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Carlos F. Arias Integrantes del Grupo (2012-2013): Líderes Academicos: Carlos F. Arias, Susana López Investigadores asociados: Pavel Isa, Tomás López, Gustavo Martínez Técnicos académicos: Rafaela Espinosa, Pedro Romero, Blanca Taboada, Marco A. Espinoza (honorarios) Estudiantes: Maestría: Georgina Cobián, Luis Felipe Paulín, Diego Cevallos, Cinthia Martínez, Joaquín Moreno, Fernando Aponte, José Luis Martínez, Juan Manuel Carreño, Yerli Marín. Doctorado: Daniela Silva, Marco Aurelio Díaz, Jesús Torres, Andrea Murillo, Miguel A. Martínez, Rosa Ma. Rubio, Enrique Rojas, Alfonso Oceguera, Liliana Sánchez, Luis Casorla. Administrativos: Lorena Salazar, Miguel Angel Olvera. Nayeli Uribe Publicaciones: 1. López, T., Silva-Ayala, D., López, S., Arias, CF. 2012. Methods suitable for high-throughput screening of siRNAs and other chemical compounds with the potential to inhibit rotavirus replication. J. Virol. Meth. 179:242-249. 2. López, S. and Arias, CF. 2012. Rotavirus-host cell interactions: An arms race. Current Opinion in Virology. 2:389-398. 3. Calderon MN, Guerrero CA, Acosta O, Lopez S, Arias CF. 2012. Inhibiting rotavirus infection by membrane-impermeant thiol/disulfide exchange blockers and antibodies against protein disulfide isomerase. Intervirology. 55:451-464. 4. Escalera-Zamudio M, Cobián-Güemes G, de los Dolores Soto-del Río M, Isa P, Sánchez-Betancourt I, Parissi-Crivelli A, Martínez-Cázares MT, Romero P, Velázquez-Salinas L, Huerta-Lozano B, Nelson M, Montero H, Vinuesa P, López S, Arias CF. 2012. Characterization of an influenza A virus in Mexican swine that is related to the A/H1N1/2009 pandemic clade.Virology. 433:176-182. 5. Yu G, Greninger AL, Isa P, Phan TG, Martínez MA, de la Luz Sanchez M, Contreras JF, Santos-Preciado JI, Parsonnet J, Miller S, DeRisi JL, Delwart E, Arias CF, Chiu CY. 2012. Discovery of a novel polyomavirus in acute diarrheal samples from children. PLoS One. 7(11):e49449. doi: 10.1371/journal.pone.0049449. Epub 2012 Nov 14. 6. Díaz-Salinas MA, Romero P, Espinosa R, Hoshino Y, López S, Arias CF. 2013. The spike protein VP4 defines the endocytic pathway used by rotavirus to enter MA104 cells. J Virol. 87:1658-1663.

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7. Martínez MA, López S, Arias CF, Isa P. 2013. Gangliosides have a functional role during rotavirus cell entry. J Virol. 87:1115-1122. 8. Rubio RM, Mora SI, Romero P, Arias CF, López S. 2013. Rotavirus prevents the expression of host responses by blocking the nucleo-cytoplasmic transport of polyadenylated mRNAs. J Virol. 87:6336-6345. 9. Arias CF. 2013. Virus diversity and evolution. Curr. Opin. Microbiol. 16:465-467. 10. Daniela Silva-Ayala, Tomás López, Michelle Gutiérrez, Norbert Perrimon, Susana López, Carlos F. Arias. 2013. A genome-wide RNAi screen reveals a role for the ESCRT complex in rotavirus cell entry. Proc Natl Acad Sci USA. 110:10270-10275. 11. Vazquez-Perez JA, Isa P, Kobasa, D, Ormsby CE, Ramírez-Gonzalez JE, Romero-Rodriguez, DP, D, Ranadheera, C, Li, Y, Bastien, N, Embury-Hyatt, C, González-Duran E, Barrera-Badillo G, Ortiz J, Ablanedo-Terrazas Y, Sevilla-Reyes E, Escalera-Zamudio M., Cobián-Güemes AG, Lopez I, Ortiz-Alcantara J., Alpuche-Aranda C, Perez-Padilla R, Reyes-Teran G. (2013) A (H1N1) pdm09 HA D222 variants associated with severity and mortality in patients during a second wave in Mexico. Virology Journal, 10:41; doi 10.1186/1743-422X-10-41. Enviados 1. Ernesto Méndez, Claudia Muñoz-Yañez, Claudia Sánchez-San Martín, Gabriela Aguirre-Crespo, Ma. del Rocio Baños-Lara, Michelle Gutierrez-Mayret, Rafaela Espinosa, Yunuen Acevedo, Carlos F. Arias, and Susana López. 2013. Studies on the entry of human astrovirus in Caco-2 cells. Submitted Journal of Virology. 2. Luis F. Paulin, María D. Soto-Del Río, Iván Sánchez, Jesús Hernández, Rosa M. Gutiérrez-Ríos, Irma López-Martínez, Rosa M. Wong-Chew, Aurora Parissi-Crivelli, P. Isa, Susana López, and Carlos F. Arias. 2013. PhyloFlu, a DNA microarray to determine the phylogenetic origin of influenza A gene segments and the genomic fingerprint of viral strains. Submitted Journal of Clinical Microbiology. 3. Marco A. Díaz-Salinas, Daniela Silva-Ayala, Susana López, and Carlos F. Arias. 2013. Rotaviruses reach late endosomes and require the cation-dependent mannose-6- phosphate receptor and the activity of cathepsin proteases to enter the cell. Submitted Journal of Virology. 4. Ezequiel M. Fuentes-Pananá, Violeta Larios-Serrato, Alfonso Méndez-Tenorio, Ana G. Cobian-Güemes, Juan L.E. Martínez-López, Pavel Isa, Carlos F. Arias, and Javier Torres. 2013. Wide-genome sequencing supports presence of Epstein-Barr virus in gastric but not in breast cancer. Submitted Journal of Virology. 5. Carrera AV, Mercado GMC, Trujillo OME, Mendoza ES, Isa P, Paulin LF, Arias CF,

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Sanchez-Betancourt JI. 2013. Genetic changes detected in internal genes of porcine influenza viruses isolated in Mexico. Submitted Transboundary and Emerging Diseases. Capítulos de libro: 1. Méndez, E. and Arias, C.F. 2013. Astroviruses chapter. In Fields Virology. 6th Edition. Editors in chief: DM Knipe and PM Howley. Lippincott Williams & Wilkins. 2. Ernesto Méndez, Andrea Murillo, Rodrigo Velázquez, Andrew Burnham, and Carlos F. Arias. 2013. Replication Cycle of Astroviruses. In Astrovirus Research: Essential Ideas, Everyday Impacts, Future Directions. Editor: Stacy Schultz-Cherry. Springer Patentes y Desarrollos Tecnológicos 1. Solicitud provisional USA: “A novel polymavirus associated with diarrhea in children”. Charles Chiu, Guixia Yu, Alexander Greninger, Pavel Isa, Carlos F. Arias, Joseph De Risi, Juliet Parsonnet y Steve Miller. No. 61/469,380, presentada el 22 de agosto de 2012. 2. Solicitud PCT: “A novel polymavirus associated with diarrhea in children”. Charles Chiu, Guixia Yu, Alexander Greninger, Pavel Isa, Carlos F. Arias, Joseph De Risi, Juliet Parsonnet y Steve Miller. No. 13/973,544, presentada el 22 de agosto de 2013. Tesis Concluidas: Licenciatura: 1. Joaquín Moreno Contreras. 2013 (Abr 27). "Papel del sistema ubiquitina-proteasoma en la morfogénesis de rotavirus". Licenciatura en Ciencias. Facultad de Ciencias, Universidad Autónoma del Estado de Morelos. (Tutor: Tomás López). Maestría 1. Luis Alberto Casorla Pérez. 2012 (Sep 27). Identificación de los cambios en el patrón de fosfoproteínas inducidos por la infección con rotavirus". Maestría en Ciencias Bioquímicas IBt/UNAM. (Tutor: Tomás López). 2. Diego Cevallos Porta. 2012 (Dic 14). “Infección de rotavirus porcino en celulas polarizadas de intestino de puerco.” 2013 Maestría en Ciencias Bioquímicas IBt/UNAM. (Tutor: Pavel Isa). 3. Ana Georgina Cobián Güemes. (Mar 7). "Metagenómica viral de enfermedades respiratorias graves". Maestría en Ciencias Bioquímicas IBt/UNAM. (Tutor: Carlos Arias). 4. Luis Felipe Paulín Paz. 2013 (Mar 21). "Desarrollo y validación de un microarreglo para detectar el origen filogenético de los ocho segmentos del genoma del virus de influenza". Maestría en Ciencias Bioquímicas IBt/UNAM. (Tutor: Carlos Arias). 5. Enrique Rojas Martínez. 2013. "Caracterización del tráfico vesicular usado por rotavirus durante su ingreso a la célula hospedera". Maestría en Ciencias Bioquímicas IBt/UNAM.

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Pase Directo a Doctorado en Ciencias Bioquímicas. (Tutor: Carlos Arias). 6.- Alfonso Oceguera 2012 (Feb.9) “Caracterizacion del sitio de desencapsidacion de los Rotavirus”. Maestría en Ciencias Bioquímicas IBt/UNAM (Tutor: Susana López). 7.- Liliana Sanchez Tacuba 2012 Jun 27) “Estudio de los mecanismos que modulan la via 2´5-oligoadenilato sintetasa/RNAsa L durante la infección por rotavirus” Maestría en Ciencias Bioquímicas. IBt/UNAM (Tutor: Susana López).

8.- Paula Rubio Alvarado 2013 (Abril 26) “Estudio y caracterización de los RNAs pequeños producidos durante la infección por rotavirus y su papel en la defensa antiviral”. Maestría en Ciencias Bioquímicas. IBt/UNAM (Tutor: Susana López). 9.- Héctor Ramirez Gomez 2013 (Ago 28) “Generación de una línea celular que inhibe la expresion de una proteína de rotavirus”. Maestría en Ciencias Bioquímicas. IBt/UNAM (Tutor: Susana López). Doctorado 1.- Vicenta Trujillo 2012 (Mar 22) “Papel de la infección por rotavirus en la inducción de estres celular” Doctorado en Ciencias Bioquimicas. IBt/UNAM (Tutor: Susana López). 2.- Rosa Rubio Robles 2013 (Jul 28) “Regulacion de la traducción en celulas infectadas por rotavirus” Doctorado en Ciencias Bioquimicas. IBt/UNAM (Tutor: Susana López). Docencia 1. Curso “Biología molecular de Virus” para maestría y doctorado en el posgrado en Ciencias Bioquimicas/UNAM y la Licenciatura en Biología de la Facultad de Ciencias, UNAM. Ago 2012 – Ene 2013. Responsables Carlos Arias y Pavel Isa. Y, Ago 2013 – Ene 2014. Responsables Carlos Arias y Tomás López. 2. Participación en Curso: “Temas selectos de Virología Molecular” en la Sección de Estudios de Posgrado en Investigación de IPN, con el tema "Los Virus Influenza". 23/10/2012 3 horas. Pavel Isa. 3. Participación en Curso Básico “Biología celular” en Programa en Ciencias Bioquímicas de la UNAM, con tema Matriz extracelular, del 28/1/2013-24/5/2013 – 6 horas. Pavel Isa. 4. Participación en II Simposio de Actualización de Herramientas Moleculares en la Investigación Biomédica. Centro Nacional de Investigación Disciplinaria en Microbiología Animal, INIFAP, 17 mayo 2012. Pavel Isa. 5. Participación en Curso “ La Ingeniería Genética y sus Aplicaciones” con el tema "Entrada de rotavirus a célula polarizada del intestino delgado". Sección de Graduados de la ENCB, mayo 2013. Pavel Isa. 6. Participación en Jornadas Internacionales de Actualización en Ingeniería Bioquímica, conferencia “Técnicas moleculares en virología y su aplicación en investigación básica y

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aplicada”. Universidad de Guadalajara, centro Universitario de los Lagos, 20 junio 2013. Pavel Isa. 7. Curso de Virología en el Departamento de Biomedicina Molecular del CINVESTAV. Tema: Reovirus, Rotavirus y Orbivirus. 2012 y 2013. Tomás López. 8. Plática para estudiantes, ITESM-Querétaro. "Estrategias globales en el estudio de las interacciones virus-célula". (09/11/12) . Tomás López. Donativos: 1. Proyecto DGAPA/UNAM. IN-213410 (2010-2012). Identificacion de virus respiratorios y subtipificación de influenza tipo A en muestras clinicas utilizando un microarreglo de DNA. Responsable Pavel Isa. 2. Proyecto Salud-Conacyt 111593 (2009-2012). Desarrollo y validación de un microarreglo de DNA para detección y subtipificación de agentes virales asociados a gastroenteritis. Responsable Pavel Isa. 3. Proyecto. SEP-CONACYT 102823 (2009-2012). Estudio del mecanismo de entrada de rotavirus a su célula huésped. Responsable: Responsable Pavel Isa. 4. Proyecto Salud-Conacyt 69852 (2011-2013). Diagnóstico molecular de patógenos asociados a enfermedades respiratorias usando un microarreglo de DNA. Responsables Ignacio Santos/Carlos F. Arias. 5. Proyecto DGAPA/UNAM. IN212211-3 (2011-2013). Papel del sistema ubiquitina-proteasoma en la replicación de rotavirus. DGAPA-UNAM. Responsable Tomás López. 6. Proyecto DGAPA/UNAM. IN211411-3 (2011-2014). Mecanismos de evasión de la respuesta antiviral por rotavirus. Responsable: Susana López. 7. Proyecto. SEP-CONACYT 153639 (2011-2014) Caracterizacion de las interacciones de los rotavirus con su celula huesped necesarias para el establecimiento de una infeccion productiva. Responsable: Susana López. 8. Proyecto DGAPA/UNAM. IN207313 (2013-2015). Identificación de los gangliósidos específicos involucrados en la entrada de diversas cepas de rotavirus. Responsable: Pavel Isa. Premios y Distinciones: Premio Universidad Nacional 2013. Investigación en Ciencias Naturales. Compartido con Susana López. Otras actividades relevantes:

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1. Comités editoriales: • Editorial Board de Journal of Virology por el periodo Ene 2004 –Dic 2014 (cinco

renovaciones de 2 años c/u) • Editorial Board de Archives of Medical Research por el periodo Abril 2011- • Revisor ad hoc de PNAS, PLoS Pathogens, Journal of Virology, Virology, Journal of

General Virology, PLoS ONE, Journal of Proteomics, Veterinary Research, Arhives of Medical Research, Revista del INSP.

2. Consejos Directivos/Administración/Académicos • Miembro del Organo de Gobierno del Centro de Investigación y Asistencia en

Tecnología y Diseño del Estado de Jalisco (CIATEJ) 2005-2012. • Miembro del Organo de Gobierno del Centro de Investigación Científica de Yucatán

(CICY) 2008-2012.

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Grupo del Dr. Baltazar Becerril Integrantes del Grupo (2012-2013): Investigadora Asociada: Dra. Lidia Riaño Técnicos Académicos: M. en C. Leopoldo Güereca, M. en C. Timoteo Olamendi, Dr. Ernesto Ortiz, Biól. Rosalba Sánchez. Estudiante de Licenciatura: Selene Uribe Estudiantes de Posgrado: Jonathan Arredondo (M), Ilse Gómez (M), Guillermo Fernández (M), Oscar Luna (D), Everardo Rodríguez (D), Miryam Villalba (D). Personal Administrativo: Linda Espinoza, María del Carmen Martínez Publicaciones:

1. Quintero-Hernández,V., Del Pozo-Yauner, L., Pedraza-Escalona, M., Juárez-González, V.R., Alcántara-Recillas, I., Possani, L.D. and Becerril, B. 2012. Evaluation of three different formats of a neutralizing single chain human antibody against toxin Cn2: Neutralization capacity versus thermodynamic stability Immunol Lett, 143, 152-160.

2. Ramírez-Carreto, S., Quintero-Hernández, V., Jiménez-Vargas, J.M., Corzo, G. Possani, L.D., Becerril, B. and Ortiz, E. 2012. Gene cloning and functional characterization of four novel antimicrobial-like peptides from scorpions of the family Vaejovidae Peptides, 34, 290-295.

3. Rodriguez-Rodriguez, E.R., Ledezma-Candanoza,L.M., Contreras-Ferrat, L.G., Olamendi-Portugal,T., Possani,L.D., Becerril,B. Riaño-Umbarila,L. 2012. A Single Mutation in Framework 2 of the Heavy Variable Domain Improves the Properties of a Diabody and a Related Single-Chain Antibody. J.Mol.Biol., 423, 337-350.

4. Aguilar, M.B., Ortiz,E., Kaas,Q. López-Vera, E., Becerril,B., Possani,L.D. and de la Cotera, E.P. 2013. Precursor De13.1 from Conus delessertii defines the novel G gene superfamily. Peptides, 41, 17-20.

5. Riaño-Umbarila, L., Timoteo Olamendi-Portugal, Citlalli Morelos-Juárez, Georgina B. Gurrola, Lourival D. Possani and Baltazar Becerril. 2013. A novel human recombinant antibody fragment capable of neutralizing Mexican scorpion toxins. Toxicon 76, 370-376.

6. González-Andrade, M., Baltazar Becerril-Luján., Sánchez-López, R., Ceceña Álvarez, H., Pérez-Carreón, J.I., Ortiz-Suri, E., Alejandro D. Fernández-Velasco and Luis del Pozo-Yauner. 2013. Mutational and genetic determinants of λ6 light chain amyloidogenesis. The FEBS Journal 280, 6173-6183. Alumnos Graduados: -Para la obtención del título de Biólogo (Facultad de Ciencias Biológicas). Universidad Autónoma del Estado de Morelos. Determinación de la importancia del residuo 110 ubicado en el CDR3 VH del scFv 3008C en el reconocimiento a la toxina Cll2 del veneno

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del alacrán Centruroides limpidus limpidus Presentada por Ilse Viridiana Gómez Ramírez, 22 de marzo de 2013. La Dra. Lidia Riaño Umbarila fue la tutora principal. -Para la obtención del grado de Maestro en Ciencias Bioquímicas. Generación y caracterización de bibliotecas de ADNc de la glándula venenosa de los alacranes Vaejovis punctatus y Vaejovis subcristatus. Presentada por Santos Ramírez Carreto el 12 de junio del 2013. El Dr. Ernesto Ortíz fue el Asesor Técnico. Docencia: Cursos de Biología Molecular y Métodos en el IBT. Curso de Lic. en Ciencias Genómicas Divulgación: Quinta generación de anti-venenos contra la picadura de alacrán. Sección de Tecnología de La Unión de Morelos, 14 de mayo del 2013. Donativos: Instituto Bioclon (Grupo Silanes) CONACyT CB-155099 (2010) DGAPA IN 217510 DGAPA IN 201913

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Grupo del Dr. Gerardo A. Corzo Burguete Integrantes del Grupo (2012-2013): Técnicos Académicos: Herlinda Catalina Clement Carretero Estudiantes de Licenciatura: Selma Margarita Jurado Reyes Vianey Flores Lara Estefania Herrera Herrera Estudiantes de Posgrado: M. en C. Alexis Rodríguez Solis M. en C. Ligia Luz Corrales García M. en C. Kenya Hernández Salgado M. en C. Francia García García Biol. María José Vargas Hernández Biol. Edgar Omar Piña Barraza QFB. Rodrigo Ibarra Vega M. en C. Guillermo de la Rosa Hernández Posdoctorales: Dr. Alexis Rodríguez Solís Administrativo Compartido con los miembros del consorcio Drs. A. Alagón, B. Becerril y L.D. Possani. Publicaciones 2012-2013 1. Schiavon, E., Pedraza-Escalona, M., Gurrola, G.B., Olamendi-Portugal, T., Corzo, G., Wanke, E., Possani, L.D.* 2012. Negative-shift activation, current reduction and resurgent currents induced by beta-toxins from centruroides scorpions in sodium channels. Toxicon 59:283–293. 2. Saucedo, A.L., del Rio, F., Picco, C., Estrada, G., Prestipino, G., Possani, L.D., Delepierre, M., Corzo, G.* 2012. Solution structure of native and recombinant expressed toxin CssII from the venom of the scorpion Centruroides suffusus suffusus, and their effects on Nav1.5 sodium channels. BBA - Proteins and Proteomics 1824:478–487. 3. Ramírez-Carreto, S., Quintero-Hernández, V., Jiménez-Vargas, J.M., Corzo, G., Possani, L.D., Becerril, B.*, Ortiz, E.* 2012. Gene cloning and functional characterization of four novel antimicrobial-like peptides from scorpions of the family Vaejovidae. Peptides 34, 290-295. 4. Caliskan, F., Garcia, B.I., Coronas, F.I., Restano-Cassulini, R., Korkmaz, F., Sahin, Y., Corzo, G., Possani, L.D.* 2012. Purification and cDNA cloning of a novel neurotoxic peptide (Acra3) from the scorpion Androctonus crassicauda. Peptides, 37, 106-112. 5. García, F, Villegas, E., Espino-Solis, G.P., Rodríguez, A., Paniagua-Solis, J.,

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Sandoval, G., Possani, L.D., Corzo, G.* 2013. Antimicrobial peptides from arachnid venoms and their microbicidal activity in the presence of commercial antibiotics. J. Antibiot. (Tokyo), 66, 3-10. 6. Caliskan, F., Quintero-Hernandez, V., Restano-Cassulini, R., Coronas-Valderrama, F.I., Corzo, G. Possani, L.D.* 2013. Molecular cloning and biochemical characterization of the first Na+-channel alpha-type toxin peptide (Acra4) from Androctonus crassicauda scorpion venom. Biochimie 95, 1216-1222. 7. Corrales-Garcia, L., Ortiz, E., Castaneda-Delgado, J., Rivas-Santiago, B., Corzo, G.* 2013. Bacterial expression and antibiotic activities of recombinant variants of human beta-defensins on pathogenic bacteria and M. tuberculosis. Protein Expr. Purif. 89, 33-43. 8. Bernáldez, J.; Román-González, S.A.; Martínez, O.; Jiménez, S.; Vivas, O.; Arenas, I.; Corzo, G.; Arreguín, R.; García, D.E.; Possani, L.D.; Licea, A.* 2013. A Conus regularis Conotoxin with a Novel Eight-Cysteine Framework Inhibits CaV2.2 Channels and Displays an Anti-Nociceptive Activity. Mar. Drugs 11, 1188-1202. 9. Carmona, G., Rodriguez, A., Juarez, D., Corzo, G., Villegas, E.* 2013. Improved Protease Stability of the Antimicrobial Peptide Pin2 Substituted with D-Amino Acids. Protein J. 32:456-466. 10. Perdomo-Morales, R.*, Montero-Alejo, V., Corzo, G., Besada, V., Vega-Hurtado, Y., González-González, Y., Perera, E., Porto-Verdecia, M. 2013. Panulirin, a novel trypsin inhibitor that regulates the prophenoloxidase activating system in the spiny lobster Panulirus argus. J. Biol. Chem. 288, 31867-31879. 11. Ardisson-Araújo, D.M. P., Morgado, F.S., Schwartz, E., Nogueira, F., Corzo, G., Melo, F.L. , Ribeiro, B..M.* 2013. Recombinant baculoviruses expressing Ba3, a new theraphosid spider toxin, cause insect cell death by necrosis during in vitro infection. PLOS ONE (Aceptado). Capítulo en libro 1. R. Rodriguez De La Vega, G. Corzo, L.D. Possani. 2012. “Scorpion Venoms as a Platform for Drug Development” in Development of Human Therapeutics, Glenn F. King (Ed.), Editorial Royal Society of Chemistry, Cambridge, United Kingdom. Patentes 1. García-Corrales, L.L., Rodríguez, A., Corzo, G. Uso de péptidos recombinantes y sintéticos como antibióticos contra Mycobacterium tuberculosis y otras bacterias patógenas. Oficina de Patentes México. Expediente MX/E/2013/077792. Fecha 25 octubre 2013. Alumnos Graduados 2012-2013 Dr. Alexis Rodríguez Solís Dr. Ligia Luz Corrales García Participación en docencia

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Coordinación del Curso de Bioquímica del Posgrado en Ciencias Bioquímicas 2012 y 2013. Sección de Química de Proteínas (8 horas) del Curso de Bioquímica del Posgrado en Ciencias Bioquímicas 2012 y 2013. Divulgación Internet, HUEVOS REVUELTOS, El Bajo y La Ponzoña, Con Alfonso Figueroa y Gerardo Corzo. Huevos Revueltos | Pláticas dispares sobre temas diversos Huevos Revueltos | Proyecto Siqueiros | Sala de Arte Público Siqueiros http://www.saps-latallera.org/saps/huevos-revueltos/ 30/05/2013. Notas periodísticas, Venenos arácnidos, contra bacterias malignas. El Economista. Sábado, 23 de noviembre de 2013. Entrevista Televisa a Investigadores del IBT 19 de junio de 2013. Gaceta Campus Morelos. Donativos • DGAPA-UNAM IN200412 (2012-2014). Expresión heteróloga de péptidos ricos en puentes disulfuro mediante la técnica del ADN recombinante: beta-defensinas humanas y neurotoxinas de arácnidos. • CONACyT CB-2010-153606 (2012-2014). Péptidos analgésicos y antimicrobianos provenientes del veneno de arácnidos. • Laboratorios Silanes SA de CV DGAJ-SJPI-220911-479 (2013). Búsqueda de componentes analgésicos obtenidos a partir de secreciones venenosas de la rana Trachycephalus venulosus, del redúvido Triatoma pallidepennis y de los arácnidos Cyclosternum fasciatum y Aphonopelma seemanni.

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Grupo Dra. A. Covarrubias Integrantes del Grupo (2012-2013): Alejandra A. Covarrubias Robles (Investigador Titular C) José Luis Reyes Taboada (Investigador Titular B) Francisco Campos Álvarez (Investigador Titular B) Marina Battaglia Rossi (Posdoctoral Proyecto, 20012-2013) Cecilia Contreras Cubas (Post-Doctoral 6 meses) Lucero Rivera Nájera (Doctorado CBQ) César L. Cuevas Velázquez (Doctorado CBQ) V. Miguel Palomar Olguín (Doctorado CBM) Guadalupe Sosa Valencia (Doctorado CBM) Carlos de la Rosa Ureña (Doctorado CBQ) Beatriz Pérez Morales (Doctorado CBM) Inti Arroyo Mosso (Maestría CBQ) David Rendón Luna (Maestría CBQ) Paulette Romero Pérez (Maestría CBQ) Darinka Méndez Ferreira (Maestría-Universidad Michoacana SNH) Coral Martínez Martínez (Licenciatura FC-UNAM) Alma Jenny García Mejía (Licenciatura FC-UNAM) José Pineda de la O. (Facultad Biología-UAEM) Publicaciones (2012-2013): Pelaez, P, Trejo MS, Iniguez LP, Estrada-Navarrete G, Covarrubias, A.A. Reyes, JL, Sanchez F. 2012. Identification and characterization of microRNAs in Phaseolus vulgaris by high-throughput sequencing BMC Genomics, 13, 83. Miguel A. Rosales, Sonia M. Cuéllar, María de la Paz Arrieta-Montiel, Jorge Acosta-Gallegos, Alejandra A. Covarrubias. 2012. Physiological traits related to terminal drought resistance in common bean (Phaseolus vulgaris L). J Sci Food Agric 93: 324-31 Miguel A. Rosales, Edilia Ocampo, Rocío Rodríguez-Valentín, Yadira Olvera-Carrillo, Jorge Acosta-Gallegos, Alejandra A. Covarrubias. 2012. Physiological analysis of common bean (Phaseolus vulgaris L.) cultivars uncovers characteristics related to the resistance to terminal drought. Plant Physiol Biochem, 56: 24-34 Contreras-Cubas, C. Rabanal, F.A. Arenas-Huertero, C. Ortiz, M.A. Covarrubias, A.A. Reyes, J.L. 2012. The Phaseolus vulgaris miR159a precursor encodes a second differentially expressed microRNA. Plant Mol Biol, 80, 103-115.

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Contreras-Cubas, C. Palomar, M. Arteaga-Vazquez, M. Reyes, J.L. Covarrubias, A.A. 2012. Non-coding RNAs in the plant response to abiotic stress. Planta, 236, 943-958. Rodriguez-Valentin, R. Campos, F. Battaglia, M. Solorzano, R.M. Rosales, M.A. Covarrubias, A.A. 2013. Group 6 Late Embryogenesis Abundant (LEA) proteins in monocotyledonous plants: genomic organization and transcript accumulation patterns in response to stress in Oryza sativa. Plant Mol Biol Rep, DOI 10.1007/s00438-013-0768-2 Campos, F. Cuevas-Velazquez, C. Fares, M.A. Reyes, J.L., Covarrubias, A.A. 2013. Group 1 LEA proteins, an ancestral plant protein group, are also present in other eukaryotes, and in the archeae and bacteria domains Mol Genet Genomics 288, 503-517. Ramirez M, Flores-Pacheco G, Reyes JL, Alvarez AL, Drevon JJ, Girard L, Hernandez G. 2013. Two Common Bean Genotypes with Contrasting Response to Phosphorus Deficiency Show Variations in the microRNA 399-Mediated PvPHO2 Regulation within the PvPHR1 Signaling Pathway Int J Mol Sci, 14, 8328-8344. Contreras-Cubas C, Covarrubias, A.A. Reyes J.L. 2013. Determining Abundance of MicroRNAs and Other Small RNAs in Legumes en: Rose,R.J. Legume Genomics. Methods in Molecular Biology 1069. pags. 81-92 Sosa-Valencia G, Covarrubias AA, Reyes JL. 2013. Signaling by MicroRNAs in Response to Abiotic Stress en: Abdin,M. Stress Signalling in Plants: Genomics and Proteomics Perspectives Vol 1. pags. 51-87. Battaglia M, Covarrubias AA. 2013. Late Embryogenesis Abundant (LEA) proteins in legumes. Front Plant Genet Genomi 4: doi 10.1007/s11105-013-0641-9 Castro-Camus E, Palomar M, Covarrubias AA. 2013. Leaf water dynamics of Arabidopsis thaliana monitored in-vivo using terahertz time-domain spectroscopy. Scientific Reports 3 : 2910 | DOI: 10.1038/srep02910 DIVULGACIÓN: - CL Cuevas Velázquez, AA Covarrubias. 2012 Las proteínas desordenadas y su función: una nueva forma de ver la estructura de las proteínas y la respuesta de las plantas al estrés. TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas, 14: 97-105 - JL Reyes (2012). Los microRNAs y las estrategias del frijol para contender con la sequía. Revista Hypatia, 44: 30. Tesis concluidas (2012-2013): Licenciatura § David Arturo Velarde Garduño. Licenciatura en Ciencias Genómicas. (Tutor: José Luis Reyes). 2012

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§ José Pineda de la O. Facultad de Biología-UAEM (Tutor: Francisco Campos Álvarez). 2013 § Edilia Ocampo Flores. Facultad de Biología-UAEM (Tutor: Alejandra A. Covarrubias). Concluida. Maestría § Carlos de la Rosa Ureña. Maestría en Ciencias Bioquímicas-IBt. (Tutor: José Luis Reyes). 2012 § Wendy Padilla. Maestría en Ciencias Bioquímicas-IBt. (Tutor: Francisco Campos Álvarez). 2013

Doctorado § Cecilia Contreras (Co-tutores: José Luis Reyes, Alejandra A. Covarrubias). 2012

DOCENCIA (2012-2013): Cursos Licenciatura: Alejandra A. Covarrubias - Taller “La Biología a partir de las biomoléculas; nuevos paradigmas y aplicaciones”. 6 h

/semestre. Facultad de Ciencias-UNAM. Semestres 13-1, 13-2 Cursos de Posgrado: José Luis Reyes: - Biología Vegetal. Maestría en Ciencias Bioquímicas 6 horas / semestre. Instituto de

Biotecnología. Semestre 2013-2, 2014-1 - Biología Molecular, Maestría en Ciencias Bioquímicas. 6 horas / semestre. Instituto de Biotecnología. Semestre 2012-2, 2013-1, 2013-2, 2014-1. - Tópico selecto: RNAs pequeños: moduladores post-transcripcionales al rescate de plantas en estrés. Doctorado en Ciencias Biomédicas. 2013-2 - Tópico selecto: RNAs pequeños: moduladores post-transcripcionales al rescate de plantas en estrés. Doctorado en Ciencias Biomédicas. Semestre: 12-1. Responsable: José Luis Reyes. Coordinador: Carlos de la Rosa (estudiante de doctorado). 2014-1 Francisco Campos A. - Biología Vegetal. Maestría en Ciencias Bioquímicas 6 horas / semestre. Instituto de

Biotecnología. Semestre 2013-1, 2014-1 - Biología Molecular. Maestría en Ciencias Bioquímicas 6 horas / semestre Instituto de

Biotecnología. Semestre 2012-2, 2013-1, 2013-2, 2014-1 - Biología Celular. Posgrado en Ciencias, Facultad de Ciencias-UAEM . 10 h / semestre.

01/01/2013 - 01/06/2013. Alejandra A. Covarrubias

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- Biología Vegetal (Respuesta de las plantas a estrés abiótico: déficit hídrico, anoxia y oxidativo). Maestría en Ciencias Bioquímicas. 6 horas / semestre. Instituto de Biotecnología. Semestres: 2013-1, 2014-1

- Bioquímica (Fotosíntesis y Síntesis de nucleótidos). Maestría en Ciencias Bioquímicas. 6 horas / semestre. Instituto de Biotecnología. Semestres: 2012-2, 2013-1, 2013-2, 2014-1

- Biología Celular (Comunicación celular y matriz extracelular vegetal). Maestría en Ciencias Bioquímicas. 3 horas / semestre. Instituto de Biotecnología. 2013-2

Estancias realizadas en nuestro grupo:

- Sabático: Dra. Loreto Holigue, Pontificia Universidad Católica de Chile. - Estancia corta: Dra. Catalina Arenas. Universidad Autónoma de San Luis Potosí.

Donativos nuevos o vigentes (2012-2013): - CONACyT - 132258 “Estudio funcional de algunas hidrofilinas vegetales y el impacto de

su expresión heteróloga en la tolerancia a sequía” Responsable: Alejandra A. Covarrubias. 2010 - 2013

- DGAPA-PAPIIT (IN-208212) para el desarrollo del proyecto “Caracterización del mecanismo de acción de proteínas intrínsecamente desordenadas en la respuesta a la limitación de agua en plantas” Responsable: Alejandra A. Covarrubias. 2012 - 2014 $600,000.00

- CONACyT - Cooperación Bilateral Científica y Tecnológica, México-Estados Unidos NSF para apoyo del proyecto “Structural characterization of proteins involved in the plant response to water deficit” en colaboración con la Dra. Jane Dyson del The Scripps Research Institute (La Jolla, CA EUA). Responsable: Alejandra A. Covarrubias. 2013-2014

- DGAPA-UNAM (IN205112-3). Identificación de transcritos regulados por microRNAs en respuesta a déficit hídrico en Phaseolus vulgaris. 2012-2014. Responsable: José Luis Reyes.

- CONACyT-SEP. Ciencia Básica CB2010 (151571) Identificación de los transcritos regulados por microRNAs en Phaseolus vulgaris en respuesta a deficit hídrico. 2012-2014. Responsable: José Luis Reyes.

Otras actividades relevantes (2012-2013): Comités editoriales: Frontiers in Plant Genetics and Genomics. Alejandra A. Covarrubias Associate Editor, BioMedCentral (BMC) Plant Biology. José Luis Reyes Comité de premios § Alejandra A. Covarrubias: Comité para la dictaminación del Premio Nacional de Ciencias. 2013. § Francisco Campos. Comisiones dictaminadoras de premios otorgados por la

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Academia de Ciencias de México. 2013. Comisión Dictaminadora. Premio de Investigación para cientificos jóvenes; Comisión Dictaminadora. Premio Weizmann. Tesis de doctorado en Ciencias Naturales. Comisión Dictaminadora. Becas para mujeres en la Ciencia L'Oréal-UNESCO-AMC. Comités técnicos: - Unidad de Proteómica-IBt-UNAM: Alejandra A. Covarrubias - Unidad de Microscopía-IBt-UNAM Electrónica: Alejandra A. Covarrubias - Unidad de Cultivo Vegetal-IBt-UNAM: Alejandra A. Covarrubias Consejos:

- Consejo Interno del IBt-UNAM. Representante del personal académico. Alejandra A. Covarrubias. 2012 – Septiembre 2013

- Otros

- Mesa Directiva de la Academia de Ciencias de Morelos. Alejandra A. Covarrubias - Subcomité de Docencia del Programa de Posgrado en Ciencias Bioquímicas, Sede

del IBt: José Luis Reyes

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Grupo Dr. A. Darszon Integrantes del Grupo (2012-2013): Investigadores Asociados Carmen Beltrán Posdoctorales Claudia Sánchez Gerardo Orta Enrique Balderas Estudiantes de Licenciatura Vilma Jimenez Sabinina-Licenciatura Estudiantes de Posgrado Teresa Tatiana Luna Ana Laura Gonzalez Cota-Doctorado Dulce María Figueiras Fierro-Doctorado Juan Garcia Rincon (Dra Beltrán) Arlet del Carmen Loza (Dra Beltrán)

Personal Administrativo Leonel Linares Labastida Miguel Trujillo/Técnico Antonio Blancas/Técnico Estudiantes de Licenciatura Cesar Arcos Hernandez

Publicaciones 2012-2013

1. Chávez JC, Hernández-González EO, Wertheimer E, Visconti PE, Darszon A, Trevino CL. Participation of the Cl-/HCO3- Exchangers SLC26A3 and SLC26A6, the Cl- Channel CFTR and the Regulatory Factor SLC9A3R1 in Mouse Sperm Capacitation. Biol Reprod. 2012 Jan 19;86(1):1-14. Print 2012 Jan. PMID: 21976599 163. Balderas E, Arteaga-Tlecuitl R, Rivera M, Gomora J, Darszon A. Niflumic acid blocks native and recombinant T-type channels. J. Cell Physiol. 2012. 227: 2542-2555. PMID: 21898399. 2. Escoffier J, Krapf D, Navarrete F, Darszon A, Visconti PE. Flow cytometry analysis reveals a decrease in intracellular sodium during sperm capacitation. J Cell Sci. 2012 Jan 15;125(Pt 2):473-85. Epub 2012 Feb 2. PubMed PMID: 22302997 3. Orta G, Ferreira G, José O, Treviño CL, Beltrán C, Darszon A. Human spermatozoa possess a calcium-dependent chloride channel that may participate in the acrosomal reaction. J. Physiol.. 590: 2659-2675. 2012. PubMed PMID:22473777. 4. Darszon A, Sánchez-Cárdenas C, Orta G, Sánchez-Tusie AA, Beltrán C, López-González I, Granados-González G, Treviño CL. Are TRP channels involved in sperm

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development and function? Cell Tissue Res. 2012. 349: 749-764. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 22580508. 5. Servin-Vences MR, Tatsu Y, Ando H, Guerrero A, Yumoto N, Darszon A, Nishigaki T. A caged progesterone analog alters intracellular Ca2+ and flagellar bending in human sperm. Reproduction. 2012 May 11. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 22580372. 6. Sánchez-Cárdenas C, Guerrero A, Treviño CL, Hernández-Cruz A, Darszon A.. Acute Slices of Mice Testis Seminiferous Tubules Unveil Spontaneous and Synchronous Ca2+ Oscillations in Germ Cell Clusters. Biol Reprod. 2012 Aug 22. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 22914313. 7. De La Vega-Beltran JL, Sánchez-Cárdenas C, Krapf D, Hernandez-González EO, Wertheimer E, Treviño CL, Visconti PE, Darszon A. Mouse sperm membrane potential hyperpolarization is necessary and sufficient to prepare sperm for the acrosome reaction. J Biol Chem. 2012 Dec 28;287(53):44384-93. doi: 10.1074/jbc.M112.393488. Epub 2012 8. Chávez JC, de la Vega-Beltrán JL, Escoffier J, Visconti PE, Treviño CL, Darszon A., Salkoff L, Santi CM. Ion permeabilities in mouse sperm reveal an external trigger for SLO3-dependent hyperpolarization. PLoS One. 2013;8(4):e60578. doi: 10.1371/journal.pone.0060578. Epub 2013 Apr 5. PubMed PMID: 23577126; PubMed Central PMCID: PMC3618424. 9. Guerrero A, Espinal J, Wood CD, Rendón JM, Carneiro J, Martínez-Mekler G, Darszon A. Niflumic acid disrupts marine spermatozoan chemotaxis without impairing the spatiotemporal detection of chemoattractant gradients. J Cell Sci. 2013 Mar 15;126(Pt 6):1477-87. doi: 10.1242/jcs.121442. Epub 2013 Feb 15. PubMed PMID: 23418354. 10. Santi CM, Orta G, Salkoff L, Visconti PE, Darszon A., Treviño CL. K+ and Cl- channels and transporters in sperm function. Curr Top Dev Biol. 2013;102:385-421. doi: 10.1016/B978-0-12 416024-8.00014-3. PubMed PMID: 23287041. 11. Balderas E, Sánchez-Cárdenas C, Chávez JC, de la Vega Beltrán JL, Gómez-Lagunas F, Treviño CL, Darszon A. The anti-inflammatory drug celecoxib inhibits t-type Ca(2+) currents in spermatogenic cells yet it elicits the acrosome reaction in mature sperm. FEBS Lett. 2013 Aug 2;587(15):2412-9. 12. Loza-Huerta A, Vera-Estrella R, Darszon A, Beltrán C. Certain Strongylocentrotus purpuratus sperm mitochondrial proteins co-purify with low density detergent-insoluble membranes and are PKA or PKC-substrates possibly involved in sperm motility regulation. Biochim Biophys Acta. 2013 Aug 6. doi:pii: S0304-4165(13)00342-5. 10.1016/j.bbagen.2013.07.029. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 23928041. 13. Wertheimer E, Krapf D, Vega-Beltran JL, Sánchez-Cárdenas C, Navarrete F, Haddad D, Escoffier J, Salicioni AM, Levin LR, Buck J, Mager J, Darszon A, Visconti PE. Compartmentalization of Distinct cAMP Signaling Pathways in Mammalian Sperm. J Biol Chem. 2013 Oct 15. ahead of print] PubMed PMID: 24129574. 14. Tateno, H., Krapf, D., Hinoa, T., Sánchez-Cárdenas, C., Darszon, A., Yanagimachid, R, y Viscontie, P. Ca2+ ionophore A23187 can make mouse spermatozoa capable of

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fertilizing in vitro without activation of cAMP-dependent phosphorylation pathways. PNAS. 2013. 110: 18543-18548. Alumnos Graduados 2012-2013 Enrique Balderas Participación en docencia 2012-2013 Tópico: Principio de Electrofisiología y Canales Iónicos Divulgación Donativos NIH 2RO1 HD038082-07ª1. Membrane Potential and cAMP Crosstralk in Sperm Capacitation. PI Pablo Visconti. 2007-2012. CONACyT de grupo 128566 “Canales de Ca2+ y Cl-, e intercambiadores Cl-/HCO3- involucrados en la movilidad, maduración y reacción acrosomal del espermatozoide”. 2010-2014. CONACyT Infraestructuro “Laboratorio Nacional de Microscopía avanzada”

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Grupo Dr. E. Galindo Integrantes del grupo (2012-2013) Personal Académico: Enrique Galindo, Inv. Tit. “C”, SNI III. Leobardo Serrano, Inv. Tit. “B”, SNI II. Carlos Peña, Inv. Tit. “B”, SNI I. Celia Flores, Técnico Titular “B” Estudiantes (los graduados en el período se indican más adelante): Doctorado Celia Flores Ocampo (E. Galindo) Karina Balderas (L. Serrano) Sergio Andrés Cristiano Fajardo (E. Galindo) Modesto Millán (C. Peña) Alehlí Holguín Salas (E. Galindo) Maestría Karen Gómez (C. Peña) Alma Lucero Jiménez (C. Peña) Jonathan Sanguino (C. Peña) Agustín Luna (L. Serrano) Karen Fernández (L. Serrano) Licenciatura Cristina Gómez (L. Serrano) Miseli Pliego (C. Peña) Eliseo Cabrera (C. Peña) Jasmín Barreto (C. Peña) Esmeralda Soriano (L. Serrano) Prácticas profesionales Paulina Ríos (L. Serrano) Erick Flores (L. Serrano) Personal por honorarios: Tania Castillo

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Personal de apoyo Leticia Díaz Juana Ferrer (hasta enero de 2013) Rubén Blancas (desde febrero de 2013) Antonio Dorantes Publicaciones 2012-2013 Artículos en revistas internacionales “Visualization of compound drops formation in multiphase processes for the identification

of factors influencing bubble and water droplet inclusions in oil drops”, G. Corkidi, A. Rojas, A. Pimentel, E. Galindo, Chemical Engineering Research and Design 90:1727–1738 (2012).

“Azotobacter vinelandii lacking the Na+NQR activity: a potential source for producing alginates with improved properties and at high yield”, I. Gaytan, C. Peña, C. Nuñez, M.S. Córdova, G. Espín, E. Galindo, World Journal of Microbiology and Biotechnology, 28: 2731-2740 (2012).

"Spray-drying microencapsulation of Trichoderma harzianum conidias in carbohydrate polymers matrices", A. Muñoz-Celaya, M. Ortíz-García , E.J. Vernon-Carter, J. Jaúregui-Rincón, E. Galindo, L. Serrano-Carreón, Carbohydrate Polymers, 88: 1141- 1148 (2012).

"Cellular damage during drying and storage of Trichoderma harzianum spores". M.T. Fernández-Sandoval, M. Ortíz-García, E. Galindo, L. Serrano-Carreón, Process Biochemistry, 47,186-194 . (2012).

“Expression of alginases and alginate polymerase genes in response to oxygen, and their relationship with the alginate molecular weight in Azotobacter vinelandii”, Flores, C., Moreno, S., Espín, G., Peña, C., Galindo, E., Enzyme and Microbial Technology 53: 85-91 (2013). .

“The acetylation degree of alginates in Azotobacter vinelandii ATCC9046 is determined by

dissolved oxygen and specific growth rate: studies in glucose-limited chemostat cultivations”, Castillo, T., Galindo, E., Peña, C., Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology 40: 715-723 (2013)..

“The challenges of introducing a new biofungicide to the market: a case study”, Galindo, E., Serrano-Carreón, L., Gutiérrez, C. R., Allende, R., Balderas, K., Patiño, M., Trejo, M., Wong, M. A., Rayo, E., Isauro, D., Jurado, C. Electronic Journal of Biotechnology, vol. 16, no. 6. http://dx.doi.org/10.2225/vol16-issue3-fulltext-6, (2013).

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“Oxygen supply strongly influences metabolic fluxes, the production of poly(3-hydroxybutyrate) and alginate, and the degree of acetylation of alginate in Azotobacter vinelandii”, Castillo, T., Heinzle, E., Peifer, S., Schneider, K., Peña M., C.F., Process Biochemistry, 48, 995-1003 (2013)..

“Alginate synthesis in Azotobacter vinelandii is increased by reducing the intracellular

production of ubiquinone”, Nuñez, C., Peña, C., Kloeckner, W., Hernández-Eligio, A., Bogachev, A.V., Moreno, S., Guzman, J., Büchs, J., Espín, Appl. Microbiol. Biotechnol., 97, 2503-2512 (2013).

“Biosynthesis of poly-b-hydroxybutyrate (PHB) with a high molecular mass by a mutant

strain of Azotobacter vinelandii (OPN)” (2013) Peña, C., López, S., García, A., Espín, G., Romo-Uribe, A., Segura, D., Annals of Microbiology (en prensa) (2013).

“High production of poly-3-hydroxybutyrate (PHB) by an Azotobacter vinelandii mutant

altered in PHB regulation using fed-batch fermentation process”, García-Romero, A., Segura, D., Espín, G., Castillo, T., Galindo, E., Peña, C., Biochemical Engineering Journal, DOI:10.1016/j.bej.2013 (en prensa) (2013).

"Foam production and hydrodynamic performance of a traditional Mexican molinillo

(beater) in the chocolate beverage preparation process", Holguín, A., López, D., Corkidi, G., Galindo, E. Food and Bioproducts Processing (en prensa) (2013).

Libro “EL QUEHACER DE LA CIENCIA EXPERIMENTAL: una guía práctica para investigar y reportar resultados en las ciencias naturales”, Siglo XXI Editores- Academia de Ciencias de Morelos, E. Galindo, Marzo de 2013. ISBN: 978-607-03-0459-0. Alumnos graduados (2012-2013) Doctorado Ana Laura Muñoz Celaya (U. A. de Aguascalientes) (L. Serrano) Tania Castillo Marenco (C. Peña) Maestría Sergio Andrés Cristiano Fajardo (E. Galindo) Andrés García Romero (C. Peña) Johanna Pillas (C. Peña, J. Büchs) Itzel Gaytán Colín (E. Galindo) Claudia Vianney Yáñez Ñeco (L. Serrano) Wendy Ivette Aragón Gómez (E. Galindo)

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Licenciatura Armando Estrada Ponciano (L. Serrano ) Erika Briones Serrano (C. Peña) Elizabeth Rubio Rodríguez (C. Peña, T. Castillo) Silvia Herrera López (C. Peña) Ana Isabel Trejo Hernández (C. Peña, C. Flores) Diana López López (E. Galindo, G. Corkidi) Melissa Ferrara (C. Peña) Participación en docencia Curso “Metodología de la Investigación”, Colegio Marymount (Preparatoria), Semestre 2012-I, Semestre 2013-I (E. Galindo).

Curso: “Bioingeniería (Del gen al producto)”, Maestría en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM, Semestres 2012-I (E. Galindo, L. Serrano, C. Peña, en colaboración con otros participantes).

Curso-Taller: “Bioprocesos con microorganismos recombinantes”, Instituto de Biotecnología, UNAM, Cuernavaca, Mor., 2012 (2 ediciones), 2013 (2 ediciones) (E. Galindo, L. Serrano, C. Peña y otros participantes) Divulgación Libro: “La Ciencia, desde Morelos para el Mundo, Tomo II, Biología: del ambiente a la genómica”, Editor Coordinador (E. Galindo), Academia de Ciencias de Morelos, La Unión de Morelos, 180. pags, ISBN: 978-607-95682-1-4, septiembre de 2012. Libro: "La Ciencia, desde Morelos para el Mundo, Tomo III: Química, Física y Matemáticas", Editor Coordinador (E. Galindo), Academia de Ciencias de Morelos, "La Unión de Morelos", 180 páginas, Septiembre 2013, ISBN: 978-607-95682-3-8. Impartición de cerca de 50 conferencias o talleres de divulgación, publicación de 6 notas periodísticas de divulgación y varios reportajes para periódicos, revistas y programas de TV (E. Galindo, L. Serrano, C. Peña, C. Flores). Donativos SEP-CONACyT (Ciencia Básica), “Estudio de la dispersión de fases en un biorreactor agitado mecánicamente: caracterización en función de la posición espacial dentro del tanque y durante el porceso de fermentación” (2011-2013) (E. Galindo).

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SEP-CONACyT (Ciencia Básica), “Estudio de los factores termodinámicos que determinan la protección contra el estrés térmico y oxidativo de esporas de Trichoderma harzianum microencapsuladas por secado por aspersión” (Mayo 2009–Mayo 2013) (L. Serrano). SEP-CONACyT (Ciencia Básica), “Producción de alginatos bacterianos por fermentación: estudio de la síntesis y composición del polímero bajo condiciones de limitación extrema”. Junio 2011-Mayo del 2014) (C. Peña). PAPITT-DGAPA, UNAM, “Estudio del papel del oxígeno disuelto en los procesos de polimerización y depolimerización del polihidroxibutirato (PHB) en cultivos de Azotobacter vinelandii en fermentador (Enero de 2013- Diciembre de 2015). (C. Peña) PAPITT-DGAPA, UNAM, “Estudio de la producción y de la transcripción génica de lacasas de Pleurotus ostreatus como respuesta al uso de cobre y/o lignina y de las condiciones de proceso”. (Enero 2011-Enero 2013) (L. Serrano). PAPITT-DGAPA, UNAM, “Fermentaciones en matraces agitados: entendiendo su comportamiento con base en el estudio de variables de operación escalables”. Renovación segundo año (2012-2013) (E. Galindo). PAPITT-DGAPA, UNAM, “Estudio de los efectos hidrodinámicos y de oxígeno disuelto sobre el crecimiento, la morfología y la producción de lacasas por P. Ostreatus en cultivo sumergido agitado mecánicamante. (Enero 2013-Enero 2015). Innovación tecnológica Transferencia de Tecnología. Convenio de Licenciamiento y Transferencia de Tecnología a la empresa Agro&Biotecnia S. de R.L. MI. de la cepa y proceso para la produccion de biofungicida para el control biológico de la antracnosis. Firmado por la UNAM y Agro&Biotecnia en Enero de 2012. Lanzamiento comercial del biofungicida “Fungifree AB” (para antracnosis del mango), desarrollado en el IBt-UNAM, producido por la empresa spin-off “Agro&Biotecnia S. de R.L. MI.” y comercializado por “FMC Agroquímica de México, S.A.”, Expo Agroalimentaria Guanajuato 2012, Irapuato, Gto., 7 de noviembre de 2012. Ampliación de los registros del biofungicida “Fungifree AB” para su uso en papaya, aguacate y cítricos (2013).

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Distinciones relevantes Chairman (E. Galindo), Congreso “Mixing XXIII”, North American Mixing Forum, Riviera Maya, Q.R. México, 17-22 de Junio de 2012. Participación de 85 ponentes de 19 paises. "Reconocimiento al Mérito Estatal de Investigación 2012" (E. Galindo) en la categoría al Mérito en Investigación, otorgado por la Secretaría de Innovación, Ciencia y Tecnología del Gobierno del Estado de Morelos, 21 de agosto de 2013. “Reconocimiento en el ámbito de ciencias” (E. Galindo), otorgado por periódico “La Unión de Morelos”, 21 de noviembre de 2013.

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Grupo Dra. P. León Integrantes del Grupo (2012-2013): - Arturo Gueravara García (Asociado) - Elizabeth Cordoba (Asociado) - Josefat Gregorio Jorge (Postdoc ABI4) - Cynthia Romero Guido (Posdoc cloroplasto) - Maricela Ramos Vega (Técnica) - Marel Change (Estudiante de Doctorado, vía MEP) - Alma Fabiola Bernal (Estudiante de Doctorado, señalización de azucares/ABI4) - Jesús López Bucio (Estudiante de Doctorado, MAPK) - Luis Alberto De Luna Valdez (Estudiante Doctorado, cloroplasto) - Carol Martínez (Estudiante de Maestría, Señalización de azucares) - Ernesto Llamas Pamanes (Estudiante Maestría, cloroplasto) - Gabriela Medina (Estudiante de Maestría, vía MEP) - Jocelyn Cisterna (Estudiante de Licenciatura cloroplasto) Publicaciones* (2012-2013):

1 León, P., Gregorio, J., and Cordoba, E. (2013) ABI4 and its role in chloroplast

retrograde communication. Frontiers in Plant Science. 3:304 doi:

10.3389/fpls.2012.00304

2 Gregorio, G., Hernandez, A.F, Cordoba, E and Leon, P (2013)

Characterization of evolutionary conserved motifs involved in activity and

regulation of the ABA-INSENSITIVE (ABI) 4 transcription factor. Molecular Plant

en prensa (Factor de Impacto 6.1)

3 López-Bucio JS, Dubrovsky JG, Raya-González J, Ugartechea-Chirino Y, López-

Bucio J, de Luna-Valdez LA, Ramos-Vega M, León P, Guevara-García AA. (2013).

Arabidopsis thaliana mitogen-activated protein kinase 6 is involved in seed

formation and modulation of primary and lateral root development. J Exp Bot.

doi:pii: S0278-6915(13)00748-5.

Capítulos de Libros Internacionales:

4 de Luna-Valdez, L. A., Sepúlveda, G. E. B. and Guevara-García, A. A. (2012).

Unraveling protein-protein interactions: the yeast two-hybrid approach. In: Gómez-

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Gómez, I. (Ed). Tools to Understand Protein-Protein Interactions. Transworld

Research Network. Kerala, India. p:127-142 ISBN: 978-81-7895-552-0.

5 de Luna,L. A., Leon, P., Encarnación, S. and Guevara-García, A. A. (2013).

Chloroplast omics and crop improvement. In: Barh Delmya (Ed). Omics and crop

improvemen. CRC Press Taylors & Francis Group, Boca Ratón FL, USA. In Press.

Tesis Concluidas* (2012-2013):

- Marel Chenge Espinosa (2012) Regulación postraduccional de la proteína DXS de la

vía MEP Maestría P. León)

-Ernesto Llamas Pamenes (2013) Caracterización de la finción de ZDS en el

desarrollo de las hojas en plantas (Maestría P. León)

- Denise Lizeth Aceves Zamudio (2012) Análisis de los elementos de respuesta a

glucosa de la región regulatoria del gen de la proteína

transportadora de azúcares (STP1) en Arabidopsis

thaliana. (Lic. E. Cordoba)

- Hamid Armando Tejas Álvarez (2012) Caracterización de la progenie de cruzas entre

la mutante mpk6 y líneas marcadoras del desarrollo del

embrión y de la raíz. (Lic. A. Guevara)

- Karen Patricia Legorreta (2012) Plantas angiospermas como biomarcadores de

exposición y efecto para metales pesados en suelo.

(Lic. A. Guevara)

- Fret Cervantes Díaz (2012) Generación de un sistema de transformación estable para el

musgo Plagiomnium cuspidatum. (Lic. A. Guevara)

- Luis Alberto De Luna (2012) Una estrategia proteómica para la identificación de

genes involucrados en al biogénesis del cloroplasto.

(Maestría A. Guevara)

Docencia* (2011-2012):

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- Curso de Biología Molecular Arturo Guevara y Elizabeth Cordoba - Curso de Biología Celular Patricia León - Curso de Biol. Molecular de Plantas Patricia León, Arturo Guevara y

Elizabeth Cordoba - Curso Interacciones Protreína-Proteína Arturo Guevara

Fundamentos y Metodologías (Sistema de Dos Híbridos)

Donativos* (2012-2013): - CONACYT 2010- 2013 Responsable Patricia León - DGAPA 2010-2013 Responsable Patricia León - CONACYT 2010-2013 Responsable Arturo Guevara - DGAPA 2010-2013 Responsable Arturo Guevara - CONACYT 2011-2014 Responsable Elizabeth Cordoba - PAPSA 2011-2014 Responsable Elizabeth Cordoba

Otras actividades relevantes* (2011-2013):

- Editor de Plant Cell - Editor Frontiers in Plant Physiology

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Grupo Dra. H. Lomelí Integrantes del Grupo (2012-2013): Investigadores: Hilda Lomelí Buyoli, Enrique Salas Vidal, Denhí Schnabel (colaboradora), Ma. Del Rayo Sánchez (honorarios), Héctor Rodríguez Magadán (honorarios),. Técnicos: Laura Ramírez Estudiantes: Roberto Moreno Ayala (doctorado-H.Lomelí), Mario Mendieta Serrano (doctorado-E.Salas), Jorge Castillo Robles (doctorado-H.Lomelí), Jerónimo Miranda Rodríguez (maestría-D.Schnabel), Francisco Castillo Castellanos (maestría-H.Lomelí), Javier Méndez Cruz (licenciatura-E.Salas), Carlos López Moreno (licenciatura-D.Schnabel). Personal Administrativo: Dulce Pacheco Benitez, María de la Paz Colín, Virginia Ramírez Granados.

Publicación. Cell proliferation patterns in early zebrafish development. Mendieta-Serrano MA, Schnabel D, Lomelí H, Salas-Vidal E. The Anatomical Record. 2013. 296(5):759-73. Tesis Concluidas.

David Bahena (HL)- Licenciatura (2012)

Jerónimo Miranda (DS)- Maestría (2012)

Docencia

Hilda Lomelí

Participante en el curso de Biología Celular semestres 2012-2 y 2013-2.

Organización e impartición del tópico selecto titulado "El pez cebra: un modelo biológico y

sus aplicaciones" con la participación de Roberto Moreno y Mario Mendieta .

Enrique Salas

Participante en el curso de Biología Celular semestres 2012-2 y 2013-2.

Participante en el curso de Biología Celular en la Facultad de Ciencias, UAEM, semestre

2013-2 y en la Facultad de Medicina, UAEM en 2012-2013.

Divulgación

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H. Lomelí. Participación en una entrevista en Radio Fórmula con el periodista Ricardo

Rocha. Tema: el premio nobel en el 2012 por los Dres. John Gurdon y S Yamanaka.

E. Salas. Evento Primera “Fiesta de las Ciencias y Humanidades” Organizado por la

Dirección General de Divulgación de la Ciencia, UNAM en el museo de ciencia

UNIVERSUM. 5 de octubre de 2013. Conferencia “Embrión digital”.

Donativos

CONACYT 2012- Abril 2014 (HL)

DGAPA 2012-2014 (HL)

DGAPA 2012-2014 (ES)

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Grupo Dr. E. Merino Integrantes del Grupo (2012-2013): Dra. Liliana Pardo López (Investigador) Dra. Rosa Ma. Gutiérrez Ríos (Investigador) Dr. Enrique Merino Pérez (Investigador) M.C. José Ricardo Ciria Merce (Técnicos académico Alumno de Doctorado) M.B. Ma. Luisa Tabche Barrera (Técnicos académico) Ing. David Alejandro Abdala Asbun (Técnicos académicos por donativo) Rosalva González Arenas (Apoyo Administrativo) Edgar Herrera Delgado (Alumno de Licenciatura) Alejandra Mayela Manjarrez Casas (Alumno de Maestría) Alejandro Granados Castro (Alumno de Maestría) Alma Lidia Martínez Valle (Alumno de Maestría) Jorge Enrique Quintana Kageyama (Alumno de Maestría) Ana Lucía Gutiérrez Preciado (Alumno de Doctorado) Carlos Daniel Vázquez Hernández (Alumno de Doctorado) Eugenio López Bustos (Alumno de Doctorado) José Luis Rodríguez Mejía (Alumno de Doctorado) Luz Adriana Vega Cabrera (Alumno de Doctorado) Patricia Oliver Ocaño (Alumno de Doctorado) Ricardo Ciria Merce (Alumno de Doctorado) Zuemy Rodríguez Escamilla (Alumno de Doctorado) Publicaciones: Freyre-Gonzalez,J.A. Manjarrez-Casas,A.M. Merino,E. Martinez-Nunez,M. Perez-Rueda,E. Gutierrez-Rios,R.M. 2013. Lessons from the modular organization of the transcriptional regulatory network of Bacillus subtilis. BMC Syst Biol, 7, 127. Barraza,A. Estrada-Navarrete,G. Rodriguez-Alegria,M.E. Lopez-Munguia,A. Merino,E. Quinto,C. Sanchez,F. 2013. Down-regulation of PvTRE1 enhances nodule biomass and bacteroid number in the common bean. New Phytol., 197, 194-206. Gutierrez-Preciado,A. Merino,E. 2012. Elucidating metabolic pathways and digging for genes of unknown function in microbial communities: the riboswitch approach. Clin Microbiol Infect, 18 Suppl 4, 35-39. Freyre-Gonzalez,J.A. Trevino-Quintanilla,L.G. Valtierra-Gutierrez,I.A. Gutierrez-Rios,R.M. Alonso-Pavon,J.A. 2012. Prokaryotic regulatory systems biology: Common principles governing the functional architectures of Bacillus subtilis and Escherichia coli unveiled by the natural decomposition approach. J. Biotechnol, 161, 278-286.

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Taboada,B. Ciria,R. Martinez-Guerrero,C.E. Merino,E. 2012. ProOpDB: Prokaryotic Operon DataBase. Nucleic Acids Res, 40, D627-D631. Alumnos Graduados: Alumna: Ana Gutiérrez Preciado. Título: Propiedades Bioquímicas e implicaciones funcionales del mecanismo de

regulación T-box. Fecha: 20 de Junio del 2013. Grado: Doctorado. Tutor: Enrique Merino Pérez Alumno: Jorge Enrique Quintana Kageyama. Título: Evolución in silico de interacciones proteína ligando: Profilina/Poli-L-Prolina

como modelo de estudio. Fecha: 9 de mayo del 2013. Grado: Maestría Tutor: Enrique Merino Pérez Nombre: Alejandro Granados Castro. Título: Procesamiento de la información y toma de decisiones en la red de esporulación

de B. subtilis Fecha: 15 Abril 2013. Grado: Maestría. Tutora: Dra. Rosa Ma. Gutiérrez Ríos. Alumno: Salvador Ángel Romero Martínez. Título: Application and integration of bioinformatic and Next-Gen DNA sequencing

methodologies for the analysis of genetically modified organisms. Fecha: 6 de Diciembre del 2012. Grado: Licenciatura. Tutor: Enrique Merino Pérez Alumna: Blanca Itzel Taboada Ramírez. Título: Predicción Computacional de promotores y operones en procariontes.

Aplicación en las bacterias Escherichia coli y Geobacter sulfurreducens. Fecha: 12 de Octubre del 2012. Grado: Doctorado. Tutor: Enrique Merino Pérez Alumno: Carlos Daniel Vázquez Hernández.

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Título: Análisis integrativo de las redes metabólicas y regulatorias del metabolismo central en Bacillus subtilis

Fecha: 24 Enero 2012. Grado: Maestría. Tutora: Dra. Rosa Ma. Gutiérrez Ríos Participación en docencia Nombre: Tópicos Selectos. Bases de programación en Perl. Doctorado en Ciencias

Bioquímicas - UNAM. Período: Semestre 2014-I. del 9 de Agosto al 22 de Noviembre 2013 Responsables: Dra. Rosa Ma. Gutiérrez Ríos, M.C. José Ricardo Ciria Merce, MenC Carlos

Daniel Vázquez y Dr. Enrique Merino Pérez. Nombre: Tópicos Selectos. Métodos y Estrategias en Bioinformática. Maestría y

Doctorado en Ciencias Bioquímicas - UNAM. Período: Semestre 2013-II. del 6 de Enero al 20 de Junio 2013. Responsables: Dra. Rosa Ma. Gutiérrez Ríos y Dr. Enrique Merino Pérez. Nombre: Tópicos Selectos. Bases de programación en Perl. Maestría y Doctorado en

Ciencias Bioquímicas - UNAM. Período: Semestre 2013-I. del 6 de Agosto al 20 de Noviembre 2012. Responsables: Dra. Rosa Ma. Gutiérrez Ríos, M.C. José Ricardo Ciria Merce y Dr. Enrique

Merino Pérez. Nombre: Talleres de Bioinformática y Perl. Período: Semestre 2012-II. 16-27 de Enero 2012 Responsable: Dra. Rosa Ma. Gutiérrez Ríos. Nombre: Curso básico de Biología Molecular. Maestría en Ciencias Bioquímicas -

UNAM Período: Enero 2012- Junio 2012 y Semestre: Enero 2013- Junio 2013. 4 clases Ponente: Dra. Liliana Pardo López Nombre: Viejas y nuevas tendencias en el uso de la fluorescencia para el análisis

estructural de las proteínas y sus procesos biológicos. Período: Semestre Agosto 2012-Diciembre 2012. 2 clases. Ponente: Dra. Liliana Pardo López. Curso: La ingeniería genética y sus aplicaciones para estudiantes de Maestría de la

ENCB. Semestre: Febrero 2012-Junio 2012. 2 clases.

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Ponente: Dra. Liliana Pardo López Nombre: Tópicos Selectos. Espectroscopía de fluorescencia: Principios y

aplicaciones para el estudio de sistemas biológicos. Período: Semestre Agosto 2013-Diciembre 2013.1 clase. Ponente: Dra. Liliana Pardo López Divulgación Nombre: Conferencia plenaria.Vanguardia Tecnológica 2012, "La 2a. Feria de

Innovación Tecnológica de la Ciudad de México". Eco-innovación desde el área de la biotecnología

Período: 22 de marzo de 2012 Ponente: Dra. Liliana Pardo López. Donativos Donativo: CONACyT 167585 Período: 2012 –2014 Monto: $906,222.00 Responsable: Dra. Rosa Ma. Gutiérrez Ríos. Donativo: DGAPA IN200612-3. Período: 2012 – 2014 Monto: $640,388.00 Responsable: Dra. Rosa Ma. Gutiérrez Ríos. Donativo: SEP-CONACyT 176381 Período: 2012-2015 Monto: $1,200,000.00 Responsable: Dra. Liliana Pardo López Donativo: DGAPA-UNAM IN201012-3 Período: 2012-2015 Monto: $600,000.00 Responsable: Dra. Liliana Pardo López. Donativo: SAGARPA-SENASICA. UNAM 22208-985-8-VII-08 Período: 2012 –2013 Monto: $1,000,000.00 Responsable: Dr. Enrique Merino Pérez.

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Donativo: DGAPA-UNAM IN203211 Período: 2011-2013 Monto: $595,668.00 Responsable: Dr. Enrique Merino Pérez. Donativo: CONACyT 154817 Período: 2011-2014 Monto: $1,998,358.00 Responsable: Dr. Enrique Merino Pérez.

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Grupo Dr. Luis Covarrubias Integrantes del Grupo (2012-2013): Laboratorio sobre Degeneración y Regeneración Tisular Investigadores

Luis F. Covarrubias Robles Susana Castro Obregón (hasta Septiembre 2013) Christopher Wood Celina García Meléndrez (desde Octubre 2013)

Asistentes de investigación Concepción Valencia García

Estudiantes Licenciatura Francisco Leyva Castro (Facultad de Ciencias, UAEM) Jorge Landgrave Gómez (Facultad de Ciencias, UNAM) Mariana Werner Sunderland (Ciencias Genómicas, UNAM) Paloma I. Meneses Giles (Ciencias Genómicas, UNAM) Iván Zea Armenta (Ciencias Genómicas, UNAM) Alejandra Guzmán Herrera (Ciencias Genómicas, UNAM) Walter Santana García (Ciencias Genómicas, UNAM) Sara Ruth Albarrán Gutiérrez (Facultad de Ciencias, UNAM) Ana Paulina de las Peñas Rincón (Facultad de Ciencias, UNAM) Wendy Villamizar Gálvez (Facultad de Ciencias, UNAM) Víctor Hugo Guadarrama Pérez (Instituto Politécnico de Zacatepec) María Carolina Gómez Parra (Instituto tecnológico de Tepic) Estudiantes Maestría

Aimée Bastidas Ponce (Posgrado en Ciencias Bioquímicas) María Concepción Cruz Santos (Posgrado en Ciencias Bioquímicas) Daniel Alberto Fuentes (Posgrado en Ciencias Bioquímicas)

Estudiantes Doctorado Niurka Trujillo Paredes (Posgrado en Ciencias Bioquímicas) Gilda Guerrero Flores (Posgrado en Ciencias Bioquímicas) José Raúl Pérez Estrada (Posgrado en Ciencias Bioquímicas) Dulce María Arzate Vázquez (Posgrado en Ciencias Biomédicas)

Personal Administrativo Minerva Carcaño Velázquez (Secretaria) Rubén Blancas (Laboratorista) Cruz Elena Martell Lugo (Auxiliar)

Publicaciones: Artículos

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1. Baizabal, J.M., Cano-Martínez, A., Valencia, C., Santa-Olalla, J., Young, K.M., Rietze, R.L., Bartlett, P.F., Covarrubias, L. (2012) Glial commitment of mesencephalic neural precursor cells expanded as neurospheres precludes their engagement in niche-dependent dopaminergic neurogenesis. Stem Cells Dev. 21, 1047-1058

2. Ocadiz-Delgado, R., Castañeda-Saucedo, E., Indra, A.K., Hernandez-Pando, R., Flores-Guizar, P., Cruz-Colin, J.L., Recillas-Targa, F., Perez-Ishiwara, G., Covarrubias, L., Gariglio, P. (2012) RXRα deletion and E6E7 oncogene expression are sufficient to induce cervical malignant lesions in vivo. Cancer Lett. 317, 226-36.

3. Cuervo, R., Hernández-Martínez, R., Merchant-Larios, H., Chimal-Monroy, J. and Covarrubias, L. (2012) Full regeneration of the tribasal Polypterus fin. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 109, 3838-43.

4. Bouzas-Rodriguez, J., Rodríguez-Valentín, R., Gracida, X., Madden, D.T., Poksay, K., Bredesen, D.E., Covarrubias, L. and Castro-Obregón, S. (2012) The Nuclear Receptor Nur77 mediates non-apoptotic cell death dependent on autophagy. PLoS ONE 7, e46422.

5. Jonathan G. Rodríguez, Amanda Villalón Rojas, Sur Herrera, Georgina Garza-Ramos, Alfredo Torres Larios, Carlos Amero, Gabriela Zárraga-Granados, Manuel Gutiérrez Aguilar, Maria Teresa Lara Ortiz, Carlos Polanco Gonzalez, Salvador Uribe Carvajal, Roberto Coria, Antonio Peña, Dale E. Bredesen, Susana Castro-Obregon, Gabriel del Rio. (2012) Moonlighting peptides with emerging function. PLoS ONE 7(7) e40125

6. Guerrero A, Espinal J, Wood CD, Rendón JM, Carneiro J, Martinez Mekler G, Darszon A (2013) Niflumic acid disrupts marine spermatozoan chemotaxis without impairing the spatiotemporal detection of chemoattractant gradients. J. Cell Science 126 1477-87.

7. Klatt, Stephan; Hartl, Daniela; Fauler, Beatrix; Gagoski, Dejan; Castro-Obregón, Susana; Konthur, Zoltán (2013) Generation and characterization of a Leishmania tarentolae strain for site-directed in-vivo biotinylation of recombinant proteins. Journal of Proteome Research.

Capítulos en libros 1. Susana Castro Obregón (2012). Autofagia en el proceso de envejecimiento.

Aspectos Moleculares del Envejecimiento. Editado por el Instituto Nacional de Geriatría, México.

2. Hernández-Martínez, R. and Covarrubias, L. (2013) Detection of cells programmed to die in mouse embryos. In: Mouse Molecular Embryology: v. 1 - Methods in Molecular Biology No. 2241 (Mark Lewandowski, Ed). En prensa.

3. Covarrubias, Luis (2013). De la clonación molecular a la clonación de animales (reprogramación genómica para la terapia celular). En: Grandes Retos del Siglo XXI (Compilador: Héctor Vasconcelos). UNAM, México. En prensa.

Tesis Concluidas:

1. Luz Adriana Vega Cabrera. “La division cellular durante el desarrollo de las extremidades de ratón”. Maestría en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Febrero 2012.

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2. Sara Ruth Albarrán Gutiérrez. “Construcción de un vector bicistrónico para medir el calcio”. Licenciatura en Biología, Facultad de Ciencias, UNAM. Febrero 2012.

3. María Concepción Cruz Santos. “Optimización del protocolo para inducir diferenciación en monocapa adherente de células troncales embriónicas de ratón a células precursoras neurales”. Maestría en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Octubre 2012.

4. Aimée Bastidas Ponce. “Análisis de la expresión espacio-temporal de Sonic Hedgehog mediante el uso de luciferasa como reportero dinámico”. Maestría en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Mayo 2013.

Docencia:

1. Curso Básico de Biología Celular (participante). Posgrado en Ciencias Bioquímicas, UNAM.

2. La Biología del Desarrollo en la Era Genómica, Facultad de Ciencias (Biología), UNAM.

3. Taller: La Biología a partir de las biomoléculas: nuevos paradigmas y aplicaciones (participante). Facultad de Ciencias (Biología).

4. Tópico selecto “Regulación del metabolismo en el contexto celular”. Posgrado en Ciencias Bioquímicas.

Donativos:

1. DGAPA IN225910 (LC) 2. DGAPA IN209813 (LC) 3. CONACYT SALUD-2005-01-14609 (LC) 4. CONACYT SEP-131031 (LC) 5. CONACYT SEP-132478 (CW) 6. DGAPA IN223810 (CW) 7. DGAPA IN221909-3(SC) 8. CONACYT SEP-106598 (SC)

Otras actividades relevantes:

1. Responsable del Laboratorio Nacional de Microscopía Avanzada (CW). 2. Miembro del Comité de Medicina Regenerativa y Terapia Celular Avanzada del

Consejo de Salubridad General, Secretaria de Salud (LC).

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Grupo Dr. Federico Sánchez

Integrantes del Grupo de Federico Sánchez (2012-2013) Investigadores Asociados: Claudia Díaz Camino Post-doctorales; Dr. Chandasekar Balu Rajeswari (abril 2012) Dr. Aarón Barraza-Celis (Febrero-julio 2013) Investigadores visitantes: Dr. Julieta Pérez. Determinacióndel papel de la lectina de frijol y soya en la eficiencia de la nodulación por R.etli y por Bradyrhizobium japonicum. (Post Doctorado, Universidad de la Plata, Argentina). 2012. Duraciónde 3 meses. Técnicos Académicos: Georgina Estrada Juan Olivares Gabriel Guillén Estudiantes de Posgrado: Lucio Ricardo Montero (doctorado) Gabriel Guillén (doctorado) Mauricio Díaz Sánchez (Maestría) Claudia V. Dorantes Torres (Doctorado) Jonathan Rodríguez-López (Doctorado) Alejandrina Hernández López (Doctorado) Aarón Barraza Celis (Doctorado) Pablo Peláez (Doctorado) Neftalí de Jesus Cruz Mireles (Maestría) Personal Administrativo Sra. Olegaria Benitez Villavueva Margarita Ferrel Fuentes (2012-2013) Francisco Reyes (2013) Maricela Izquierdo Producción primaria del grupo de Federico Sánchez (2012-2013)

1-Islas-Flores T, Guillén G, Sánchez F, Villanueva MA. 2012.Changes in RACK1 expression induce defects in nodulation and development in Phaseolus vulgaris. Plant Signaling and Behaviour (addendum) 7: 1, 1–3.

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2-Pelaez P, Trejo M S, Iniguez L P, Estrada-Navarrete G, Covarrubias A A, Reyes J L, and Sanchez F. 2012. Identification and characterization of microRNAs in Phaseolus vulgaris by high-throughput sequencing. BMC Genomics 13:83 (http://www.biomedcentral.com/1471-2164/13/83) 3-Ana B. Mendoza-Soto, Federico Sanchez and Georgina Hernandez. 2012. MicroRNAs in Plant Metal Toxicity Response. Front. Plant Sci. 3:105. doi:10.3389/fpls.2012.00105 4-Jesús Montiel, Noreide Nava, Luis Cárdenas, Rosana Sánchez-López, Manoj Kumar Arthikala, Olivia Santana, Federico Sánchez and Carmen Quinto. 2012. A Phaseolus vulgaris NADPH Oxidase Gene Is Required For Root Infection By Rhizobia. Plant and Cell Physiology. Plant Cell Physiol, 53, 1751-63. 5- Luis Eduardo Servín-Garcidueñas, Marco Rogel, Ernesto Ormeño-Orrillo, Alfonso Delgado-Salinas, Julio Martinez, Federico Sánchez, and Esperanza Martínez-Romero 2012. Genome sequence of Rhizobium sp. strain CCGE510, a symbiont isolated from nodules of the endangered wild bean Phaseolus albescens. J. Bact. 194: 6310-6311. 6-Aarón Barraza, Georgina Estrada-Navarrete, Maria Elena Rodriguez-Alegria, AgustinLopez-Munguia, Enrique Merino, Carmen Quinto, Federico Sanchez. 2013. Down-regulation of PvTRE1 Enhances Nodule Biomass and Bacteroid Number in Common Bean. New Phytologist. 197, 194-206. 7-Gabriel Guillén†, Claudia Díaz-Camino†, Carlos A. Loyola-Torres, Rosaura Aparicio-Fabre, Alejandrina Hernández-López , Mauricio Díaz-Sánchez and Federico Sanchez. 2013. Detailed analysis of putative genes encoding small proteins in legume genomes. 4: 1-12. Frontiers in Plant Sciences. doi: 10.3389/fpls.2013.00208. 8-Aarón Barraza and Federico Sánchez. 2013. Trehalase: A neglected carbon metabolism regulator? Plant Signaling & Behavior 8: 7, e24778; July 2013. 9- Pablo Peláez y Federico Sánchez. 2013. Small RNAs in plant defense responses during viral and bacterial interactions: similarities and differences. Frontiers in Plant Sciences. 4:343. doi:10.3389/fpls.2013.00343 10-Rodriguez Lopez J., Martínez Centeno CG., Annamalai, P., Guillen Solis G., Olivares Grajales JE., Stefano, G., Lledias Martínez JF., Ramos, F., Ghabrial, SA., Brandizzi, F., Rocha Sosa M., Diaz Camino C., Sánchez F. 2013. Nodulin 22, a Novel Small Heat Shock Protein of the Endoplasmic Reticulum, is linked to the Unfolded Protein Response in Common Bean. MPMI. http://apsjournals.apsnet.org/doi/pdf/10.1094/MPMI-07-13-0200-R Alumnos Graduados 2012-2013 Aarón Barraza Grado: Doctorado en Ciencias Bioquímicas

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Institución: Instituto de Biotecnología. UNAM Título: -"Caracterización de la TPS de Phaseolus vulgaris, modificación de su

expresión y efecto en la simbiosis Fecha de Examen: 30 de enero 2013.

Participación en Docencia.

-Genómica Funcional 2, nivel Licenciatura en Licenciatura en Ciencias Genómicas 6 horas a la semana (Responsable) Impartido en Licenciatura en Ciencias Genómicas de 07/08/2012 a 23/11/2012.

-Biología Vegetal, nivel Posgrado en Ciencias Bioquímicas 6 horas al semestre

(Docente) Impartido en el IBT-UNAM de 04/12/2012 a 06/12/2012. -Fronteras de la Genómica,nivel Licenciatura en Licenciatura en Ciencias

Genómicas3 horas a la semana (Docente) Impartido en Licenciatura en Ciencias Genómicas de 23/02/2012 a

23/02/2012. -Biología Vegetal, nivel Posgrado en Ciencias Bioquímicas 6 horas al semestre

(Docente) Impartido en el IBT-UNAM de 04/12/2012 a 06/12/2012. -Frontiers in Genomics, nivel Licenciatura en Licenciatura en Ciencias

Genómicas 6 horas a la semana (Responsable) Impartido en IBT-CCG de 06/02/2013 a 24/05/2013.

-Symbiomics, nivel Posgrado en Posgrado en Ciencias Bioquímicas 4 horas a la

semana (Responsable) Impartido en IBT-UNAM de 06/02/2013 a 24/05/2013.

Divulgación -TV,Difusión de la actividad científica realizada en mi laboratorio. TV UNAM. TV-UNAM para Educación Secundaria y Preparatoria [Regional]. 14/11/2013. -TV,Charlas con Científicos. Academia de Ciencias de Morelos (ACMOR. Las Plantas transgénicas. Qué son y cómo se hacen http://acmor.org.mx/ [Regional]. 30/05/2013.

Donativos -$ 2000000 Pesos ($ 800000 este período) Fecha de Inicio 01/01/2013. Donados por CONACyT. Uso : La autofagia y la inmunidad innata en la interacción simbiótica Phaseollus vulgaris-Rhizobium etli. aprobación duración 3 año(s) . Clave del Proyecto 0177744. -$ 425000 Pesos ($ 221000 este período) Fecha de Inicio 01/02/2011. Donados por International Atomic Energy Agency. Uso : Transcriptome, gene discovery and functional genomics analysis of nitrogen-fixing root-nodules from Phaseolus vulgaris, Phaseolus acutifolius (tepari bean)and

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Vigna unguiculata (cowpea) heat and drought tolerant cultivars.. aprobación , duración 3 año(s) . Clave del Proyecto 16601/RO. -$ 600000 Pesos ($ 200000 este período) Fecha de Inicio 01/01/2012. Donados por DGAPA-UNAM. Uso : El papel de la proteína inhibidora de BAX (BI-1)de Phaseolus vulgaris y la muerte celular durante la simbiosis con Rhizobium etli.. aprobación , duración 3 año(s) . Clave del Proyecto IN222012.

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Grupo Dr. J. Dubrovsky INTEGRANTES DE GRUPO 2012-2013 Investigadores: Dra. Svetlana Shishkova Técnicos M. en C. Selene Napsucialy Mendivil I.B.I. Marcela Ramírez Yarza Posdocs Dra. Yamel Sonia Ugartechea Chirino (becaria de DGAPA, Enero a Mayo 2012). Dr. Jun-Cheol Moon (becario de la SRE, Enero a Marzo de 2012) Dr. Ashutosh Sharma (becario de CONACyT, a partir de Abril a Julio de 2012) Dr. Jesús Montiel González (becario de CONACyT, a partir de Octubre de 2012 a Mayo de 2013). Dra. María de Lourdes Velázquez Hernandez (becaria de CONACyT, a partir de Julio de 2013) Estancias Temporales Dra. Elena Basiuk Dra. María Laura Las Peñas Dr. Victor B. Ivanov M.C.. Adriana Santamaría Bonfil M.C. Jonathan Salazar León Estudiantes de Servicio Social Rodrigo Jiménez Cobo Víctor Hugo Maldonado Sánchez Ivette Stephanie Hernandez Rufino Flores Zapotitla Alexis Omar Campuzano González Karla Uriostegui Norma Isamar Hernández Pozo Estudiantes de Licenciatura Héctor Hugo Torres Martínez Carlos Alfonso Sierra Jessica Pacheco Mendoza

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Estudiantes de Maestría Lic. Mayra Liliana Lopez Valle Biol. Hector Hugo Torres Martínez Biol. Raquel Sánchez Izquierdo Estudiantes de Doctorado Lic. Andrés Cuevas Moreira M.C. Gustavo Rodríguez Alonso Biol. Blanca Jazmín Reyes Hernández M. en C. Ramsés De Jesús García M. en C. Selene Napsucialy Mendivil Personal Administrativo Jesús Moreno Mercado Mario Roberto Cruz Jarillo Juana Maricela Izquierdo Cabrera PUBLICACIONES 2012-2013 Dubrovsky J. G. and Forde B. G. 2012. Quantitative analysis of lateral root development: pitfalls and how to avoid them. PLANT CELL, 24: 4–14, doi:10.1105/tpc.111.089698. IF 8.987 Orozco-Arroyo G., Vázquez-Santana S., Camacho A., Dubrovsky J.G., Cruz-García F. 2012. Inception of maleness: auxin contribution to flower masculinization in the dioecious cactus Opuntia stenopetala. Planta, 236: 225-238. DOI: 10.1007/s00425-012-1602-5. IF 3.000 Ivanov V.B., Dubrovsky J.G. 2013. Longitudinal zonation pattern in plant roots: conflicts and solutions. 2013. Trends in Plant Science, 18:237-243, http://dx.doi.org/10.1016/j.tplants.2012.10.002. IF 11.808 Shishkova S., Las Peñas M.L., Napsucialy-Mendivil S., Matvienko M., Kozik A., Montiel J., Patiño A., Dubrovsky J.G. 2013. Determinate primary root growth as an adaptation to aridity in Cactaceae: towards evolution and genetic control of the trait. Annals of Botany, 112: 239-252, doi: 10.1093/aob/mct100. IF 3.449 Basiuk V., Basiuk E., Shishkova S., Dubrovsky J.G. 2013. Systemic phytotoxic impact of as-prepared carbon nanotubes in long-term assays: A case study of Parodia ayopayana (Cactaceae). Science of Advanced Materials, 5:1337-1345, DOI: 10.1166/sam.2013.1594 IF 2.509

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Lira-Ruan V., Napsucialy-Mendivil S., Dubrovsky J.G. 2013. Heuristic aspect of the lateral root initiation index: a case study of role of NO in root branching. Applications in Plant Sciences 1:1-8, doi:10.3732/apps.1300029. IF en trámite (nueva revista de Botanical Society of America) Ivanchenko, M.G., den Os D., Monhausen G.B., Dubrovsky J.G., Bednarova A., Krishnan N. 2013. Auxin increases the hydrogen peroxide (H2O2) concentration in tomato (Solanum lycopersicum) root tips while inhibiting root growth. Annals of Botany, doi:10.1093/aob/mct181. IF 3.449 Garay-Arroyo A., Ortiz-Moreno E., Sánchez M.P., Murphy A.S., Marsch-Martínez N., de Folter S., García-Ponce B., Corvera-Poiré A., Jaimes-Miranda, F., Pacheco-Escobedo M., Dubrovsky J.G., Pelaz, S., Alvarez-Buylla, E.R. 2013. The MADS transcription factor XAL2/AGL14 modulates auxin transport during Arabidopsis root development by regulating PIN expression. The EMBO Journal, 32: 2884-2895. IF 9.822 López-Bucio J.S., Dubrovsky J. G., Raya-González J., Ugartechea-Chirino Y., López-Bucio J., de Luna-Valdez L.A., Ramos-Vega M., León P., Guevara-García A.A. Arabidopsis thaliana mitogen-activated protein kinase 6 is involved in seed formation and modulation of primary and lateral root development. Journal of Experimental Botany, doi:10.1093/jxb/ert368 IF 5.242 Capitulos de libros: Dubrovsky J.G. and Rost T.L. 2012. Pericycle. In: A. M. Hetherington, Ed. Encyclopedia of Life Sciences. Second Edition. John Wiley & Sons, Ltd: Chichester. ISBN: 9780470015902, DOI: 10.1002/9780470015902.a0002085.pub2. Dubrovsky J.G. and Shishkova S. 2013. Developmental adaptations in roots of desert plants with special emphasis on cacti. In: Plant Roots: The Hidden half. 4th Edition. A. Eshel and T. Beeckman (eds.), CRC Press, Taylor and Francis Group, Boca Raton, Florida. ISBN: 13:978-1-4398-4649-0 ALUMNOS GRADUADOS 2012-2013 (JD) Hector Hugo Torres Martínez, tesis de licenciatura, 24 de Agosto, 2012. (JD) Biol. Raquel Sánchez Izquierdo, tesis de maestría 22 de Junio de 2012

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Participación en docencia 2012-2013 (SS) Participación en 3 cursos de Posgrado en ciencias BQ, coordinación de curso de Biología Vegetal, participación en 1 curso de Licenciatura, en Comités Tutorales de 3 estudiantes de Maestría y Doctorado, miembro de jurado de 3 exámenes de estudiantes de Posgrado. (JD) Participación en 2 cursos de Posgrado en ciencias BQ, UNAM y en Comités Tutorales de 5 estudiantes de Maestría y Doctorado; participación como miembro de jurado en 6 exámenes de estudiantes de Posgrado (sin considerar los estudiantes de laboratorio). DIVULGACIÓN Entrevista con el Dr. J. Dubrovsky transmitida por TELEVISA Morelos. El tema "UNAM y Cactáceas", 1 de Octubre de 2012. Entrevista con el Dr. J. Dubrovsky transmitida por TELEVISA, Programa: "Reactor Ftv", Capítulo: 367. El tema: "Ciencias y artes", 2 de Junio de 2013. DONATIVOS (SS) 2012-2014, Proyecto financiado por DGAPA, UNAM (IN2049012): “Estudio de la regulación genética del crecimiento determinado de la raíz de cactáceas desérticas”. Monto del periodo: $400,000.00. 2013-2014, Proyecto financiado por SEP-CONACyT (128135): “Integration of nodulation signalling pathway and assessment of its performance in promoting nitrogen-fixing rhizobial symbiosis in rice”. Monto del periodo: $375,290.00. (JD) 2011-2014, Proyecto financiado por SEP-CONACyT (127957): “Caracterización y mapeo genético de las mutantes de Arabidopsis thaliana afectadas en el desarrollo del sistema radical: Parte II”. Monto: $1,300,000.00 2012-2014, Proyecto financiado por DGAPA, UNAM (IN204312) “Análisis del desarrollo de la raíz de Arabidopsis thaliana a nivel genético y celular”. Monto del periodo: $392,720.00

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Grupo Dr. O. Pantoja Integrantes del Grupo 2012-2013 Dra. Bronwyn Jane Barkla Investigador Dra. Rosario Vera Investigador Dr. Julio César Amezcua Investigador en Estancia Post-Doctoral M.C. Paul Rosas Estudiante Doctorado M.C. Adriana Garibay Estudiante Doctorado Biol. Delia Angélica Narváez Estudiante Maestría Biol. María Fernanda Gómez Estudiante Maestría Ing. Gustavo Moisés Lastiri Estudiante Maestría Daniel Lagunas Estudiante Licenciatura Ruth García Estudiante Licenciatura Carlos Ignacio Rangel Estudiante Licenciatura María Guadalupe Muñoz Laboratorista

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Publicaciones 2012-2013 Barkla,B.J. Vera-Estrella,R. Pantoja,O. 2014. Growing Arabidopsis in vitro: cell suspensions, in vitro culture, and regeneration. Methods Mol Biol, 1062, 53-62. Barkla,B.J. Vera-Estrella,R. Pantoja,O. 2013. Progress and challenges for abiotic stress proteomics of crop plants. Proteomics, 13, 1801-1815. Barkla,B.J. Vera-Estrella,R. Pantoja,O. 2012. Protein profiling of epidermal bladder cells from the halophyte Mesembryanthemum crystallinum. Proteomics, 12, 2862-2865. Pantoja,O. 2012. High affinity ammonium transporters: molecular mechanism of action. Front Plant Sci, 3, 34. Vera-Estrella,R. Barkla,B.J. Amezcua-Romero,J.C. Pantoja,O. 2012. Day/Night Regulation of Aquaporins During the CAM Cycle in Mesembryanthemum crystallinum Plant Cell Environ, 35, 485-501. Alumnos Graduados 2012-2013 Luis Adrian Lerin Morales - Licenciatura, Universidad Politécnica de Sinaloa. Fecha de examen - 14 Dic, 2012 Título de Tesis: Análisis del Metabolismo Ácido de las Crasuláceas (CAM) en las células vejiga de Mesembryanthemum crystallinum. Tutor: Dra. Bronwyn Barkla María Fernanda Gómez Méndez – Licenciatura, Universidad Autónoma Estado de Morelos. Fecha de Examen – 6 Diciembre, 2012. Título de Tesis: Caracterización de los metales pesados en el tonoplasto de Nicotiana tabacum. Tutor: Dra. Bronwyn Barkla

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Delia Angélica Narváez Barragán. Licenciatura en Biología, Universidad Autónoma del Estado de Morelos. Fecha de Examen: Diciembre 2012. Título de Tesis: Análisis de la expresión de genes que codifican para transportadores de los metales pesados Zn2+ y Cd2+ en plantas de Nicotiana tabaccum. Tutor: Dra. Rosario Vera Armando Arturo Hernández Giles. Licenciatura, Universidad Politécnica del estado de Morelos. Examen 10 de Mayo 2013 Título de Tesis: Caracterización electrofisiológica de las proteínas mutantes de PvAMT1;1-H125P, -D203A y -W181D transportadoras de iones amonio de Phaseolus vulgaris. Tutor: Dr. Omar Pantoja Participación en docencia 2012-2013 Dra. Bronwyn J. Barkla 2013 (1) Curso: Licenciatura en Ciencias Genómicas – Seminario 2 --Proteínas y Proteómica (2 clases, 8 hrs) 2012 (1) Curso: Licenciatura en Ciencias Genómicas – Seminario 2 --Proteínas y Proteómica (2 clases, 8 hrs) Dra. Rosario Vera Estrella 2014 (I) Coordinadora del curso de Biología Celular de Maestría y Doctorado del programa de Bioquímica, sede Instituto de Biotecnología/UNAM 2014 (I) Profesor en el curso taller purificación y caracterización de proteínas. Posgrado en Ciencias Bioquímicas. 12 horas. 2013 (II) Profesor en el curso Biología Celular. Posgrado en Ciencias Bioquímicas. 12 horas. 2013 (II) Profesor en el curso. Licenciatura de Ciencias Genómicas. Centro de Ciencias Genómicas/UNAM. Cuernavaca, Morelos. 8 horas. 2013 (I) Coordinadora del curso de Biología Celular de Maestría y Doctorado del programa de Bioquímica, sede Instituto de Biotecnología/UNAM 2013 (I) Profesor en el curso taller purificación y caracterización de proteínas. Posgrado en Ciencias Bioquímicas. 12 horas. 2012 (II) Profesor en el curso Biología Celular. Posgrado en Ciencias Bioquímicas. 12 horas. 2012 (II) Profesor en el curso. Licenciatura de Ciencias Genómicas. Centro de Ciencias Genómicas/UNAM. Cuernavaca, Morelos. 8 horas al semestre 2012 (I) Coordinadora del curso de Biología Celular de Maestría y Doctorado del programa de Bioquímica, sede Instituto de Biotecnología/UNAM 2012 (I) Profesor en el curso taller purificación y caracterización de proteínas. Posgrado en Ciencias bioquímicas. 12 horas Dr. Omar Pantoja Ayala 2013 (II) Profesor en el curso Biología Celular. Posgrado en Ciencias Bioquímicas. 8 horas.

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2013 (II) Profesor en el curso Biología Vegetal. Posgrado en Ciencias Bioquímicas. 6 horas. 2012 (II) Profesor en el curso Biología Celular. Posgrado en Ciencias Bioquímicas. 8 horas. 2012 (II) Profesor en el curso Biología Vegetal. Posgrado en Ciencias Bioquímicas. 6 horas. Divulgación María Fernanda Gómez-Méndez, Delia Narváez Barragán y Omar Pantoja. 2012. Bioremediación, una alternativa natural contra la contaminación. La Unión de Morelos. 7 de mayo de 2012 Amezcua-Romero JC, Vera-Estrella R. 2012. Las plantas y sus acuaporinas. Ciencia. Enero-Marzo pp 58-67 Donativos CONACYT/DAAD 2013-2015 – Collaboration with Dr. Hans-Peter Mock, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Germany. Proyecto: Bilateral Science Collaboration Mexico/Germany Título: A dual approach towards the identification of vacuolar proteins important for plant salt tolerance by employing crop plants and model salt tolerant plants.. Cantidad: $130,000 MXN pesos DGAPA: 2013-2015 Proyecto IN203913 Título: Label Free Quantitative Proteomics to identify integral membrane proteins important for plant salt tolerance. Cantidad: $720, 000 pesos CONACyT 2012-2015 Proyecto 178232. Título: Participación de los compartimentos prevacuolares en la tolerancia a la salinidad. Cantidad: $1006560 Pesos DGAPA: 2010-2013 Proyecto: IN203711-3. Título: Análisis proteómico de las membranas plasmática y vacuolar de las raíces de Mesembryanthemum crystallinum expuestas a la salinidad y la sequía. Cantidad: $ 598 000.00 DGAPA: 2012-2014 Projecto IN203112 Título: Identificación de aminoácidos importantes en el funcionamiento del transportador de amonio PvAMT1;1 Cantidad: $720,000.00 pesos

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CONACyT Diciembre 2011 Título: Apoyos para infraestructura para confinamiento de Organismos Genéticamente Modificados Cantidad: $1,000,000.00

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Grupo Dr. G. Pedraza Integrantes del Grupo 2012-2013 Dra. Lourdes Álvarez (Estancia posdoctoral/CONACYT) Dr. Tomás Villaseñor (Estancia Posdoctoral/DGAPA) M. en C. Noemí Camacho Concha (Servicios Profesionales/CONACYT) Biol. Laura Valdez (Estudiante de Maestría/Ciencias Bioquímicas) Yaxem López (Estudiante Licenciatura/UNAM) Gilberto Villa (Estudiante Licenciatura/UPEMOR) Rafael Maldonado (Estudiante Licenciatura/UAEM) Erick Pérez (Estudiante Licenciatura/UNAM) Alejandro Costets (Estudiante Licenciatura/UAEM) Jorge Ochoa (Estudiante Licenciatura/UAEM) Oswaldo López (Técnico Académico) Manuel Saucedo (Laboratorista) Clara Díaz (Asistente Ejecutivo) Carmelita Gante (Auxiliar de Laboratorio) Alumnos Graduados Gilberto Basilio Villa Rojas. Ingeniero en Biotecnología, Universidad Politécnica del Estado de Morelos. Participación de Caspasa-1 en el proceso neurodegenerativo de la enfermedad de Alzheimer. Abril 2013. Ana Laura Valdez Hernández. Bióloga, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México. El papel de Nalp1b1 en la inflamación inducida por obesidad. Agosto 2013. Yaxem López Sevilla, Bióloga. Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México. Regulación de la expresión de Merlin por los microRNAs 7 y 146a. Octubre 2013. Participación en Docencia. Gustavo Pedraza Coordinador del Curso de Biología Celular. Maestría en Ciencias Bioquímicas. Semestres 12-2 y 13-2

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Profesor del curso de Biología Celular. Maestría en Ciencias Bioquímicas. Semestres 13-1 y 14-1. Profesor del Curso Básico de Inmunología. Sociedad Mexicana de Inmunología. Oaxtepec, Mor. Enero 2013. Profesor del Curso Avanzado de Inmunología. Sociedad Mexicana de Inmunología. Zacatecas, Zac. Septiembre 2013. Lourdes Álvarez y Gustavo Pedraza Tópico selecto: Mecanismos moleculares que controlan la activación del sistema inmune innato. Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Doctorado en Ciencias Biomédicas. Semestres 12-2 y 13-2. Donativos 2012-2014 CONACYT. Proyecto 154542: El papel del inflamasoma en la neurodegeneración colinérgica inducida por oligomeros b-Amiloides. 2012-2014 ICGEB. Proyecto CRP/MEX11-01: Characterization of the transduction pathways activated by M. tuberculosis leading to inefficient immune response. 2013-2015 DGAPA/UNAM. Proyecto IN209513: El papel del inflamasoma de Nalp1b1 en la resistencia a insulina y leptina inducida por la inflamación resultante de la obesidad. Publicaciones Artículos Meza-Sosa, K. F., Valle-García, D. Pedraza-Alva, G. and Pérez-Martínez, L. (2012) The role of microRNAs in the central nerveous system development and fucntion. J. of Neuroscience Research. 90:1-12. Zoltan Varga, Georgina Gurrola-Briones, Ferenc Papp, Ricardo C. Rodríguez de la Vega, Gustavo Pedraza-Alva, Rajeev B. Tajhya, Rezso Gaspar, Luis Cardenas, Yvonne Rosenstein, Christine Beeton, Lourival D. Possani2 Gyorgy Panyi (2012) Vm24, a natural immunosuppressant peptide potently and selectively blocks Kv1.3 potassium channels of human T cells. Molecular Pharmacology. 82:372-82. Cortés-Mendoza J, Díaz de León-Guerrero S, Pedraza-Alva G, Pérez-Martínez L. (2013) Shaping synaptic plasticity: The role of activity-mediated epigenetic regulation on gene transcription. Int J Dev Neurosci. 31:359-69

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Camacho-Concha, N., Olivos-Ortiz, A., Nuñez-Rivera, A., Pedroza-Zavedra, A., Gutierrez-Xicotencatl, L., Rosenstein, Y and Pedraza-Alva, G. (2013). CD43 abrogates contact inhibition of growth and promotes cell transformation by targeting the merlin pathway. PLoS ONE 8(11): e80806. Libros Título del libro: Molecular aspects of inflammation E-Book series, Bentham Science Publishers, Sharjah, U.A.E. Editores: Leonor Pérez-Martínez, Gustavo Pedraza-Alva and Eduardo Ferat Osorio. Research sign post, Kerala, India. 2013 En presa. Capítulos en Libros Leonor Pérez-Martínez and Gustavo Pedraza-Alva. Cell signaling: from non-specific bands to posttranslational modifications-mediated protein-protein interactions. In: Tools to understand protein-protein interactions (Ed. Isabel Gómez Gómez). Research sign post, Kerala, India. 2012. Laura Montero-León, Ana Laura Valdez-Hernández, Carlos Pérez-Lemus and Gustavo Pedraza-Alva. Inflammasomes: Homeostasis guardians. In: Molecular aspects of inflammation (Ed. Leonor Pérez-Martínez, Gustavo Pedraza-Alva and Eduardo Ferat Osorio). Research sign post, Kerala, India. 2013. En prensa. Lourdes Alvarez-Arellano, Sol Díaz de León-Guerrero, Karla F. Meza-Sosa Itzia Jiménez-Ferrer C. and Leonor Pérez-Martínez. Neurodegenerative disorders and inflammation. In: Molecular aspects of inflammation (Ed. Leonor Pérez-Martínez, Gustavo Pedraza-Alva and Eduardo Ferat Osorio). Research sign post, Kerala, India. 2013. En prensa. Divulgación. Karla F. Meza-Sosa., David Valle-García, Gustavo Pedraza-Alva y Leonor Pérez-Martínez. (2013) MicroARNs, los pequeños grandes actores del sistema nervioso. Ciencia, 64:79-86.

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Grupo Dr. M. Zurita Integrantes del Grupo 2012-2013 Investigadoras: Dra. Martha Vázquez Dra. Viviana Valadez Dra. Denhi Schnabel Estudiantes: Dr. Juan Luís Monribot M. en C. Grisel Cruz M. en C. Alyeri Bucio M. en C. Cinthya Gurrión. M. en C. Brenda López M. en C. Silvia Meyer Biol. Mandy Juárez QFB. Ma. Tere Urriostegui Lic. CG Dafne Ibarra Benjamín Hernández Secreataria: Minerva Carcano Técnico Lab: Carmen Muñoz Intendencia. Silvia Velázquez. Publicaciones 2012-2013 VIVIANA VALADEZ-GRAHAM1*, YASUHIDE YOSHIOKA2* OSCAR VELAZQUEZ1, AKIHITO KAWAMORI2 ADINA NEUMAN, MARTHA VAZQUEZ, MASAMITSU YAMAGUCHI2 AND MARIO ZURITA (2012) DATRX INTERACTS WITH DREF IN THE CHROMATIN TO REGULATE GENE EXPRESSION. NUCLEIC ACIDS RES. 40, 1460-1474. YASUHIDE YOSHIOKA, NGUYEN TRONG TUE, SHUNSUKE FUJIWARA, RISA MATSUDA, VIVIANA VALADEZ-GRAHAM , MARIO ZURITA AND MASAMITSU YAMAGUCHI (2012) Drosophila transcription factor DREF acting via the JNK pathway is required for thorax development. Genesis 50(8):599-611

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MARIANA HERRERA*, GRISEL CRUZ*, CLAUDIA VILLICAÑA, VIVIANA VALADEZ, ENRIQUE REYNAUD AND MARIO ZURITA+. (2012) PHYSICAL AND FUNCTIONAL INTERACTIONS BETWEEN THE SWC6/P18HAMLET SUBUNIT OF THE SWR1/SRCAP CHROMATIN-REMODELING COMPLEX WITH THE DNA REPAIR/TRANSCRIPTION FACTOR TFIIH. JOURNAL OF BIOL. CHEM. 287: 33567-33580

CLAUDIA VILLICAÑA, GRISEL CRUZ, AND MARIO ZURITA (2013) THE GENETIC DEPLETION OR THE TRIPTOLIDE INHIBITION OF TFIIH IN P53 DEFICIENT CELLS INDUCE A JNK-DEPENDENT CELL DEATH IN DROSOPHILA. JOURNAL OF CELL SCIENCE 126, 2502-2515 JUAN MONRIBOT-VILLANUEVA1, R. ALEJANDRO JUÁREZ-URIBE1, ZORAYA PALOMERA-SÁNCHEZ1, LUCÍA GUTIÉRREZ-AGUIAR1, MARIO ZURITA1, JAMES A. KENNISON2, AND MARTHA VÁZQUEZ1 (2013) TNAA, AN SP-RING PROTEIN, INTERACTS WITH OSA, A SUBUNIT OF THE CHROMATIN REMODELING COMPLEX BRAHMA AND WITH THE SUMOYLATION PATHWAY IN DROSOPHILA MELANOGASTER. PLOS ONE (APR 19;8(4):E62251

CLAUDIA VILLICAÑA, GRISEL CRUZ AND MARIO ZURITA (2013) THE BASAL TRANSCRIPTION MACHINERY AS A TARGET FOR CANCER THERAPY. (Sometido Molecular Cancer). Alumnos Graduados 2012-2013

MARIANA HERRERA, DOCTORADO EN CIENCIAS BIOQUÍMICAS. GRADO OBTENIDO EN SEPTIEMBRE DEL 2012 (MARIO ZURITA) SIVIA MEYER MAESTRÍA EN CIENCIAS BIOQUIMICAS, GRADO OBTENIDO EN 2012 (VIVIANA VALADEZ) ALYERI BUCIO. MAESTRIA EN CIENCIAS BIOQUIMICAS. GRADO OBTENIDO EN MAYO DEL 2012. (MARIO ZURITA) JUAN LUIS MONRIBOT. DOCTORADO EN CIENACIAS BIOQUÍMICAS, GRADO OBTENIDO EN JUNIO DEL 2013 (MARTHA VAZQUEZ) CLAUDIA VILLICAÑA, DOCTORADO EN CIENCIAS BIOQUÍMICAS. GRADO OBTENIDO EN OCTUBRE DEL 2013 (MARIO ZURITA)

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Participación en docencia 2012-2013 Curso básico de biología molecular (segundo semestre del 2013, tema: transcripción en eucariotes) Tópico selecto: De la cromatina al RNA (segundo semestre del 2013) Participación en muchos comités tutorales del posgrado en ciencias bioquímicas y biomédicas. Donativos: PAPIIT (2012-2014) CONACyT (2011-2013) Fundación Miguel Alemán (2012, 2013).

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Grupo Dr. JL Puente Integrantes del grupo 2012-2013 Personal Académico Dr. Víctor H. Bustamante Santillán. Investigador Titular A. Dr. Alejandro Huerta Saquero. Investigador Asociado C*. Dra. Lucía Perezgasga Ciscomani Técnico Académico Titular C.

Biol. Francisco J. Santana Estrada. Técnico Académico Titular A. Dra. Claudia V. Silva Romero Posdoc (JLP) Dr. Ramón Cervantes Rivera Posdoc (JLP) Dra. Deyanira Pérez Morales Posdoc (VHB) Dra. Verónica Iranzú Martínez Santos Posdoc (JLP) Estudiantes Sara Berenice Martínez Luna. Doctorado. Carmen A. Contreras García Doctorado Gustavo Caballero Flores Doctorado Emma Aurora Cruz Gómez Doctorado Abraham Medrano López. Doctorado. Cristina Lara Ochoa. Doctorado María Magdalena Banda H. Maestría (VHB) Rubiceli Manzo Durán Maestría (VHB) Irene J. Palacios Velázquez. Maestría (VHB)* Aurora Labastida Martínez. Maestría* Jaime Enrique Bello Díaz. Maestría Héctor Ramírez Bustamante Licenciatura (RCR) Andrés Escalera Maurer. Licenciatura (VIM)* Nelly Jazmín Pacheco Cruz Estancia Temporal (VHB)* Personal Administrativo Amapola Blanco Zavala. Proyectos. Rosalva González Arenas. Secretaria.

Rebeca Herrera Trujillo Laboratorista Maria Xochitl González C. Laboratorista José Luis Gama Ferrer Laboratorista* *Terminaron su estancia en el laboratorio en el periodo.

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Publicaciones

§ Garnett, J.A., Martínez-Santos, V.I., Saldaña, Z., Pape, T., Hawthorne, W., Chan, J., Simpson, P., Cota, E., Puente, J.L., Girón, J.A. and Matthews, S. (2012). Structural insights into the biogenesis and biofilm formation by the E. coli common pilus. Proc Natl.Acad.Sci U S A, 109, 3950-3955. § Kamada, N., Kim, Y.G., Sham, H.P., Vallance, B.A., Puente, J.L. Martens, E.C. and Nuñez, G. (2012). Regulated Virulence Controls the Ability of an Attaching and Effacing Pathogen to Compete with the Gut Microbiota. Science. 336 (6086): 1325-1329. § Castañeda-Ramírez, A., Puente, J.L., González-Noriega, A. and Verdugo-Rodríguez, A. (2012). Silencing of VAMP3 expression does not affect Brucella melitensis infection in mouse macrophages. Virulence. 3, 434-439. § Moreno-Enriquez,A. Evangelista-Martinez,Z. Gonzalez-Mondragon,E.G. Calderon-Flores,A. Arreguin,R. Perez-Rueda,E. Huerta-Saquero,A. 2012. Biochemical Characterization of Recombinant L-Asparaginase (AnsA) from Rhizobium etli, a Member of an Increasing Rhizobial-Type Family of L-Asparaginases J Microbiol Biotechnol, 22, 292-300. § Martínez-Santos, V.I., Medrano-López, A., Saldaña, Z., Girón, J.A. and Puente, J.L. (2012). Transcriptional regulation of the ecp operon by EcpR, IHF and H-NS in attaching and effacing Escherichia coli. J. Bacteriol. 194: 5020-5033. § García-Angulo, V.A., Martínez-Santos, V.I., Villaseñor, T., Santana-Estrada, F., Huerta-Saquero, A., Martínez, L.C., Jiménez, R., Lara, C., Téllez-Sosa, J.M., Bustamante, V.H. and Puente, J.L. (2012). A distinct regulatory sequence is essential for the expression of a subset of nle genes in attaching and effacing Escherichia coli. J. Bacteriol. 194: 5589-5603. § Ibarra, J.A., García-Zacarias, C.M., Lara-Ochoa, C., Carabarin-Lima, A., Tecpanecatl-Xihuitl, J.S., Pérez-Rueda, E., Martínez-Laguna, Y. and Puente, J.L. (2013) Further Characterization of Functional Domains of PerA, Role of Amino and Carboxy Terminal Domains in DNA Binding. PLoS ONE 8(2): e56977. doi:10.1371/journal.pone.0056977. § Durand,D. Ochoa,T.J. Bellomo,S.M. Contreras,C.A. Bustamante,V.H. Ruiz,J. Cleary,T.G. 2013. Detection of Secretory Immunoglobulin A in Human Colostrum as Mucosal Immune Response against Proteins of the Type Three Secretion System of Salmonella, Shigella and Enteropathogenic Escherichia coli Pediatr.Infect Dis J, 32, 1122-1126. § Huerta-Saquero,A. Evangelista-Martinez,Z. Moreno-Enriquez,A. Perez-Rueda,E. 2013. Rhizobium etli asparaginase II: An alternative for acute lymphoblastic leukemia (ALL) treatment Bioengineered, 4, 30-36.

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§ Hernandez-Tamayo, R., Sohlenkamp, C., Puente, J.L., Brom, S. and Romero, D. 2013. Characterization of IntA, a bidirectional site-specific recombinase required for conjugative transfer of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli CFN42 J Bacteriol. 195: 4668-4677. § Martinez, L.C., Martinez-Flores, I., Salgado, H., Fernandez-Mora, M., Medina-Rivera, A., Puente, J.L., Collado-Vides, J. and Bustamante, V.H. 2013. In Silico Identification and Experimental Characterization of Regulatory Elements Controlling the Expression of the Salmonella csrB/C Genes J Bacteriol, Nov 1. [Epub ahead of print]. Tesis concluidas Licenciatura • Andrés Escalera Maurer. Biología. Fac. de Ciencias, UNAM. Examen: 12 de febrero de 2012 (Tutor Verónica I. Martínez). Maestría • Aurora Labastida Martínez. Maestría en Ciencias Bioquímicas. Examen: 19 de Febrero de 2013. (Tutor Dr. José L. Puente) • Irene Jaquelín Palacios Velázquez. Maestría en Ciencias Bioquímicas. Examen: 29 de Noviembre de 2013. (Tutor Dr. Víctor H. Bustamante) Doctorado • Verónica Iranzú Martínez Santos. Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Examen: 30 de Noviembre de 2012. (Tutor Dr. José L. Puente). Docencia José Luis Puente • Responsable y profesor del taller "La Biología a partir de las biomoléculas; nuevos paradigmas y aplicaciones", niveles I, II, III y IV. Licenciatura en Biología. Facultad de Ciencias, UNAM. Semestres 2012-2 a 2013-2. • Profesor y responsable de la asignatura optativa Fisiología Microbiana. Facultad de Ciencias, UNAM. Sem. 2012-2 (junto con Ricardo Oropeza). Víctor H. Bustamante • Participación en el curso básico de Biología Molecular con el tema Regulación de la expresión genética en procariontes. Posgrado Ciencias Bioquímicas. Sems. 2012-2 a 2014-1.

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• Responsable del Tópico “Mecanismos de regulación de la expresión génica en bacterias” (junto con Cinthia Núñez). Sem. 2013-2 y 2013-2. Donativos • Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT). Clave 154287. 2012-2015

(JLP). • Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). Clave IN227410.

2010-2012 (JLP). • Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). Clave IN209713.

2013-2015 (JLP). • Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT). Clave 83277. 2009-2012

(VHB). • Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT). Clave 179071. 2013-2015

(VHB). Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). Clave IN205512-3. 2012-2014 (VHB).

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Grupo Dr. E. Reynaud Integrantes del Grupo 2012-2013. Nancy Ashley Perez Arizmendi (S.S.) Paola Vargas Gutiérrez (Lic.) Luis Angel Carvajal (Lic.) José Emanuel Peregrina García(lic.) Jesus Ferrer González (Maestría) Iván Fernandez Cruz (Maestría) Sandra Zué Villarreal Reyna (Maestría) Fernando Rosales Bravo (Maestría) Yoandy Ferrer Marcelo (Doc.) Iván Sanchez Díaz (Doc.) M. en C Bernardo Sachman Ruiz (Estancia de investigación) Dr. Verónica Narváez Padilla (Sabático) M. en B. René Hernández Vargas (Técnico Académico) María del Carmen Muñoz García (Laboratorista) Silvia Velazquez (Auxiliar de laboratorio) Publicaciones 2012-2013 Perturbation of tyraminergic/octopaminergic function inhibits oviposition in the cattle tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Cossío-Bayúgar R, Miranda-Miranda E, Narváez Padilla V, Olvera-Valencia F, Reynaud E. J Insect Physiol. 2012 May;58(5):628-33. Physical and functional interactions between Drosophila homologue of Swc6/p18Hamlet subunit of the SWR1/SRCAP chromatin-remodeling complex with the DNA repair/transcription factor TFIIH. Herrera-Cruz M, Cruz G, Valadez-Graham V, Fregoso-Lomas M, Villicaña C, Vázquez M, Reynaud E, Zurita M. J Biol Chem. 2012 Sep 28;287(40):33567-80. Alumnos Graduados 2012-2013 M. en C. Sandra Zué Villarreal Reyna Participación en docencia 2012-2013 Participé en los cursos de Bioquímica y Biología molecular del Posgrado en ciencias Bioquímicas. Impartí el tópico Selecto: "MicroRNAs y su implicación en enfermedades humanas" Divulgación

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Participé en al menos cinco videos de, entrevistas, divulgación y promoción de la ciencia producidos por el Instituto de Biotecnología, el Campus UNAM Morelos y Televisa Morelos. Donativos Donativo Sep-Conacyt conv 2009 No. 131685 “Análisis genético, celular y molecular de los Circuitos Neuronales involucrados en la percepción y transducción del dolor en Drosophila melanogaster.” DonativoPAPIIT No. IN203611 “Análisis de la Interacción in vivo de Alfa-Synucleina-1 y Sinfilina-1 mediante FRET y su relación con el mal de Parkinson Usando como modelo a Drosophila melanogaster” Donativo de la Fundación Miguel Alemán Valdez “Análisis de factores que alteran la dinámica de la interacción a-sinucleina/sinfilina in vivo en un modelo de mal de Parkinson.”

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Grupo Dr. Lorenzo Segovia Integrantes del Grupo 2012-2013 Dra. Marcela Ayala Aceves Dra. Claudia Martínez Anaya Dr. Ernesto Pérez-Rueda Dra. Leticia Brambila (PD)

Dra. Nancy Rivera Gomez (Temp) Doctorado: Dagoberto Armenta Medina Miguel Olarte Lozano Cesar Poot Hernandez Mayra Avelar Estefanía Sierra Ibarra Fernando García Maestría: Guillermo Antonio Huerta Miranda Joaquín Ramírez Ramírez. Mabel Peña Marey Mario Antonio Mendoza Núñez Iris Bravo Licenciatura:

Jhonatan Hernandez Gustavo Tapia Vanessa Gómez Gómez Producción Vazquez-Duhalt R*, Aguila S, Arrocha A, Ayala M. QM/MM molecular modeling and Marcus theory in the molecular design of electrodes for enzymatic fuel cells. ChemElectroChem. Aceptado. Vidal A, Aguila S, Ayala M, Batista C, Vazquez-Duhalt R*. Peroxidase activity stabilization of cytochrome P450(BM3) by rational analysis of intramolecular electron transfer. Journal of Biological Inorganic Chemistry. 122 (2013) 18-26. Ayala M*, Hernandez-Lopez E, Perezgasga L, Vazquez-Duhalt R. Reduced coke formation and aromaticity due to chloroperoxidase-catalyzed transformation of asphaltenes from Maya crude oil. Fuel. 92 (2012) 245-249.

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Freyre-Gonzalez JA, Manjarrez-Casas AM, Merino E, Martinez-Nuñez MA, Perez-Rueda E, Gutierrez-Rios RM. 2013. Lessons from the modular organization of the transcriptional regulatory network of Bacillus subtilis. BMC Systems Biology. 7, 127. Martinez-Nuñez MA, Poot-Hernandez AC, Rodríguez-Vazquez K, Perez-Rueda E. 2013. Increments and duplication events of enzymes and transcription factors influence metabolic and regulatory diversity in prokaryotes. PLoS ONE. 8, e69707. Tenorio-Salgado S, Tinoco R, Vazquez-Duhalt R, Caballero-Mellado J, Perez-Rueda E. 2013. Identification of volatile compounds produced by the bacterium Burkholderia tropica that inhibit the growth of fungal pathogens. Bioengineered. 4.

Balderas-Martínez Y, Savageau M, Salgado H, Perez-Rueda E, Enrique Morett E, Collado-Vides J. 2013. Transcription factors in Escherichia coli prefer the holo conformation. PLoS ONE. 8, e65723.

Peimbert M., Alcaraz LD., Bonilla-Rosso G., Olmedo-Alvarez G., García-Oliva F., Segovia L., Eguiarte L.E., and Souza V.(2012) Comparative metagenomics of two microbial mats at Cuatro Ciénegas Basin I:Ancient lessons on how to cope with an environment under severe nutrient stress. Astrobiology -12,648-658. Ibarra JA, Perez-Rueda E, Carroll RK, Shaw LN. 2013. Global Analysis of Transcriptional Regulators in pathogenic Staphylococcus aureus. BMC Genomics, 14, 126.

Ibarra JA, García-Zacarias CM, Lara-Ochoa C, Carabarin-Lima A, Tecpanecatl S, Perez-Rueda E, Martínez-Laguna Y, Puente JL. 2013. Further characterization of functional domains of PerA, role of amino and carboxy terminal domains in DNA binding. PLoS ONE, 8, e56977. Huerta-Saquero A, Evangelista-Martínez Z, Moreno-Enriquez A, Perez-Rueda E. 2013. Rhizobium etli asparaginase II: an alternative for Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL). Bioengineered. 4(1). Perez-Rueda E, Martínez-Núñez MA. 2012. The Repertoire of DNA-Binding Transcription Factors in Prokaryotes: Functional and Evolutionary Lessons. Science Progress. 95, 233-247. Vazquez-Lima,H. Guadarrama,P. Martinez-Anaya,C. 2012. Geometric distortions on a three-coordinated T1 Cu site model as a potential strategy to modulate redox potential. A theoretical study J Mol Model, 18, 455-466. Moreno-Enríquez A, Evangelista-Martínez Z, González-Mondragón E, Calderón-Flores A, Arreguín R, Perez-Rueda E, Huerta-Saquero A. 2012. Biochemical characterization of recombinant L-asparaginase (AnsA) from Rhizobium etli, a member of an increasing Rhizobial-type family of L-asparaginases. J. Microbiology and Biotechnology. 22, 292-300.

Capítulos de libro

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Torres,E. Ayala,M. 2013. Biocatalysis by Metalloenzymes en: Kenneth,P. Comprehensive Inorganic Chemistry II (Second Edition) Vol 6 Homogeneous Catalytic Applications. Amsterdam. Elsevier. pags. 685-735 Arena-Ortiz L, Rojas-Herrera R, Apodaca-Hernandez J, Perez-Rueda E. 2013 Flora Bacteriana en Camarones. En Recursos Genéticos Microbianos en la zona Golfo-Sureste de México. Volumen I. Editores M. Gamboa, R. Rojas. En prensa.

Hernández-Montes G, Armenta-Medina D, Perez-Rueda E. 2013. Evolution of metabolism: A network perspective of the amino acid biosynthesis pathways. Dubitzky,W.e.a. Encyclopedia of Systems Biology. Springer. Perez-Rueda E, Rivera-Gomez N, Martinez-Nuñez MA, Tenorio-Salgado S. 2012. Evolution of DNA-binding Transcription Factors and Regulatory Networks in Prokaryotes in: Filloux,A.A.M. Evolution of regulatory networks in bacteria Horizon Scientific Press. 333-346. Graduados: Doctorado: Nancy Rivera Gómez. Maestría. Karina Jasmin Salcedo Vite. Fernando García Jesús Banda Adriana Espinosa Licenciatura: Valerie de Anda Jhonatan Hernandez Valdes CONACYT, 2012-2015. Caracterización de la relación estructura-función de proteínas con actividad modificadora de la celulosa . CONACYT, 2010-2013. Comparación de rutas metabólicas utilizando algoritmos genéticos: Un enfoque genómico. CONACYT, 2010-2013. Análisis evolutivo y diseño de dominios Rossmann en la super familia de las aminoácido deshidrogenasas. PAIPA-UNAM. Reconstrucción de redes regulatorias en Arqueas. 2011-2013. PAIPA-UNAM. Uso de información evolutiva para diseñar quimeras de proteínas. 2011-2013

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Grupo Dr. M. Soberón Integrantes del Grupo 2012-2013 Isabel Gómez Gómez, Investigador Titular B Claudia Rodríguez, Investigador asociado C (Hasta Diciembre 2012) Gretel Flores Ramírez, Investigador Posdoctoral (A partir Agosto 2013) Blanca Inés García Gómez, Técnico Académico Titular B Lisbeth Cabrera, Técnico Académico (Por proyecto) Biviána Flores Escobar, Estudiante Doctorado (tutor IG) Fernando Zúñiga Navarrete, Estudiante Doctorado (tutor MS) José Ocelotl Oviedo, Estudiante Doctorado (tutor MS) Gustavo G. Caballero, Estudiante de Doctorado (tutor MS, hasta Diciembre 2012) Daniel Rodríguez, Estudiante Maestría (tutor IG, grado Abril 2013) Alan I. Jiménez Reyes, Estudiante Maestría (tutor MS) Daniela Carmona León, Estudiante Maestría (tutor IG) Meztlli O. Gaytán Enríquez, Estudiante Maestría (tutor CR) Francisca Villanueva, Estudiante Maestría (tutor MS) Rosalba Salgado Morales, Estudiante Licenciatura (tutor BG, grado Agosto 2013) Georgina J. Gutiérrez Rodríguez, Estudiante Licenciatura (tutor BG) Publicaciones 2012-2013 Artículos

1. Rodríguez-Almazán, C., Reyes, E. Z., Zúñiga-Navarrete, F., Muñoz-Garay, C., Gomez, I., Evans, A. M., Likitvivatanavong, S., Bravo, A., Gill. S. S., and Soberón, M. (2012) Cadherin binding is not a limiting step for Bacillus thuringiensis subs. israelensis Cry4Ba toxicity to Aedes aegypti larvae. Biochemical Journal. 443: 711-717 2. Cancino-Rodezno, A., Lozano, L., Oppert, C., Castro, J. I., Lanz-Mendoza, H., Encarnación, S., Evans, A. E., Gill, S. S., Soberón, M., Jurat-Fuentes, J. L., and Bravo, A. (2012) Comparative proteomic analysis of Aedes aegypti larval midgut alter intoxication with Cry11Aa toxin from Bacillus thuringiensis. Plos One, 7, e37034 3. Jiménez, A. I., Reyes, E. Z., Cancino-Rodezno, A., Bedoya, L. P., Caballero-Flores, G. G., Muriel-Millan, L. F., Likitvivatanavong, S., Gill, S. S., Bravo, A., and Soberón, M. (2012) Aedes aegypti alkaline phosphatase ALP1 is a functional receptor of Bacillus thuringiensis Cry4Ba and Cry11Aa toxins. Insect Biochemistry and Molecular Biology. 42: 683-689. 4. Soberón, M., Rodriguez-Almazan, C., Muñóz-Garay, C., Pardo-López, L., Porta, H., Bravo, A. (2012) Bacillus thuringiensis Cry and Cyt mutants useful to counter toxin action in specific environments and to overcome insect resistance in the field. Pesticide Biochemistry and Physiology. 104: 111-117

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5. Bravo, A., Gómez, I., Porta, H., García-Gómez, B. I., Rodriguez-Almazan, C., Pardo, L., and Soberón, M. (2013). Evolution of Bacillus thuringiensis Cry toxins insecticidal activity. Microbial Biotechnlogy. 6: 17-26

6. Pardo-López, L., Soberón, M., Bravo, A. (2013) Bacillus thuringiensis insecticidal 3-domain Cry toxins: Mode of action, insect resistance and consequences for crop protection. FEMS Microbiology Reviews. 37: 3-22 7. Soberón, M., López-Díaz, J. A., and Bravo, A. (2013) Cyt toxins produced by Bacillus thuringiensis: A protein fold conserved in several pathogenic microorganims. Peptides. 41: 87-93. 8. Zúñiga-Navarrete, F., Gómez, I., Peña, G., Bravo, A., and Soberón, M. (2013) A Tenebrio molitor GPI-anchored alkaline phosphatase is involved in binding of Bacillus thuringiensis Cry3Aa to brush border membrane vesicles. Peptides. 41: 81-86 9. Bedoya-Pérez L. P., Cancino-Rodezno, A., Flores-Escobar, B., Soberón, M., and Bravo, A. (2013) Role of UPR pathway in defense response of Aedes aegypti against Cry11Aa from Bacillus thuringiensis. International Journal of Molecular Sciences. 14: 8467-8478. 10. Flores-Escobar, B., Rodríguez-Magadan, H., Bravo, A., Soberón, M., Gómez, I. (2013) Manduca sexta aminopeptidase-n and alkaline phosphatase have a differential role in the mode of action of Cry1Aa, Cry1Ab and Cry1Ac toxins from Bacillus thuringiensis. Applied and Environmental Microbiology. 79: 4543-4550 11. López-Diaz, J. A., Cantón, P. A., Gill, S. S., Soberón, M., Bravo, A. (2013) Oligomerization is a key step in Cyt1Aa membrane insertion and toxicity but not necessary to synergize Cry11Aa toxicity in Aedes aegypti larvae. Environmental Microbiology. Aceptado. 12. García-Gómez, B. I., Sánchez, J., Martínez de Castro, D. L., Ibarra, J. E., Bravo, A., and Soberón, M. (2013). Efficient production of Bacillus thuringiensis Cry1AMod toxins under regulation of cry3Aa promoter and single cysteine mutations in the protoxin region. Applied and Environmental Microbiology. 79: 6969-6973. 13. Tabashnik, B. E., Fabrick, J. A., Unnithan, G. C., Yelich, A. J., Masson, L., Zhang, J., Bravo, A., and Soberón, M. (2013) Efficacy of genetically modified Bt toxins alone or in combinations against Pink Bollworm resistant to Cry1Ac and Cry2Ab. PLoS ONE. 8, e80496 14. Cantón, P. E., López-Díaz, J. A., Gill, S. S., Bravo, A., and Soberón, M. (2013) Membrane binding and oligomer membrane insertion are necessary but insufficient for Bacillus thuringiensis Cyt1Aa toxicity. Peptides. En linea 25 Octubre 2013 15. Portugal, L., Gringonten, J. L., Caputo, G. F., Soberón, M., Muñoz-garay, C., Bravo, A. (2013) Toxicity and mode of action of insecticidal Cry1A proteins from Bacillus thuringiensis in an insect cell line, CF-1 Peptides. En linea 1 Noviembre 2013. Capítulos libros. 1. Bravo, A., Martínez de Castro, D. L., Sánchez, J., Muñoz-Garay, C., Matus, V., Cantón, P. E., López-Díaz, J., Portugal, L., Mendoza, G., Soberón, M. (2013) Mode of action of

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Bacillus thuringiensis toxins and their use in transgenic crops to control insect pests. In Proceedings of the Indo-Mexico workshop on Biotechnology held at CSIR-NCL, Pune, India from October 7-9, 2013. P 122-134 (Deshpane, M.V and Ruiz-Herrera, J.) Published by CSIR-National Chemical Laboratory. 2. Soberón, M., Gómez, I., García-Gómez, B. I., Carmona, D., Ocelotl, J., Villanueva, F., Flores, B., Bravo, A. (2013) Mode of action of mosquitocidal toxins from Bacillus thuringiensis and their use in control of insect vectors of human diseases. In Proceedings of the Indo-Mexico workshop on Biotechnology held at CSIR-NCL, Pune, India from October 7-9, 2013. P 279-288 (Deshpane, M.V and Ruiz-Herrera, J.) Published by CSIR-National Chemical Laboratory. Alumnos Graduados 1. Fernando Zúñiga Navarrete, Maestría en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Mayo 2012. (tutor MS) 2. Daniel Rodríguez, Maestría en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Abril 2012. (tutor IG) 3. Rosalba Salgado Morales, Licenciatura en Ciencias UAEM (tutor BG, grado Agosto 2013). Participación en Docencia 1. Participación en curso Purificación y caracterización de proteínas semestre 2012-1 (MS) 2. Participación en curso de Bioquímica Maestría Ciencias Bioquímicas semestre 2012-1 (MS) 3. Tópico Selecto. Despliegue en fagos: Fundamentos y aplicaciones en el estudio de interacciones moleculares semestre 2012-2 (IG) 4. Tópico selecto. Fundamentos y Metodologías de las Interacciones proteína-proteína. Semestre 2012-1. Donativos vigentes 1. Convenio Pioneer Dupont 750,000,000 USD (Mario Soberón y Alejandra Bravo) Enero 2010-Diciembre 2014. 2 NIH National Institutes of Health 2R01 AI066014-06 (Resp. Sarjeet S. Gill) sub-contrato 500,000.00 USD (Alejandra Bravo y Mario Soberón). 5 años. Julio 2010-Junio 2015 3. PAPIIT-UNAM Contrato IN205411. $600,000 pesos. Enero 2011-Diciembre 2013 (MS).

4. PAPIIT-UNAM. Proyecto IN209011 $600,000 pesos Enero 2011-Diciembre 2013 (IG) 5. CONACyT, Contrato No. 179977. $ 1,400,000 pesos Enero 2013-Diciembre 2015 6. CONACYT contrato No $ pesos (CR)

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Grupo Dr. X. Soberón Integrantes del Grupo 2012-2013 Consorcio con Gloria Saab y Joel Osuna. Técnicos Filiberto Sánchez y Humberto Flores Soto. Estudiantes tutoreados por X. Soberón: Vito Adrián Cantú y Yossef López de los Santos (IBt); Omar Cruz (INMEGEN). Publicaciones 2012-2013 Ochoa-Leyva,A. Montero-Moran,G. Saab-Rincon,G. Brieba,L.G. Soberon,X. 2013. Alternative Splice Variants in TIM Barrel Proteins from Human Genome Correlate with the Structural and Evolutionary Modularity of this Versatile Protein Fold PLoS ONE, 8, e70582. Tsai,I.J. Zarowiecki,M. Holroyd,N. Garciarrubio,A. Sanchez-Flores,A. Brooks,K.L. Tracey,A. Bobes,R.J. Fragoso,G. Sciutto,E. Aslett,M. Beasley,H. Bennett,H.M. Cai,J. Camicia,F. Clark,R. Cucher,M. De Silva,N. Day,T.A. Deplazes,P. Estrada,K. Fernandez,C. Holland,P.W.H. Hou,J. Hu,S. Huckvale,T. Hung,S.S. Kamenetzky,L. Keane,J.A. Kiss,F. Koziol,U. Lambert,O. Liu,K. Luo,X. Luo,Y. Macchiaroli,N. Nichol,S. Paps,J. Parkinson,J. Pouchkina-Stantcheva,N. Riddiford,N. Rosenzvit,M. Salinas,G. Wasmuth,J.D. Zamanian,M. Zheng,Y. Cai,X. Soberon,X. Olson,P.D. Laclette,J.P. Brehm,K. Berriman,M. 2013. The genomes of four tapeworm species reveal adaptations to parasitism Nature, 496, 57-63. Lopez-de Los Santos Y. Chan,H. Cantu,V.A. Rettner,R. Sanchez,F. Zhang,Z. Saier,M.H. Soberon,X. 2012. Genetic engineering of the phosphocarrier protein NPr of the Escherichia coli phosphotransferase system selectively improves sugar uptake activity J Biol Chem, 287, 29931-29939. Saab-Rincon,G. Olvera,L. Olvera,M. Rudino-Pinera,E. Benites,E. Soberon,X. Morett,E. 2012. Evolutionary Walk between (beta/alpha)(8) Barrels: Catalytic Migration from Triosephosphate Isomerase to Thiamin Phosphate Synthase J Mol Biol, 416, 255-270. Alumnos Graduados 2012-2013 Omar Cruz Correa “Desarrollo de pruebas genómicas prioritarias para la salud Pública de México”. Programa de Maestría en Ciencias Bioquímicas, UNAM. 2013. Vito Adrián Cantú Robles “Análisis de una librería binaria de mutantes Npr. ”. Programa de Maestría en Ciencias Bioquímicas, UNAM. 2013.

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Participación en docencia 2012-2013 Impartición de dos módulos (5 sesiones) en el curso de Enfoques Genómicos, Licenciatura en Ciencias Genómicas. Febrero-Marzo de 2012 y Febrero-Marzo de 2013. Divulgación Soberón, X. 2012. La medicina genómica en México, consideraciones para su desarrollo. En: Fortalezas y desafíos de los servicios de salud de México en el siglo XXI. Comité Ejecutivo Nacional de Trabajadores de la Secretaría de Salud. (M. A. García Ayala, Coordinador).

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Grupo Dr. L. Possani Integrantes del Grupo (2012-2013): Investigadora asociada: Dra. Georgina Gurrola Briones Posdoctorandos: Dra. Rita Restano-Cassulini, Dra. Verónica Quintero Hernández, Dra. Lidia González Morales, Dra. Juana Maria Jiménez Vargas, Dra. María Martha Pedraza Escalona Técnicos académicos: Dr. Fernando Zamudio Zuñiga, Fredy I. Coronas Valderrama Estudiantes Licenciatura: Jéssica Sarahí Quevedo Zamora, Ivett Uribe Mendoza Maestría: José Ignacio Veytia Bucheli y Jimena Isaias Cid Uribe de nuestro posgrado; Rosby del Carmen Nájera Mesa y Leonel Vargas Jaime de la UAEM (co-tutoria solamente) Doctorado: Itzel Amaro Estrada y María Teresa Romero Gutiérrez de la UNAM, Rodolfo Rodríguez Ravelo de la Universidad de la Habana, Cuba. Administrativos: Biól. Cipriano Balderas Altamirano, Linda Solaris Espinosa Gerente de proyecto: CP. Carmen Martínez Segura (todos compartidos con el consorcio Baltazar Becerril y Gerardo Corzo) Publicaciones (2012-2013): Revistas indizadas: 1. Schiavon, E.,Pedraza-Escalona, M., Gurrola, G.B., Olamendi-Portugal, T., Corzo, G., Wanke, E., Possani, L.D. Negative-shift activation, current reduction and resurgent currents induced by beta-toxins from Centruroides scorpions in Nav channels. Toxicon 59:283-293 (2012). 2. Guerrero.Vargas, J., Mourao, C.B.F., Quintero-Hernández, V., Possani, L.D., Schwartz, E.F. Identification and phylogenetic analysis of Tityus pachyurus and Tityus obscurus putative Na+-channel scorpion toxins. PloS ONE 7(2): e30478 (2012). 3. Saucedo, A.L., Flores-Solis, D., Rodríguez de la Vega, R., Ramírez-Cordero, B., Hernández-López, R. Cano-Sánchez P., Noriega Navarro, R., García-Valdés J., Coronas-Valderrama, F., de Roodt, A., Brieba, L.G., Possani, L.D., Del Rio Portilla, F. New tricks of an old pattern: structural versatility of scorpin toxin common cysteine spacing. J. Biol. Chemistry 287 (15):12321-12330 (2012). 4. Quintero-Hernández, V. Del Pozo-Yauner, L., Pedraza-Escalona, M., Juarez-González, V.R., Alcantara-Recillas, I., Possani, L.D., Becerril, B. Evaluation of three different formats of a neutralizing single chain human antibody against toxin Cn2: Neutralization capacity versus thermodynamic stability. Immunol. Lett. 143:152-160 (2012). 5. Caliskan, F., Quintero-Hernández, V., Restano-Cassulini, R., Batista, C.V.F., Zamudio, F.Z., Coronas, F.I., Possani, L.D. Turkish scorpion Buthacus macrocentrus: general characterization of the venom and description of Bu1, a potent mammalian Na+-channel α-toxin. Toxicon 59:408-415 (2012).

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6. Saucedo, A.L., Del Rio Portilla, F., Picco, C., Estrada, G., Prestipino, G., Possani, L.D., Delepierre, M., Corzo , G. Solution structure of native and recombinant expressed toxin CssII from the venom of the scorpion Centruroides suffusus suffusus, and their effects on Nav1.5 sodium channels. B.B.Acta - Proteins and Proteomics 1824:478-487 (2012). 7. Jimenez-Vargas, J.M., Restano-Cassulini, Possani, L.D. Interacting sites of scorpion toxin ErgTx1 with hERG1 K+ channels. Toxicon 59:633-641 (2012). 8. Ramírez-Carreto, S., Quintero-Hernández, V., Jiménez-Vargas, J.M., Corzo, G., Possani, L.D., Becerril, B., Ortiz, E. Gene cloning and functional characterization of four novel antimicrobial-like peptides from scorpions of the family Vaejovidae. Peptides 34:290-295(2012). 9. Jiménez-Vargas, J.M., Restano-Cassulini, R. Possani, L.D. Toxin modulators and blockers of hERG K+ channels. Toxicon 60: 492-501 (2012). 10. Gurrola, G.B., Hernández-López, R., Rodríguez de la Vega, R., Varga, Z., Batista, C.F., Salas-Castillo, S., Panyi, G., Del Rio Portilla, F., Possani, L.D. Structure, function and chemical synthesis of Vaejovis mexicanus peptide 24: a novel potent blocker of Kv1.3 potassium channels of human T lymphocytes. Biochemistry 51:4049-4061 (2012). 11. Varga,Z., Gurrola-Briones,G., Papp,F., Rodríguez de la Vega,R.C., Pedraza-Alva, G., Tajhya,R.B., Gaspar,R.,Cardenas,L., Rosenstein,Y., Beeton, C., Possani,L.D., Panyi,G. Vm24, a natural immunosuppressant peptide potently and selectively blocks Kv1.3 potassium channels of human T cells. Molecular Pharmacology 82:372-382 (2012). 12. Rodríguez-Rodríguez, E.R., Ledezma-Candanoza, L.M., Contreras-Ferrat, L.G., Olamendi-Portugal, T., Possani, L.D., Becerril, B., Riaño-Umbarila,L. A single mutation in framework 2 of the heavy variable domain improves the properties of a diabody and a related single-chain antibody. J. Mol. Biol. 423:337-350 (2012). 13. Caliskan, F., García, B.I., Coronas, F.I., Restano-Cassulini, R., Korkmaz, F., Shin, Y., Corzo, G., Possani, L.D. Purification and cDNA cloning of a novel neurotoxic peptide (Acra3) from the scropion Androctonus crassicauda. Peptides 37:106-112(2012). 14. Rendon-Anaya, M., Delaye, L., Possani, L.D., Herrera-Estrella, A. Global transcriptome analysis of the scorpion Centruroides noxius: new toxin families and evolutionary insights from an ancestral scorpion species. PLoS ONE, vol.8, issue 8 e43331, 12 pages, (2012). 15. Clement, H., Costa de Oliveira, V., Zamudio, F.Z., Lago, N.R., Valdez-Cruz, N.A., Bernand Valle, M., Alagon, A.C. Possani, L.D., De Roodt, A.R. Isolation, amino acid sequence and biological characterization of an “aspartic-49” phospholipase A2 from Bothrops (Rhinocerophis) ammodytoides venom. Toxicon 60:1314-1323 (2012).

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16. Clement, H., Olvera, A., Rodríguez, M., Palomares, L.A., Possani, L.D., Odell, G.V., Alagón, A., Sánchez-López, R. Identification, cDNA cloning and heterologous expression of a hyaluronidase from the tarantula Brachypelma vagans venom. Toxicon 60:1223-1227 (2012). 17. Xueli Wang, Juana M. Jimenez-Vargas, Chenqi Xu, Lourival D. Possani and Shunyi Zhu. Positive selection-guided mutational analysis revealing two key functional sites of scorpion ERG K+ channel toxins. Biochemical and Biophysical Research Communications 429:111-116 (2012). 18. Luna-Ramírez, K., Quintero-Hernández, V., Vargas-Jaimes, L., Batista, C.V., Winkel, K., Possani, L.D. Characterization of the venom from the Australian scorpion Urodacus yaschenkoi: molecular mass analysis of components, cDNA sequences and peptides with antimicrobial activity. Toxicon 63:44-54 (2013). 19. Pedraza-Escalona, M., Possani, L.D. Scorpion β-toxins and voltage-gated sodium channels: interactions and toxicity effects. Frontiers in Bioscience - Landmark 18(2): 572-587 (2013). 20. García, F., Villegas, E., Espino-Solis, G.P., Rodríguez, A., Paniagua-Solis, J., Sandoval, G., Possani, L.D., Corzo, G. Antimicrobial peptides from arachnid venoms and their microbicidal activity in the presence of commercial antibiotics. Journal of Antibiotics 66:3-10 (2013) 21. Rodriguez-Ravelo, R., Coronas, F.I., Zamudio, F.Z., González-Morales, L., Espinosa-López, G., Ruiz-Urquila, A., Possani, L.D. Scorpion Rhopalurus junceus (Scorpiones, Buthidae) of Cuba: variations of venom components from specimens collected in different geographical areas. The Journal of Venomous Animals including Tropical Diseases 19:13 doi:10.1186/1678-9199-19-13(2013). 22. Caliskan, F., Quintero-Hernández, V., Restano-Cassulini, Coronas-Valderrama, F.I., Corzo, G., Possani, L.D. Molecular cloning and biochemical characterization of the first Na+-channel α-type toxin peptide (Acra4) from Androctonus crassicauda scorpion venom. Biochimie 95:1216-1222(2013). 23. Aguilar, M.B., Ortiz, E., Kaas, q., López-Vera, E., Becerril, B., Possani, L.D., Heimer de la Cotera, E.P. Precursor De13.1 from Conus delssertii defines the novel G gene superfamily. Peptides 41:17-20(2013). 24. Bernáldez, J., Roman, S., Martínez, O., Jiménez, S., Vivas, O., Arenas, I., Corzo, G., Arreguín, R., García, D. E., Possani, L.D., Alexei Licea, A. Conus regularis conotoxin with a novel eight-cysteine framework inhibits CaV2.2 channels and displays a nociceptive behavior. Marine Drugs 11:1188-1202 (2013). 25. Sánchez-Vázquez, L., Silva-Sánchez, J., Jiménez-Vargas, J.M., Rodríguez-Romero, A., Muñoz-Garay, C., Rodríguez, M.C., Gurrola, G.B., Possani, L.D. Enhances antimicrobianl activity of novel synthetic peptides derived from vejovine and hadrurin. B. B. Acta – General

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Subjects 1830:3427-3436 (2013). 26. Mourao, C.B.F., Heghinian, M.D., Barbosa, E.A., Mari, F.,Bloch Jr. C., Restano-Cassulini, R., Possani, L.D., Ferroni Schwartz, E. Characterization of a novel peptide toxin from Acanthoscurria paulensis spider venom: a distinct cysteine assignment into the HWTX-II family. Bochemistry 52:2440-2452 (2013). 27. Schwartz, E.F., Bartok, A., Schwartz,C.A., Papp, F., Gómez-Lagunas, F., Panyi, G., Possani, L.D. OcyKTx2, a new K+-channel toxin characterized from the venom of the scorpion Opisthacanthus cayaporum. Peptides 46:40-46(2013). 28. Valdez-Velázquez, L.L., Quintero-Hernández, V., Romero-Gutierrez, M.T., Coronas, F.I.V., Possani, L.D. Mass fingerprinting of the venom and transcriptome of venom gland of scorpion Centruroides tecomanus. PLoS One, 8, issue 6, e66486 (15 paginas) (2013). 29. Deuis,J.R., Zimmermann, K., Romanovsky, A.A., Possani, L.D., Cabot, P.J., Lewis,R.J., Vetter, I. An animal model of oxaliplatin-induced cold allodynia reveals a crucial role for Nav1.6 in peripheral pain pathways. Pain 154: 1749-1757 (2013). 30. Quintero-Hernández, V., Jiménez-Vargas, J.M., Gurrola, G.B., Valdivia H.H., Possani, L.D. Scorpion venom components that affect ion-channels function. Toxicon: doi.org/101016/j.toxicon.2013.07012 (2013). 31. Abdel-Rahman, M.A., Quintero-Hernandez, V., Possani, L.D. Venom proteomic and venomous glands transcriptome analysis of the Egyptian scorpion Scorpio Maurus palmatus (Arachnida:Scorpionidae). Toxicon 74:193-207 (2013). 32. Rodríguez-Ravelo,R.,Restano-Cassulini, R., Zamudio F.Z., Coronas,F.I.V., Espinosa-López, G., Possani, L.D. A K+ channel blocking peptide from the Cuban scorpion Rhopalurus garridoi. Peptides (http://dx.doi.org/10.1016/peptides.2013.10.010), (2013). 33. Luna-Ramírez, K., Sani, M.A., Silva-Sánchez, J., Jiménez-Varga, J.M., Reyna-Flores, F., Winkel, K.D., Wright. C.E., Possani, L.D., Separovic, F. Membrane interactions and biological activity of antimicrobial peptides from Australian scorpion. BBA mebrane (en prensa, 2013). Capítulos de libro: 1. Rodríguez de la Vega, R.C., Vidal, N.,Possani, L.D. Scorpion peptides, in Handbook of Biologically Active Peptides 2ed (A. Kastin, Ed.) Academic Press, Chapter 59: Scorpion venom peptides (J.M. Sabatier, section Ed.), pp.423-429 (2013). 2. R. C. Rodríguez de la Vega, G. Corzo, L. D. Possani. Scorpion venoms as platform for drug development, in Venoms to Drugs: Venom as a source for the development of human therapeutics (Glenn F. King, Ed.) RSC Drug Discovery, chapter 7 (en prensa, 2013).

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3. Rodríguez Rodríguez, E.R., Riaño Umbarila,L.,Possani,L.D. y Baltazar Becerril. Anti-venoms: Recombinant neutralizing antibodies, a new generation of scorpion anti-venoms. Handbook of Toxinology - Scorpion Venoms, Editorial Springer (aceptado, está en prensa) 2013. Patentes de Invención Concedidas Fases nacionales de la solicitud internacional WO2008139243 A1, No. inicial: PCT/IB2007/001544: “Vm23 Y Vm24, dos péptidos del veneno de alacrán que bloquean con alta selectividad a los canales de potasio (subtipo Kv1.3) de los linfocitos T humanos y disminuyen la reacción in vivo de DTH en ratas”. L. D. Possani P., G. Gurrola-Briones, S. P. Salas-Castillo, C. V. Ferreira B., Z. S. Varga, G. Panyi, R. Gáspár.

1. IL202113. Concedida en Israel el 4 de mayo 2013. Solicitud Internacional WO2008139243 A1.

2. MX298891. Concedida en México el 3 de mayo de 2012. Solicitud Internacional

WO2008139243 A1.

3. SG156838. Concedida en Singapur el 29 de junio de 2012. Solicitud Internacional publicada WO2008139243 A1.

4. CU23816. Concedida en Cuba el 30 de abril de 2012. Solicitud Internacional

publicada como WO2008139243 A1.

5. US8394770. Concedida en Estados Unidos el 12 de marzo de 2013. Solicitud Internacional WO2008139243 A1.

6. JP5249319. Concedida en Japón e1 31 de julio de 2013. Solicitud Internacional WO2008139243 A1.

Patentes de invencón solicitadas:

1. 2012904150. “Scorpion venom anti-microbial peptides”. L. D. Possani P. et al. Solicitada provisionalmente en Australia conjuntamente con la Universidad de Melbourne el 21 de septiembre de 2012.

2. MX 2013007474 A. “Nuevos anticuerpos monoclonales contra el receptor DEC-

205 de células dendríticas de pollo”. Possani P. L. D., Pedraza E. M. Martha, Espino S. P. G., Olvera R. A. y Cardoso T. H. M. Presentada en México el 26 de junio de 2013.

TRANSFERENCIA TECNOLÓGICA

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El 15 de noviembre de 2012 se firmó el convenio de transferencia tecnológica entre la UNAM y los Laboratorios Silanes S.A. de C.V., registrado con el número DGAJ-SPI 091012-598, titulado: “DESARROLLO Y TRANSFERENCIA DE LA TECNOLOGÍA DE PRODUCCIÓN DE LAS TOXINAS RECOMBINANTES DE DIFERENTES ESPECIES DE ALACRÁN”.

Alumnos graduados (2012-2013): 1. Para la obtención del título de Biólogo de la Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad Autónoma del Estado de Morelos: “Caracterización molecular de un banco de cDNA de la Glándula venenosa del alacrán Diplocentrus melici” por Leonel Vargas Jaime. El tutor principal fue la Dra. Veronica Quintero-Hernández. Fecha: 23 de marzo de 2012. 2. Para la obtención del título de Ingeniero en Biotecnología Universidad Politécnica del Estado de Morelos: “Establecimiento y caracterización de una línea celular que exprese de manera estable y constitutiva el canal de sodio hNav1.7 por Jéssica Sarahí Quevedo Zamora. El tutor principal fue la Dra. Rita Restano Cassulini.Fecha: 30 de enero de 2013. 3. Para la obtención del grado de Doctor en Ciencias (Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México: Bases estructurales de la neutralización de la toxina Cn2 de Centruroides noxius Hoffmann por el anticuerpo scFv 9004G, por el M. en C. Juan Carlos Canul Tec. Fecha de presentación: 23 de mayo de 2012. 4 . Para la obtención del grado de Doctor en Ciencias (Instituto de Biotecnología y Centro de Ciencias Genómicas, Universidad Nacional Autónoma de México: Toxinas de alacrán que afectan canales de potasio del tipo hERG1, por la maestra Juana María Jiménez Vargas. Fecha de presentación: 24 de agosto de 2012. Participación en docencia (2012-2013): - Participación en el curso básico de Bioquímica de nuestro posgrado - Participación en Tópico Selecto de la carrera de Ciencias Genómicas del Campus Cuernavaca (4 horas). Divulgación (2012-2013): -Varias participaciones en programas de televisión y algunas reportages en revistas y en la Gaceta UNAM. Donativos (2012-2013): 1. Proyecto IN200113 de DGAPA-UNAM (2012-15): Caracterización química-funcional de componentes del veneno de alacranes. 2. Proyecto SEP-CONACyT 153496 (2011-2013): Eventos moleculares asociados a la intoxicación por veneno de alacranes: un análisis por biología de sistemas. 3. Convenio bilateral CONACyT-Japón, proyecto 160732 (2011-2014): Biomedicine for inwardly retifying potassium channel. 4. Proyecto clave P542; National Institute of Health USA (2011-2014). Calcins as membrane-permeable ligands of Ryanodine receptors. 5. Compañía Silanes/Bioclón S.A. de C.V. (2013). Expresión de toxinas recombinantes para producción de sueros inmunes. 6. Convenio de transferencia tecnológica de las toxinas recombinantes del veneno de alacranes a la compañía: Laboratorios Silanes S.A. de C.V. (2013-1014).