ECOLOGIA microbiana biodiversidad
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DIVERSIDAD
Biodiversidad o diversidad biolgica es,
segn el Convenio Internacional sobre la Diversidad Biolgica, se hace referencia a la amplia
variedad de seres vivos sobre la Tierra y los patrones naturales que la conforman, resultado de
miles de millones de aos de evolucin segn procesos naturales y tambin de la influencia
creciente de las actividades del ser humano.
IMPORTANCIA
Es resultado de un proceso histrico natural de gran antigedad.
la biodiversidad es garante de bienestar y equilibrio en la biosfera.
representa un capital natural.[8] El uso y beneficio de la biodiversidad ha contribuido de
muchas maneras al desarrollo de la cultura humana, y representa una fuente potencial
para subvenir a necesidades futuras.
Biorremediacin: Pseudomonas putida, P. aeroginosa
Fertilizantes Biologicos (PGPM): Azospirillum, Rhizobium,
Bacillus
Antibioticos: Penicilliun, Streptomices, nuevos
Biocontrol: Bacillus cereus UW85 vs Phytophthora root
rot of alfalfa; Trichoderma harzianum vs Pythium,
Rhizoctonia, and Fusarium
CATEGORIAS PRINCIPALES
El aspecto ecolgico: vista sistmico y funcional (ecosistemas).
El aspecto econmico: la biodiversidad es el primer recurso para la vida diaria.
El aspecto cientfico: La biodiversidad es importante porque cada especie puede dar una pista a
los cientficos sobre la evolucin de la vida.
NIVELES
COMUNIDADES Y ECOSISTEMAS
Diversidad funcional
ESPECIES - HISTORIA EVOLUTIVA
Diversidad taxonmica y filogentica
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GENES
Diversidad gentica
DIVERSIDAD DEL ECOSISTEMA
a) Considera el flujo de energa y recirculacin de materiales.
b) Requiere del Anlisis Estadstico (Bioestadstica).
c) Generalmente utiliza un sistema artificial (Microcosmos).
tres niveles: La diversidad local o diversidad alfa (), la diferenciacin de la diversidad entre reas
o diversidad beta () y la diversidad regional o gamma ()
ALFA: riqueza especfica de una comunidad local
BETA: cambio de composicin especfica a lo largo de un gradiente ambiental o geogrfico.
HETEROGENEIDAD
(DIVERSIDAD) DE HBITATS
GAMMA: riqueza especfica de una regin o continente
ANALISIS
a) Filogenia.- Secuenciacin de genes para definicin de gneros y especies
b) Anlisis Gentico.- Conjugacin, Transduccin, Transformacin
c) Anlisis Genmico.- Hibridacin DNA-DNA, Hibridacin DNA-RNA, etc.
d) Caracterizacin Fenotpica.- Fuente de carbono, nitrgeno; morfologa celular y
morfologa colonial; actividad enzimtica, etc.
Concepto biolgico de especie: Individuos en comunidad reproductiva deben ser accesibles a
otros ecolgicamente en el mismo ambiente y debe haber flujo de genes
METODOS DE EVALUACIN
Caracterizacin fenotpica
Taxonoma numrica: morfologa; biofsica (intervalos de pH, salinidad y temperatura para crecer,
resistencia a los antibiticos, metales pesados, colorantes y otros reactivos qumicos, etc.);
bioqumica (enzimas, uso de sustratos como fuente de carbono y nitrgeno, requisitos de factores
de crecimiento etc.)
Taxonoma qumica: composicin de protenas, de pared celular, de cidos grasos, G+C mol% etc.,
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TECNICAS MOLECULARES
DIVERSIDAD Y ESTABILIDAD DE LAS COMUNIDADES MICROBIANAS
Las comunidades biolgicas usualmente contiene unas pocas especies con muchos
individuos y muchas especies con pocos individuos.
Las especies dominantes normalmente son responsables de la mayor parte del flujo de la
energa dentro del nivel trfico.
Las especies menos abundantes determinan la diversidad (cantidad intensidad de las
interacciones) de ese nivel trfico y de la comunidad entera.
Las comunidades que tienen una estructura compleja, ricas en informacin como
resultado de una gran riqueza de especies, requieren una menor cantidad de energa para
mantener su estructura.
La diversidad de especies tiende a ser mayor en: ecosistemas biolgicamente controlados, donde:
la importancia de las interacciones entre poblaciones predomina sobre el estrs abitico.
En estas comunidades, el ambiente fisicoqumico permite mayor adaptacin entre
especies, resultando una mayor riqueza de asociaciones.
Un ejemplo de estos hbitats es el suelo, donde la diversidad es normalmente alta.
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La diversidad de las especies tiende a ser baja en: ecosistemas controlados por factores fsicos.
En situaciones donde el ambiente es influenciado por un fuerte factor unidireccional,
dispondr de una menor flexibilidad para mantener su estabilidad.
Las poblaciones adaptadas tienden a ser altamenteespecializadas (estenotolerantes) y las
comunidades son dominadas por unas pocas poblaciones (baja diversidad de especies).
Los desiertos en la Antrtida son ejemplos de hbitats fsicamente controlados donde la
diversidad de especies es muy baja.
Mtodo Cultivo Objetos de anlisis Nivel de taxon
Anlisis fenotpicos (Tax.
Nm.)
Dependiente (D) Fuentes de C y N, intervalos de pH, salinidad, Temp.
etc.
Cepas y especie
(Biolog)
Taxonoma qumica D Protenas, cidos grasos, etc. Cepas y especie
GC-FAME D o ND (No
dependiente)
Fatty Acid Methyl Ester Especie (fungal
Biolog)
Filogenia D o ND Genes o cromosoma Gnero
Hibridacin DNA-DNA D DNA total-DNA total Especies
RFLP D DNA-Sonda Cepa-gnero
Micro Arreglo ND DNA metagenomico-sonda Cepa-gnero
AFLP D DNA total Especies
BOX-PCR D DNA-total Cepas
Rep-PCR D DNA total Cepas
RISA D o ND Ribosomal intergenic spacer Especie
T-RFLP ND Gene de 16S rRNA Especie
DGGE ND Gen de 16S rRNA Especie
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CICLOS BIOGEOQUIMICOS
La biogeoqumica estudia la interaccin entre los compuestos geoqumicos y los organismos vivos.
Se denomina ciclo biogeoqumico al movimiento de cantidades masivas de carbono, nitrgeno,
oxgeno, hidrgeno, calcio, sodio, sulfuro, fsforo y otros elementos entre los componentes
vivientes y no vivientes del ambiente (atmsfera y sistemas acuticos) mediante una serie de
procesos de produccin y descomposicin.
ELEMENTOS BIOGEOQUIMICOS
Elementos
principales
Elementos
secundarios
Elementos traza
H, C, N, O, P, S
RECICLADO CON
MAS INTENSIDAD
Mg, K, Na, y
RECICLADO CON
MENOR INTENSIDAD
B, Co, Cr, Cu, Mo, Ni, Se, Sn, V,
Zn
FUNCIONES UNICAS DE PROCARIOTAS
a) Fotosntesis anoxignica (Chlorobium, Chromobacterium)
b) Quimiolitotrofa (produccin de energa por la oxidacin de compuestos inorgnicos),
(Thiobacillus, Nitrobacter, Leptothrix)
c) Metabolismo oxidativo basado en aceptores de electrones diferentes del oxgeno (NO3-,
SO4= y CO2), (Psudomonas, Desulfovibrio, Methococcus )
d) Produccin de metano (Methanobacterium)
e) Uso y fijacin del nitrgeno atmosfrico (Azotobacter, Azoarcus, Klebsiella)
El flujo de energa en el ecosistema es abierto.
El flujo de materia es, en gran medida, cerrado (reciclado por los descomponedores).
De esta manera, siguen un ciclo biogeoqumico que tiene una zona abitica y una zona
bitica. La primera suele contener grandes cantidades de elementos biogeoqumicos pero
el flujo de los mismos es lento, tienen largos tiempos de residencia. En cambio, el flujo a
travs de la parte bitica del ciclo es rpido.
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CICLOS BIOGEOQUMICOS
Describen el movimiento y la conversin de materiales por medio de la actividad
bioqumica que se producen en la atmsfera, en la hidrosfera y en la litosfera
TRANSFORMACIONES
DEGRADACIN
Descomposicin de una sustancia por rotura de los enlaces que unen los elementos qumicos que
la forman. Puede producirse por la accin del oxgeno, la luz, el calor y ciertos microorganismos.
Degradacin abitica.- Degradacin de una materia por procesos qumicos o fsicos; por
ejemplo: hidrlisis, fotolisis, reduccin, oxidacin.
Degradacin bitica total.- Degradacin biolgica que conduce a una mineralizacin total.
MINERALIZACIN
Degradacin completa de materiales orgnicos en inorgnicos. Se realiza preferentemente por la
accin de los descomponedores de los ecosistemas, fundamentalmente los microorganismos.
Proceso importante para cerrar los ciclos de materia de los ecosistemas
Mineralizacin Aerbica.- La materia orgnica es completamente degradada (oxidada) a CO2 y
H2O, y si en la molcula orgnica original hay N, S y P, estos se transforman en NO3-, SO4
= y PO34-.
Mineralizacin Anaerbica.- Los productos de la degradacin de la materia orgnica son CH4
y/o CO2, H2, NH3, H2S, PO43-.
ASIMILACIN.- Reduccin de un compuesto inorgnico (NO3-, SO4
= o CO2) para usarlo como como
aporte nutricional
FIJACIN.- Reduccin de un elemento o compuesto gaseoso como fuente de nutrimento para la
biosntesis
VOLATILIZACIN.- La desaparicin en forma gaseosa de una sustancia de la superficie de las hojas,
del agua o de partculas de suelo donde estaba adsorbida. La volatilizacin depende, entre otros,
1.- Fsicas
a) Disolucin
b) Precipitacin
c) Volatilizacin
d) Fijacin
2.- Qumicas
a) Biosntesis
b) Biodegradacin
c) Biotransformaciones oxidorreductoras
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del tamao de las partculas (materia slida), el clima, interacciones con un sustrato e
interacciones con otros componentes de la formulacin
Oxidacin.- Reaccin qumica o bioqumica mediante la cual un compuesto o elemento acta
como donador de electrones.
a) Oxidacin directa.- La que se realiza sin intervencin de organismos vivos. Los oxidantes,
oxgeno cloro, bromo etc., actan directamente.
b) Oxidacin biolgica.- Llamada tambin digestin aerobia, consiste, en esencia, en la
combinacin del oxgeno con los distintos materiales orgnicos, producindose energa. Se realiza
en la clula mediante reacciones catalizadas por enzimas. Una parte de la energa producida
se transforma en calor y otra la utiliza la clula para los procesos respiratorios.
Reduccin.- Reaccin qumica o bioqumica mediante la cual un compuesto o elemento acta
como aceptor de electrones.
RESPIRACIN:
Conjunto de reacciones qumicas mediante las que un organismo obtiene energa.
Respiracin aerobia.- Conjunto de reacciones bioqumicas donde el aceptor final de electrones es
el oxgeno, teniendo como productos finales CO2 y H2O.
Respiracin anaerobia.- Conjunto de reacciones bioqumicas donde el aceptor final de electrones
es un compuesto diferente al oxgeno. Por ejemplo: nitrato, sulfato, azufre, dixido de carbono,
xido frrico y otros compuestos de fierro, o tambin un compuesto orgnico como el fumarato.
FERMENTACIN
Proceso catablico en el que se llevan a cabo reacciones de oxido-reduccin de compuestos
orgnicos balanceados internamente con liberacin de energa.
En la fermentacin, los procesos de xido-reduccin ocurren en ausencia de aceptores terminales
de electrones exgenos
CICLO DEL CARBONO
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INTERACCION CICLO DEL CARBONO, OXIGENO Y NITROGENO
CICLO DEL HIDROGENO
METANOGENESIS:
Usan CO2 como nica fuente de carbono y producen CH4. Anaerobia , arquea. Metanococcus,
Metanosarcina.
HCO-3 + H- + 4H2 CH4 + 3H2O
PRODUCCIN BIOLGICA
1. Fermentaciones anaerbicas 2. Subproducto de la fotosntesis acoplada a la fijacin de nitrgeno
PRODUCCIN NO BIOLGICA
1. Produccin antropognica 2. Descomposicin fotoqumica del metano 3. Fotodisociacin del vapor de agua
UTILIZACIN DEL HIDRGENO
1. Reduccin anaerbica de NO3
-
, SO4
=
, Fe3
+
y Mn4+
.
2. Generacin de CH4
3. Formacin de agua por metabolizacin axidativa 4. Utilizacin aerbia:
H2 + 1/2O
2 H
2O
REACCIN GLOBAL DE UTILIZACIN DEL HIDRGENO
6H2 + 2O
2 + CO
2 {CH
2O} + 5H
2O
BACTERIAS DEL HIDRGENO
1. Alcaligenes 2. Pseudomonas 3. Paracoccus 4. Xanthobacter 5. Nocardia 6. Azospirillum
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Metilotrofia: Usan CH4 como nica fuente de carbono y producen CO2. Aerobia.
Methylomonas
CH4 + O2CO2 + H2O
ACETOGNESIS (Quimioautotrofos anaerobias): es el proceso a travs del cual bacterias
anaerobias producen acetato a partir de diversas fuentes de energa y de carbono. Clostridium
thermoaceticum, Acetobacterium woodii
2CO2 + 4H2 CH3COOH + 2H2O