Martes 9:00 12:00 AM · Exposiciones de temas ... Guía de Estudio •Formato cartel –Para...
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Profesor: Dr. José Luis Medina Franco
Diseño de Fármacos Asistido por ComputadoraDepartamento de Farmacia, Facultad de QuímicaDIFAQUIM, UNAMEdificio F, cubículo [email protected]
Martes 9:00 – 12:00 AMSalón 2 de Posgrado, Edificio B, Facultad de Química
Facebook (DIFACQUIM, UNAM)
¿Motivación para inscribirse al curso?
Semestre 2019-1
Definir:
• Quimioinformática
• Bioinformática
• Modelado molecular
• Espacio químico
• Similitud molecular
Presentación del Curso
➢Temas del curso
➢Bibliografía
➢Programa de actividades
➢Evaluación
➢Cronograma
Semestre 2019-1
Temas
Semestre 2019-1
• Introducción al diseño de fármacos
• Historia de la quimionformática
• Bases de datos moleculares
• Representación molecular
• Espacio químico
• Similitud molecular
• Cribado virtual
• Panoramas de actividad y activity cliffs
• Tópicos selectos
Libros de Texto y Artículos Principales
• Leach AR, Gillet VJ (2007) An Introduction to Chemoinformatics. Dordrecht, The Netherlands: Springer
• Gasteiger J, Engel T. (2003) Chemoinformatics: A Textbook. Weinheim, Germany: Wiley VCH
• Schleyer PvJ. Ed. (1998) Encyclopedia of ComputationalChemistry. New York, USA: Wiley
Semestre 2019-1
Lecturas Complementarias
Semestre 2019-1
Lecturas Complementarias
Semestre 2019-1
Duffy BC et al. (2012) Bioorg Med Chem 20:5324-5342
Revistas Científicas*Para participaciones en clase
• Journal of Chemical Information and Modeling*
• Journal of Cheminformatics*
• Molecular Informatics*
• F1000Research, Chemical Information
• Molecular Diversity*
• Journal of Computer-Aided Drug Design
• Journal of Medicinal Chemistry*
• ChemMedChem
• Otras Med Chem …
Semestre 2019-1
Desarrollo y aplicación de métodos
Investigar: ¿cuál es el enfoque(scope) de cada revista?
Aplicación de métodos
Modelado molelcular (3D)
Dinámica de las sesiones y actividades
• Repaso de tarea
• Clase
• Exposición de tema asignado
• Exposición de tema libre de revistas de revistas quimioinformáticas(applicación Researcher)
• Práctica y ejercicio(s) en clase
• 2 exámenes escritos (teórico, práctico)
• Presentaciones orales
• Guía de estudio del curso (resumen):
– Entrega el 24 de abril, 2018
Semestre 2019-1
Exposiciones de temas
• Se proporciona un artículo (o capítulo de libro) base 1 semana antes.
– Identificar un artículo adicional al proporcionado.
• Exposición oral de 30 min.
• Resumen en inglés del tema (oral, no lectura de resumen).
• TODOS entregan un resumen breve del artículo base (en inglés).
• TODOS hacen al menos una pregunta en inglés al ponente.
Semestre 2019-1
Asignados
Libre
• Antes de cada sesión, identificar un artículo de interés de revista de quimioinformática.
• En la clase, 1 o 2 alumnos darán un resumen oral breve del artículo (5-10 min) enfatizando en objetivo, estrategia, significancia y conclusiones (se recomienda la aplicación Researcher).
Guía de Estudio
• Formato cartel
– Para impresión larga y en tamaño oficio/carta
– Resumen ilustrado de conceptos más importantes del curso
• Versión en Español y Inglés
• Considerar desarrollar en formato digital:
– Página Web
– Aplicación para smartphone
Semestre 2019-1
Ejemplo de guía de estudio
Semestre 2019-1
Ejemplo de guía de estudio
Semestre 2019-1
Criterios de Evaluación
Semestre 2019-1
Actividad % Calificación final
2 examenes parciales 40%
Exposiciones 35%
Tareas 15%
Participaciones en clase 10%
TOTAL 100%
• Para escribir la calificación en actas:
Intervalo Calificación
oficial
de 0 a 5.99 puntos 5
de 6.0 a 6.59 puntos 6
de 6.60 a 7.59 puntos 7
de 7.60 a 8.39 puntos 8
de 8.40 a 9.39 puntos 9
de 9.40 a 10 puntos 10
Semestre 2019-1
Sin clase:21 agosto y 18 de septiembre (congresos)
Tecnología… y DiFAC?Expectativas Esperadas vs. Reales
The Hype Curve of Technology
Semestre 2019-1
Próxima sesión: 228 agosto, 2018
• Revisión de tarea: perfil de revistas
• Exposición del tema: Historia breve de la quimioinformática
– Lecturas base:
– WIRES Comput. Mol Sci. 2011, 46-56
– Molecules 2016, 21, 151
– Expone:
• Clase y práctica: bases de datos moleculares
• Consultar: Manual de Quimioinformática, Capítulo 1 (disponible en www.difacquim.com)
Semestre 2019-1