icios y el Deportivo Municipal[editar]

Jefferson, nació en el distrito de Villa El Salvador, Lima. Pariente de los también futbolistas Roberto "La Foca" Farfán, Rafael "Focaza" Farfán (por lado paterno) yLuis "Cuto" Guadalupe (por lado materno) —quienes integraron alguna vez la selección nacional de fútbol del Perú—. Comenzó en las divisiones menores en elDeportivo Municipal 4 5 6

Alianza Lima[editar]

En 1999, fue vendido al Club Alianza Lima con sólo 14 años de edad en una módica suma. Es en el equipo blanquiazul donde debutó en Primera División, hecho que se dio el 28 de julio del 2001, cuando Farfán tenía 16 años, en un partido disputado ante el Deportivo Wanka.

En 2001, jugó para la selección peruana en las categorías menores, ganando así los XIV Juegos Bolivarianos que se diputaron en Ecuador.

A partir del 2002, fue titular indiscutible en Alianza, siendo nombrado como el jugador revelación del año. Al año siguiente fue considerado el mejor jugador del campeonato y llevó a su equipo al título anotando el gol decisivo en tiempo suplementario en la final ante Sporting Cristal. En el 2004, sólo jugó la primera mitad del año para Alianza, anotando 14 goles y ayudando de esta manera a conseguir el Torneo Apertura. .

PSV Eindhoven[editar]

En junio del 2004, pasó al PSV Eindhoven por una cifra que ascendió a 1.8 millones de euros, firmando un contrato hasta el 2010. Con el PSV marcó goles importantes tanto en la liga holandesa como en la UEFA Champions League, llegando hasta las semifinales en la temporada 2004/2005. En la temporada 2006/07, salió goleador de su club y, una vez más, elegido el jugador más querido por la fanaticada tulipán. Luego de eso, estuvo a un paso de firmar por los clubes ingleses Chelsea o Portsmouth, aunque ello finalmente no se produjo. A lo largo de las cuatro temporadas que Farfán estuvo en el PSV, logró anotar 67 goles.

A mediados de 2008, luego de obtener el tetracampeonato con el PSV, el cuadro holandés llegó a un acuerdo con el Schalke 04 para venderlo, acuerdo que ascendió a los 17 millones de euros aproximadamente.

Schalke 04[editar]

El 10 de junio de 2008, el Schalke 04 confirmó oficialmente el traslado. Farfán firmó por cuatro temporadas con el club alemán.7

Es considerado uno de los mejores jugadores del Schalke 8 y también uno de los más queridos por los hinchas. A lo largo de su trayectoria en el club alemán, Jefferson ha anotado importantes goles dándole la victoria a su equipo en muchas ocasiones.

En marzo de 2011, anotó dos goles ante el Valencia por la Champions League 2010/11, propiciando que el Schalke 04 acceda a cuartos de final.

Pero el gol que él mismo considera como uno de los mejores de su carrera,9 y que le valió el apelativo de "cohete", tuvo lugar en un encuentro contra el Bayer Leverkusen, el 23 de

octubre de 2011. En el minuto 82', se robó una pelota cerca del área del Schalke y recorrió a gran velocidad casi todo el campo para definir luego de pierna derecha. La prensa alemana se rindió ante este tanto calificando de "supervelocista" a Farfán por su corrida de 80 metros en 10 segundos.10

En el 2011, crecieron rumores sobre el posible traslado de Farfán a un club español, en vista que su contrato vencía en 2012.11 Ante esto, los hinchas reaccionaron pidiéndole que se quede. Incluso, llegaron a hacerle un video en el que le piden que no deje el club.12 Sin embargo, las negociaciones para una extensión del contrato no han progresado. Según una última encuesta hecha por transfermarkt, Farfán se encuentra en el puesto N°13 de jugadores más caros de la Bundesliga, siendo el latino más caro, encima de jugadores como Lucas Barrios, o su compatriota Claudio Pizarro. 13

En el 2013 ‘La Foquita’ cerró una temporada más que buena con el FC Schalke 04. El equipo azul venció 2-1 de visita al SC Friburgo y clasificó a la fase previa de la Champions League 2013-14 2013-2014 tras terminar en el cuarto lugar de la Bundesliga.14