Curr´ıculum Vitae Maximino Aldana Gonza´lez - … · BMC Systems Biology 9:42, (2015). Nota:...

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Currıculum Vitae

Maximino Aldana Gonzalez

Octubre, 2018

1 Datos Personales.

• Correo electronico: [email protected]

• Lugar y fecha de nacimiento: Mexico D.F., 8 de junio de 1970.

• Estado Civil: Casado.

• Nacionalidad: Mexicano.

2 Datos Laborales Actuales

• Cargo: Investigador Titular “B” de Tiempo Completo Definitivo.

• Institucion: Instituto de Ciencias Fısicas, UNAM.

• Antiguedad: 18 anos.

• SNI: Investigador nivel II.

• PRIDE: nivel D.

• Domicilio Laboral: Instituto de Ciencias Fısicas, UNAM. Avenida Universidad s/n, Colonia

Chamilpa, Cuernavaca, Morelos, Mexico. CP. 62210.

• Telefono: Tel. (555)-622-7787.

3 Formacion Academica.

• Licenciatura.

– Institucion: Facultad de Ciencias, UNAM.

– Programa: Licenciatura en Fısica.

– Fecha de Titulacion: 27 de febrero de 1995.

• Maestrıa.

mailto:[email protected]

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– Programa: Maestrıa en Ciencias (Fısica).

– Fecha de titulacion: 8 de febrero de 1996.

• Doctorado.


– Programa: Doctorado en Ciencias (Fısica).

– Fecha de Titulacion: 14 de diciembre de 2000.

4 Reconocimientos

• Catedra Marcos Moshinsky 2013/2014. Otorgado por el Instituto de Fısica de la UNAM y la

Academia Mexicana de Ciencias.

• Reconocimiento en la Gaceta UNAM del 28 de noviembre de 2013 por pertenecer a los 10 Academicos de Carrera mas citados en el ano 2012 en el area de Fısica.

• Antonio Madero Visiting Scholar 2011/2013. Otorgado por la Fundacion Mexico en Harvard

a traves del David Rockefeller Center for Latin American Studies, Harvard University.

• Speciality Chief Editor. Revista de investigacion Frontiers in Systems Biology. Desde junio de

2012.

• Premio Jorge Lomnitz Adler en Dinamica no Lineal 2009. Otorgado por el Instituto de

Fısica de la UNAM y la Academia Mexicana de Ciencias.

5 Puestos admnistrativos

• Coordinador Academico. Centro de Ciencias de la Complejidad, UNAM. Del 1 de marzo de

2016 al 1 de marzo de 2018.

• Secretario Academico. Instituto de Ciencias Fısicas, UNAM. Del 1 de agosto de 2013 al 16 de

agosto de 2015.

6 Experiencia en investigacion

• Investigador Titular de Tiempo Completo

– Institucion: Instituto de Ciencias Fısicas, UNAM.

– Fechas: desde octubre de 2003 a la fecha.

• Postdoctorado.

– Institucion: The James Franck Institute, University of Chicago. Estancia posdoctoral

compartida con The Santa Fe Institute of Complex Systems.

– Fechas: 1 de enero de 2001 al 30 de noviembre de 2003.

• Estancias de investigacion.

– Visiting Scholar. Earth-Life Science Institute, Tokio Institute of Technology, Tokio, Japan.

Del 1 al 31 de julio de 2017.

3

– Antonio Madero Visiting Scholar. FAS Center for Systems Biology and David Rockefeller

Center for Latin American Studies, Harvard University, USA. Del 1 de septiembre de 2011 al

30 de marzo de 2013.

– FAS Center for Systems Biology, Harvard University, USA. Del 7 al 14 de marzo de 2010.

– James Franck Institute, University of Chicago, Chicago, Illinois, USA. Del 20 de junio al 20

de agosto de 2008.

– James Franck Institute, University of Chicago, Chicago, Illinois, USA. Del 20 de enero al 2 de

marzo de 2008.

– Consortium of the Americas for Interdisciplinary Science, University of New Mexico, Albu-

querque, USA. Del 23 de septiembre al 2 de diciembre de 2007.

– Institute for Biocomplexity and Informatics, University of Calgary, Canada. Del 18 al 30 de

junio de 2006.


querque, USA. Del 1 de julio al 30 de noviembre de 2005.


querque, USA. Del 15 de junio al 1 de septiembre, 2004.

7 Produccion Cientıfica. 7.1 Artıculos de investigacion

Nota: De acuerdo con Google Scholar, mis trabajos de investigacion han recibido 2873 citas hasta octubre

de 2018.

https://scholar.google.com.mx/citations?user=DkpQdGcAAAAJ&hl=es

1. Modeling the role of the microbiome in evolution. Saul Huitzil, Santiago Sandoval-Motta,

Alejandro Frank, Maximino Aldana. Frontiers in Physiology. En revision, (2018).

2. Delay in the dispersal of flocks moving in unbounded space using long-range inter- actions. Martın Zumaya, Hernan Larrande y Maximino Aldana. Scientific Reports. Aceptado,

2018.

3. Evolving ecosystems: inheritance and selection in the light of evolution. Santiago San-

doval Motta, Maximino Aldana y Alejandro Frank. Archives in Medical Research 48(8): 780-789

(2018).

4. The human microbiome and the missing heritability problem. Santiago Sandoval-Motta,

Maximino Aldana, Esperanza Martınez-Romero, Alejandro Frank. Frontiers in Genetics, 8:80

(2017).

5. Adaptive resistance to antibiotic in bacteria: A Systems Biology perspective. Santiago

Sandoval Motta and Maximino Aldana. WIREs Systems Biology and Medicine, 8:253267, (2016).

Nota: Artıculo seleccionado para aparecer en la portada de la revista.

6. Adaptive Resistance in Bacteria Requires Epigenetic Inheritance, Genetic Noise, and Cost of Efflux Pumps. Santiago Sandoval Motta, Philippe Cluzel, Maximino Aldana. PLoS

ONE 10(3):e0118464, (2015).

7. Complex regulation of Hsf1-Skn7 activities by the catalytic subunits of PKA in Saccha-

romyces cerevisiae: experimental and computational evidences. Sergio Prez-Landero, San-

tiago Sandoval-Motta, Claudia Martınez-Anaya, Runying Yang, Jorge Luis Folch-Mallol, Luz Marıa

Martınez, Larissa Ventura, Karina Guillen-Navarro, Maximino Aldana-Gonzalez, Jorge Nieto-Sotelo.

BMC Systems Biology 9:42, (2015).

Nota: Este es un artıculo teorico-experimental en el que mi estudiante de doctorado Santiago Sandoval Motta y yo hicimos el modelo matematico y computacional del sistema, mientras que los demas autores llevaron a cabo los experimentos.

8. Criticality as an emergent property of genetic networks that exhibit evolvability. Chris-

tian Torres-Sosa, Sui Huang, Maximino Aldana. PLoS Computational Biology 8(9): e1002669,

(2012).

9. Pattern Recognition in Neural Networks with Competing Dynamics: Coexistence of Fixed-Point and Cyclic Attractors Jose Luis Herrera Aguilar, y Maximinno Aldana. PLoS

ONE 7(8): e42348, (2012).

10. Regulatory design governing progression of population growth phases in bacteria.

Agustino Martınez-Antonio, Jason G. Lomnitz, Santiago Sandoval, Maximino Aldana, Michal Sav-

ageau. PLoS ONE 7(2): e30654, (2012).

11. Discrete dynamics model for the Ca2+ signaling network related to sperm motility.

Jesus Espinal, Maximino Aldana, Adan Guerrero, Christopher Wood, Alberto Darszon, Gustavo

Martınez Mekler. PLoS ONE, 6(8): e22619, (2011).

12. On the Emergence of Collective Order in Swarming Systems: A Recent Debate. M.

Aldana, H. Larrande and B. Vazquez. International Journal of Modern Physics B, 23(18): 3661-

3685, (2009).

13. Floral Morphogenesis: Stochastic Explorations of a Gene Network Epigenetic Land- scape E.R. Alvarez-Buylla, A. Chaos, M. Aldana, M. Bentez, Y. Cortes-Poza, C. Espinosa-Soto1,

D.A. Hartasanchez, R. Beau Lotto, D. Malkin, G.J. Escalera Santos, P. Padilla-Longoria. PLoS

ONE, 3(11): e3626, (2008).

14. On the Occurrence and Robustness of Current Reversals in Overdamped Deterministic Ratchets under Symmetric Forcing. R. Salgado-Garcıa, G. Martınez-Mekler, M. Aldana.

Physical Review E, 78: 01126, (2008).

15. Intrinsic and Extrinsic Noise Effects on the Phase Transition of Network Models with Applications to Swarming Systems. M. Aldana, C. Huepe, H. Larralde and A. Pimentel.

Physical Review E, 77: 061138 (2008).

16. Critical Dynamics in Genetic Regulatory Networks: Examples From Four Kingdoms.

M. Aldana, E. Alvarez-Builla, E. Balleza, A. Chaos, S. Kauffman and I. Shmulevich. PLoS ONE,

3(6): e2456, (2008).

17. New tools for characterizing swarming systems: a comparison of minimal models. C.

Huepe and M. Aldana. Physica A, 387: 2809-2822, (2008).

18. Gene Expression Dynamics in the Macrophage Exhibit Criticality. Matti Nykter, Nathan

D. Price, Maximino Aldana, Stephen Ramsey, Stuart A. Kauffman, Leroy Hood, Olli Yli-Harja, Ilya

Shmulevich. Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, 105(6): 1897-1900, (2008).

19. Phase Transitions in Systems of Self-Propelled Agents and Related Network Models.

M. Aldana, V. Dossetti, C. Huepe, V.M. Kenkre, and H. Larralde. Physical Review Letters, 98:

095702, (2007).

20. Robustness and Evolvability in Genetic Regulatory Networks. M. Aldana, E. Balleza,

S.A. Kauffman. Journal of Theoretical Biology, 245: 433-448, (2007).

21. From genes to flower patterns and evolution: dynamic models of gene regulatory

networks. A. Chaos, M. Aldana, C. Espinosa-Soto, B. Garcıa-Ponce, A. Garay-Arroyo, and R.E.

Alvarez-Buylla. Journal of Plant Growth Regulation, 25: 278-289, (2006). 4

5

22. Deterministic Ratchets, Circle Maps, and Current Reversals. R. Salgado Garcıa, M.

Aldana and G. Martınez-Mekler. Physical Review Letters 96: 134101, (2006).

23. Eukaryotic Cells are Dynamically Ordered or Critical but not Chaotic. I. Shmulevich,

S.A. Kauffman, M. Aldana. Proceedings of the National Academy of Sciences, USA. 102(38):

13439-13444, (2005).

24. Static Pairwise Annihilation in Complex Networks. M. F. Laguna, M. Aldana, H. Larralde,

P. E. Parris, and V. M. Kenkre. P hysical Review E. 72: 026102, (2005).

25. Phase Transitions in Scale-Free Neural Networks: Departure From the Satandard

Mean-Field Universality Class. M. Aldana, H. Larralde. Physical Review E, 70: 066130,

(2004).

26. Intermittency and Clustering in a System of Self-Driven Particles. M. Aldana, C. Huepe.

Physical Review Letters, 92(16): 168701, (2004).

27. Polymer Transport in Random Potentials and the Genetic Code: The Waltz of Life.

M. Aldana, G. Cocho, H. Larralde, G. Martı nez-Mekler. Annales Henri Poincare, 4: 435-450,

(2003).

28. Boolean Dynamics of Networks with Scale-Free Topology. M. Aldana. Physica D, 185:

45-66, (2003).

29. A Natural Class of Robust Networks. M. Aldana, Phillipe Cluzel. Proceedings of the National

Academy of Sciences, USA. 100(15): 8710-8714, (2003).

30. Phase Transitions in Self-Driven Many-Particle Systems and Related Non-Equilibrium Models: a Network Approach. M. Aldana and C. Huepe. Journal of Statistical Physics,

112(1/2): 135-153, (2003).

31. Translocation Properties of Primitive Molecular Machines and their Relevance to the Structure of the Genetic Code. M. Aldana, G. Cocho, H. Larralde, G. Martınez-Mekler.

Journal of Theoretical Biology, 220(1): 27-45, (2003).

32. Numerical and Theoretical Studies of Noise Effects in the Kauffman Model. X. Qu, M.

Aldana, Leo. P. Kadanoff. Journal of Statistical Physics, 109(5/6): 967-986, (2002).

33. Dynamical Phase Transition in a Neural Network Model with Noise: an Exact Solution.

C. Huepe-Minoletti and M. Aldana-Gonzalez. Journal of Statistical Physics, 108(3/4): 527-540,

(2002).

34. Statistical Characterization of Random Electrostatic Potentials. M. Aldana, H. Larralde,

G. Martınez-Mekler. Phys Rev E 61(6): 6136-6148, (2000).

35. Primitive Molecular Machine Scenario for the Origin of the Three Base Codon Com- position. G. Martınez-Mekler, M. Aldana, F. Cazarez-Bush, R. Garcıa-Pelayo, G. Cocho. Origins

of Life and Evolution of the Biosphere 29(2): 203-214, (1999).

36. Primordial Synthesis Machines and the Origin of the Genetic Code. M. Aldana, F.

Cazarez-Bush, G. Cocho, G. Martınez-Mekler. Physica A 257: 119-127, (1998).

7.2 Capıtulos de libros

Nota: Los capıtulos marcados con “*” fueron arbitrados.

1. *Critical Dynamics in Gene Networks. Santiago Sandoval Motta, Christian Torres-Sosa,

Mayra P. Garcıa. In Fontiers in Ecology, Evolution and Complexity, Eds: M. Benıtez, O. Mira-

montes, A. Valiente-Banuet. Copit arXives, (2014).

6

2. *Criticalidad, Robustez y Evolucion en Redes Geneticas. M. Aldana. En Encuentros con

la Complejidad. Eds: Jorge Flores Valdes y Gustavo Martınez Mekler. Editorial Siglo Veintiuno

(2011). Pp: 150-177. ISBN: 978-607-03-0278-7

3. *Boolean Threshold Networks: Virtues and Limitations for Biological Modeling. Jorge.

G. T. Zanudo, Maximino Aldana and Gustavo Martınez-Mekler. En Information Processing in

Biological Systems. Eds: Andre Ribeiro and Samuli Niiranen. Springer-Verlag (2010). Pp: 113-

151.

4. *Gene Regulatory Models for Plant Development and Evolution. E.E. Alvarez-Buylla,

M. Benıtez, M. Aldana, G.J.E. Santos, A. Chaos-Cador, P. Padilla-Longoria, R. Verduzo-Vazquez.

En Plant Develpmental Biology (Biotechnological Perspectives Vol. 1). Eds: Eng-Chong Pua and

Michael Davey. Springer, Heidelberg (Oct. 2009). Capıtulo 1, pp: 3-20.

5. *Boolean Dynamics with Random Couplings. M. Aldana-Gonzalez, Susan Coppersmith, Leo

P. Kadanoff. En Perspectives and Problems in Nonlinear Science. A Celebratory Volume in Honor

of Larry Sirovich, Ehud Kaplan, Jerry Marsden, and Katepalli R. Sreenivasan Eds. Springer-Verlag,

New York Inc. (2003), 23-90.

7.3 Artıculos en memorias

1. Movimiento Colectivo. Maximino Aldana. En Memorias de la XXIII Escuela de Verano en

Fısica. Llevada a cabo en Cuernavaca, Morelos, Mexico, 22 de junio al 3 de julio de 2015. Editores:

R. Jauregui y J. Recamier, (2015).

2. Modelaje de la Vıa de Senalizacion de Calcio Relacionada con la Motilidad del Es- permatozoide. J. Espinal, M. Aldana, G. Martınez-Mekler. En Memorias de la XVIII Escuela

de Verano en Fısica. Llevada a cabo en Cuernavaca, Morelos, Mexico, 1 al 5 de agosto de 2010.

Editores: R. Jauregui y J. Recamier, (2011).

3. Redes Complejas. Maximino Aldana. En Memorias de la XV Escuela de Verano en Fısica.

Llevada a cabo en Cuernavaca, Morelos, Mexico, del 30 de julio al 11 de agosto de 2007. Editores:

R. Jauregui y J. Recamier, (2008).

4. On the Role of Molecular Machines in the Origin of the Genetic Code. G. Martınez-

Mekler, M. Aldana, G. Cocho. En Statistical mechanics of biocomplexity: proceedings of the XV

Sitges Conference, held at Sitges, Barcelona, Spain 8-12 June 1998, editors Reguera D, Vilar JMG,

Rubi JM, (Springer Verlag Lecture Notes in Physics, 527:112-123).

7.4 Artıculos y actividades de difusion y revision

1. Leyes de escalamiento y criticalidad en modelos de votantes y dinamica neuronal. Maximino Aldana. Aceptado en la revista INTERdisciplina-UNAM, 2018.

2. La microbiota intestinal en relacion con la obesidad. Maximino Aldana y Leonardo Huerta.

Periodico El Universal. 17 de agosto de 2018.

3. Documental sobre microbioma y obseidad. Maximino Aldana. Instituto Mexicano de Radio

y Television, Morelos. Abril 2018. (https://www.youtube.com/watch?v=PlSQiQZJkhs).

4. Resistencia epigenetica de las bacterias a los antibioticos. In La Union de Morelos News-

paper. Mayo 2014.

5. ¿Realmente sabemos educar a los hijos? M. Aldana y J. Dıaz. Columna Sin Embargo se

Mueve del periodico La Union de Morelos. 22 of mayo de 2013.

http://www.youtube.com/watch?v=PlSQiQZJkhs)



6. ¿Que le Falta a la Ciencia en Mexico? M. Aldana. Revista Temas: Cultura, Ideologıa y

Sociedad 69:26-30, (2012).

7. Structure and Dynamics of Genetic Networks. Maximino Aldana. In Consortimu News.

Consortium of the Americas for Interdisciplinary Science. University of New Mexico, USA. Nitant

Kenkre Editor. (Diciembre 2007).

8. Estructura y Dinamica de Redes Geneticas. M. Aldana. Gaceta de Biomedicas, UNAM.

Febrero, 2007.

9. The Emergent Science of Complex Networks. M. Aldana. Review of the books Lined by

A-L Barabasi and Nexus by M. Buchanan. Physics Today, 56 (3) (March 2003), 71-72.

10. La vida en la Tierra... ¿Se origino en la Tierra? M. Aldana. Revista ¿Como ves? UNAM,

23 (October, 2000), 10-18.

8 Formacion de Recursos Humanos

Alumnos graduados bajo mi direccion:

1. Rogelio Nino Hernandez. Licenciatura en Ciencias Genomicas, UNAM.

Obtencion del tıtulo: 27 de noviembre de 2017.

2. Mayra Patricia Garcıa Alcala. Maestrıa en Ciencias Fısicas, UNAM.

Obtencion del grado: Enero 27, 2016.

3. Martın Zumaya Hernandez. Maestrıa en Ciencias Fısicas, UNAM.


4. Saul Huitzil Juarez. Maestrıa en Ciencias Fısicas, UNAM.


5. Santiago Sandoval Motta. Doctorado en Ciencias Biomedicas, UNAM.

Obtencion del grado: Septiembre 9, 2015.

6. Diego Rodrıguez Sarmiento. Licenciatura en Ciencias Genomicas, UNAM.

Obtencion del grado: Mayo 12, 2015.

7. Christian Torres Sosa. Doctorado en Ciencias Bioquımicas, UNAM.

Obtencion del grado: Noviembre 6, 2014.

8. Mayra Patricia Garcıa Alcala. Licenciatura en Fısica, Universidad de Guadalajara.

Obtencion del grado: 10 de septiembre de 2012.

9. Bertha Vazquez Rodrıguez. Maestrıa en Ciencias Fısicas, Universidad Nacional Autonoma de

Mexico.


10. Jose Luis Herrera Aguilar. Doctorado en Ciencias de la Computacion, Universidad Autonoma del

Estado de Morelos.

Obtencion del grado: 13 de diciembre, 2011.

11. Bertha Vazquez Rodrıguez. Licencuatura en Fısica, Universidad Autonoma del Estado de Morelos.

Obtencion del grado: 18 de septiembre, 2009.

12. Diego Hartasanchez Frenk. Licenciatura en Fısica, Universidad Nacional Autonoma de Mexico.


7

13. Jaime Arturo Pimentel Cabrera. Maestrıa en Ciencias Fısica, Universidad Nacional Autonoma de

Mexico.

Obtencion del grado: 22 de Abril de 2008.

14. Enrique Balleza Davila. Doctorado en Ciencias Fısicas, Universidad Nacional Autonoma de Mexico.

Obtencion del grado: 13 de Noviembre de 2007.

15. Santiago Sandoval Motta. Licenciatura en Ciencias Genomicas, Universidad Nacional Autonoma

de Mexico.

Obtencion del grado: 4 de agosto de 2007.

Actualmente soy tutor principal de los siguientes alumnos:

1. Grisel Cordva Villalba. Maestrıa en Ciencias Biomedicas, UNAM.

2. Martın Sumaya Hernandez. Doctorado en Ciencias Fısicas, UNAM.

3. Mayra Patricia Garcıa Alcala. Doctorado en Ciencias Fısicas, UNAM.

4. Saul Huitzil Juarez. Doctorado en Ciencias Fısicas, UNAM.

5. Pavel Mote Hernandez. Licenciatura en Ciencias Genomicas. UNAM.

9 Proyectos de investigacion

Actualmente soy responsable de los proyectos:

• El papel del microbioma en la heredabilidad fenotıpica: un enfoque de la Biologıa de

Sistemas. PAPIIT-UNAM IN226917.

• Unidad de Comunicacion del Centro de Ciencias de la Complejidad (UCC3): Un proyecto integral para la ensenanza y la comunicacion publica de la ciencias en proyectos multi, inter y transdisciplinarios. PAPIME-UNAM PE308217.

Ademas, he sido responsable de los proyectos:

• Dinamica y Criticalidad en Redes Complejas de Regulacion. CONACyT 129471. Durante

el periodo 2011–2014.

• Fenomenos Colectivos en Redes Complejas. PAPIIT-UNAM IN112407-3. Durante el periodo

2006–2009.

10 Organizacion de Eventos

1. Organizador del evento The Third Week on Complexity Sciences. 26 al 28 de noviembre de

2018. Centro de Ciencias de la Complejidad, UNAM. Mexico.

2. Miembro del Comite Organizador del evento Symposium on Active Matter and Processes Out of Equilibrium, dentro del marco del International Materials Research Congress 2017. 20

al 25 de agosto de 2017. Cancun, Quintana Roo, Mexico.

3. Miembro del Comite Organizador del evento Microbioma MX: Primera reunion nacional enfocada al estudio del microbioma. 10 al 20 de mayo de 2016. Centro de Ciencias de la

Complejidad, UNAM. Mexico. 8

9

4. Miembro del Comite Orgenizador del evento Workshop on Criticality in Natural and Social Complex Systems: Celebrating Germinal Cocho’s 80th Birthday. 28 de julio al 1 de

agosto de 2014. Cuernavaca, Morelos, Mexico.

5. Miembro del Comite Organizador del XII Latin American Workshop on Non Linear Phe- nomena 2011. 10-14 de octubre 2011. San Luis Potosı, Mexico.

6. Miembro del Comite Organizador del XXXIX Winter Meeting on Statistical Physics 2010.

5-8 de enero de 2010. Taxco, Guerrero, Mexico.

7. Miembro del Comite Organizador del XXXVIII Winter Meeting on Statistical Physics 2009.

6-9 de enero de 2009. Taxco, Guerrero, Mexico.

8. Miembro del Comite Organizador del evento New Paths for Random Walks. 12-23 de enero de

2009. Cuernavaca, Morelos, Mexico.

9. Miembro del Comite Organizador del evento Workshop on New Directions in Genetic Reg- ulatory Networks. 24 de septiembre al 1 de octubre de 2006. Cuernavaca, Morelos, Mexico.

11 Experiencia docente

• 1994-1998. Profesor de asignatura en la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional Autonoma

de Mexico. Impartı los siguientes cursos:

– Fısica General para Fısicos, licenciatura.

– Fısica Clasica I (Mecanica), licenciatura.

– Matematicas Generales par Biologos, licenciatura.

– Funciones Especiales y Transformadas Integrales, licenciatura.


de Mexico y en la Facultad de Ciencias de la Universidad Autonoma del Estado de Morelos. Impartı

los siguientes cursos:

– Calculo I (calculo diferencial e integral de una variable), licenciatura.

– Calculo II (calculo diferencial de varias variables), licenciatura.

– Calculo III (calculo diferencial e integral de varias variables), licenciatura.

– Variable Compleja, licenciatura.

– Ecuaciones Diferenciales Ordinarias, licenciatura.

– Funciones Especiales y Transformadas Integrales, licenciatura.

– Termodinamica Estadıstica, licenciatura.

• 2002-2003. L. E. Dickson Instructor at the Mathematics Department of the University of Chicago.

Impartı los siguientes cursos:

– Mathematical Methods for the Physical Sciences (undergrad program).


de Mexico y en la Facultad de Ciencias de la Universidad Autonoma del Estado de Morelos. Impartı

los siguientes cursos:

– Metodos Matematicos para Fısicos I, licenciatura.

– Metodos Matematicos para Fısicos II, licenciatura.

– Termodinamica Estadıstica, licenciatura.

10

– Relatividad Especial, licenciatura.

– Introduccion a Redes Neuronales, licenciatura.

– Ecuaciones Diferenciales para las Ciencias Genomicas, licenciatura.

– Sistemas Complejos y Dinamica no Lineal, licenciatura.

– Mecanica Clasica, posgrado.

– Mecanica Estadıstica, posgrado.

– Procesos Estocasticos, posgrado.

– Impartı el curso Java programming for physicists en el Departamento de Fısica y Astronomıa

de la Universidad de Nuevo Mexico en 2007.

• 2013-presente. A partir del 2013 he impartido los siguientes cursos:

• Fısica Estadıstica. Posgrado en Ciencias Fısicas, UNAM. Semestre 2014-I.

• Mecanica Clasica. Facultad de Ciencias de la UAEMor. Semestre 2014-I.

• Mecanica Clasica. Posgrado en Ciencias Fısicas, UNAM. Semestre 2014-II.

• Mecanica Cuantica. Posgrado en Ciencias Fısicas, UNAM. Semestre 2015-I.

• Fısica Estadıstica. Postgrado en Ciencias Fısicas, UNAM. Semestre 2015-II.

• Mecanica Clasica. Posgrado en Ciencias Fısicas, UNAM. Semestre 2016-I.

• Fısica Estadıstica. Posgrado en Ciencias Fısicas, UNAM. Semestre 2016-II.

• Fısica Moderna. Curso Propedeutico de Ingreso al Posgrado en Ciencias Fısicas de la UNAM,

del 15 de septiembre al 6 de noviembre de 2015.

• Metodos de la Fısica Matematica 2 (Ecuaciones Diferenciales). Licenciatura en Fısica,

UAEMor. Semestre 2017-I.

• Fısica Estaıstica. Posgrado en Ciencias Fısicas, UNAM. Semestre 2017-II

• Metodos de la Fısica Matematica 1 (Variable Compleja). Licenciatura en Fısica, UAEMor.

Semestre 2018-I.

• Fısica Moderna. Curso Propedeutico de Ingreso al Posgrado en Ciencias Fısicas de la UNAM.

Semestre 2019-I.

12 Seminarios, Congresos, Talleres y Conferencias desde el 2004

1. Modelando el papel del micribioma en la evolucion: ¿Por que necesitamos a las bacterias? Coloquio del Posgrado en Ciencias Fısicas, UNAM. Instituto de Fısica, UNAM. 25 de

septiembre, 2018. CDMX, Mexico.

2. Modelando el papel del micribioma en la evolucion: ¿Por que necesitamos a las bacterias? Coloquio del Centro de Investigacion en Dinamica Celular, UAEMor. 10 de septiembre,

2018. Morelos, Mexico.

3. El papel del microbioma en la evolucion: ¿Por que necesitamos a las bacterias?. Evento

conmemorativo del 50 aniversario de la Facultad de Ciencias Fısico-Matematicas de la Universidad

Nicolaita. Morelia, Michoacan. 13 de junio de 2018.

4. The role of the microbiome in evolution. The Second Week on Complexity Sciences. Centro

de Ciencias de la Complejidad, UNAM. Enero, 2018. CDMX, Mexico.

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5. El papel del microbioma en la evolucion. Conferencia Magistral. Instituto de Ciencias Basicas

e Ingenierıa, Universidad Autonoma del Estado de Hidalgo. 5 de diciembre de 2017. Hidalgo,

Mexico.

6. ¿Que son los sistemas complejos? Evento conmemorativo de los 40 aos de la Facultad de

Ciencias Polıticas de la Universidad Autonoma del Estado de Mexico. 23-27 de octubre, 2017.

Toluca, Estado de Mexico.

7. Biologıa de sistemas para el estudio del microbioma y su influencia en enfermedades humanas. Primer Programa de Residencia para Periodistas: Ciencia, Salud, Tecnologıa y Medio

Ambiente. Instituto de Ecologıa, UNAM. 1-7 de octubre de 2017. UNAM, Mexico.

8. The role of the microbiome in evolution. International Conference in Complex Systems 2017.

17-22 de septiembre de 2017. Cancun, Quintana Roo, Mexico.

9. Modeling collective motion: How to keep the flock together. Materials Research Congress

2017. 20 al 25 de agosto, 2017. Cancun, Quintana Roo, Mexico.

10. The three-base structure of the genetic code. ELSI Workshop on Self-assembly Processes

out of Equilibrium. Earth-Life Science Institute, Tokyo Institute of Technology. 12 de julio de 2017.

Tokyo, Japan.

11. Movimiento colectivo: ¿como mantener al grupo unido? XIII Encuentro Xalapeo de Fısica.

Universidad Veracruzana. Octubre 12-14, 2016. Veracruz, Mexico.

12. ¿Que son los sistemas complejos? Coloquio del Instituto de Ciencias Nucleares, UNAM. 27 de

mayo de 2016, Mexico.

13. Epigenetic inheritance of antibiotic resistance in bacteria: a stochastic formulation.

2015-2016 Warwick EPSRC Symposium: Fluctuation-driven phenomena in biological systems. 18-

22 de abril de 2016, Warwick, Inglaterra.

14. Antibiotic resistance in bacteria. UNAM-Saitama University Forum. 3 al 6 de marzo, 2016.

Saitama University, Japon.

15. Pairwise decomposition of complex perturbation: The N-body problem revisited. XLV

Winter Meeting on Satistical Physics. Enero 10-13, 2016. Taxco, Mexico.

16. Epigenetic inheritance of adaptive antibiotic resistance in bacteria. International Work-

shop on Nonlinearity, Nonequilibrium and Complexity: Questions and Perspectives in Statistical

Physics, Noviembre 29 a Diciembre 4, 2015. Ciudad de Mexico.

17. ¿Que son los sistemas complejos? Primera Semana de Ciencias de la Complejidad. Noviembre

17-20, 2015. UNAM, Mexico.

18. Aspectos eticos en el trabajo cientıfico. Coloquio del Posgrado en Ciencias Fısicas, UNAM.

Nobiembre 19, 2015.

19. Adaptive resistance to antibiotics in bacteria. XIV Latin American Workshop on Nonlinear

Phenomena. Septiembre 21-25, 2015. Cartagena, Colombia.

20. Pairwise decomposition of complex perturbations acting on Boolean networks. Work-

shop on Brains and Beyond. Agosto 31 a Septiembre 4, 2015. Capri, Italia.

21. Movimiento colectivo. XXIII Escuela de Verano en Fısica. Llevada a cabo en Cuernavaca,

Morelos, Mexico, 22 de junio al 3 de julio de 2015.

22. Emergencia de la resistencia a antibioticos en bacterias. IV Convencion internacional y

XI Nacional de Profesores de Ciencias Naturales. Noviembre 13-14, 2014. Oaxaca, Mexico.

12

23. Movimiento colectivo: Cmo mantener al grupo unido. VI Reunion tematica de materiales

complejos y nanoestructurados. Noviembre 26-28, 2014. Instituto de Fısica, BUAP. Puebla, Mexico.

24. Modelos de movimiento colectivo. Jornadas de Otono celebrando el LX Aniversario de la Uni-

versidad Autonoma de Chihuahua. Octubre 20-24 de 2014. Universidad Autonoma de Chihuahua,

Mexico.

25. Curso de redes complejas. XXII Escuela de Verano en Fısica. Del 30 de junio al 4 de julio de

2014. Instituto de Ciencias Fısicas, UNAM. Cuernavaca, Mexico.

26. Herencia epigenetica de la resistencia a antibioticos en bacterias. Coloquio del Instituto

de Fısica de la UASLP. 12 de marzo de 2014.

27. Herencia epigenetica de la resistencia a antibioticos en bacterias. XV Escuela de Otono

de Biologıa Matematica. Universidad de Sonora. Noviembre 15, 2013.

28. Pairwise decomposition of multi-component perturbations. Workshop on Mathematical

Physics: Symposium in honor of Kurt Bernardo Wolf. Centro Internacional de Ciencias, Cuer-

navaca. Noviembre 22, 2013.

29. Mecanismos epigeneticos de resistencia a antibioticos en bacterias. Seminario del Depar-

tamento de Fısica, UAM-Cuajimalpa. Octubre 7, 2013.

30. Evolution of criticality in genetic networks. Workshop From molecular mechanisms to macro-

scopic dynamics in biological networks. The Graduate Center of the City University of New York.

Abril 9, 2013.

31. Emergence of critical dynamics in the evolution of genetic networks. Computations in

Science Seminar. The James Franck Institute of the University of Chicago. Febrero 20, 2013.

32. Dynamic models to predict the effect of multi-drug combinations on bacterial growth based on pairwise combinations. Bauer Forum, FAS Center for Systems Biology, Harvard

University. Junio 6, 2012.

33. Critical dynamics in genetic networks as an emergent property in evolution. Workshop

on Algebraic Methods in Systems and Evolutionary Biology. Mathematical Biosciences Institute,

Columbus, Ohio. Mayo 7-11, 2012

34. Problemas del trabajo cientıfico y la cooperacion internacional desde el Sur. Foro de

discusion Ultimo Jueves para la revista Temas, organizado por Rafael Hernandez. David Rockefeller

Center for Latin American Studies, Harvard University. 27 de octubre de 2011.

35. Dynamical criticality in genetic networks is an emergent property in evolution. Systems

Biology Theory Lunch. Harvard Medical School, Harvard University, USA. 14 de octubre, 2011.

36. Dynamical criticality in genetic networks is an emergent property in evolution. Bauer

Forum. FAS Center for Systems Biology, Harvard University, USA. 12 de octubre, 2011.

37. ¿Que son los sistemas complejos y como se comportan? XIX Escuela de Verano en Fısica.

Instituto de Ciencias Fısicas, UNAM. 1-5 de agosto de 2011.

38. Evolucion de Redes Geneticas: Un Enfoque Dinamico. Seminario del Centro de Investi-

gacion en Energıa, UNAM. 15 de Junio, 2011.

39. Evolucion de Redes Geneticas. Primer Congreso Mexicano de Ciencias de la Complejidad.

Ciudad de Mexico. 4–6 de octubre de 2010.

40. Nuevos Paradigmas en la Evolucion de Redes Geneticas. Primer Taller de Biologıa

Sintetica. CINVESTAV Unidad Irapuato, Mexico. 23 de julio de 2010.

13

41. Phase Transitions in Swarming Systems: A Recent Debate. XI Latin American Workshop

on Nonlinear Phenomena: LAWNP 09. Buuzios, Rıo de Janeiro, Brasil. 5-9 de octubre, 2009.

42. Curso de Sistemas Complejos. XVIII Simposio Peruano de Fısica. Arequipa, Peru. 31 de

agosto al 6 de septiembre, 2009.

43. Transiciones de fase en el movimiento colectivo de muchas partıculas. Seminario de

Fısica. Departamento de Fısica e Inteligencia Artificial, Universidad Veracruzana, Xalapa, Ver-

acruz, Mexico. 20 de marzo de 2009.

44. Critical dynamics in genetic regulatory networks: A holistic perspective. Japan-Mexico

Workshop on Pharmacobiology and Nanobiology. Instituto de Fisiologı a Celular, UNAM, Mexico.

25-26 de febrero, 2009.

45. La relevancia evolutiva de criticalidad dinamica en en redes geneticas. Primer Congreso

“Complejidad, Ciencia y Sociedad: Nuevas Agendas Para la Reflexion y la Investigacion. Oaxtepec,

Morelos, Mexico. 23-24 de febrero, 2009.

46. Critical Dynamics in Genetic Networks: Examples from Four Kingdoms. XVI Confer-

ence on Nonequilibrium Statistical Mechanics and Nonlinear Physics: MEDYFINOL 08. Punta del

Este, Uruguay. 1-5 de noviembre, 2008.

47. On the Emergence of Collective Order in Swarming Systems: A Recent Debate. Escuela

y Taller Interdisciplinario de Sistemas Complejos. Isla Margarita, Venezuela. 27-30 de octubre,

2008.

48. Criticality in Genetic Regulatory Networks. Computations in Science Seminar. James

Franck Institute, University of Chicago, USA. 6 de agosto, 2008.

49. Phase Transitions in Swarming Systems: A Recent Debate. Computations in Science

Seminar. James Franck Institute, University of Chicago, USA. February 20, 2008.

50. Critical Dynamics in Genetic Regulatory Networks: Examples from Four Kingdoms. Workshop on Conputational Philosophy: Lessons from Simple Models. Niels Bohr Institute, Uni-

versity of Copnenhagen, Denmark. October 10-13, 2007.

51. Robustness, Evolvability and Criticality in Genetic Regulatory Networks. Workshop on

Dynamics of Regulatory Networks. Cuernavaca, Morelos, Mexico. Julio 22-Agosto 11, 2007.

52. A Network Approach for the Study of Many-Particle Swarms: Achievements, Limita- tions and New Directions. SIAM Conference on Applications of Dynamical Systems. Snowbird,

Utah, USA. Mayo 27-Junio 2 2007.

53. Robustness and Evolvability in Genetic Regulatory Networks. Workshop on New Direc-

tions in Complex Systems. Buyukada, Istambul, Turkey. Setiembre 2006.

54. Genetic Networks: Structure and Function. Series of lectures given at the Consortium of

the Americas for Interdisciplinary Science, University of New Mexico, Albuquerque, New Mexico,

USA. July-November, 2006.

55. Robustness and Evolvability in Genetic Regulatory Networks. Institute for Biocomplexity

and Informatics. University of Calgary, Alberta, Canada. Junio 2006.

56. Robustness and Evolvability in Genetic Regulatory Networks. Workshop on Computa-

tional Systems Biology, Tampere University of Technology, Tampere, Finland. Junio 2006.

57. Estructura y Dinamica de Redes Geneticas. Programa de Genomica Computacional y

Genomica de Sistemas, Centro de Ciencias Genomicas, UNAM. Mayo 2006.

58. Robustez y Evolucion en Redes Geneticas. Coloquio del Departamento de Fısica del CIN-

VESTAV. CINVESTAV, Mexico D.F. Abril 5, 2006.

14

59. Phase Transitions in Systems of Self-Propelled Particles and Majority Voter Models.

IPAM workshop on Swarming by Nature and by Design. Institute of Pure and Applied Mathematics,

University of California in Los Angeles. Febrero 2006.

60. Distributed Robustness and Evolvability in Genetic Regulatory Networks. Computations

in Science Seminar. The James Frank Institute, The University of Chicago, Chicago, Illinois, USA.

October 12, 2005.

61. Inagural Conference of the Institute of Biocomplexity and Informatics, Robustness and

Evolvability in Genetic Regulatory Networks. Calgary, Alberta, Canada. August 27-September 1,

2005.

62. Evolucion de Redes Geneticas. Seminario Problemas Cientıficos y Filosoficos. Coordinacion

de Humanidades, UNAM. D.F., Mexico. April 2005.

63. Robustez y Evolucion de Redes Geneticas. Centro de Ciencias Genomicas, UNAM. Cuer-

navaca, Mexico. April 2005.

64. Workshop on Stochasticity and Nonlinearity on Three Continents, Robustness and Evolv-

ability in Genetic Regulatory Networks. University of New Mexico, Santa Fe, New Mexico, USA.

March 30-April 2, 2005.

65. Transiciones de Fase en Modelos de Votantes y Sistemas de Movimiento Colectivo. Seminario Jesus Reyes Corona. Instituto de Fısica “Luis Rivera Terrazas”, Benemerita Universidad

Autonoma de Puebla. Febrero, 2005.

66. XXXIV Winter Meeting on Statistical Mechanics. Phase Transitions in Majority Voter

Models and Many-Particle Systems. Taxco, Guerrero, Mexico. January 4-January 7, 2005.

67. Orden y Movimiento Colectivo en Sistemas de Muchas Partıculas. Seminario del Depar-

tamento de Termociencias. Centro de Investigacion en Energıa, UNAM. Octubre, 2004.

68. Transiciones de Fase en Redes Neuronales Complejas. Seminario Fronteras de la Fısica.

Centro de Ciencias Fısicas, UNAM. Septiembre, 2004.

69. Dynamical Phase Transitions in Complex Neural Networks. University of New Mexico,

USA. June 2004.

70. Understanding Genetic Regulatory Networks. University of New Mexico, USA. June 2004.

71. Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics (GENSIPS), Dynamics of Genetic

Networks with Scale-Free Topology. Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland, USA. May 25-

28, 2004.

13 Otras actividades academicas e institucionales

• Coordinador Academico del Centro de Cienciasd de la Complejidad de la UNAM. Del 1 de marzo

de 2016 al 1 de marzo de 2018.

• Secretario Academico del Instituto de Ciencias Fısicas de la UNAM, del 1 de agosto de 2013 al 16

de agosto de 2015.

• Miembro del Consejo Interno del Instituto de Ciencias Fısicas de la UNAM, de julio de 2010 a

agosto de 2011.

• Organizador (junto con el Dr. Guillermo Hinojosa) del Coloquio Semanal del Instituto de Ciencias

Fısicas de la UNAM, de junio de 2008 a agosto de 2010.

15

• Miembro de la Comision de Computo del Instituto de Ciencias Fısicas de la UNAM, de febrero de

2008 a agosto de 2011.

• Secretario de la Mesa Directiva del Colegio del Personal Academico del Instituto de Ciencias Fısicas

de la UNAM, del 2006 al 2008.

• Analista Evaluador en el Comite de Ciencias Naturales y Exactas de los Comites Interinstitucionales

de Evaluacion de la Educacion Superior (CIEES), mayo de 1997 a Noviembre de 2000.

• Arbitro de las revistas:

– Physical Review Letters.

– Physical Review E.

– Physica A.

– Physica D.

– Chaos: Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science.

– Journal of Theoretical Biology.

– Journal of Modern Physics A.

– Journal of Modern Physics B.

– Revista Mexicana de Fısica.

– The European Physical Journal E.

– PLoS Computational Biology.

– PLoS ONE.

– BMC Evolutionary Biology.

– Artificial Intelligence in Medicine.

– Proceedings of the National Academy of Science, USA.

– The New Journal of Physics.

– Frontiers in Genetics.

– Frontiers in Physiology.

Curr´ıculum Vitae Maximino Aldana Gonza´lez - … · BMC Systems Biology 9:42, (2015). Nota:...

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