manual de biologia celular.pdf

download manual de biologia celular.pdf

of 67

Transcript of manual de biologia celular.pdf

  • UNIVERSIDAD AUTONOMA DE BAJA CALIFORNIA FACULTAD DE CIENCIAS

    Biologa Celular y Molecular MANUAL DE PRCTICAS

    BIOLOGIA: PLAN DE ESTUDIOS 2008

    Nombre del Profesor: Dr. Faustino Camarena Rosales

  • Biologa Celular y Molecular

    2 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    CONTENIDO

    Tabla de contenido

    PROPSITO GENERAL DE LA UNIDAD DE APRENDIZAJE: BIOLOGA CELULAR Y MOLECULAR .................5

    INTRODUCCIN AL LABORATORIO:.....................................................................................................7

    REGLAMENTO DE LABORATORIO ........................................................................................................8

    CONSIDERACIONES GENERALES ..................................................................................................................8

    NORMAS DE TRABAJO ........................................................................................................................8

    COMPORTAMIENTO .........................................................................................................................10

    DISPOSICIONES PARA ACADMICOS, ALUMNOS Y COLABORADORES DEL LABORATORIO DE BIOLOGA MOLECULAR, .......11

    LIBRETA DE LABORATORIO ......................................................................................................................13

    REPORTE DE PRCTICAS DE LABORATORIO ..................................................................................................14

    PRCTICA 1: INTRODUCCIN AL TRABAJO DE LABORATORIO ............................................................17

    PRCTICA #2: IDENTIFICACIN DE CLULAS Y SUS ESTRUCTURAS ......................................................18

    USO DEL MICROSCOPIO ..........................................................................................................................19

    USO DEL OBJETIVO DE INMERSIN .............................................................................................................20

    ILUMINACION KHELER ....................................................................................................................20

    OBSERVACIN DE CLULAS ......................................................................................................................21

    TINCIN GRAM ....................................................................................................................................22

    PRCTICA 3: SISTEMA DE MEMBRANAS ............................................................................................25

    PRIMERA PARTE: PROCESOS DE TRANSPORTE PASIVO, CORRESPONDIENTE A LA OSMOSIS Y LA DIFUSIN.....................25

    SEGUNDA PARTE: TINCIN DE HEMATOXILINA- EOSINA (HE) ..........................................................................29

    TERCERA PARTE: OBSERVACIN DE CLULAS EN TEJIDOS.................................................................................29

    PRCTICA 4: OBSERVACIN Y SEPARACIN DE ORGNELOS DE DOBLE MEMBRANA .........................31

    PRIMERA PARTE: SEPARACIN Y OBSERVACIN DE PLSTIDOS .........................................................................31

    AISLAMIENTO DE LA FRACCION DE CLOROPLASTOS.............................................................................32

    OBSERVACIN MICROSCPICA DE LA FRACCION DE CLOROPLASTOS....................................................32

    OBSERVACIN MICROSCPICA DE LOS CLOROPLASTOS TRATADOS CON UREA.....................................33

    OBSERVACIN MICROSCPICA DE LOS CLOROPLASTOS TRATADOS CON TRITON..................................33

    IDENTIFICAR CROMOPLASTOS ...................................................................................................................33

    OBSERVACIN DE AMILOPLASTOS..............................................................................................................34

    OBSERVACIN DE LEUCOPLASTOS. ............................................................................................................34

    SEGUNDA PARTE: EXTRACCIN DE MITOCONDRIAS .......................................................................................34

    RECOMENDACIONES PARA PLASMAR LOS RESULTADOS Y SU ANLISIS ..................................................................35

  • Biologa Celular y Molecular

    3 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    TERCERA PARTE: RESPIRACIN ................................................................................................................36

    RESPIRACIN: ......................................................................................................................................36

    COMPLEMENTO: USO DE LOS MICROPIPETEADORES AUTOMTICOS ..................................................................37

    EJERCICIO A:........................................................................................................................................37

    EJERCICIO B: ........................................................................................................................................38

    EJERCICIO C: ........................................................................................................................................38

    EJERCICIO D:........................................................................................................................................38

    CON PIPETAS DE GRAN VOLUMEN (MAYOR DEL ML) .......................................................................................39

    RECOMENDACIONES PARA PLASMAR LOS RESULTADOS Y SU ANLISIS ..................................................................39

    PRCTICA 5: OBSERVACIN DE CLULAS ASOCIADAS A LA DIVISIN CELULAR ...................................40

    PRIMERA PARTE: EXAMINANDO CLULAS DE LEVADURA ................................................................................40

    SEGUNDA PARTE: OBSERVACIN DE MITOSIS ..............................................................................................41

    TERCERA PARTE: MEIOSIS.......................................................................................................................41

    OBSERVACIN DE ESPERMAS EN VIVO.........................................................................................................42

    TINCIN WRIGHT .................................................................................................................................42

    OBSERVACIN DE LAMINILLAS ..................................................................................................................43

    PRCTICA 6: TECNOLOGA DE ADN ...................................................................................................44

    INTRODUCCION: ..............................................................................................................................44

    GENERALIDADES DE LOS PROTOCOLOS. .......................................................................................................44

    CONSERVACIN....................................................................................................................................44

    HOMOGENIZACIN ...............................................................................................................................45

    DEGRADACIN Y ELIMINACIN DE COMPUESTOS ORGNICOS............................................................................46

    RESUSPENSIN Y CONSERVACIN ..............................................................................................................46

    GENERALIDADES DE LA ELECTROFORESIS......................................................................................................47

    DESCRIPCIN DE LA ELECTROFORESIS..........................................................................................................47

    CARACTERSTICAS DE LA MUESTRA .............................................................................................................48

    CORRIENTE ELCTRICA............................................................................................................................48

    AMORTIGUADOR ..................................................................................................................................49

    MATRIZ .............................................................................................................................................49

    OTROS REACTIVOS. ...............................................................................................................................51

    CUANTIFICACIN DE ADN.......................................................................................................................52

    ESTIMACIN DE LA CONCENTRACIN DE ADN POR VISUALIZACIN. ....................................................................52

    ESTIMACIN MEDIANTE ESPECTROFOTMETRO.............................................................................................53

    EXTRACCIN DE ADN POR EL MTODO DE CLOROFORMO ................................................................................53

    EXTRACCIN DE ADN POR EL MTODO DE FENOL ..........................................................................................54

    EXTRACCIN SALINA ..............................................................................................................................55

    EXTRACCIN DE ADN CON CTAB .............................................................................................................56

    ELECTROFORESIS ..................................................................................................................................56

    PREPARACIN AGAROSA EN HORNO DE MICROONDAS.....................................................................................56

  • Biologa Celular y Molecular

    4 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    PREPARACIN EN TERMOPLATO ................................................................................................................57

    ELECTROFORESIS ..................................................................................................................................57

    PRCTICA REPLICACIN ARTIFICIAL DE ADN.....................................................................................59

    INTRODUCCION: ..............................................................................................................................59

    PCR ..................................................................................................................................................59

    MUESTRA DE LOS CIDOS NUCLEICOS.........................................................................................................59

    CONDICIONES QUMICAS DE LA REACCIN....................................................................................................59

    CONDICIONES FSICAS ............................................................................................................................61

    OTROS CUIDADOS .................................................................................................................................63

    PRIMERA PARTE PCR INESPECFICO............................................................................................................63

    SEGUNDA PARTE: PCR ESPECFICO ............................................................................................................65

    LITERATURA.....................................................................................................................................67

  • Biologa Celular y Molecular

    5 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    PROPSITO GENERAL DE LA UNIDAD DE APRENDIZAJE

    Las Ciencias Naturales constituyen disciplinas cuyo campo de estudio son los fenmenos fsicos,

    qumicos y biolgicos que se dan en el medio natural; analizndolos bajo diferentes enfoques, para

    construir generalizaciones de manera racional que permitan explicar el comportamiento de los

    organismos en el marco de la evolucin biolgica.

    En este contexto, el curso de biologa celular y molecular, busca bridarles a los alumnos los fundamentos

    bsicos para comprender y estudiar a la unidad bsica de la vida, a la clula, desde el punto de vista

    funcional y estructural, as como su interaccin con su ambiente. Por otro lado, el curso involucra el

    desarrollo de habilidades prcticas para el estudio microscpico y bioqumico de algunos componentes

    celulares, como por ejemplo el ADN.

    Busca adems, que el alumno integre los elementos bsicos para su incorporacin en los cursos

    avanzados de su formacin profesional, as como en optativas vinculada al rea de biologa celular y

    molecular, ya que el conocimiento a nivel celular resulta indispensable para comprender la estructura

    elemental de todos los individuos.

    Los conocimientos y habilidades adquiridos le brindaran las herramientas para realizar investigacin

    cientfica, as como para poder preparar informes tcnicos en el rea, con responsabilidad y tica

    profesional.

    En este contexto el manual del curso constituye un auxiliar y gua de las actividades prcticas y de

    laboratorio. El documento est organizado en dos partes, la descripcin de la normatividad para el

    trabajo en el laboratorio y la gua de las actividades practicas.

    Las prcticas estn divididas en una sesin de introduccin al trabajo de laboratorio y 5 mdulos

    prcticos, correspondientes a 48 horas de trabajo en laboratorio, de acuerdo a la siguiente tabla:

    #

    Competencia(s) Descripcin Material de

    Apoyo

    Duracin

    1 Introduccin al trabajo de

    laboratorio

    3

    2 Categorizar los mtodos de

    estudio aplicados a la

    Biologa y Fisiologa Celular,

    para su tipificacin, con base

    en la utilizacin practica de

    algunas de ellos, para su

    posterior aplicacin en el

    trabajo profesional con

    Identificacin de clulas y

    sus estructuras

    Trabajo en

    laboratorio

    Microscopios

    compuestos y

    material

    biolgico

    3

  • Biologa Celular y Molecular

    6 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    responsabilidad

    3 Diferenciar las estrategias

    para el estudio de las

    cubiertas celulares,

    mediante el anlisis de las

    tcnicas bsicas, para su

    utilizacin en laboratorio,

    con actitud crtica.

    Identificacin de cubiertas

    celulares y sistema de

    membranas de clulas

    eucariontes

    Microscopios

    compuestos y

    material

    biolgico

    9

    4 Comparar los mtodos

    utilizados para la

    identificacin de orgnelos

    en tejidos multicelulares,

    con base en la utilizacin de

    tcnicas bsicas, para su

    posterior aplicacin en el

    campo profesional, con

    disciplina y respeto.

    Identificacin de clulas

    eucariontes en tejidos

    orgnicos y separacin

    mecnica de orgnelos y

    sistemas

    Microscopios

    compuestos y

    material

    biolgico

    Centrifugas,

    micro pipetas

    9

    5 Comparar las metodologas

    convencionales para la

    descripcin de los estadios

    de la divisin celular,

    explorando las tcnicas de

    microscopia en forma

    profesional

    Reconocimiento de estadios

    de la divisin celular

    Microscopios

    compuestos y

    material

    biolgico

    6

    6 Valorar diferentes

    metodologas de la

    tecnologa de ADN a nivel

    celular para ejemplificar su

    aplicacin, con actitud

    profesional

    Metodologa para los

    estudios en Biologa

    Molecular

    Material de

    laboratorio

    diverso

    12

    7 Aplicar tcnicas de

    replicacin artificial de ADN

    para analizar sus fases con

    actitud crtica y profesional

    Replicacin artificial de ADN Material de

    laboratorio

    diverso

    6

    Debemos destacar que las practicas involucran varias sesiones de laboratorio, por lo que una vez

    concluido se reportar a mas tardar una semana despus.

  • Biologa Celular y Molecular

    7 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Introduccin al laboratorio:

    En el desarrollo de las prcticas se busca la familiarizacin metodolgica con las tcnicas bsicas

    utilizadas en la Biologa Celular y Molecular. Por seguridad para los usuarios, los materiales y equipos se

    mantendrn en el laboratorio.

    La evaluacin de las prcticas se realizar con los siguientes criterios

    - Asistencia (menos del 80%, no tiene derecho a la evaluacin ordinaria)

    - Reporte individual de la prctica de laboratorio, para su entrega ser requisito llevar a cada sesin la

    libreta de laboratorio.

    -- y contestar en el reporte de la prctica las siguientes preguntas

    Qu material y equipo aprendi a usar?

    Genero datos experimentales?

    Qu conocimientos son bsicos en el tema?

    Qu habilidades y destrezas son requeridas para obtener adecuados resultados?

    Se enviar por la plataforma Blackboard en PDF

    . .

  • Biologa Celular y Molecular

    8 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Reglamento de Laboratorio

    Consideraciones generales El trabajo en los laboratorios relacionados con las reas de Ecologa Molecular y Biotecnologa, estn

    asociados con diferentes tipos de riesgos, que los podemos categorizar en:

    Peligros para las personas que trabajan en el laboratorio.

    Peligros para la salud de otras personas, as como riesgos para el ambiente, producidos por las

    actividades que se realizan.

    Riegos en el manejo de los materiales y equipos utilizados.

    Por lo tanto es necesario tener una serie de precauciones para garantizar la reproducibilidad de los

    resultados.

    NORMAS DE TRABAJO Es Obligatorio

    En el laboratorio utilizar en todo momento: bata, guantes y zapato cerrado.

    Lavarse las manos antes y despus del trabajo en el laboratorio.

    Mantener en funcionamiento el aire acondicionado a la temperatura indicada por el encargado

    del laboratorio (esto tiene como objetivo mantener en buenas condiciones el equipo de trabajo

    en condiciones de temperatura extrema).

    Mantener limpia el rea de trabajo y material que se utilice.

    Si utiliza equipos, materiales de uso delicado y reactivos, es responsabilidad del usuario leer

    manuales o consultar sobre su funcionamiento.

    Muchos de los reactivos que se emplean son sensibles a la luz o temperatura y peligrosos para la

    salud humana (mutagnicos o carcinognicos), por lo que se debe estudiar las fichas tcnicas

    donde se sealan las propiedades qumicas y fsicas de los mismos as como su manejo y los

    riesgos para la salud.

    Cuidar los reactivos y trabajar con alcuotas independientes.

    Respetar las bitcoras, los cronogramas de actividades y los registros de uso de los aparatos.

    Notificar cualquier desperfecto del equipo e informar al responsable del laboratorio cuando los

    reactivos estn por terminarse.

    Mantener en buen estado los reactivos, soluciones y los espacios de trabajo asignados.

  • Biologa Celular y Molecular

    9 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Todo el material deber ser lavado con jabn enzimtico, posteriormente deber enjuagarse

    con abundante agua destilada.

    Etiquete las muestras, reactivos y soluciones adecuadamente, indicando la siguiente

    informacin:

    Muestras

    Nombre del responsable

    Fecha

    Origen y detalle del contenido de la muestra

    Soluciones

    Nombre del responsable

    Fecha

    Nombre de la solucin, indicando los componentes y la concentracin

    Reactivos

    Fecha en que se recibi y fecha de apertura

    En caso de que pierda la etiqueta original, rotular el reactivo.

    DE LOS CONGELADORES Y REFRIGERADORES SE ELIMINAR TODO LO QUE NO CUMPLA LA

    REGLAMENTACIN

    Es responsabilidad de cada uno de los usuarios el disponer adecuadamente los desechos txicos,

    mediante la asignacin de contenedores especficos. Por otro lado, es importante esterilizar el material

    biolgicamente peligroso (bacterias modificadas, sustancias), antes de depositarlos en sus respectivos

    contenedores.

    Est prohibido

    Sacar fuera del laboratorio, equipo y materiales (nicamente podrn salir con autorizacin del

    responsable del laboratorio).

    El acceso a personas no autorizadas.

    Comer y Fumar dentro del laboratorio.

    Utilizar artculos personales (celulares, computadoras, etc.) con guantes.

  • Biologa Celular y Molecular

    10 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    El laboratorio es un lugar de trabajo, si es requerido platicar se recomienda ocupar los espacios externos

    al laboratorio.

    En caso de duda contactar a la persona responsable del laboratorio.

    El trabajo operativo en estos laboratorios implica costos, tanto en tiempo como en recursos, por lo

    que se recomienda utilizar el sentido comn en todas sus acciones.

    COMPORTAMIENTO En los laboratorios relacionados con la Ecologa Molecular y la Biotecnologa, generalmente se

    comparten equipos y recursos, adems de largos tiempos de compaa, por lo que tambin es

    importante considerar los aspectos relacionados con la actitud, particularmente la disposicin al trabajo

    en equipo, el respeto a los colegas y finalmente el buen humor.

    DEJE FUERA DEL LABORATORIO TODO LO QUE SEAN CRITICAS DESTRUCTIVAS, ACTITUDES OFENSIVAS Y

    NEGATIVAS

    La limpieza y el orden en el espacio de trabajo auxilian para obtener buenos resultados al disminuir los

    riesgos de contaminacin de los artculos que utilizamos y de nosotros mismos, adems permiten un

    mejor ambiente de trabajo. Si hay orden en el laboratorio y en el espacio de trabajo, tambin lo hay en

    las ideas.

  • Biologa Celular y Molecular

    11 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Disposiciones para acadmicos, alumnos y colaboradores del laboratorio de

    Biologa Molecular, La normatividad federal vigente en materia de seguridad, obliga a los usuarios del laboratorio seguir las

    siguientes recomendaciones:

    1. Todas las gavetas deben de estar disponibles para cualquier inspeccin que se realice. Si

    alguien desea mantener sus reactivos o materiales bajo candado, deber mantener disponible

    una copia de la llave con el encargado del laboratorio.

    2 Todos los reactivos deben estar colocados en charolas de contencin.

    3. De todos los reactivos deber estar disponible la hoja de seguridad, en espaol.

    4. Los residuos del laboratorio quedan clasificados en las siguientes categoras:

    a. Residuos biolgico infecciosos

    i. Punzo cortantes como navajas

    ii. Guantes

    iii. Desechos de disecciones o residuos animales y vegetales

    iv. Desechos de cultivo microbiolgicos

    b. Residuos lquidos

    i. Mezcla de solventes

    ii. Contaminados con bromuro de etidio

    c. Residuos slidos contaminados con bromuro de etidio

    d. Basura general

    5. Los desechos se colocaran en recipientes especficos para su acumulacin, posteriormente se

    pasaran al almacn general de la Facultad de Ciencias. En bitcoras especficas se anotaran las

    cantidades generadas.

    a. Residuos biolgico infecciosos

    i. Punzo cortantes como navajas:

    1. Los desechos se colocaran en el bote rojo ubicado en la mesa del laboratorio

    2. En la bitcora se anotar la cantidad aproximada que mensualmente deposite por responsable

    ii. Guantes (no contaminados con Bromuro de etidio):

    1. Los desechos se colocaran en el bote con bolsa roja ubicada al frente del laboratorio

    2. En la bitcora el encargado del laboratorio anotar la cantidad aproximada que semanalmente se

    deposite

  • Biologa Celular y Molecular

    12 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    3. La bolsa roja no debe llenarse a ms del 80 % de su capacidad. En caso de llenarse por favor cerrar y

    colocar la siguiente.

    4. NO DEBEN DE TIRARSE GUANTES NO CONTAMINADOS EN NINGUN OTRO RECIPIENTE

    iii. Desechos de disecciones o residuos animales y vegetales

    1. El responsable de la generacin del desecho determinara su mejor destino. S corresponde a la bolsa

    roja (biolgico infecciosos), favor de anotar en la bitcora.

    iv. Desechos de cultivo microbiolgicos

    1. El responsable de la generacin del desecho determinara su mejor destino. S corresponde a la bolsa

    roja (biolgico infecciosos), favor de anotar en la bitcora.

    b. Residuos lquidos (no contaminados con bromuro de etidio)

    i. Mezcla de lquidos no contaminados con bromuro de etidio

    1. Los desechos se colocaran temporalmente en los frascos cubiertos con papel alumi nio que estn

    sobre las mesas, despus en el frasco de galn color mbar, el cual esta etiquetado y ubicado en la

    gaveta debajo de la campana de extraccin de vapores al final del laboratorio

    2. En la bitcora se anotar la cantidad aproximada que mensualmente se deposite por responsable

    ii. Contaminados con bromuro de etidio

    1. Los desechos se colocaran temporalmente en el frasco de galn color mbar, el cual esta etiquetado y

    ubicado en cuarto oscuro, en la gaveta debajo de la tarja

    2. En la bitcora se anotar la cantidad aproximada que mensualmente se deposite por responsable

    c. Residuos slidos contaminados con bromuro de etidio

    i. Geles

    1. Los desechos se colocaran en el bote etiquetado, ubicado en el cuarto oscuro

    2. En la bitcora ubicada en el cajn superior del lado izquierdo, se anotar la cantidad aproximada que

    semanalmente se deposite

    ii. Plsticos, papel y cartn

    1. Los desechos se colocaran en el bote etiquetado, ubicado en el cuarto oscuro

    2. En la bitcora ubicada en el cajn superior del lado izquierdo, se anotar la cantidad aproximada que

    semanalmente se deposite

    d. Basura general.

    NO DEBERA CONTENER NINGUNO DE LOS RESIDUOS ANTES INDICADOS. El conserje asignado al

    laboratorio la recoger peridicamente

  • Biologa Celular y Molecular

    13 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Libreta de Laboratorio Toda la descripcin del proceso que involucra la generacin de datos en el laboratorio debe estar anotada en la libreta de laboratorio o bitcora. Es una herramienta obligada que garantiza la reproduccin de los experimentos y respalda nuestra investigacin al registrar las actividades e ideas, errores y aciertos.

    PREVIO A CUALQUIER ACTIVIDAD PRACTICA, DEBE OBTENER INFORMACION TEORICA DEL TEMA Y

    ESCRIBIRLO EN LA LIBRETA

    La libreta deber ser de pasta dura, hojas enumeradas y cosidas (evite cuadernos engargolados). Toda anotacin debe ser escrita con tinta.

    La libreta deber ser nica; exclusivamente se usar en el laboratorio.

    - Etiquete correctamente la libreta con sus datos personales, ttulo del curso o proyecto, nombre del profesor o tutor.

    - De preferencia dejar las dos primeras pginas como ndice, la ltima pgina para incluir una tabla de abreviaturas y cdigos utilizados. Las penltimas pginas sern para anotar las frmulas de los reactivos que se utilicen

    - Anote todo lo que realice en laboratorio en forma cronolgica, con informacin clara y entendible. Remarque sus resultados.

    - Indique lo que sucedi en cada ocasin que trabaje en el laboratorio, incluyendo la informacin terica, variaciones de los protocolos y la justificacin correspondiente, evitando anotar datos en hojas sueltas.

    - No utilice corrector, ni sobrescriba, en su caso cruce con una lnea las palabras o frases escritas errneamente.

    - En cada pgina se recomienda anotar: ttulo de la actividad o experimento, fecha, nmero de pgina y en lo posible los archivos electrnicos generados y asociados a los experimentos realizados.

    - No arranque las hojas. No se admite la bitcora si no tiene continuidad en su enumeracin.

    - Anote todos los clculos que realice.

    - Cronolgicamente, pegue las fotos, grficas y otros documentos o comprobantes que se generen de su trabajo en el laboratorio.

    - Resuma sus resultados, analcelos y contrstelos, finalmente sintetice sus conclusiones.

    Anote el listado de todos los materiales y equipos utilizados y describa los mtodos seguidos

    Discuta las actividades realizadas as como los resultados obtenidos, explicitando sus sugerencias

    Sintetice sus conclusiones

    Nota: para ms informacin de la libreta de laboratorio se recomienda la siguiente bibliografa:

    Kanare, H. M: 1985. Writing the Laboratory Notebook. Washington D.C.: American Chemical Society.

    http://www.ruf.rice.edu/~bioslabs/tools/notebook/notebook.html

    http://www.chem.tamu.edu/class/majors/syllabusmaterials/laboratorynotebook.htm

  • Biologa Celular y Molecular

    14 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Reporte de Prcticas de laboratorio Un reporte debe llenar dos objetivos. Primero, debe describir clara y completamente los

    procedimientos seguidos (en trminos reproducibles) y los resultados hallados (en forma original y

    posteriormente con su anlisis). Segundo, debe ubicar los resultados en perspectiva con el estado actual

    del conocimiento, interpretando su importancia.

    Las partes que contiene un reporte cientfico, son las siguientes:

    TITULO.

    Nominacin sinttica de la investigacin, la cual debe ser breve y concreta, enunciando el

    problema a resolver.

    INTRODUCCIN.

    Presentacin de la informacin base, que dentro del cuerpo de conocimiento nos ubica en el

    problema planteado as como la informacin relacionada a su resolucin. Tambin se refiere a la

    importancia del trabajo, esto ltimo puede tratarse en un punto separado.

    ANTECEDENTES.

    Resumen de otras investigaciones similares o bien que fundamenten los aspectos

    metodolgicos del trabajo.

    COMPETENCIA.

    MATERIALES Y MTODOS DE TRABAJO.

    En forma sinttica se explica la aplicacin de los mtodos, generalmente en forma referencial,

    as como la descripcin de los materiales, de tal forma que el lector del trabajo, cuente con la

    informacin necesaria para poder repetir la experiencia, con base a lo descrito.

    RESULTADOS.

    Presentacin ordenada tanto los datos obtenidos sin procesamientos, as como la informacin

    procesada, con los resultados de los estadgrafos.

    DISCUSIN.

    Corresponde a una disertacin razonada del contraste de los resultados obtenidos contra los

    antecedentes bibliogrficos (cuerpo de conocimiento existente), as como los puntos de vista

    fundamentados del autor.

    Se buscar obtener algunos de los siguientes puntos:

    1) Analizar los resultados.

    2) Compararlos con los de otros.

    3) Identificar fuentes de error, sin llegar al extremo de invalidar el propio trabajo.

    4) Especular acerca de los significados ms amplios de las conclusiones obtenidas.

    5) Identificar los siguientes pasos en la investigacin del problema.

  • Biologa Celular y Molecular

    15 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    6) Sugerir mejoras.

    CONCLUSIONES.

    En forma breve se presenta el cuerpo de conocimiento adquirido a partir de la investigacin

    realizada as como los ms sobresalientes resultados obtenidos.

    BIBLIOGRAFA REFERIDA.

    Se cita en forma organizada y homognea, tanto los libros, los artculos y en general las obras

    consultadas, que fue indispensable su indicacin o referencia en el contenido del trabajo.

    Considerando su valor utilitario, se describe a continuacin en sntesis los procedimientos para

    citar material bibliogrfico en el texto y en la seccin final del reporte cientfico de literatura citada.

    Como citar en el texto.

    - Despus de un prrafo donde se cite a un determinado autor, se anota entre parntesis,

    ejemplo (Barnes, 1969).

    - En el caso de que el nombre del autor forme parte del texto, el ao se indica entre parntesis,

    ejemplo Barnes (1969).

    - Si se trata de ms de un autor, se anota entre parntesis despus del primer autor la palabra et

    al., que del latn significa "y otros", ejemplo (Barnes, et al., 1969).

    - En el caso de que un autor, sea consultado para ms de una referencia de un mismo ao, estas

    se anotan con una letra en orden, despus del ao, ejemplo (Barnes, 1969a), (Barnes, 1969b), etc. y en

    la seccin de literatura citada se enlistan en orden cronolgico.

    Como indicar las referencias en la seccin de literatura citada.

    La literatura deber anotarse en orden alfabtico y en caso de que un autor contribuya con ms

    de un trabajo en orden cronolgico, siguiendo el mismo formato en toda la seccin, se recomienda

    seguir el siguiente formato:

    - Datos que se registran:

    1. Nombre del autor. Se indica apellido paterno (primer apellido) completo, inicial de segundo apellido,

    inicial de nombre.

    2. Fecha de publicacin.

    3. Ttulo de la obra. Se ponen maysculas en las letras iniciales.

    4. Numero de edicin. En el caso de la primer edicin o edicin nica, no se indica.

    5. Pas o en su caso ciudad de edicin.

    6. Casa editorial. Cuando la casa editorial es muy conocida, no es necesario poner la casa editorial.

    7. Paginas referidas.

    8. En el caso de artculos, el sustitucin de los incisos anteriores 4 a 6, se indica el nombre de la revista

    (en caso de conocerse se utiliza la abreviatura convencional), Volumen y Nmero de la revista.

  • Biologa Celular y Molecular

    16 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    a) Referencia de un libro:

    Barnes, R.P. 1969. Invertebrate Zoology. 2da. ed. Philadelphia. Ed. Saunders. 350-355 pp.

    b) Referencia de una revista:

    Hunter, P.A. y D.D. Keck. 1949. California Plant Communities. Aliso, 2 (1): 87-105.

    TABLAS, GRFICAS Y FIGURAS.

    Debido a que existen diversos criterios de ubicacin de las presentaciones grficas,

    especialmente cuando intervienen polticas editoriales, usualmente se presentan al final del trabajo,

    aunque en un reporte interno que no tiene que pasar por consideraciones editoriales, se recomienda

    intercalarlas de acuerdo al escrito.

  • Biologa Celular y Molecular

    17 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    PRCTICA 1: Introduccin al trabajo de laboratorio

    INTRODUCCION:

    Durante la primera sesin de laboratorio se busca promover la exploracin rpida de los aspectos

    bsicos para el trabajo en el laboratorio de Biologa Celular y Molecular de la Facultad de Ciencias,

    considerando la normatividad, reglas de operacin y sobre todo los cuidados que se deben tener. l

    Para el reporte de prctica se recomienda investigar el marco de referencia terico de la sesin, as

    como la introduccin para el reporte, por parte del estudiante

    Informacin relacionada con el marco de referencia:

    Cules son las principales recomendaciones para trabajar en laboratorios de Biologa?

    Cules son las caractersticas que diferencian a los laboratorios de zoologa, botnica, qumica y

    biologa molecular?

    MATERIAL:

    BATA PARA LABORATORIO

    METODOLOGIA:

    1. En forma terica se revisaran aspectos generales del laboratorio, as como el reglamento y las

    recomendaciones para el manejo de los desechos.

    2. Recorrido en el laboratorio, con el fin de identificar las diferentes reas de trabajo as como

    los principales equipos.

    3. Revisin del manejo de la libreta de laboratorio.

    Recomendaciones para plasmar los resultados y su anlisis:

    1. Resuma la informacin terica y contrstela con el marco de referencia que obtuvo.

    2. Esquematice la distribucin de las reas del laboratorio, identifique los recipientes para

    desechos y analice los cuidados que debe tener en cada rea.

    3. Prepare su libreta de laboratorio, contraste con la informacin que recomiendan diversos

    autores para llevar la libreta de laboratorio y explique su valor utilitario.

    4. Procure emitir recomendaciones para mejorar los diferentes aspectos sealados en la sesin.

  • Biologa Celular y Molecular

    18 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    PRCTICA #2: Identificacin de clulas y sus estructuras

    INTRODUCCION:

    En una primera parte se busca promover la exploracin rpida de algunas clulas procariontas y

    eucariontas, para lo cual se debe conocer el adecuado uso de los microscopios compuestos y el uso de la

    iluminacin Klher. En forma adicional para las clulas procariontas se promover el desarrollo de

    habilidades asociadas a la tincin gram.

    Para el reporte de prctica se recomienda investigar el marco de referencia terico de la sesin, as

    como la introduccin para el reporte, por parte del estudiante

    Informacin relacionada con el marco de referencia:

    Cules son los tipos de microscopio tiles en la actividad relacionada con la biologa celular y

    molecular?

    Cules son las principales caractersticas de los microscopios compuestos?

    Copie un esquema de un microscopio compuesto

    Cules son las principales recomendaciones para el uso del microscopio?

    COMPETENCIA: Categorizar los mtodos de estudio aplicados a la Biologa y Fisiologa Celular, para su

    tipificacin, con base en la utilizacin practica de algunas de ellos, para su posterior aplicacin en el

    trabajo profesional con responsabilidad

    MATERIAL:

    5 Portaobjetos y 5 cubreobjetos

    Hematoxilina

    Eosina

    Alcohol etlico absoluto

    Estuche de diseccin

    Caja Petri

    Muestras celulares (por ejemplo: sangre, muestras de charcas, raspado bucal, plantas)

    Microscopios compuestos

    METODOLOGIA:

  • Biologa Celular y Molecular

    19 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Uso del microscopio

    El microscopio es un instrumento delicado. Debido a esto debe recordar las siguientes instrucciones

    bsicas:

    a) Coloque el microscopio en una posicin cmoda sobre la mesa. Tmelo siempre del brazo. Si desea

    cambiar la posicin del instrumento levntelo y NO lo arrastre por la mesa.

    b) Es conveniente verificar la limpieza de los lentes antes de comenzar a realizar observaciones.

    c) Encienda la lmpara, baje el condensador y abra el diafragma completamente. Recuerde, la

    observacin se realiza ms eficientemente con iluminacin Kheler.

    Realizacin de la observacin

    a) Aleje el objetivo de la platina y coloque la lente de aumento menor (4x).

    b) Seleccione la preparacin que desea observar, revsela para asegurarse que esta se encuentra limpia.

    c) Abra la pinza del carro, coloque la preparacin con el cubreobjetos hacia arriba y cierre el carro.

    d) Ajuste la posicin del carro de modo que la regin a observar quede justo en el orificio de la platina.

    e) Usando el macromtrico acerque la lente a la preparacin. Cuando logre un foco aproximado utilice el

    micromtrico (grelo lentamente) para el ajuste de precisin.

    f) Si desea cambiar el aumento, gire el revlver y seleccione el nuevo objetivo a utilizar. Debiera bastar

    un pequeo ajuste del micromtrico para llegar a foco, si fuera necesario reajuste la iluminacin usando

    el condensador.

  • Biologa Celular y Molecular

    20 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Si requiere usar el lente de inmersin (100x en los microscopios de la FC) NUNCA lo use como objetivo

    seco, puede rayarlo.

    Uso del objetivo de inmersin

    a) La preparacin debe estar enfocada a 40X (objetivo a seco), gire el revlver de modo que el objetivo

    de inmersin quede en una posicin intermedia (40X y 100X).

    b) Coloque una gota de aceite de inmersin sobre el cubre objeto.

    c) Lleve el objetivo de inmersin al eje ptico.

    d) Utilizando el tornillo micromtrico lleve el objeto a foco, si lo requiere modifique la cantidad de luz

    del condensador.

    e) Cuando finalice la observacin baje la platina, retire la preparacin. Limpie tanto el objetivo como la

    preparacin con un pao humedecido con Xilol.

    Al finalizar las observaciones el microscopio y las preparaciones deben quedar limpios. Gire el revlver y

    deje la lupa como lente de observacin. Apague la lmpara y enrolle el cordn en el pie del microscopio.

    Recomendaciones para plasmar los resultados y su anlisis

    Debe seguir una estructura, que puede variar segn el observador, pero que debe ser sistemtica y

    ordenada. Se sugiere que considere en sus observaciones el siguiente esquema:

    a) Objetivo: referido al porque se realiza la observacin (Ej. observacin de ncleo)

    b) Material: es el rgano o tejido del que se obtuvo la preparacin (Ej. rin de rata)

    c) Mtodo: se refiere a la tcnica histolgica usada para elaborar la preparacin (a fresco o

    permanente) y a la tincin utilizada. (Ejemplo Preparacin a fresco de clulas)

    d) Aumento: la amplificacin del objeto observado y depende del ocular y del objetivo.

    Aumento = aumento del objetivo x aumento del ocular

    e) Observaciones: considere describir la forma celular; relacin con otros elementos presentes,

    tamao celular; forma, nmero y posicin del ncleo y algunas caractersticas del citoplasma

    f) Esquematice y coloree lo observado

    ILUMINACION KHELER

    El Dr. Kheler, desarroll un nuevo sistema de iluminacin, que an hoy en da se maneja

    y lleva su nombre, agregando un diafragma de campo luminoso posterior a la emisin de

  • Biologa Celular y Molecular

    21 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    luz emitida por un bombillo de bajo poder, y centrando la mayor intensidad de luz

    exactamente cubriendo el dimetro de cada lente frontal de cada objetivo en su apertura

    numrica especfica, para de esta manera, poder aprovechar al 100% la luz emitida por la

    fuente emisora.

    Metodologa:

    1.-Llevar el espcimen a foco utilizando el objetivo 10X.

    2.-Cerrar completamente el diafragma del condensador.

    3.-Cerrar completamente el diafragma de campo.

    4.-Con el control de altura del condensador llevar el condensador hasta arriba.

    5.-Bajar el condensador poco a poco hasta observar una figura geomtrica (octgono) bien definida con

    el reborde ligeramente azulado.

    6.-Con los tornillos de centrado del condensador colocar el octgono al centro del campo de

    observacin.

    7.-Abrir el diafragma de campo hasta que una de las aristas toque el borde del campo de observacin y

    repetir el centrado hasta que todas las aristas toquen el borde del campo de observacin al mismo

    tiempo.

    8.-Cambie al objetivo 40X.

    9.-Abrir el diafragma del condensador a la apertura numrica marcada por el objetivo.

    10.-Observando con un solo ojo (derecho) mover el mando micromtrico hasta obtener el mejor punto

    de enfoque.

    11.-Observando con el otro ojo (izquierdo) sin tocar el micromtrico gire la dioptra hasta obtener el

    mejor punto de enfoque.

    12.- Cambie al objetivo 10X.

    13.- Abrir el diafragma del condensador a la apertura numrica marcada por el objetivo.

    14.- S el espcimen continua en foco, los ajustes se hicieron correctamente, de lo contrario repita desde

    el punto 8 hasta lograr el correcto ajuste.

    Observacin de clulas

    Buscando revisar las caractersticas generales de las clulas eucariontas, se recomienda obtener una

    muestra donde exista una notable riqueza, como puede ser una muestra de una charca o de tejido

    epidrmico de la boca tomado con un palillo.

  • Biologa Celular y Molecular

    22 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    1. Coloque la muestra sobre el portaobjetos en hmedo, por lo que si es necesario agregue una gota de

    agua.

    2. Incremente el aumento hasta 100x utilizando adecuadamente el aceite mineral.

    3. Utilizando la iluminacin Klher y optimizando la iluminacin, observe las clulas..

    4. Esquematice sus observaciones, indicando los datos de la laminilla y tcnica de tincin.

    No se olvide utilizar ampliamente el sistema de iluminacin as como los campos de poca y gran

    profundidad, as como el uso del micrmetro para el adecuado enfoque por cada campo.

    Tincin Gram

    l. Coloque la muestra sobre el porta objetos y distribyala.

    2. Fije la muestra por secado, pasndolo sobre un mechero. El paso del portaobjetos sobre la llama del

    mechero debe ser rpido, repita hasta que este seca la muestra. La temperatura del porta debe ser la

    que soporta el dorso de la mano sin quemarla

    2. Coloque unas gotas del colorante violeta de genciana, cubriendo la extensin; el tiempo de actuacin

    del colorante es de dos minutos.

    3. Lave con agua destilada para arrastrar el colorante.

    4. Ponga solucin de lugol durante un minuto.

    5. Lave nuevamente con agua destilada.

    6. Decolore con unas gotas de alcohol de 96, que debe actuar de 30 segundos a un minuto, para

    arrastrar el colorante que queda libre.

    7. Lave cuidadosamente con agua destilada.

    8. Agregue unas gotas de safranina durante un minuto.

    9. Lave con agua destilada.

    10. Seque al aire.

    11. Agregue aceite de inmersin y observe a 100X, utilizando adecuadamente el aceite mineral.

    12. Utilizando la iluminacin Klher y optimizando la iluminacin, observe las clulas. No se olvide

    utilizar ampliamente el sistema de iluminacin as como los campos de poca y gran profundidad, as

    como el uso del micrmetro para el adecuado enfoque por cada campo.

  • Biologa Celular y Molecular

    23 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    13. Esquematice sus observaciones.

    Las bacterias Gram positivas aparecen en visin microscpica teidas de un color morado intenso, por la

    violeta de genciana.

    Las bacterias Gram negativas, aparecen en visin microscpica teidas de un color rosado dbil, por la

    safranina.

    a) Se arranca del suelo una planta de leguminosa con sus races. En las raicillas finas se vern unos

    ndulos en forma de pequeas verrugas. Con las pinzas se desprende un ndulo. Se lava para quitarle la

    arena. El ndulo se parte con el bistur sobre un portaobjetos agregando una gota de agua. Se quitan los

    residuos del ndulo, secando la preparacin a la llama del mechero, se coloca el portaobjetos en el

    soporte de tinciones y se tie segn la tcnica de Gram.

    b) Con la aguja de diseccin se toma una pequea porcin de yogurt. Se disuelve en una gota de agua y

    se hace una extensin sobre el portaobjetos. Se lava la preparacin, dejando caer con un cuentagotas

    unas gotas de la mezcla alcohol-cloroformo para arrastrar las gotas de grasa del yogurt y se deja secar al

    aire. Se coloca el portaobjetos en el soporte de tinciones y se tie segn la tcnica de Gram.

    c) Disuelva en una gota de agua sobre un portaobjetos, una pequea porcin de sarro dentario tomada

    con la aguja y con esto se hace una extensin o frotis que se seca a la llama del mechero. Se coloca el

    portaobjetos en el soporte de tinciones y se tie segn la tcnica de Gram.

    Rhizobium leguminosarum: Ndulos de leguminosas: trbol, soya, alfalfa. Gram negativas

    Acetobacter aceti: Telita que se forma sobre el vinagre. Gram negativa.

    Lactobacilus vulgaris: Yogurt. Gram positiva

    Informe de resultados

    Los resultados de una tincin de Gram se reportan como sigue:

  • Biologa Celular y Molecular

    24 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    - Forma bacteriana

    - Coloracin

    - Agrupacin bacteriana (escasa, media, abundante)

    - En muestras de esputo, excretas, saliva o "pus" se considera la respuesta leucocitaria y su tipo

    (polimorfonuclear o monocitos) as como el conteo de clulas epiteliales a 10X.

    La flora bacteriana observada por tincin de Gram se informa por gnero, forma o agrupacin, pero

    nunca por especie, ya que la identificacin solo se puede lograr mediante pruebas bioqumicas

  • Biologa Celular y Molecular

    25 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    PRCTICA 3: Sistema de membranas

    INTRODUCCION:

    En una primera parte se busca promover la exploracin rpida de algunas caractersticas del sistema de

    membranas, como lo es el transporte pasivo (difusin y osmosis). Posteriormente la identificacin de

    clulas eucariontes y caractersticas microscpicas principales, para lo cual se promover el desarrollo

    de habilidades asociadas a la tincin Hematoxilina-Eosina.

    Para el reporte de prctica se recomienda investigar el marco de referencia terico de la sesin, as

    como la introduccin para el reporte, por parte del estudiante

    Informacin relacionada con el marco de referencia:

    Primera parte: procesos de transporte pasivo, correspondiente a la osmosis y

    la difusin. OBJETIVO: Demostrar los procesos pasivos de transporte de molculas, de difusin y osmosis.

    MATERIAL:

    METODOLOGIA:

    Materiales

    Vasos de precipitado o recipientes

    Pipeteador

    Pipetas de 10 y 5 mL

    Estuche de diseccin

    Cuchillo

    Portaobjetos y cubreobjetos

    Aproximadamente 100 gr de azcar

    Aproximadamente 100 gr de sal

    1 zanahoria

    2 huevos frescos

    1 microscopio compuesto

  • Biologa Celular y Molecular

    26 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Metodologa:

    1. Demostracin de la difusin

    a. Coloque agua destilada en un recipiente (mida el volumen)

    b. Agregue 5 gotas de azul de metileno

    c. Describa lo que sucede cada 15 minutos

    2. Demostracin de la osmosis, prueba A, en zanahoria

    a. Corte un trozo de la zanahoria

    b. Horade de tal forma que se forme un recipiente.

    c. Llene la cavidad con azcar o sal

    d. Coloque el trozo en un recipiente con agua, de tal forma que la parte externa este en contacto con

    lquido

    e. Describa lo que sucede despus de 2 horas

    3. Demostracin de la osmosis, prueba B, en zanahoria

  • Biologa Celular y Molecular

    27 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    a. Corte un trozo de zanahoria y hordelo.

    b. Agregue 1 mL de agua destilada

    c. Coloque el trozo en un recipiente con solucin hper-salina o hper azucarada, de tal forma que la

    parte externa este en contacto con el lquido

    d. Describa lo que sucede despus de 2 horas

    4. Demostracin de la osmosis con un huevo.

    a. Rompa con sumo cuidado la cscara de un huevo, en el extremo ms cnico, dejando una pequea

    perforacin.

    b. Por el otro extremo del huevo rompa la cscara, sin daar la membrana

    c. Llene la cavidad con agua destilada

    d. Coloque el huevo de tal forma que la parte externa este en contacto con lquido hper-salino o hper

    azucarado

    e. Describa lo que sucede despus de 2 horas

    5. Demostracin de la osmosis con bolsa de dilisis

    a. Cierre uno de los extremos de un tubo de dilisis, amarrando fuertemente un hilo.

    b. Llene el interior con una determinada concentracin de sal o azcar

    c. Colquelo de tal forma que la parte externa este en contacto con lquido que contenga una diferente

    concentracin.

    6. Demostracin de la osmosis en clulas

    a. Vegetales a escala macroscpica. Coloque un trozo de tejido vegetal en diferentes concentraciones de

    sal o azcar y anote las caractersticas del tejido cada 30 minutos

  • Biologa Celular y Molecular

    28 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    b. Clulas vegetales a escala microscpica. Coloque tres finos tejidos (como el de la cebolla) en

    portaobjetos. Agregue a cada gota de un lquido con una diferente concentracin de sal o az car y

    observe al microscopio. Esquematice sus observaciones.

    c. Clulas animales a escala microscpica. Coloque tres gotas de sangre en portaobjetos. Agregue a cada

    gota de un lquido con una diferente concentracin de sal o azcar y observe al microscopio.

    Esquematice sus observaciones.

    Recomendaciones para plasmar los resultados y su anlisis

    En cada inciso se realizan recomendaciones para plasmar resultados. Analice los resultados con respecto

    a lo esperado de acuerdo a la bibliografa.

  • Biologa Celular y Molecular

    29 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Segunda parte: Tincin de Hematoxilina- Eosina (HE) 1. Obtencin una gota de sangre o muestra de clulas.

    2. Realizacin del frotis sanguneo. Se hace colocando una pequea gota de sangre sobre un extremo del

    porta, con el lado de otro porta, en un movimiento uniforme, extiende la gota sobre el primer porta.

    3. Secar el frotis al aire.

    4. Fijar del frotis con alcohol absoluto (echar alcohol sobre la muestra hasta cubrirla totalmente, dejar

    que el alcohol se evapore totalmente).

    5. Tincin con hematoxilina (Echar el colorante sobre la muestra hasta cubrirla totalmente, esperar

    exactamente 15 minutos, echando ms colorante si ste se evaporara).

    6. Lavar abundantemente con agua para que el colorante sobrante desaparezca y deje de actuar.

    7. Tincin con eosina (echar el colorante sobre la muestra y dejar actuar durante 1 minuto

    exactamente).

    8. Lavar abundantemente con agua para que el colorante sobrante se elimine y no siga actuando.

    9. Secar al aire.

    10. Observar al microscopio comenzando con pocos aumentos.

    Tercera parte: Observacin de clulas en tejidos. Para la realizacin de esta parte de la prctica, se tendrn disponibles diversas laminillas, preparadas en

    el laboratorio de histologa de la Facultad de Ciencias, las cuales principalmente correspondern a tejido

    epitelial teido con la tcnica de Hematoxilina-Eosina (HE).

  • Biologa Celular y Molecular

    30 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Para cada una de las laminillas.

    1. Observe el tejido utilizando los menores aumentos, hasta localizar zonas donde se puedan identificar

    claramente a las clulas.

    2. Incremente el aumento hasta 100x utilizando adecuadamente el aceite mineral.

    3. Utilizando la iluminacin Klher y optimizando la iluminacin, observe las clulas, procurando

    identificar orgnelos internos, especialmente del sistema de membranas.

    4. Esquematice sus observaciones, indicando los datos de la laminilla y tcnica de tincin.

    No se olvide utilizar ampliamente el sistema de iluminacin as como los campos de poca y gran

    profundidad, as como el uso del micrmetro para el adecuado enfoque por cada campo.

  • Biologa Celular y Molecular

    31 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    PRCTICA 4: Observacin y separacin de orgnelos de doble membrana

    INTRODUCCION:

    En una primera parte se busca promover el desarrollo de habilidades para la separacin de orgnelos de

    doble membrana y su observacin. Posteriormente la identificacin de procesos fisiolgicos

    relacionados con la respiracin.

    Para el reporte de prctica se recomienda investigar el marco de referencia terico de la sesin, as

    como la introduccin para el reporte, por parte del estudiante

    Competencia:

    Comparar los mtodos utilizados para la identificacin de orgnelos en tejidos multicelulares, con base

    en la utilizacin de tcnicas bsicas, para su posterior aplicacin en el campo profesional, con disciplina

    y respeto.

    Materiales y equipos

    Tubos eppendorf

    Homogeneizador

    Amortiguador STE y TEK (Tris-HCl 50 mM pH 7.5; EDTA 10 mM y KCl al 1.5%)

    Sacarosa

    Tubos de centrfuga

    Centrfuga eppendorf

    Centrfuga refrigerada

    Mini fuga

    Primera parte: Separacin y observacin de plstidos Los cloroplastos de las clulas de espinaca se aislarn utilizando el mtodo modificado de F.R Whatley y

    D.I. Arnon (1962). La espinaca se homogeniza en un amortiguador de sal. Despus que el tejido de la

    planta se macera en un mortero, el homogenizado se filtra a travs de una gaza para remover los

    pedazos grandes de tejidos. El filtrado es centrifugado a 200 g por 1 minuto. El sobrenadante se

    centrfuga a 1300 g por 5 minutos, sedimentando los cloroplastos.

  • Biologa Celular y Molecular

    32 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    AISLAMIENTO DE LA FRACCION DE CLOROPLASTOS

    1. Pese 4 g de hojas frescas de espinaca, a las cuales se les removieron las venas centrales.

    2. Corte las hojas en pequeos pedazos y colquelas en un mortero fro.

    Aada 15 ml de la solucin amortiguadora de Tris-NaCl fra y arena purificada. Macere el tejido por 2

    minutos.

    3. Filtre la suspensin a travs de varias capas de gaza a un tubo de centrfuga de 15 ml fro.

    4. Centrifugue el lquido filtrado a 200 g por 1 minuto. Verifique que los tubos de centrfuga estn

    balanceados.

    5. Decante el sobre nadante a un tubo fro y centrifugue a 1300 g por 5 minutos.

    6. Despus de la centrifugacin, mida la distancia A. A es la distancia en centmetros desde el extremo

    inferior del tubo de centrfuga al tope del pellet. Anote los datos en la pgina; stos se utili zarn para

    calcular el Coeficiente de Sedimentacin.

    7. Decante y descarte el sobre nadante y usando una probeta, aada unas gotas de la solucin

    amortiguadora fra de Tris-NaCl al pellet que qued en el tubo de centrfuga. Resuspenda el pellet

    con una pipeta Pasteur.

    8. Tape el tubo de centrfuga, e invierta el mismo para mezclar su contenido. Colocar en hielo.

    OBSERVACIN MICROSCPICA DE LA FRACCION DE CLOROPLASTOS

    1. Con una pipeta Pasteur remueva una gota de la suspensin de cloroplastos y lleve a cabo una

    preparacin hmeda wet mount. Use una pequea gota de modo que no tenga que ejercer presin

    sobre el cubreobjetos, daando los cloroplastos.

    2. Examine los cloroplastos bajo el objetivo de alta potencia y luego y luego bajo el objetivo de

    inmersin en aceite.

    3. Observa la morfologa de varios cloroplastos. Identifica los cloroplastos que tengan una morfologa

    interna poco homognea.

    4. Represente con un diagrama los cloroplastos que muestren detalles internos e identifique sus

    estructuras.

  • Biologa Celular y Molecular

    33 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    OBSERVACIN MICROSCPICA DE LOS CLOROPLASTOS TRATADOS CON UREA

    1. Coloque una pequea gota de la suspensin de cloroplastos en un portaobjetos limpio. Aada una

    gota de la solucin de urea saturada y coloque un cubreobjetos. Cuidado de no presionar el

    cubreobjetos.

    2. Examine los cloroplastos bajo el objetivo de alta potencia y el de inmersin de aceite por 5 minutos y

    conteste las preguntas de la pgina 12

    3. Dibuje los cloroplastos que presenten una morfologa alterada.

    OBSERVACIN MICROSCPICA DE LOS CLOROPLASTOS TRATADOS CON TRITON

    1. Prepare un montaje hmedo usando una pequea gota de la suspensin de cloroplastos y una gota

    de solucin de Triton X-100 al 2%.

    2. Examine la preparacin bajo el objetivo de alta potencia y el de inmersin de aceite

    Identificar cromoplastos

    Cromoplastos

    1. De un tomate maduro corte finamente una pequea porcin de la parte pulposa.

    2. Coloca el tejido sobre un portaobjetos, sin adicionar agua y se protege con un cubreobjetos.

    3. Comprima suavemente la preparacin con los dedos hasta obtener un completo aplastamiento del

    fragmento de pulpa de tomate.

    4. Examinar la preparacin al microscopio con el objetivo 10x y seleccionar una zona en la que las

    clulas estn menos aglutinadas.

    5. Examinar la preparacin al microscopio con los objetivos 40x y 100x (aceite de inmersin).

    6. Identificar los distintos orgnulos celulares visibles y dibujar las observaciones. Al microscopio se

    observan unas clulas muy separadas unas de otras, aprecindose en el citoplasma una serie de

    grnulos rojizos-anaranjados que son los cromoplastos. Tambin se puede ver el ncleo redondeado. En

    las zonas poco alteradas por la compresin es posible visualizar grandes vacuolas incoloras as como la

    presencia de grnulos de almidn en forma arrionada.

  • Biologa Celular y Molecular

    34 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Observacin de amiloplastos

    1. Un pltano maduro se abre y con cuidado se corta muy finamente, colocando el material en un

    portaobjetos y distribuyndolo procurando hacer un frotis, con la misma navaja.

    2. Fijar la muestra por secado a temperatura ambiente (3 min.)

    3. Agregar una gota de lugol y mantenga a temperatura ambiente durante 3 minutos.

    4. Lavar suavemente con agua destilada.

    5. Colocar un cubreobjetos y comprimir suavemente la preparacin con los dedos.

    6. Examinar la preparacin al microscopio con el objetivo 10x y seleccionar una zona en la que las

    clulas estn menos aglutinadas. Posteriormente examine con los objetivos 40x y 100x (aceite de

    inmersin), cerrando el diafragma hasta el mximo permitido por el foco luminoso.

    7. Identifique los distintos orgnulos celulares visibles. Los amiloplastos se observan como estructuras

    ovaladas y de tamao considerable, por lo general, muestran capas concntricas de crecimiento del

    grano, las cuales son muy variadas y especficas de cada especie de planta, fruto o semilla. En el pltano,

    los granos de almidn se tien de color violeta al reaccionar con el lugol.

    Observacin de Leucoplastos.

    El reactivo lugol, que se utiliza para observar estas estructuras, es a la vez una fijador (agente qu mico

    que destruye las clulas sin modificar su estructura) y un colorante de algunos tejidos vegetales

    (celulsicos, lignificados y suberificados), as como de sustancias de reserva (almidn), siendo de gran

    inters para el reconocimiento de diferentes especies vegetales, pues cada especie, dentro del mismo

    gnero, presenta distinta organizacin de los tejidos y almacena el almidn de forma diferente.

    De la papa se toma una porcin y se raspa con la punta de la lanceta. Se deposita el raspado sobre el

    portaobjetos y se aade una gota de agua y otra de lugol. Se coloca un cubre y se observa al

    microscopio.

    Los grnulos de almidn se tien de color azul-violeta intenso por el yodo. Se pueden observar las capas

    de crecimiento excntricas, que presentan los grnulos de almidn alrededor de un punto central.

    Segunda parte: Extraccin de mitocondrias Extraccin de mitocondrias a partir de tejidos ricos en mitocondrias, utilizando al menos de 3 a 5 gr. de

    tejido rico en mitocondrias (hgado, cerebro o gnadas maduras).

    1. Con un homogeneizador de aspas o vidrio, se homogeneza el tejido (3 a 5 gr., rico en mitocondrias)

    en dos volmenes de TEK (Tris-HCl 50 mM pH 7.5; EDTA 10 mM y KCl al 1.5%). Durante el

    homogeneizado mantenga la muestra en hielo y evite la formacin de espuma (caracterstica de un

    exceso de molido).

  • Biologa Celular y Molecular

    35 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    2. Centrifugue a 200 xg, por 5 min. a 4 C.

    3. Subyaciendo (es decir desde la parte de abajo) a la muestra agregue lentamente un volumen de TEK-

    15% sacarosa.

    4. Centrifugue (1,500 xg por 10 min. a 4C) y obtenga el precipitado (obscuro- ncleos) y el

    sobrenadante (claro- mitocondrias).

    5. Para concentrar el precipitado o el sobrenadante, por separado (no los revuelva), centrifugue a

    14,000 x g durante 1:30 hora a 4 C y elimine el sobrenadante.

    6. Resuspenda el precipitado con 10 ml de TEK y repita la centrifugacin a 14,000 xg por 30 minutos.

    7. En caso de que el sobrenadante este turbio o con pigmentos, repita el paso 6.

    9. Resuspenda el precipitado con TEK (mitocondrias en 0.9 ml por cada 5 gr. de teji do inicial) y conserve

    en congelador, correctamente etiquetado, posteriormente para observar los orgnelos en microscopio,

    tia con verde de malaquita, y para extraer ADN, utilice cualquiera de los protocolos.

    Recomendaciones para plasmar los resultados y su anlisis

    Describa en cada protocolo lo que sucede en cada paso.

    Analice cada uno de los pasos, con base en la informacin terica de la prctica, es decir interprete lo

    que se hace en cada paso.

    Con base en el anlisis, describa puntualmente lo que aprendi.

  • Biologa Celular y Molecular

    36 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Tercera parte: Respiracin

    Respiracin:

    1. Marque en una curva del tubo en forma de "S", una escala, utilizando un marcador y una regla.

    2. En una gradilla coloque tres tubos de ensayo y prepare el sistema, colocando el tubo S en un tapn,

    sellando cualquier posible fuga y en la curva lejana del tubo coloque unas gotas de colorante. Marque

    los tubos 1, 2, 3 y llnelos del siguiente modo:

    Tubo 1 = 1 ml de sacarosa (2% p/v)+ 1 ml de suspensin de levadura.

    Tubo 2 = 1 ml de galactosa (2% p/v)+ 1 ml de suspensin de levadura.

    Tubo 3 = 1 ml de agua + 1 ml de suspensin de levadura.

    2. Mezcle las soluciones. En cada tubo coloque el tapn horadado al cual previamente le coloco el tubo

    en forma de "S". El tapn debe quedar bien sellado con parafilm.

    Anote cualquier cambio que observe en la mezcla.

    El gas producido se acumular en el extremo cerrado del tubo "s". Registre el nivel del gas cada minuto

    por alrededor de 20 min. Anote los datos en una tabla.

    Recomendaciones para plasmar los resultados y su anlisis

    Describa en cada protocolo lo que sucede en cada paso.

    Analice cada uno de los pasos, con base en la informacin terica de la prctica, es decir interprete lo

    que se hace en cada paso.

  • Biologa Celular y Molecular

    37 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Las levaduras son procariotas o eucariotas?

    En qu partes de la clula de levadura ocurre la gluclisis?

    El tipo de carbohidrato fermentado afecta la tasa formacin de gas?

    Qu tipo de carbohidrato sustent la tasa ms rpida de fermentacin?

    Qu molcula es desdoblada en la reaccin que produce el CO2?

    Por qu es ventajoso para un organismo realizar fermentacin?

    Con base en el anlisis, describa puntualmente lo que aprendi.

    Complemento: Uso de los micropipeteadores automticos

    Materiales y equipos requeridos:

    Puntas de pipeteador automtico

    Pipeteas Pasteur

    Pipetas de diferentes medidas

    Minifuga

    Pipeteadores automticos

    Pistones para pipetas

    METODOLOGIA:

    Ejercicio a:

    - Deposite los siguientes volmenes (en microlitros):

    Tubo Solucin I

    (agua)

    Sol. II

    (aceite)

    Sol. III

    (alcohol)

    1 40 15 ---

    2 40 --- 40

    3 40 10 10

    - Centrifugue

    - Extraiga las fases y anote los volmenes recuperados.

  • Biologa Celular y Molecular

    38 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Ejercicio b:

    - Deposite en un trozo de papel aluminio los siguientes volmenes:

    Muestra Solucin I

    (agua)

    Sol. II

    (aceite)

    Sol. IV

    (colorante)

    1 4 --- 2

    2 4 4 2

    - Homogenece y solo coloque el agua con el colorante en el pozo del gel, en la muestra 2, tenga cuidado

    de no agregar aceite

    Ejercicio c:

    - Deposite los siguientes volmenes en un tubo (en microlitros):

    Tubo Solucin I

    (agua)

    Sol. II

    (aceite)

    Sol. III

    (alcohol)

    1 0.5 0.5 ---

    2 0.5 --- 0.5

    3 0.3 0.3 0.4

    - Centrifugue y extraiga el volumen completo, que en los tres ejercicios debe ser de 1 microlitro

    Ejercicio d:

    Para cada pipeteador:

    1.- En una balanza coloque un recipiente (acorde a los volmenes que posteriormente se manejaran)

    2.- Acorde al pipeteador, tome el menor volumen posible de agua destilada y coloque en el recipiente

    que tiene en la balanza, anote el resultado.

    3.- En eventos independientes, tome al menos 4 volmenes diferentes de agua destilada y colquelo en

    el recipiente que tiene en la balanza, anote el resultado.

    4.- Grafique el resultado para cada pipeteador, anotando el nmero de inventario del equipo.

  • Biologa Celular y Molecular

    39 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Con pipetas de gran volumen (mayor del mL)

    Para las siguientes sesiones prcticas tambin se requiere un dominio de las tcnicas de pipeteo de

    grandes volmenes, por lo que se plantean solo recomendaciones especficas:

    Nunca se aspire con la boca.

    No moje los pistones con los reactivos.

    Recomendaciones para plasmar los resultados y su anlisis

    Analice cada uno de los pasos, con base en la informacin terica de la prctica, es decir interprete lo

    que se hace en cada paso.

    Con base en el anlisis, describa puntualmente lo que aprendi.

  • Biologa Celular y Molecular

    40 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    PRCTICA 5: Observacin de clulas asociadas a la divisin celular

    INTRODUCCION:

    En una primera parte se busca promover el desarrollo de habilidades para la observacin de l os estadios

    de mitosis. Posteriormente la identificacin de clulas reproductivas de organismos dioicos.

    Para el reporte de prctica se recomienda investigar el marco de referencia terico de la sesin, as

    como la introduccin para el reporte, por parte del estudiante

    Informacin relacionada con el marco de referencia:

    Revise los estadios de la mitosis y meiosis, esquematcelos y resuma las caractersticas de cada estadio.

    OBJETIVO: Utilizando como herramienta el microscopio, reconocer morfolgicamente clulas que se

    encuentren en los diferentes estadios de divisin celular.

    Materiales y Equipos

    Estuche de diseccin

    Cubreobjetos

    Portaobjetos

    Vaso de precipitado de 50 ml

    Navaja

    laminillas

    Microscopio compuesto

    Termoplato

    METODOLOGIA:

    Primera parte: Examinando Clulas de Levadura 1.- Mezcle un poco de azcar en agua con levaduras y deje por unos 5 minutos la mezcla. Usando una

    pipeta Pasteur, transferir varias gotas de levaduras a un portaobjetos. Agregar una gota de rojo neutro y

    colocar el cubreobjetos. Usar aumento (40 X) para observar la levadura.

    2.- Bajo condiciones ptimas, las levaduras se multiplican por gemacin, que involucra un proceso en el

    citoplasma con un subsiguiente desprendimiento de una nueva clula. Busque en su preparado, clulas

    con yemas.

  • Biologa Celular y Molecular

    41 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Segunda parte: Observacin de mitosis Al menos una semana antes de la sesin, escoja una cebolla fresca de 5 a 7 cm de dimetro. Quite las

    races y fibras secas de la base del bulbo.

    1. Inserte 3 palillos de forma que la cebolla se pueda suspender en un vaso o recipiente con agua, de tal

    forma que las races toquen continuamente el agua.

    2. Procedimiento de tincin:

    a. Elija de la cebolla una o varias races completa. La regin de mayor inters es la apical (zona de

    crecimiento).

    b. Con la hoja de afeitar de un solo filo corte la mitad inferior de la punta de una raz. Pngala en un vaso

    pequeo y cbrala con colorante de acetocarmin. Caliente paulatinamente el vaso con el colorante de 3

    a 5 minutos, evitando que el lquido hierva.

    c. Corte la parte ms intensamente teida de la punta de la raz y colquela en un portaobjetos,

    agregndole una gota de acetocarmin. Corte la raz en pequeos trozos y cbrala con un portaobjetos.

    Coloque papel absorbente sobre la preparacin y con el borrador de un lpiz presione firmemente, para

    convertir el material en una capa delgada, evitando resbale el cubreobjetos. Limpie el exceso de

    colorante con papel.

    d. Localice en la preparacin a las clulas que presenten estructuras filamentosas teidas ms

    intensamente.

    e. Localice y esquematice una clula que se encuentre en: a) Interfase. b) Profase. c) Metafase. d)

    Anafase. e) Telofase. Preste especial atencin en la forma y disposicin de los cromosomas.

    Considerando que la mayora de las clulas que se observen estarn en interfase, se recomienda ser

    persistente en la bsqueda de los diferentes estadios de la mitosis.

    Recomendaciones para plasmar los resultados y su anlisis

    Analice cada uno de los pasos, con base en la informacin terica de la prctica, es decir i nterprete lo

    que se hace en cada paso. Esquematice lo observado en el microscopio. Con base en el anlisis, describa

    puntualmente lo que aprendi.

    Tercera parte: Meiosis OBJETIVO: Identificar clulas gamticas y en diferentes estadios meiticos

    Material y equipos:

    Muestras de esperma

    tubos cnicos de centrfuga de 15 mL

  • Biologa Celular y Molecular

    42 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    pipetas Pasteur con bulbo.

    pipetas graduadas de 5 mL

    caja de Petri

    Porta y cubre objetos

    Estuche de diseccin

    Solucin Wright

    Fijador "buffer"

    Aceite de inmersin

    Preparaciones permanentes de diferentes tejidos gamticos

    Microscopio

    METODOLOGIA:

    NOTA IMPORTANTE PARA LA PRACTICA SE TENDRAN DISPONIBLES LAMINILLAS DE GONADAS DE

    DIFERENTES TIPOS DE ORGANISMOS NO SERA NECESARIO SACRIFICAR A UN ORGANISMO

    Por otro lado, ser muy interesante contar con donadores de esperma para observar los espermas en

    vivo

    Observacin de espermas en vivo

    1. A partir de la muestra donada, tome una gota de semen y depostelo en un portaobjetos.

    2. Coloque un cubreobjetos y observe con los menores aumentos, utilizando la menor cantidad de luz

    posible.

    3. Observe las clulas, con el mayor aumento de 100x utilizando adecuadamente el aceite mineral, la

    iluminacin Klher y optimizando la iluminacin,

    4. Esquematice lo observado.

    Tincin Wright

    Preparacin de laminillas

    1. Con una pipeta Pasteur tomar una muestra de esperma y colocar una gota en un extremo de un

    portaobjetos.

  • Biologa Celular y Molecular

    43 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    2. Con el extremo de un segundo portaobjetos distribuir la muestra de manera homognea a manera de

    frotis, repartiendo lo mejor posible la muestra.

    3. Agregar 3 gotas de solucin Wright y cubriendo el portaobjetos en el interior de una caja Petri.

    4. Esperar 5 minutos

    5. Agregar 3 gotas del fijador "bfer".

    6. Esperar 7 minutos.

    7. Lavar con agua destilada.

    8. Secar al aire.

    9. Observar al microscopio

    Observacin de laminillas

    1. Observe el tejido utilizando los menores aumentos, hasta localizar zonas donde se puedan identificar

    claramente a las clulas.

    2. Incremente el aumento hasta 100x utilizando adecuadamente el aceite mineral.

    3. Utilizando la iluminacin Klher y optimizando la iluminacin, observe las clulas, procurando

    identificar orgnelos internos, especialmente del sistema de membranas.

    4. Esquematice sus observaciones, indicando los datos de la laminilla y tcnica de tincin.

    No se olvide utilizar ampliamente el sistema de iluminacin as como los campos de poca y gran

    profundidad, as como el uso del micrmetro para el adecuado enfoque por cada campo.

    Observacin de laminillas

    1. En cada una de las laminillas procure reconocer los diferentes tipos de gametos. Utilice el microscopio

    a 100x.

    Recomendaciones para plasmar los resultados y su anlisis

    Esquematice sus observaciones e intrprete lo observado.

  • Biologa Celular y Molecular

    44 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    PRCTICA 6: Tecnologa de ADN

    INTRODUCCION: En una primera parte se practicaran diversos protocolos de extraccin de ADN para posteriormente

    evaluar su calidad y cantidad utilizando mtodos electroforticos. Con el objetivo de buscar la mayor

    racionalizacin en las actividades que se desarrollaran se explican los pasos de las metodologas que se

    utilizarn.

    Para el reporte de prctica se recomienda investigar el marco de referencia terico de la sesin, as

    como la introduccin para el reporte, por parte del estudiante

    Generalidades de los protocolos.

    El primer paso de los mtodos moleculares, aplicados a los estudios poblacionales es la extraccin del

    ADN. En la extraccin de cidos nuclecos, existen cinco etapas principales: 1) conservacin de tejidos, 2)

    homogenizacin de tejidos, 3) degradacin y eliminacin de compuestos orgnicos diferentes al ADN o

    ARN, 4) precipitacin de los cidos nucleicos y 5) resuspensin y conservacin.

    Conservacin

    Para la conservacin de tejidos existen diversas alternativas, las cuales son utilizadas de acuerdo a las

    condiciones especficas de trabajo. La tcnica de mayor eficacia es la de crio-conservacin en nitrgeno

    lquido, pero lamentablemente es la que presenta una mayor dificultad en su aplicacin, ya que son

    requeridos recipientes especiales y facilidades para la adquisicin del nitrgeno lquido.

    Una alternativa fcil de aplicar en cualquier lugar de Mxico, es la combinacin entre el uso de Hielo

    seco (dixido de carbono comprimido), para el transporte de muestras hasta el laboratorio y la

    conservacin en ultracongelador a temperaturas menores de -70 C. Con el hielo seco tambin se

    pueden congelar rpidamente las muestras, ya que al ponerlo en contacto con alcohol o ter, disminuye

    notablemente la temperatura y para proteccin de las muestras solo se requieren utilizar bolsas de

    plstico. En trabajo de campo, se recomienda poner en una bolsa de plstico a la muestra, la cual se

    introduce en otra bolsa, a la que se le agrega el hielo seco y el alcohol, resultando una reaccin

    inmediata que literalmente congela a la muestra.

    Otras alternativas, incluyen el uso de etanol, con el que se deshidrata rpidamente la muestra, o

    soluciones hipersalinas con DMSO al 20% y en casos especiales la deshidratacin con el sol as como con

    otros agentes castrantes de la humedad.

  • Biologa Celular y Molecular

    45 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Homogenizacin

    Para facilitar la degradacin de los tejidos, sin daar los cidos nucleicos, podemos combinar el uso de

    mtodos fsicos con los qumicos. El ms eficiente de los mtodos fsicos, involucra la congelacin de la

    muestra y su posterior macerado en un mortero precongelado. La congelacin ms recomendable se

    logra con nitrgeno lquido y como mtodo alternativo, con el uso de hielo seco y etanol.

    Debido a las dificultades operativas de estas tcnicas, es posible utilizar homogeneizadores de vidrio

    (Potter Elvehjen) y lo ms comn, es el macerado con una navaja sobre una superficie slida, como

    podra ser un portaobjetos.

    Posteriormente se aplican mtodos de homogenizado qumico, con detergentes (para desnaturalizar los

    lpidos) y enzimas que facilitan la degradacin de las protenas (como proteinza K). Con soluciones

    amortiguadoras se mantienen las condiciones salinas (con KCl 1 mM) y de pH neutro en la muestra (Tris-

    HCl, 0.25mM, pH 7.8 a 8.0). Adicionalmente se agrega EDTA (0.02 a 1.0 mM), como agente castrante de

    los iones magnesio y calcio, requeridos para la accin de las exonucleasas que degradan los cidos

    nucleicos.

    Para garantizar una adecuada reaccin, los tejidos macerados, se colocan en tubos de 1.5 ml, con el

    amortiguador (TES, TEK o TEN), el detergente (comnmente SDS al 0.2 % u otros detergentes no inicos

    como el IGEPAL) y protenas K, posteriormente se tapan hermticamente y se mantienen en agitacin

    constante, con temperaturas desde la ambiental (TA) hasta los 65 C. Cabe aclarar que el tiempo de

    digestin qumica, vara dependiendo de la naturaleza del tejido y la tcnica de conservacin,

    ocupndose desde una hasta veinticuatro horas. Los tiempos y cantidades de reactivos se deben

    estandarizar, buscando evitar la sobre digestin por efecto de las exonucleasas.

    Otros agentes utilizados en el homogenizado qumico son la albumina (al 0.5% para remover cidos y

    fosfolpidos), sorbitol o manitol (balance inico), carbonato de sodio (controlar la concentracin de

    sales), sacarosa (mantener la densidad del medio).

  • Biologa Celular y Molecular

    46 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Degradacin y eliminacin de compuestos orgnicos

    Para la degradacin de los compuestos orgnicos, generalmente se utiliza fenol estabilizado, cloroformo

    estabilizado con alcohol isomlico o cloroformo. Dependiendo de la tcnica de conservacin as como

    de las condiciones y tipo de tejido, se elige la tcnica ms adecuada. Para la eliminacin de los

    compuestos, en cada paso se utilizan tcnicas de centrifugacin, con velocidades superiores a 10,000 xg

    con tiempos superiores a los 5 minutos.

    Precipitacin de los cidos nucleicos

    Despus de la eliminacin de los compuestos orgnicos, en solucin quedan los cidos nucleicos, debido

    a su alto gradiente de sedimentacin en agua (o en el amortiguador). Para precipitarlos, a la solucin se

    le incrementa notablemente la salinidad (con acetato o cloruro de sodio) y se le agrega alcohol y

    posteriormente es centrifugado en velocidades superiores a 10,000 xg por ms de 10 minutos.

    Cabe aclarar, que comnmente son utilizados dos tipos de alcohol, el etanol y el isopropanol. Con

    etanol, se necesita facilitar la precipitacin utilizando temperaturas bajas por largos periodos (la noche a

    -20 C o una hora a -70 C). En algunos casos, pueden requerirse sucesivos lavados con alcohol, para

    eliminar las sales.

    Una vez formado el precipitado (el cual puede no observarse a simple vista), se elimina el alcohol, por

    centrifugacin, decantacin y evaporacin. El precipitado de los cidos nucleicos, en caso de que se

    observe, pasara de un color blanquecino, cuando est hmedo, a uno semi transparente, cuando est

    totalmente seco. Es importante eliminar totalmente el alcohol y las sales, ya que pueden interferir con

    las reacciones posteriores.

    Resuspensin y conservacin

    Para la resuspensin, es prudente considerar el uso que se le dar al ADN. En el caso de requerir la

    muestra por unos cuantos das, para PCR (reaccin de polimerasas en cadena, por sus siglas en ingles), el

    precipitado obtenido previamente puede resuspenderse en agua que preferentemente haya sido

    destilada, desionizada, nanopurificada y esterilizada (H20ddue).

    Para un aplicacin general se conserva en TE y en algunos casos es recomendable agregarle enzimas que

    degraden el ARN, como la ARNaza. La posterior conservacin se realiza a bajas temperaturas, como la de

    -20 C cuando se utilizara en las siguientes semanas, o a -80 C para mantenerla por meses o incluso

    aos.

    Los protocolos especficos para la extraccin del ADN dependern de las muestras y costos de extraccin

    permisibles (en tiempo y esfuerzo), que van desde unos cuantos pesos hasta decenas de pesos. En el

    primer caso, con costos muy bajos, encontramos las tcnicas de extraccin fenlica o de cloroformo que

    requieren al menos unas 4 horas de dedicacin.

  • Biologa Celular y Molecular

    47 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    En el mercado existen juegos comerciales, con un costo de alrededor de 3 a 6 veces el equivalente al de

    una extraccin convencional, pero que requieren generalmente una hora de trabajo en laboratorio y

    generalmente con una mayor garanta de reproducibilidad.

    Generalidades de la electroforesis

    La electroforesis es el movimiento de partculas elctricamente cargadas a travs de un gas o lquido

    como resultado de un campo elctrico formado entre unos electrodos sumergidos en el medio. En

    nuestro caso, la tcnica se aplica para la separacin por tamao de los fragmentos en l os cidos

    nucleicos. Por efecto de la corriente elctrica directa, las molculas se mueven a travs de una matriz

    inerte (de polmetros de agarosa o acrilamida), que se encuentra en un amortiguador, todos estos

    durante un tiempo determinado.

    Considerando las caractersticas de las muestras, son diversas las variables que intervienen en la

    electroforesis y que es necesario controlar. Las principales a considerar son: caractersticas de la

    muestra, corriente elctrica (Volts, Watts y Amperes), amortiguador, matriz (tipo y concentracin) y

    otros reactivos.- al final de la pgina, se presenta una mayor explicacin.

    Descripcin de la electroforesis

    La electroforesis es el movimiento de partculas elctricamente cargadas a travs de un gas o lquido

    como resultado de un campo elctrico formado entre unos electrodos sumergidos en el medio. En

    nuestro caso, la tcnica se aplica para la separacin por tamao de los fragmentos en los cidos

    nucleicos. Por efecto de la corriente elctrica directa, las molculas se mueven a travs de una matriz

    inerte (de polmetros de agarosa o acrilamida), que se encuentra en un amortiguador, todo esto durante

    un tiempo determinado.

  • Biologa Celular y Molecular

    48 Nombre del profesor Dr. Faustino Camarena Rosales

    Considerando las caractersticas de las muestras, son diversas las variables que intervienen en la

    electroforesis y que es necesario controlar. Las principales a considerar son: caractersticas de la

    muestra, corriente elctrica (Volts, Watts y Amperes), amortiguador, matriz (tipo y concentracin) y

    otros reactivos.

    Caractersticas de la muestra

    Previo a la realizacin de una electroforesis, se debe tener una idea del tamao de los fragmentos, para

    tomar adecuadas decisiones en las variables a controlar. La informacin requerida es mnima y puede

    ser subjetiva, separando los tamaos de las molculas en tres categoras simples:

    Tamaos grandes, fragmentos mayores de 2,000 pares de bases (pb)

    Tamaos medianos, de entre 500 y 5,000 pb

    Tamaos pequeos, menores de 1,000 pb

    Corriente elctrica

    Las tres variables a considerar