Asignatura: Laboratorio Clínico en Microbiología (Curso 2007 – 2008) Facultad de Biología (Licenciatura en Bioquímica)

LA INFORMÁTICA EN EL LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA. RECURSOS INFORMÁTICOS PARA LA ORGANIZACIÓN DEL LABORATORIO

Y EMISIÓN DE RESULTADOS

TEMA 15

CONCEPTOS Informática: Conjunto de conocimientos científicos y técnicas que hacen posible el tratamiento automático de la información mediante ordenadores. (R.A.E.)

Software: Conjunto de programas, instrucciones y reglas informáticas para ejecutar ciertas tareas en una computadora. (R.A.E.)

Programa: Conjunto unitario de instrucciones que permite a un ordenador realizar funciones diversas, como el tratamiento de textos, el diseño gráfico, la resolución de problemas matemáticos, el manejo de bancos de datos, etc. (R.A.E.)

Ordenador: Máquina electrónica, dotada de memoria de gran capacidad y de métodos de tratamiento de la información, que puede resolver problemas aritméticos y lógicos gracias a la utilización de software registrado en ella. (R.A.E.)

Microbiología e Informática: RECURSOS

► Aplicaciones informáticas de uso general

► Redes de comunicación. Internet y sus aplicaciones

► Aplicaciones específicas en microbiología clínica: Gestión de la información

► Otros recursos de interés

►  Procesadores de texto ►  Hojas de cálculo ►  Gestores de bases de datos ►  Editores de páginas “web” ►  Programas de presentación ►  Editores de imágenes

APLICACIONES INFORMÁTICAS DE USO GENERAL

►  Lectores de archivos ►  Reconocimiento óptico de

caracteres (OCR) ►  Reconocimiento de voz ►  Paquetes estadísticos ►  Otras ..........

PROCESADORES DE TEXTO

CARACTERÍSTICAS:

  Crear, editar, componer, almacenar, modificar e imprimir textos digitales: Cortar, copiar, pegar, vincular, buscar, reemplazar, etc.

  Diferentes formatos: Párrafo, fuentes, bordes y sombreados, tabulaciones, columnas, tablas, etc.

  Visualización de páginas: Diferentes diseños, marcas, presen-taciones preliminares, etc.

  Inserción de elementos: Campos, imágenes, símbolos, objetos, etc.

 Otras herramientas: Correctores ortográficos y/o gramaticales, dic-cionarios multilingües y/o de sinónimos etc.

Ejemplos: Word (Microsoft); Wordperfect (Corel); Wordpro (Lotus Smartsuite); Write (OpenOffice); ….

HOJAS DE CÁLCULO

CARACTERÍSTICAS:

Ejemplos: Excel (Microsoft); Lotus 1, 2 3 (Lotus Smartsuite); QuatroPro (Corel); Calc (OpenOffice); …

 Manejar, números y textos, en forma de tablas y en campos de información: Establece relaciones entre ellos.

  Campos de información: Celdas, (intersección de filas y columnas), que componen la hoja.

  Pueden realizar cálculos con funciones y/o fórmulas: Matemá-ticas, estadísticas, de búsqueda, lógicas, etc.

  Crear gráficas: Con los datos almacenados o calculados, así como rectas de regresión y/o ajuste, etc.

 Otras herramientas: Muchas de las de los procesadores de texto.

GESTORES DE BASES DE DATOS

CARACTERÍSTICAS:  Gestionar datos: Administrar conjuntos de información relacionada

(base de datos), almacenada, actualizada y estructurada, pudiendo ser manipulada y analizada por el propio programa o por otros.

  Datos: Almacenados en tablas de diferentes tipos y, cada tabla se compone de registros y cada registro de campos.

  Formato: Gráfico en pantalla; impreso y digital en salida.   Búsquedas: Existe la posibilidad de filtros.   Cálculos: Existe la posibilidad de cálculos sencillos.  Otros herramientas: Muchas de los procesadores de textos y de las

hojas electrónicas.   Tipos de bases de datos : Según variabilidad, contenido y modelo.

Ejemplos: Oracle (Oracle); Acces (Microsoft); File Maker (File maker); Progress (Progress software); End Note (Thomson); ….

TIPOS DE BASES DE DATOS

Según variabilidad: Estáticas: De sólo lectura. Dinámicas: Permite ser actualizada en el tiempo.

Según contenido: Bibliográficas: Contiene representación de fuente primaria. De texto completo: Almacena fuentes primarias. Directorios: Como las guías telefónicas. Multimedia: Imágenes, audios, videos, etc. De información biológica: Información de ciencias biológicas o médicas

Según modelo: Jerárquicas: Organizadas en forma de árbol (nodos primarios y secundarios) De red: Un mismo nodo primario puede tener varios primarios. Relacional: Utiliza relaciones entre campos de datos. Orientadas a objetos: Almacena los objetos completos. Documentales: Indexación a texto completo. Deductivas: Permite hacer deducciones a través de inferencias. Distribuidas: Almacenan datos en diferentes computadores en red.

PROGRAMAS DE PRESENTACIONES

CARACTERÍSTICAS:  Organizar, ilustrar y distribuir ideas de forma clara y sen-

cilla: En pantalla o en forma de diapositivas, transparencias, carteles o pósters.

  Posibilita: Animaciones, autoformatos, autoajustes de texto, di-seños de tablas, publicaciones en “web”, combinaciones de colores etc.

 Otras herramientas: Muchas de las propias de los procesa-dores de textos, hojas electrónicas y editores de imagen.

Ejemplos: Powerpoint (Microsoft); Freelance Graphics (Lotus); Corel Presentations (Corel); Harvard Graphics (Harvard Graphics); ….

EDITORES DE PÁGINAS “WEB”

CARACTERÍSTICAS:

  Crear y editar documentos de hipertexto: Utilizan lenguaje HTML (HyperText Markup Language) visible en internet.

  Lenguaje HTML: Lenguaje que estructura documentos en forma de etiquetas, compatible y de fácil aprendizaje que crea docu-mentos atractivos con hiperenlaces, imágenes, etc.

  Tecnología: WYSIWYG (“What You See Is What You Get” ó “Lo que ves es lo que obtienes”)

 Otras herramientas: Correctores ortográficos, gramaticales, y otras propias de procesadores de textos.

Ejemplos: Frontpage (Microsoft); Dreamweawer (Macromedia); Hot Metal (Softquad); ….

EDICIÓN DE IMÁGENES

CARACTERÍSTICAS:

  Visualización y edición de imágenes, cambiar formatos de éstas, hacer composiciones, retoques, etc.

  Recursos gráficos: Añadir texto a las composiciones, herra-mientas de dibujo, seleccionar y editar partes de una imagen, cambiar de posición una imagen, cambiar tamaño de imagen, cambiar colores, creación de diferentes formatos, etc.

 Otras herramientas: Creación y superposición de capas y máscaras de capa, .

Ejemplos: Photoshop (Adobe); Gimp (Gimp); ….

LECTORES DE ARCHIVOS

CARACTERÍSTICAS:   Visualizar, imprimir y navegar por textos e imágenes:

Ficheros en formato PDF (Portable Document Format) que se presentan en pantalla de manera idéntica que en el documento impreso.   Cualquier persona en cualquier lugar puede abrir un archivo PDF. Sólo es

necesario tener el software gratuito Adobe Reader. Pueden firmarse digitalmente.

  El formato PDF de Adobe permite la redistribución del texto y/o imágenes para que se muestre correctamente en plataformas portátiles, como los dispositivos Palm OS, Symbian y Pocket PC.

  Se pueden descargar: Artículos de revistas, impresos, libros electrónicos y formularios de solicitudes y proyectos..

 Otras herramientas: Algunos programas admiten también la edición de archivos en PDF , crear formularios, etc.

Ejemplos: Acrobat Reader (Adobe) que es sólo lector; Acrobat (Adobe) que es también editor.

RECONOCEDORES ÓPTICOS DE CARACTERES (OCR)

CARACTERÍSTICAS:   Extraer: De una imagen escaneada los caracteres que

componen un texto para almacenarlos en un formato (ASCII o Unicode) con el que puedan interactuar procesadores de textos. Transforma documentos impresos en digitales.

  Los OCR (Optical Character Recognition): En la actualidad, junto al texto, registran y almacenan el formato en el que se escribió el texto.

 Otras herramientas: Algunos programas (OCR) admiten también la edición de archivos en PDF y buen reconocimiento de tablas y los OMR (Optical Mark Recognition) útiles para el reconocimiento de marcas.

Ejemplos: OmniPage (Scan Soft); TextBrige (Scan Soft) ABBYY Fine Reader (Abbyy); ….

RECONOCEDORES DE VOZ

CARACTERÍSTICAS:   Comunicar, mediante la voz, directamente al usuario con el

ordenador sin necesidad de ningún soporte intermedio de comunicación.

  Niveles de reconocimiento: Después de entrenamiento llega a ser superior al 95%, llega a reconocer cerca de 160 palabras por minuto.

 Otras herramientas: Control de sistemas operativos y diversos programas de utilidad.

  Son prácticos para: Los que no saben escribir bien a máquina o los que tienen algún impedimento físico y porque deja libres las manos para utilizarlas en otra cosa.

Ejemplos: Dragon Naturally Speakimg (Scan Soft); Via Voice (IBM); Free Speech (Philips); ….

PAQUETES ESTADÍSTICOS

CARACTERÍSTICAS:   Definición: Son un conjunto de programas informáticos

específicamente diseñados para el análisis estadístico de datos con el objetivo de resolver problemas de estadística descriptiva, inferencial o ambos

  Permiten: Aplicar a un mismo fichero de datos un conjunto ilimitado de procedimientos estadísticos de manera sincronizada, sin salir del programa.

 Otras características: Requieren un cierto nivel de conoci-mientos de estadística.

Ejemplos: SPSS (SPSS); Gauss (Aptech); Mathematica (Wolfrand Research); ….

OTRAS

 PROGRAMAS PARA LA CREACIÓN DE ETIQUETAS. De código de barras, de código difuso…..

 PROTOCOLOS DE COMUNICACIONES. Ponen en contacto los autoanalizadores con el servidor central y vuelcan en este los datos generados por aquellos.

 ETC. ……..