Grupo de Computación Científica y Programación Paralela ...

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Composici´on Computaci´oncient´ ıfica ıneas de trabajo Trabajos en desarrollo y en planificaci´on Grupo de Computaci´ on Cient´ ıfica y Programaci´ on Paralela Universidad de Murcia http://www.um.es/pcgum/ Presentaci´onL´ ıneas de Investigaci´on, M´ aster de Bioinform´ atica, Universidad de Murcia, noviembre 2013

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Composicion Computacion cientıfica Lıneas de trabajo Trabajos en desarrollo y en planificacion

Grupo de Computacion Cientıfica y ProgramacionParalela

Universidad de Murcia

http://www.um.es/pcgum/

Presentacion Lıneas de Investigacion, Master de Bioinformatica, Universidad de Murcia, noviembre 2013

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Contenidos

1 Composicion

2 Computacion cientıfica

3 Lıneas de trabajo

4 Trabajos en desarrollo y en planificacion

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6 doctores + 4 no doctores

Doctores Universidad de Murcia 3

Doctores Universidad Miguel Hernandez 2

Doctores Universidad Politecnica de Cartagena 1

Haciendo tesis doctoral 3

Haciendo tesis de master (informatica) 4

Haciendo proyecto fin de grado 1

Publicaciones: http://dis.um.es/~domingo/investigacion.html

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Computacion cientıfica: integracion de modelos con tecnicascomputacionales para solucion de problemas complejos, congrandes volumenes de datos y/o necesidades de computacion.

Ciencia: Medicina Farmacia Biología Química Física Ingenierías ...

Modelos: Matemáticos Estadísticos Físicos ...

Computación: Numérica Estadística Heurística Algoritmos Paralela ...

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Computacion cientıfica

Modelado matematico y estadıstico

Desarrollo de algoritmos eficientes

Metodos aproximados, metaheurısticas

Paralelismo

Modelado del tiempo de ejecucion, Optimizacion yautooptimizacionAplicacion a: algoritmos, esquemas algorıtmicos, aplicacionesAdaptacion a: multicores, redes de ordenadores, GPUs...

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Computacion cientıfica

Modelado matematico y estadıstico

Desarrollo de algoritmos eficientes

Metodos aproximados, metaheurısticas

Paralelismo

Modelado del tiempo de ejecucion, Optimizacion yautooptimizacionAplicacion a: algoritmos, esquemas algorıtmicos, aplicacionesAdaptacion a: multicores, redes de ordenadores, GPUs...

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Computacion cientıfica

Modelado matematico y estadıstico

Desarrollo de algoritmos eficientes

Metodos aproximados, metaheurısticas

Paralelismo

Modelado del tiempo de ejecucion, Optimizacion yautooptimizacionAplicacion a: algoritmos, esquemas algorıtmicos, aplicacionesAdaptacion a: multicores, redes de ordenadores, GPUs...

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Computacion cientıfica

Modelado matematico y estadıstico

Desarrollo de algoritmos eficientes

Metodos aproximados, metaheurısticas

Paralelismo

Modelado del tiempo de ejecucion, Optimizacion yautooptimizacionAplicacion a: algoritmos, esquemas algorıtmicos, aplicacionesAdaptacion a: multicores, redes de ordenadores, GPUs...

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Computacion cientıfica

Modelado matematico y estadıstico

Desarrollo de algoritmos eficientes

Metodos aproximados, metaheurısticas

Paralelismo

Modelado del tiempo de ejecucion, Optimizacion yautooptimizacionAplicacion a: algoritmos, esquemas algorıtmicos, aplicacionesAdaptacion a: multicores, redes de ordenadores, GPUs...

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Computacion cientıfica

Modelado matematico y estadıstico

Desarrollo de algoritmos eficientes

Metodos aproximados, metaheurısticas

Paralelismo

Modelado del tiempo de ejecucion, Optimizacion yautooptimizacionAplicacion a: algoritmos, esquemas algorıtmicos, aplicacionesAdaptacion a: multicores, redes de ordenadores, GPUs...

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Computacion cientıfica

Modelado matematico y estadıstico

Desarrollo de algoritmos eficientes

Metodos aproximados, metaheurısticas

Paralelismo

Modelado del tiempo de ejecucion, Optimizacion yautooptimizacionAplicacion a: algoritmos, esquemas algorıtmicos, aplicacionesAdaptacion a: multicores, redes de ordenadores, GPUs...

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Aplicaciones

Aproximadamente 17, de las cuales 6 medicina-quımica-biologıa

Electromagnetismo: paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Econometrıa: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Medicina: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas

Simulacion de moleculas: paralelismo, computacion matricial

Diseno de farmacos: paralelismo, metaheurısticas

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Aplicaciones

Aproximadamente 17, de las cuales 6 medicina-quımica-biologıa

Electromagnetismo: paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Econometrıa: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Medicina: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas

Simulacion de moleculas: paralelismo, computacion matricial

Diseno de farmacos: paralelismo, metaheurısticas

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Aplicaciones

Aproximadamente 17, de las cuales 6 medicina-quımica-biologıa

Electromagnetismo: paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Econometrıa: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Medicina: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas

Simulacion de moleculas: paralelismo, computacion matricial

Diseno de farmacos: paralelismo, metaheurısticas

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Aplicaciones

Aproximadamente 17, de las cuales 6 medicina-quımica-biologıa

Electromagnetismo: paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Econometrıa: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Medicina: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas

Simulacion de moleculas: paralelismo, computacion matricial

Diseno de farmacos: paralelismo, metaheurısticas

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Aplicaciones

Aproximadamente 17, de las cuales 6 medicina-quımica-biologıa

Electromagnetismo: paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Econometrıa: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Medicina: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas

Simulacion de moleculas: paralelismo, computacion matricial

Diseno de farmacos: paralelismo, metaheurısticas

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Aplicaciones

Aproximadamente 17, de las cuales 6 medicina-quımica-biologıa

Electromagnetismo: paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Econometrıa: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas,computacion matricial

Medicina: estadıstica, paralelismo, metaheurısticas

Simulacion de moleculas: paralelismo, computacion matricial

Diseno de farmacos: paralelismo, metaheurısticas

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Ejemplo: Preclampsia

Modelo estadıstico resuelto con algoritmos numericosmatriciales.

Aproximacion del mejor modelo con tecnicas de optimizacionmetaheurısticas.

Aceleracion de la resolucion y aproximacion del modelo conalgoritmos matriciales paralelos.

En sistemas multicore, cluster de ordenadores ysupercomputador.

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Ejemplo: Preclampsia

Modelo estadıstico resuelto con algoritmos numericosmatriciales.

Aproximacion del mejor modelo con tecnicas de optimizacionmetaheurısticas.

Aceleracion de la resolucion y aproximacion del modelo conalgoritmos matriciales paralelos.

En sistemas multicore, cluster de ordenadores ysupercomputador.

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Ejemplo: Preclampsia

Modelo estadıstico resuelto con algoritmos numericosmatriciales.

Aproximacion del mejor modelo con tecnicas de optimizacionmetaheurısticas.

Aceleracion de la resolucion y aproximacion del modelo conalgoritmos matriciales paralelos.

En sistemas multicore, cluster de ordenadores ysupercomputador.

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Ejemplo: Preclampsia

Modelo estadıstico resuelto con algoritmos numericosmatriciales.

Aproximacion del mejor modelo con tecnicas de optimizacionmetaheurısticas.

Aceleracion de la resolucion y aproximacion del modelo conalgoritmos matriciales paralelos.

En sistemas multicore, cluster de ordenadores ysupercomputador.

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Proyecto actual

Nacional: Mejora de Arquitectura de Servidores, Serviciosy AplicacionesVarios grupos de la Facultad de Informatica de Murcia(liderado por Manuel Acacio), y coordinado con UniversidadPolitecnica de Valencia y Universidad de Castilla-La ManchaCCPP: Optimizacion y autooptimizacion de rutinas paralelas,y aplicaciones en ciencia e ingenierıa.

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Aplicaciones previstas en el proyecto

Compresion y transmision de imagenes 2D, 3D y vıdeo decualquier especialidad medica:Historiales medicos.Problemas de almacenamiento de pruebas y diagnosticos.Operaciones de cirugıa con asistencia remota.

Extraccion de comportamientos o caracterısticas dedeterminadas enfermedades para ayudar a su deteccion odiagnostico.

Atencion medica a traves de Internet.

Solucion de problemas complejos con grandes volumenes dedatos y/o necesidades de computacion: analisis de imagenes,modelado estadıstico, analisis genomico, simulacion demoleculas...

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Trabajos en curso (iniciandose) en temas debiologıa-bioinformatica

Simulacion de disolucion de acido en estomago. Dentro detesis doctoral sobre Desarrollo y optimizacion demetaheurısticas paralelas parametrizadas y aplicacionescientıficas. Metaheurısticas y paralelismo.

Simulaciones moleculares. Dentro de tesis de master.Metodos numericos y paralelismo.

Diseno de farmacos. Dentro de tesis de master.Metaheurısticas y paralelismo.