Proteínas
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Transcript of Proteínas
Puedo analizar
Estructra primaria: composición y orden de los aa
Estructura secundaria: interacción entre aa cercanos Alfa hélices (H) Hojas plegadas beta (E) Giros (T) Colas ( C)
Estructura Terciaria: interacción entre aa no cercanos Puentes di sulfuro Interacciones hidrofóbicas
Estructura cuaternaria: interacción entre subunidades
Estructura primaria: composición y orden de los aa
Composición aminiacídica
Peso molecular teórico
Punto isoeléctrico
Hidrofobicidad
Numero de aaPeso molecularPI % composion de aaCoef de ext molarVida media en distintos org.
http://ca.expasy.org/tools/#proteome
Hidrofobicidad
http://bp.nuap.nagoya-u.ac.jp/sosui/sosui_submit.html
Sosui: indica si la prot es soluble o tiene segmentos transmembrana
http://bp.nuap.nagoya-u.ac.jp/sosui/sosui_submit.html
Estructura secundaria: interacción entre aa cercanos Alfa hélices (H) Hojas plegadas beta (E) Giros (T) Colas ( C) Areas acceseibles a solventes (ASA)
http://sable.cchmc.org/
También puedo buscar dominios
Los dominios están asociados a funciones o estructuras
Varios programas llevan a bases de datos
http://ca.expasy.org/tools/#proteome
Determina los dominios encontradosComparado con la base de datos de prosite
clic
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cdd.shtml
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cdd.shtml
Motivos particulares:
Hay varios motores de búsqueda Los puedo encontrar en el expasy
Ej. Motivo de union al DNA HTH