Ciencias Bsicas en Salud: Medicina Genomica

Heinner Guio MD, PhDLima, 09 de Diciembre del 2015

La investigacion en el area medicaesta permitiendo grandes avances

Medicina predictiva

Medicina Curativa

Medicina preventiva

Eficacia del medicamento Efectos adversos

Igual diagnosticoIgual prescripcion

Medicina Curativa

Medicina Preventiva

AMBIENTE

HOSPEDERO PATOGENOINTERACCION HOSPEDERO-PATOGENO

DESARROLLO DEINFECCION OENFERMEDAD

Susceptibilidad geneticaInmunologia

Genotipos bacterianosResistencia

ComorbilidadesNutricion

Urbanizacion

SocieconomiaControl de TBTasmision

EPIDEMIOLOGIA

CIENCIAS BASICAS

Medicina Preventiva

Genomica>>Transcriptomica>>ProteomicaADN ARN Proteinas

Medicina predictiva

Antecedentes familiares

Asesora sobre los riesgos de salud

Informacin genmica

Programa de Ayuda en decisin clnica

TabacoObesidad

EstrsSedentarismo

Dieta rica en grasas

Frutas/vegetales

Droga A

Droga B

Medicina Personalizada

Nigeria (30); Japan (45); China (45); USA (30)

Y la poblacin Amerindia?En que estn basados los

diagnsticos genticos actuales?

Es aplicable el diagnostico gentico a la poblacin Peruana?

..ACACTATGCACCACCTAAGTCTTGATC..

..ACACTATGCACCACCTAAGTCTTGATC..

..ACACTATGCACCACCTAAGTCTTGATC..

..ACACTATGCACCACCTAAGTCTCGATC..

..ACACTATGCACCACCTAAGTCTCGATC..

..ACACTATGCACCACCTAAGTCTCGATC..

..ACACTGTGCACCACCTAAGTCTCGATC..

No! Todos nosotros tenemos errores de ortografa (variacin gentica)

Nuestros genomas son similares en 99.9%, pero son grandes (3 x 109 pares de bases) entonces

~ 3 millones de errores de ortografa entre dos genomas.

Hay un solo genoma?

Nuestra Historia Empieza en fricaEn teora somos mas resistentes a la infeccion

El mestizaje y lo globalizacion podrian disminuir la resitencia inicial a la infeccion

PEL: Peruvians from Lima, Peru

Donde estan los nativos Americanos?

ADAPTACION Y EVOLUCION

30% de nuestra poblacion vive sobre los 2500 msnmEl diagnostico y tratamiento medico esta basado en la fisiologia del hombre andino?

Migrar a la altura es un factor de riesgo para incrementar la PA por consiguiente las dosis de medicamentos deberia regularse

Effects of High Altitude on Blood Pressure High Alt Med Biol10(1):11-5 (2009)Medication and dosage considerations in the prophylaxis and treatment of high-altitude illness Chest 133(3):744-55 (2008)

ADAPTACION Y EVOLUCION

Anemia en gestantes: patologa o adaptacin?

Hemoglobin, altitude and birth weight: does maternal anemia during pregnancy influence fetal growth? J Reprod Med 49(4):29

Efecto de las migraciones

ASHANINKA CANDOSHI SHAPRA

CHACHAPOYAS MATSIGENKA

MOCHESHIPIBO-CONIBO

MATSS

NAHUAS

JAQARUS

AFRODESCENDIENTES

Mestizo Mestizo

Desde 1940 hay un mayor incremento en la poblacin urbana

0

5000

10000

15000

20000

25000

1940 1961 1972 1981 1993 2000 2005 2010 2015

Pobl

aci

n en

Mile

s de

habi

tant

es

Urbano Rural

Cada dia, es un dia menos de oportunidad para entender nuestra diversidad genetica!!

Mestizo Mestizo

Grfico1

21971334010834

46981785208568

80584955479713

110919235913287

154585996589757

186472427292087

202964367650338

219675777990227

236217078350320

Urbano

Rural

Hoja1

194019611972198119932000200520102015

Urbano219713346981788058495110919231545859918647242202964362196757723621707

Rural401083452085685479713591328765897577292087765033879902278350320

Fuente: Per:Compendio Estadstico 2001Fuente: Per:Estimaciones y Proyecciones de Poblacin, 1950-2050. Urbana-Rural 1970-2025. Boletn de Anlisis Demogrfico N 35.

URB72.6%

RUR27.4%

Poblaciones seleccionadas(Representatividad, Vulnerabilidad, Grado de aislamiento)

- Lima- Callao- Trujillo- Arequipa- Cusco- Iquitos- Puno- Tacna- Moquegua- Ancash- Chiclayo- Ayacucho- Tumbes.

Poblacin Nativa (n=17) Poblacin Mestiza (n=13)

100 muestras por cada poblacion (N=3000)

Resultados de los 150 genomas secuenciados

Nuevos polimofismos propios en la poblacion peruana

30%

Anterior (11,0M)

Nueva (3,3M)

Meta: Encontrar nueva variacin

1000 genomesGenoma humanoHap map

# de

Var

iant

es N

ueva

s

Distribucin de variaciones nuevas

Los mestizos peruanos son en su mayoria de componentes nativos peruanos

# de

Var

iant

es p

atog

nic

as

Variantes patognicas en la poblacin global

La mayoria de variantes patogenicas se encuentran estudiadas en la poblacion europea

Susceptibilidad en tuberculosis

La presencia de (MCP-1)-1 2G/2G -1607 >>>x13 veces mas severa y 6.5 veces de desarrollar lesiones permanentes en TB pulmonar

Inhibidores de esta proteina podrian ayudar al tratamiento de TB.

Genes Immun. 2012 Dec;13(8):605-20

Fenotipo:-Rapido

-Intermedio

-Lento

Farmacogentica en el metabolismo de INH y RIF

>>>>MDR

>>>>Efectos adversos

TRATAMIENTOINH y RFP

Farmacogentica en el metabolismo de INH

0

10

20

30

40

50

60

Callao LimaCuidad

Lima Este Lima Sur

Lento

Intermedio

Rapido

NAT2: Metabolizador de Isoniazida

05

101520253035404550

Callao LimaCiudad

Lima Este Lima Sur

Alto

Bajo

FENOTIPOS LENTOS CON RESPECTO A RIESGO HEPATOXICIDAD ANALIZANDO CYP2E1

Farmacogentica en el metabolismo de RIF

0.0

20.0

40.0

60.0

80.0

100.0wt/wt . AADAC*1

wt/++ .AADAC*1/AADAC*2.++/++ . AADAC*2 Rapido +++

Normal

Rapido +

Farmacogentica en el metabolismo de RIF

0.0

20.0

40.0

60.0

80.0

100.0wt/wt . AADAC*1

wt/++ .AADAC*1/AADAC*2.++/++ . AADAC*2 Rapido +++

Normal

Rapido +

Gracias

Nmero de diapositiva 1La investigacion en el area medica esta permitiendo grandes avancesNmero de diapositiva 3Nmero de diapositiva 4Nmero de diapositiva 5Medicina predictivaNmero de diapositiva 7Nmero de diapositiva 8Nmero de diapositiva 9Nmero de diapositiva 10Nmero de diapositiva 11Nmero de diapositiva 12Nmero de diapositiva 13Nmero de diapositiva 14Nmero de diapositiva 15Nmero de diapositiva 16Nmero de diapositiva 17Nmero de diapositiva 18Nmero de diapositiva 19Nmero de diapositiva 20Nmero de diapositiva 21Nmero de diapositiva 22Nmero de diapositiva 23Nmero de diapositiva 24