Proteínas

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Puedo analizar Estructra primaria: composición y orden de los aa Estructura secundaria: interacción entre aa cercan Alfa hélices (H) Hojas plegadas beta (E) Giros (T) Colas ( C)

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Proteínas. Puedo analizar. Estructra primaria : composición y orden de los aa. Estructura secundaria : interacción entre aa cercanos Alfa hélices (H) Hojas plegadas beta (E) Giros (T) Colas ( C). - PowerPoint PPT Presentation

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Puedo analizar

Estructra primaria: composición y orden de los aa

Estructura secundaria: interacción entre aa cercanos Alfa hélices (H) Hojas plegadas beta (E) Giros (T) Colas ( C)

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Estructura Terciaria: interacción entre aa no cercanos Puentes di sulfuro Interacciones hidrofóbicas

Estructura cuaternaria: interacción entre subunidades

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Estructura primaria: composición y orden de los aa

Composición aminiacídica

Peso molecular teórico

Punto isoeléctrico

Hidrofobicidad

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Numero de aaPeso molecularPI % composion de aaCoef de ext molarVida media en distintos org.

http://ca.expasy.org/tools/#proteome

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Hidrofobicidad

http://bp.nuap.nagoya-u.ac.jp/sosui/sosui_submit.html

Sosui: indica si la prot es soluble o tiene segmentos transmembrana

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http://bp.nuap.nagoya-u.ac.jp/sosui/sosui_submit.html

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Estructura secundaria: interacción entre aa cercanos Alfa hélices (H) Hojas plegadas beta (E) Giros (T) Colas ( C) Areas acceseibles a solventes (ASA)

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http://sable.cchmc.org/

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También puedo buscar dominios

Los dominios están asociados a funciones o estructuras

Varios programas llevan a bases de datos

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http://ca.expasy.org/tools/#proteome

Determina los dominios encontradosComparado con la base de datos de prosite

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clic

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cdd.shtml

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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cdd.shtml

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Motivos particulares:

Hay varios motores de búsqueda Los puedo encontrar en el expasy

Ej. Motivo de union al DNA HTH

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