Slide 1Canan KÜLAH
Kinolon Dirençli
Sularnda Direnç Genlerinin Aratrlmas
Direnç mekanizmalar
E.coli OmpF, OmpC
Plazmid aracl direnç aktarm
3
Hawkey PM. Mechanisms of quinolone action and microbial response. JAC 2003,51 Suppl S1: S29–35,
Jacoby AG. Mechanisms of resistance to quinolones. CID 2005; 41:S120–6
Li XZ. Quinolone resistance in bacteria: emphasis on plasmid-mediated mechanisms. Int J Antimicrob Agents 2005, 25: 453-463
Direnç mekanizmalar
parC
parE
4
Hawkey PM. Mechanisms of quinolone action and microbial response. JAC 2003,51 Suppl S1: S29–35,
Jacoby AG. Mechanisms of resistance to quinolones. CID 2005; 41:S120–6
Direnç mekanizmalar
qnrA
qnrS
qnrB
qnrC
qnrD
Is plasmid-mediated quinolone resistance a clinically significant problem?
CMI 2008; 14: 295–297
Çalmann amac
Kinolon direnç oranlarnn belirlenmesi
gyrA ve parC mutasyonlarnn
qnrS ve aac(6’)-Ib varlnn aratrlmas
7
508 Escherichia coli
120 Klebsiella spp.
Kültür ve bakteri tanmlamas
BBL Crystal Identification Systems E/NF (Becton Dickinson, ABD)
Murray PR. Manual of Clinical Microbiology. Vol. 1. 2003, 8th ed. ASM Press, Washington, DC
Antibiyotik Duyarllk Testleri
Disk Difüzyon Yöntemi
Agar Dilüsyon Yöntemi
Antibiyotik MK (µg/ml)
-CLSI. Methods for dilution antimicrobial susceptibility test for bacteria that grow aerobically;
Approved Standard 7th ed. M7-A7. 2006.
GSBL Üretiminin Gösterilmesi
Çift disk sinerji yöntemi
Jarlier V, Nicolas MH, Fournier G, Philippon A: Rev Inf Dis;10: 867. 1988
DNA eldesi ve çoaltlmas
qnrA 5`-atttctcacgccaggatttg-3` 5`-gatcggcaaaggttaggtca-3` 516
qnrB 5`-gatcgtgaaagccagaaagg-3' 5`-acgatgcctggtagttgtcc-3 469
qnrS 5`-acgacattcgtcaactgcaa-3' 5`-taaattggcaccctgtaggc-3 417
aac(6’)-Ib 5'-ttgcgatgctctatgagtggcta-3' 5'-ctcgaatgcctggcgtgttt-3' 482
parE 5'-tacaccggtcaacattgagg-3' 5'-ttaatattgccgccgtcgg-3' 648
parC 5'-aaacctgttcagcgccgcatt-3' 5'-gtggtgccgttaagcaaa-3' 395
Robicsek A, Strahilevitz J, Sahm D.F, Jacoby G.A, Hooper D.C. AAC, 50: 2872–74. 2006
Park C.H, Robicsek A, Jacoby G.A, Sahm D, and Hooper D.C. AAC, 50: 3953-3955, 2006
Saenz Y, Zarazaga M, Brinas L, Ruiz-Larrea F, Torres C.. JAC, 51:1001-1005, 2003
Vila J, Ruiz J, Goni P, Jimenez de Anta MT. AAC, 40: 491-493, 1996
Nükleik asit dizileme
TÜBTAK MAM GMBE de yapld
lgili kodonlarda mutasyonlarn varl, standart
dizilerle karlatrlmak suretiyle saptand
Hall TA. BioEdit: a user-friendly biological sequence lignment editor and analysis program
for Windows 95/98/NT. Nucl Acids Symp, 41: 95-98,1999.
BLAST. National Center for Biotechnology Information. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST
statistiksel Analiz
Tanmlayc istatistikler say ve yüzde olarak ifade edildi
Kategorik yapdaki deikenler bakmndan gruplar aras
farkllklar Ki-kare testi ile incelendi
Sonuçlar %95 güven aralnda deerlendirildi
p<0.05 deeri anlaml kabul edildi.
BULGULAR
BULGULAR
Nalidiksik aside dirençli/orta duyarl olan izolatlar, ampisilin
amoksisilin/klavulonik asit
sefuroksim
sefoksitin
gentamisin
tobramisin
amikasin
trimetoprim-
16
BULGULAR
parC; ….
Ser80Ile
µg/ml
QRDR
BULGULAR
yüksek bulundu
18
BULGULAR
19
TARTIMA
TARTIMA
TARTIMA
Eraç B, Gill A, Amyes SGB, Gülay Z.
Siprofloksasine dirençli Escherichia coli sularnda Gyr A
mutasyonlarnn incelenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, 37: 125-130, 2003.
8 izolat; Ser-83-Leu ve Asp-87-Tyr veya Asp-87-Asn
Güven Ö.
tayclnn ve direnç mekanizmalarnn saptanmas.
stanbul Üniversitesi Salk Bilimleri Enstitüsü, Yüksek Lisans Tezi, 2007.
6 izolat; gyrA Ser-83-Leu ve Asp-87-Asn
par C Ser-80-Ile ve Ser-83-Tyr
ve elik eden Glu84Gly veya Glu84Val
TARTIMA
Ser80Ile
skln arttryor
Belirlenen aac(6’)-Ib lerin %58-92’si aac(6’)-Ib-cr
Robicsek A, Strahilevitz J, Jacoby G.A, Macielag M, Abbanat D, Bush K, and Hooper D.C. Fluoroquinolone modifying enzyme: a novel
adaptation of a common aminoglycoside acetyltransferase. Nature Medicine. 12: 83-88, 2006. 24
TARTIMA
Poirel L, Gür D, Minarini L, Arslan U, Nordmann P.
Molecular epidemiology of plasmid mediated quinolone resistance determinants in extended spectrum
beta-lactamase producing E.coli and K.pneumoniae isolates from Turkey,
18th European Congres of Cilinical Microbiology and Infectious Diseases, P1527, Barcelona (2008).
GSBL üreten 50 izolatta 39 aac(6’)-Ib-cr (+)
Bu çalmada;
çalmalar Nazik H, Öngen B. ANKEM Derg 2010;24(1):46-54
SONUÇ
ilimizde E.coli ve Klebsiella spp. kaynakl infeksiyonlarn
ampirik tedavisinde güvenilir olmad
olduu gösterilmitir
qnrA, qnrB, qnrS pozitif kontrol sularn temin ettii için
teekkür ederiz
tarafndan (Proje No: 2009-20-01-14) desteklenmitir