Nome científicoDrosophila melanogaster MeigenVernáculomosca-da-fruta, mosca-do-vinagrefruit fly

Geografia natural, diversidadeMundial (temperados e tropicais)http://www.genetics.org/content/156/1/257.long

Gradientes com a latitudehttp://www.genetics.org/content/140/2/659

http://www.gsejournal.org/content/25/6/517

http://www.gsejournal.org/content/26/1/15

Genomahttp://www.hgsc.bcm.tmc.edu/content/drosophila-melanogaster-genome-project

Divergência de HomoDeuterostomia 650 MaAspetos práticos30–60 descendentes por fêmea; tempo de geração 10 dias a 25 ºCcoleções de mutantes, extensa literaturahttp://flystocks.bio.indiana.edu/bloomhome.htm (menu fly work)Transgénicos U

Espécies próximas12 espécies de Drosophila sequenciadashttp://flybase.org/static_pages/species/sequenced_species.html

Drosophila simulans

Áreas de investigaçãoGenética, Desenvolvimento(http://www.sdbonline.org/fly/aimain/1aahome.htm), imunidade“inata”, evolução, teste de compostos

Nome científicoMus musculus L.Vernáculoratinho, murganholaboratory mouse, house mouse

Geografia natural, diversidadeDesde a Europa ocidental até ao Sueste da Ásia (expandida paradiversas regiões temperadas e tropicais do Novo Mundo, África, etc.)5 subespécies diferenciadas geograficamente

Genomahttp://www.sanger.ac.uk/Projects/M_musculus/

http://fantom.gsc.riken.jp/

Divergência de HomoEuarchonta 80-90 Ma (afinidade muito tarde reconhecida, pois os roedores

constituem um ramo de evolução molecular mais rápida que outros mamíferos –

long branch attraction coloca-os facilmente como grupo divergente precocemente)

Aspetos práticosAté 25 g; 3 semanas de gestação, desmame às 3–4 semanas, 4+ninhadas por fêmea (depende das estirpes); tempo de geração 12semanas , geralmente 4–5 crias por ninhada; vírus hepatiteTransgénicos U(notavelmente, o sistema Cre-LoxP http://cre.jax.org/introduction.html ehttp://en.wikipedia.org/wiki/Cre-Lox_recombination, e o uso de nucleasesZFN http://www.genetics.org/content/186/2/451.full,http://www.nature.com/nbt/journal/v29/n1/full/nbt.1731.html ehttp://www.pnas.org/content/107/34/15022.full)Espécies próximasMus spretus (Mediterrâneo ocidental incluindo até Portugal)Rattus norvegicus (ratazana)

Áreas de investigaçãotradicionalmente: farmacologia, toxicologia, imunologia e vacinas, cancromodelos de patologiasinvestimento sem paralelo na criação de estirpes mutantes (v. p. ex.http://www.informatics.jax.org/strains_SNPs.shtml e http://research.jax.org/grs/type/gemm/strains.html)recentemente, aumento substancial dos GEMMs (genetically engineered mouse models,v. transgénicos) e do desenho de experimentação sobre envelhecimento

Nome científicoMacaca mulatta ZimmermannVernáculomacaco Rhesusrhesus macaque

Geografia natural, diversidadeÁsia do Sul e SuesteChina vs. India (1-7 subespécies)

Genomahttp://www.sciencemag.org/site/feature/misc/webfeat/macaque/ (outgroup na comparaçãocom chimpanzé)Divergência de HomoHominoidea 25 MaAspetos práticos5 – 8 Kg; gestação 5,5 meses, desmame 1 ano; geração 4 anos; 1-2 filhos porparto; chegam aos 30 anos;enriquecimento ambiental http://www.nal.usda.gov/awic/pubs/Primates2009/primates.shtml Transgénicos U

Espécies próximasMacaca fascicularis

Áreas de investigaçãoFisiologia, Psicologia, vacinas (raiva, polio, varíola), teste de drogasanti-SIDA, transgénico, verhttp://www.sciencemag.org/site/feature/misc/webfeat/macaqueposter/poster.html

http://pin.primate.wisc.edu/factsheets/entry/rhesus_macaque

http://tprc.nibio.go.jp/eng/research/disease_e.html

Nome científicoCallithrix jacchus L.Vernáculosagui-de-tufos-brancoscommon marmoset

Geografia natural, diversidadeBrasil

Genomahttp://www.genome.wustl.edu/genomes/view/callithrix_jacchus

Divergência de HomoCatarrhini 40 MaAspetos práticos200 – 350 g; gaiolas relativamente grandes; em pares ou grupos; se em grupo,apenas o par dominante se reproduz; gestação 4 meses, desmame 2 meses;longevidade até 20 anos; suscetíveis a Herpes (mortal); geração 1,5-2 anos(fêmeas); reproduz-se pelo menos 2 vezes ao ano, 2-4 por parto, relativamentegrandes;enriquecimento ambiental http://www.nal.usda.gov/awic/pubs/Primates2009/primates.shtml

Transgénicos U

Espécies próximas

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Áreas de investigaçãoPatologias (infecciosas, neurológicas), teratologia, reprodução, imunologia,endocrinologia, obesidade, envelhecimentohttp://pin.primate.wisc.edu/callicam/research1.html

Nome científicoGallus gallus L.Vernáculogalinha (pinto)chicken

Geografia natural, diversidadeÍndia/Ásia sueste

Genomahttp://genome.wustl.edu/genomes/detail/gallus-gallus/

Divergência de HomoSynapsida 320 MaAspetos práticosMaturidade 2 anosTransgénicos U

Espécies próximasCoturnix japonica

Áreas de investigaçãoDesenvolvimento, imunologia

Nome científicoDanio rerio F. HamiltonVernáculopeixe-zebrazebra fish, leopard danio

Geografia natural, diversidadeÁsia do Sul

Genomahttp://www.sanger.ac.uk/Projects/D_rerio/, http://vega.sanger.ac.uk/Danio_rerio/Info/Index

e http://www.ensembl.org/Danio_rerio/Info/Index

Divergência de HomoSarcopterygii 420 MaAspetos práticosAquários, ovíparo; longevidade até 66 meses (42 meses na natureza);http://zfin.org/zf_info/zfbook/zfbk.html geração 2,5 – 3 meses; eclosão às 48 – 72h;fertilidade máx. 7 – 18 meses, até 1000 embriões de 8 fêmeas num tanque de5 litros, coletam-se por aspiraçãoTransgénicos U

Espécies próximasDanio nigrofasciatus

Áreas de investigaçãoDesenvolvimento, patologia (ocular, neuronal, cardíaca, inflamatória),imunologia, neurologia http://zfin.org/ http://zgc.nci.nih.gov/Info/Summary

Invenção da tecnologia ZFN (http://www.nature.com/nbt/journal/v26/n6/abs/nbt1398.html

e http://www.nature.com/nbt/journal/v26/n6/abs/nbt1409.html)

Nome científicoStrongylocentrotus purpuratus StimpsonVernáculoouriço-do-marsea urchin

Geografia natural, diversidadePacífico NE costeiro

Genomahttp://www.spbase.org/SpBase/

Divergência de HomoChordata 600 MaAspetos práticoshttp://www.spbase.org/SpBase/resources/methods/Lab_Manual.pdf

Transgénicos U

Espécies próximasEucidaris tribuloides

Áreas de investigaçãoDesenvolvimento (mapas de indução genética durante a segmentação do zigoto, especialmente pelatranscrição) http://www.pnas.org/content/102/14/4936.full e http://www.pnas.org/content/107/8/3930.full

Nome científicoCaenorhabditis elegans MaupasVernáculonemátodenematode, roundworm

Geografia natural, diversidadeMeios antropogénicos ricos em matéria orgânica, global (regiões temperadas)

Genomahttp://wormbase.org/db/gb2/gbrowse/c_elegans/

Divergência de HomoDeuterostomia 650 MaAspetos práticosGeração 3,5 dias a 20 ºC (embriogénese 14-16 horas) cerca de 200 descendentespor hermafrodita autofertilizadoAlimenta-se de bactérias (placas de Petri com relvados de E. coli OP50, quechegam para 2 gerações); larvas dauer, conservação por congelamento emglicerol; “orange death” (contaminante fúngico)http://wormbook.org/toc_wormmethods.html http://www.wormatlas.org/ Transgénicos U

Espécies próximasCaenorhabditis briggsae, Caenorhabditis remanei

Áreas de investigaçãoGenética (incluindo RNAi), desenvolvimento (959 células somáticas,apoptose), modelos de doença, sistema nervoso, sono, atrofia muscular, testede compostos (drogas anti-helmintes ou mais gerais), ambientes extremos(resiliência impressionante: sobreviveram ao desastre do Space Shuttle em2003) http://wormbook.org/

Nome científicoSaccharomyces cerevisiae Meyen ex E.C. HansenVernáculolevedura da cervejabaker’s yeast, brewer’s yeast

Geografia natural, diversidadeVinhas

Genomahttp://www.yeastgenome.org/

Divergência de HomoFilozoa 1000 MaAspetos práticosCiclo celular de 1,5 - 2 horas a 30 ºCAlgumas tecnologias historicamente importantes:YACs, Yeast 2-hybrids, recombinação homólogaTransgénicos U

Espécies próximasSaccharomyces paradoxus, Candida albicans eoutras SaccharomycetaceaeSchizosaccharomyces pombe (> 300 Madivergência!)

Áreas de investigaçãoGenética, Biologia CelularVanguarda da genómica (13 MB sequenciadas em 1996): transcriptome, deletion lines, gene ontology,genómica comparativa...http://www.genetics.org/site/misc/yeastbook.xhtml

http://www.sciencemag.org/content/327/5964/425.full

http://www.broadinstitute.org/annotation/fungi/comp_yeasts/background.html

Algumas referências gerais WWWImportant model organisms (Wikipedia)http://en.wikipedia.org/wiki/Model_organism#Important_model_organismsSociety for Developmental Biology Research Links — Organisms (alguns links desatualizados, mas bom apesar disso)http://www.sdbonline.org/index.php?option=content&task=view&id=14&Itemid=19 International Sequencing Consortiumhttp://www.intlgenome.org/viewDatabase.cfmHuman Genome Sequencing Center (inclui diversos Genomas de animais-modelo)http://www.hgsc.bcm.tmc.edu/content/genome-data The Genome Institutehttp://genome.wustl.edu/genomes/zincfingers.orghttp://www.zincfingers.org/