12

17/0

8/20

12

0

200

400

600

800

1000

1200

1400

1600

1800

2000

USO DE CPU EN XIUHCOATL SEM (32 -34)

LANCADNodo Cinvestav: SISTEMA DE ALMACENAMIENTO LUSTRE

95%

5%

USO DEL HOMELIBRE USADO

80%

20%

USO DEL SCRATCHLIBRE USADO

RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO

“XIUHCOATL“

RESUMEN DE LAS CONVOCATORIAS 1 Y 2

LANCADNodo Cinvestav: Resumen de Convocatorias

SOLICITUDES/PROYECTOS

-49 (APROBADAS)-50 (RECIBIDAS)

SOLICTUDES PROVENIENTES DE 5 UNIDADES• ZACATENCO (25)• MERIDA (16)• TAMAULIPAS (4)• IRAPUATO (3)• MONTERREY (1)

SOLICTUDES POR DEPARTAMENTOS• FISICA ---------------------------------------------

(27)• QUIMICA ----------------------------------------- (8)• L.T.I. ----------------------------------------------- (4)• GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR ------ (3)• LANGEBIO --------------------------------------- (2)• LABORATORIO DE GEOMICA EVOLUTIVA - (1)• FISIOLOGIA ,BIOFISICA Y NEUROCIENCIAS (1)• CGSTIC -------------------------------------------- (1)• MATEMATICAS --------------------------------- (1)• INGENIERIA ELECTRICA ------------------------ (1)

DICTAMEN

• El 16 de Julio se dio a conocer a los solicitantes , el resultado del dictamen.

CUENTAS/SUBCUENTAS CREADAS

• 79

HORAS TOTALES8,260,000 (APROBADAS)

2, 934,709 (UTILIZADAS AL 16 DE AGOSTO)

LANCADNodo Cinvestav: (USO TOTAL DE CPU Y GPU)

43%

28%

29%0% 0% 0% 0%

USO TOTAL DE CPU AL DIA 16 de AGOSTO DE 2012 POR DEPARTAMENTO

LABORATORIO DE TECNLOGIAS DE INFORMACION

QUIMICA

FISICA

MATEMATICA

INGENIERIA ELECTRICA

LANGEBIO

GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR

36%

0%8%

1%

55%

USO TOTAL DE CPU AL DIA 16 DE AGOSTO DE 2012 POR UNIDAD

TAMAULIPASIRAPUATOMERIDAMONTERREYZACATENCO

2%

98%

0%

USO TOTAL DE GPU AL DIA 16 de AGOSTO DE 2012 POR DEPARTAMENTO

LABORATORIO DE TECNLOGIAS DE INFORMACION

QUIMICA

FISICA

MATEMATICA

INGENIERIA ELECTRICA

LANGEBIO

GENETICA Y BIOLOGIA MOLE-CULAR

2%

98%

USO TOTAL DE GPU AL DIA 16 DE AGOSTO DE 2012 POR UNIDAD

TAMAULIPASIRAPUATOMERIDAMONTERREYZACATENCO

APLICACIONES

abinitbwaclispclustalw-2.0.10deMonEspressog03Gadget-2GamesGromacsI-TASSERigraphMAXIMAMuscle-3.7

NAMD_2.8NAMD_2.8-GPUNewblernwchemOACTAVEorca_x86_64_exe_r2360Parallel-TCoffeePolyboriTCOFFEvelvetWien2kYamboZeusmp7 APLICACIONES PROPIAS

ADF (En proceso)Cactus-Codes (En Proceso)SIESTA (En proceso)Terachem (En proceso)VASP (En proceso)

LANCADNodo Cinvestav: Aplicaciones Instaladas

LABORATORIO NACIONAL DE COMPUTO DE ALTO DESEMPEÑO (LANCAD)

“NODO CINVESTAV”

CONVOCATORIA EXTERNA

REQUISITOS PARA SOLICITUD DE RECURSOS• Requisitos similares a la segunda convocatoria

+

LANCADNodo Cinvestav: Primera Convocatoria para instituciones externas.

CONVENIO

•Se firmará un convenio que efectuarán las dos partes, el CINVESTAV y la institución interesada en usar tiempo de CPU.

http://clusterhibrido.cinvestav.mx/

LABORATORIO NACIONAL DE COMPUTO DE ALTO DESEMPEÑO

(LANCAD)

SEGUNDA PARTE

La consolidación y mantenimiento al día, a través del tiempo, de un Laboratorio Nacional de Cómputo de Alto Desempeño, que permita resolver en primera instancia los problemas científicos más demandantes mediante una GRID de capacidades excepcionales en la zona metropolitana de la Ciudad de México conformada por las tres instituciones académicas de mayor importancia en el cómputo científico de alto desempeño.

LANCADObjetivo General

Nodo Cinvestav Xiuhcoatl (24.97 TF)

Nodo UAMAitzaloa (18.49 TF)Nodo UNAM

Kanbalam (5.07 TF)

DISTANCIAS Y EMPALMES

• DISTANCIAS SIN INTEGRAR LA ULTIMA MILLA» DISTANCIA FUSION MECANICO

• UNAM – UAM-I 34,325m 21 2

• UNAM – CINVESTAV 27,544m 20 1

• CINVESTAV – UAM-I 31,588m 20 2

• DISTANCIAS INTEGRANDO LA ULTIMA MILLA» DISTANCIA FUSION MECANICO

• UNAM – UAM-I 39,325m 21 2

• UNAM – CINVESTAV 32,544m 20 1

• CINVESTAV – UAM-I 36,588m 20 2

• Fusión Empalme por fusión

• Mecánico Empalme mecánico en patch panel

Rack con empalme por fusión

Rack con empalme mecánico

LANCADLa red de FO dentro del Metro.

Longitud total de la red de fibra óptica 108.4 km

LANCADSegunda Parte: Desarrollo Científico

El Cómputo de Alto Desempeño es indispensable, en la actualidad, para la realización de proyectos científicos y tecnológicos en temas relacionados con, entre otros:

Imagenología

médicaRobótic

a

Diseño y

automatizació

n de proces

osAeroná

utica Sísmica

Biomedicina

Astronomía Energía

Nanotecnologí

aGenóm

ica

Ingeniería molecular

Materiales

Modelación matemática

Contaminación ambiental

Estudios climáticos

LANCADSegunda Parte: Desarrollo Científico

Cadena de valor

Una plataforma competitiva de Cómputo de Alto Desempeño posibilita el desarrollo de esta cadena de valor.

Una plataforma no competitiva de Cómputo de Alto Desempeño, compromete, fuertemente, las posibilidades de desarrollo de esta cadena de valor.

Educación superior

Investigación científica

Desarrollo tecnológico Innovación

LANCADSegunda parte: evolución del TOP500

LANCADSegunda parte: evolución del TOP500

LANCADSegunda parte: Escenarios de inversión anual

EL PROYECTO FUE PRESENTADO Y APROBADO POR EL CONACyT

XIUHCOATL PROYECCION DE CRECIMIENTO

OBJETIVO:• Lograr alcanzar un performance real de al menos

90TF, incrementando la capacidad:– De procesamiento CPU.– Del número de tarjetas GPGPU.– De puertos Infiniband QDR/FDR.

• Incrementar la capacidad del Sistema de Almacenamiento Lustre.

• Incrementar la capacidad de memoria RAM en algunos servidores.

LANCADNodo Cinvestav: Proyección de Crecimiento

EL PERFORMANCE

ACTUAL DE XIUHCOATL ES DE 24.74 TF REALES

SE REQUIERE AUMENTAR LA CAPACIDAD DE PROCESAMIENTO PARA LOGRAR ALMENOS 90 TF

REALES

ESTE CRECIMIENTO

SE PUEDE ALCANZAR USANDO:

-TECNOLOGÍA AMD.

-TECNOLOGÍA NTEL.

UN SERVIDOR EN LA ULTIMA

TECNOLOGÍA DE CPU INTEL CON UN TOTAL DE 16 CORES A 2.6GHz

PROVEE UN PERFORMANCE:

-TEÓRICO DE 332.8 GFLOP/S .

-REAL DE 300 GFLOP/S.

UN SERVIDOR EN LA ULTIMA

TECNOLOGÍA DE AMD CON UN TOTAL DE 16

CORES A 2.5GHz PROVEE UN

PERFORMANCE: -TEÓRICO DE 320

GFLOP/S. -REAL DE 256

GFLOP/S.

LANCADNodo Cinvestav: Proyección de Crecimiento

La nueva tecnología de procesadores Intel, es capaz de realizar hasta 8 operaciones de

punto flotante por ciclo de reloj.

La nueva tecnología de procesadores AMD, es capaz de realizar hasta 4 operaciones de

punto flotante por ciclo de reloj.

LANCADNodo Cinvestav: Proyección de Crecimiento

PASOS A REALIZAR PARA LA ACTUALIZACIÓN DE AL MENOS 90TF

Definir la tecnología

con la que se realizará el

crecimiento.

Se requiere de un nuevo SW

IB para interconectar con el actual e incrementar el

número de puertos.

Evaluar las modalidades

que beneficien el

consumo energético.

Se requiere de alrededor de 10 Racks de footprint

adicional, para el alojamiento

del nuevo equipo.

Para abatir la disipación de calor

se requiere de aproximadamente

90TR extras. Ó

(Una combinación con sistemas In-

Row, etc.).

Instalar un nuevo Centro

de Datos.

La arquitectura y diseño con que se proyectó el cluster Xiuhcoatl, permite incrementar el número de puertos InfiniBand hasta en 1296 puertos (actualmente hay 324 puertos), y en esta primera etapa de crecimiento, en términos de núcleos de procesamiento se podrá crecer hasta más de una decena de Miles de núcleos con el mismo cluster.

• La palabra chocolate viene del náhuatl: Xocolatl( se debería pronunciar como shocolatl, que es el sonido sh de la x )

• Xiuhcoatl, se pronuncia entonces shiuhcoatl o de plano Chiuhcoatl!

Chi….. que

RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO

“XIUHCOATL“