Evaluación de metodologías de detección de elementos ... · Beca pre-Doctorado M000-676-15 M.C....
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Evaluación de metodologías de detección de elementos transgénicos en campo: Selección y validación de una técnica sensible, específica y de bajo costo Convocatoria CIBIOGEM 2014-Proyecto 234606 Responsable técnico: Dra. Gracia Alicia Gómez Anduro 1 . E_mail: [email protected] Participantes: M.C. Carolina Garciglia Mercado 1 , M. C. María Guadalupe Barrera Andrade 2 , M.C. Mario Arce Montoya 1 , M.C. Julio Antonio Hernández González 1 , Dr. Felipe Ascencio Valle 1 , Dr. Carlos Eliud Angulo Valadez 1 1 Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste (CIBNOR). Instituto Politécnico Nacional #195, colonia Playa Palo de santa Rita Sur. La Paz, B.C.S. México. C.P. 23096, Tel:(52) (612) 123-8484 Fax:(52) (612) 125-3625. 2 Centro Nacional de Referencia en Detección de Organismos Genéticamente Modificados. Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria (SENASICA). Kilómetro 37.5 Carretera Federal México-Pachuca, Tecámac de Felipe Villanueva Centro, Estado de México. Presupuesto: $1, 183, 000 Gasto corriente: $ 983,000 Gasto de inversión: $ 200,000 RESULTADOS Y PRODUCTOS Contratos Contrato Estudiante Producto SH15-147- GAMC M.C. Carolina Garciglia Mercado Estandarización de una técnica sencilla de detección de NOS y 35S SH15-219- SIBE pI.B.Q. Elias Silva Burquez Estandarización de una técnica sencilla de extracción de ADN de hojas y semillas SH15-324- GAAH M.C. Héctor Daniel Garza Avelar Diseño y construcción de genes sintéticos para ser usados como controles positivos de ADN Publicaciones en proceso Artículo científico World wide meta-analysis of transgenic elements” Artículo de divulgación Perspectiva de la detección de elementos transgénicos en México y el mundo Estudiantes Beca pre-Doctorado M000-676-15 M.C. Claudia Alicia Contreras Godinez Beca Post-Doctorado Oscar Palacios, inicia Noviembre 2015 Software para el análisis de elementos transgénicos (protección intelectual y marca registrada CIBscanner 1.1® en proceso) Microarreglo para la identificación de 33 elementos transgénicos (protección intelectual y marca registrada TransGenic CIBarray® en proceso) Kit de detección de elementos transgénicos en campo (protección intelectual y marca registrada CIBscreen®-TransGenic en proceso) Verano del 2016 La Paz, B.C.S. México Taller de detección de OGMs en campo a partir de hojas y polen II Foro de Discusión de OGMs II Foro de Discusión de OGMs-CIBNOR RESUMEN OBJETIVO MONTO AUTORIZADO PERSPECTIVAS DEL PROYECTO EQUIPO SOLICITADO Contacto: [email protected], [email protected] Proyecto FINNOVA para producir 500 kits y hacer las pruebas de sensibilidad, especificidad y fácil uso del kit en campo Empresa en el Parque de Innovación Tecnológica (BioHelis)-CIBNOR para la generación, producción y venta de kit de detección de transgénicos en campo Laboratorio acreditado en CIBNOR para la detección de elementos transgénicos y certificación de productos orgánicos Evaluar las metodologías actuales de detección de elementos transgénicos en campo y compararlas con una herramienta colorimétrica de detección de ADN para seleccionar y validar una técnica sensible, específica y de bajo costo que pueda ser transferido como tecnología al personal de inspección y monitoreo de OGMs en México. Congelador de -20 vertical: $20,000 Rotor de centrifuga: $10,000 2 cámaras de electroforesis: $10,600 Juego de micropipetas: $23,149.13 Termociclador de PCR: $120,000 Pockit combo: $15,000 + envío. Equipo económico para PCR en campo, se usará para compararlo con la técnica propuesta en éste proyecto Determinar metodología de extracción de ADN de polen. Pruebas en campo para captación de polen con aspiradora. Regular la temperatura del baño maría propuesto para campo. Comparar la metodología propuesta en éste proyecto con PCR y detección en tiras reactivas. Taller de transferencia y capacitación al personal de inspección y monitoreo de OGMs. POR REALIZAR INTRODUCCIÓN METODOLOGÍA 1) Block A, et al., 2013. The GMOseek matrix: a decision support tool for optimizing the detection of genetically modified plants. BMC Bioinformatics. 14:256. 2) James C. 2013. Global Status of commercialized biotech/GM crops. ISAAA. Ithaca, NY.Brief 46. REFERENCIAS México ocupa el lugar 17 a nivel mundial en cultivo de transgénicos (algodón y soya). A nivel mundial , los OGMs más sembrados son: soya, maíz, algodón y canola La Ley de Bioseguridad, emitida en Marzo del 2005, regula lo referente a OGMs. La cantidad y tipo de elementos que conforman un organismo genéticamente modificado (OGM) se encuentra en aumento [1]. Las herramientas de detección se basan en: diferenciación fenotípica, detección de proteínas y detección de ADN. La detección de ADN que identifican el promotor del virus del mosaico de la coliflor (CaMV35S) y el terminador de la Nopalina Sintetasa (NOS) detectan el 72% de los transgénicos comercializados actualmente [2]. El costo de las pruebas detección de ADN es alto debido al uso de equipo sofisticado, enzimas especiales y personal capacitado. El presente proyecto plantea la optimización de una técnica de bajo costo para la detección de OGMs en campo. Un evento típico de OGM consta de: promotor, gen de selección, gen de interés biotecnológico y terminador.
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Evaluación de metodologías de detección de elementos transgénicos en campo:
Selección y validación de una técnica sensible, específica y de bajo costo
Convocatoria CIBIOGEM 2014-Proyecto 234606
Responsable técnico: Dra. Gracia Alicia Gómez Anduro1. E_mail: [email protected]
Participantes: M.C. Carolina Garciglia Mercado1, M. C. María Guadalupe Barrera Andrade2, M.C. Mario Arce Montoya1, M.C. Julio Antonio Hernández González1,
Dr. Felipe Ascencio Valle1, Dr. Carlos Eliud Angulo Valadez1
1Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste (CIBNOR). Instituto Politécnico Nacional #195, colonia Playa Palo de santa Rita Sur. La Paz, B.C.S. México. C.P. 23096, Tel:(52) (612) 123-8484 Fax:(52) (612) 125-3625. 2Centro Nacional de Referencia en Detección de Organismos Genéticamente Modificados. Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria (SENASICA). Kilómetro 37.5 Carretera Federal México-Pachuca, Tecámac de Felipe Villanueva Centro, Estado de México.
Presupuesto: $1, 183, 000
Gasto corriente: $ 983,000
Gasto de inversión: $ 200,000
RESULTADOS Y PRODUCTOS
Contratos
Contrato Estudiante Producto
SH15-147-
GAMC
M.C. Carolina
Garciglia Mercado
Estandarización de una técnica sencilla de
detección de NOS y 35S
SH15-219-
SIBE
pI.B.Q. Elias Silva
Burquez
Estandarización de una técnica sencilla de
extracción de ADN de hojas y semillas
SH15-324-
GAAH
M.C. Héctor Daniel
Garza Avelar
Diseño y construcción de genes sintéticos para
ser usados como controles positivos de ADN
Publicaciones en proceso
Artículo científico World wide meta-analysis of transgenic elements”
Artículo de divulgación Perspectiva de la detección de elementos transgénicos
en México y el mundo
Estudiantes
Beca pre-Doctorado M000-676-15 M.C. Claudia Alicia Contreras Godinez
Beca Post-Doctorado Oscar Palacios, inicia Noviembre 2015
Software para el análisis de
elementos transgénicos
(protección intelectual y
marca registrada CIBscanner
1.1® en proceso)
Microarreglo para la identificación de
33 elementos transgénicos (protección
intelectual y marca registrada
TransGenic CIBarray® en proceso)
Kit de detección de elementos transgénicos en
campo (protección intelectual y marca registrada
CIBscreen®-TransGenic en proceso)
Verano del 2016
La Paz, B.C.S. México
Taller de detección de OGMs en
campo a partir de hojas y polen
II Foro de Discusión de OGMs
II Foro de Discusión
de OGMs-CIBNOR
RESUMEN
OBJETIVO
MONTO AUTORIZADO
PERSPECTIVAS
DEL PROYECTO
EQUIPO SOLICITADO Contacto: [email protected], [email protected]
Proyecto FINNOVA para producir
500 kits y hacer las pruebas de
sensibilidad, especificidad y fácil uso
del kit en campo
Empresa en el Parque de Innovación
Tecnológica (BioHelis)-CIBNOR para la
generación, producción y venta de kit de
detección de transgénicos en campo
Laboratorio acreditado en CIBNOR
para la detección de elementos
transgénicos y certificación de productos
orgánicos
Evaluar las metodologías actuales de detección
de elementos transgénicos en campo y
compararlas con una herramienta colorimétrica
de detección de ADN para seleccionar y validar
una técnica sensible, específica y de bajo costo
que pueda ser transferido como tecnología al
personal de inspección y monitoreo de OGMs
en México.
Congelador de -20 vertical: $20,000
Rotor de centrifuga: $10,000
2 cámaras de electroforesis: $10,600
Juego de micropipetas: $23,149.13
Termociclador de PCR: $120,000
Pockit combo: $15,000 + envío.
Equipo económico para PCR en
campo, se usará para compararlo con
la técnica propuesta en éste proyecto
Determinar metodología de extracción de
ADN de polen.
Pruebas en campo para captación de
polen con aspiradora.
Regular la temperatura del baño maría
propuesto para campo.
Comparar la metodología propuesta en
éste proyecto con PCR y detección en tiras
reactivas.
Taller de transferencia y capacitación al
personal de inspección y monitoreo de
OGMs.
POR REALIZAR
INTRODUCCIÓN
METODOLOGÍA
1) Block A, et al., 2013. The GMOseek matrix:
a decision support tool for optimizing the
detection of genetically modified plants.
BMC Bioinformatics. 14:256.
2) James C. 2013. Global Status of
commercialized biotech/GM crops. ISAAA.
Ithaca, NY.Brief 46.
REFERENCIAS
México ocupa el lugar
17 a nivel mundial en
cultivo de transgénicos
(algodón y soya).
A nivel mundial , los
OGMs más sembrados
son: soya, maíz, algodón
y canola
La Ley de Bioseguridad, emitida en Marzo
del 2005, regula lo referente a OGMs.
La cantidad y tipo de elementos que conforman
un organismo genéticamente modificado (OGM)
se encuentra en aumento [1].
Las herramientas de detección se basan en:
diferenciación fenotípica, detección de proteínas
y detección de ADN.
La detección de ADN que identifican el
promotor del virus del mosaico de la coliflor
(CaMV35S) y el terminador de la Nopalina
Sintetasa (NOS) detectan el 72% de los
transgénicos comercializados actualmente [2].
El costo de las pruebas detección de ADN es
alto debido al uso de equipo sofisticado, enzimas
especiales y personal capacitado.
El presente proyecto plantea la optimización de
una técnica de bajo costo para la detección de
OGMs en campo.
Un evento típico de OGM consta de:
promotor, gen de selección, gen de interés
biotecnológico y terminador.
