Procedimientos en Microbiologa ClnicaRecomendaciones de la Sociedad Espaola de Enfermedades Infecciosas y Microbiologa Clnica Editores: Emilia Cercenado y Rafael Cantn

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Diagnstico microbiolgico de las infecciones gastrointestinales

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Coordinador: Jordi Vila Estape Autores: Miriam lvarez Martnez Javier Buesa Gmez Javier Castillo Garca Jordi Vila Estape

ISBN-978-84-612-7852-7

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INDICE DEL DOCUMENTO CIENTFICO 1. Introduccin 2. Consideraciones clnicas 3. Recogida de muestras 4. Diagnstico microbiolgico de los diversos microorganismos causantes de infeccin gastrointestinal 4.1. Bacterias 4.1.1. E. coli diarreagnicas 4.1.2 Shigella spp. 4.1.3 Salmonella spp. 4.1.4. Campylobacter spp. 4.1.5 Yersinia spp. 4.1.6 Bacillus cereus 4.1.7. Staphylococcus aureus 4.1.8. Clostridium perfringens 4.1.9. Vibrio spp. 4.1.10. Aeromonas mesfilas 4.1.11. Plesiomonas shigelloides 4.1.12. Clostridium difficile 4.2. Virus 4.2.1. Aislamiento de virus en cultivos celulares 4.2.2. Microscopa electrnica 4.2.3. Tcnicas de deteccin de antgenos vricos 4.2.4. Rotavirus 4.2.4.1 Deteccin de antgenos de rotavirus 4.2.4.2 Mtodos moleculares 4.2.5. Norovirus 4.2.5.1 Deteccin de antgenos de norovirus 4.2.5.2 Mtodos moleculares 4.2.6. Adenovirus 4.2.6.1 Deteccin de antgenos de adenovirus 4.2.6.2 Mtodos moleculares 4.2.7. Astrovirus 4.2.7.1 Deteccin de antgenos de astrovirus 4.2.7.2 Mtodos moleculares 4.2.8. Sapovirus 4.2.9. Interpretacin e informacin de los resultados 4.3. Parsitos 4.3.1 Examen macroscpico 4.3.2 Examen microscpico 4.3.2.1 Examen en fresco 4.3.2.2 Tcnicas de concentracin 4.3.2.3 Tinciones especficas 4.3.2.4 Determinacin de tamaos con el microscopio 4.3.3. Protozoos 4.3.3.1 Amebas 4.3.3.2 Flagelados 4.3.3.3 Ciliados 4.3.3.4 Coccidios 4.3.3.5 Microsporidios 4.3.4 Helmintos 4.3.4.1 Nematodos intestinales 4.3.4.2 Nematodos tisulares 4.3.4.3 Cestodos 4.3.4.4 Trematodos 5. Bibliografa NDICE DE LOS DOCUMENTOS TCNICOS 1. PNT-GE-01. Diagnstico microbiolgico de las infecciones gastrointestinales bacterianas 2. PNT-GE-02. Diagnstico microbiolgico de las infecciones gastrointestinales vricas 3. PNT-GE-03. Diagnstico microbiolgico de las infecciones gastrointestinales parasitarias

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Procedimientos en Microbiologa ClnicaRecomendaciones de la Sociedad Espaola de Enfermedades Infecciosas y Microbiologa Clnica Editores: Emilia Cercenado y Rafael Cantn

30. DIAGNSTICO MICROBIOLGICO DE LAS INFECCIONES GASTROINTESTINALES. 2008Coordinador: Autores: Jordi Vila Estape Miriam lvarez Martnez Javier Buesa Gmez Javier Castillo Garca Jordi Vila Estape

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DOCUMENTO CIENTFICO

1. INTRODUCCION Las infecciones agudas del tracto gastrointestinal figuran entre las enfermedades infecciosas ms frecuentes, superadas slo por las infecciones del tracto respiratorio. Aunque muchas veces se trata de un ligero contratiempo en los adultos sanos, un desequilibrio electroltico puede provocar una deshidratacin en las personas muy e nfermas y en nios y ancianos. A nivel mundial, las infecciones gastrointestinales siguen siendo una de las causas ms importantes de morbilidad y mortalidad entre los lactantes y los nios. Se ha estimado que en Asia, frica y Latinoamrica, dependiendo de factores socioeconmicos y nutricionales, la probabilidad de que un nio muera antes de los 5 aos por estas causas puede llegar al 50%. Las epidemias de diarrea en lactantes, nios y adultos son generalmente causadas por microorganismos presentes en el agua o en los alimentos contaminados habitualmente por heces que presentan microorganismos patgenos. Las infecciones tambin se pueden transmitir de persona a persona por contacto directo o a travs de fmites.

2. CONSIDERACIONES CLNICAS Las manifestaciones clnicas ms destacadas de las gastroenteritis son fiebre, vmitos, dolor abdominal y diarrea moderada a intensa. La diarrea es un dato central y su presencia y naturaleza constituyen la base para la clasificacin de las infecciones gastrointestinales en dos sndromes: diarrea acuosa o secretora y diarrea invasiva o disentera. Diarrea acuosa o secretora. La forma ms comn de gastroenteritis se caracteriza por evacuaciones intestinales frecuentes, ms o menos lquidas, denominadas diarrea. La diarrea est provocada por mecanismos patognicos que atacan el intestino delgado proximal, porcin del intestino en la que se produce ms del 90% de la absorcin fisiolgica de fluidos. La forma ms pura de diarrea acuosa es la producida por bacterias secretoras de enterotoxinas, como por ejemplo Vibrio cholerae o Escherichia coli enterotoxignica (Tabla 1).

Tabla 1. Caractersticas de los sndromes gastrointestinales infecciosos ms importantes Microorganismo clnico ECET ECEP ECEI ECEHa

Sndrome Diarrea acuosa Diarrea acuosa Disentera Diarrea acuosa Colitis hemorrgica (sndrome urmicohemoltico) Diarrea acuosa Diarrea acuosa/disentera Diarrea acuosa o disentera Diarrea acuosa o disentera Diarrea acuosa o disentera Diarrea acuosa Diarrea acuosa Diarrea acuosa Diarrea acuosa Disentera

Mecanismo patognico (Factores de virulencia) Fimbrias, toxinas termolbil (TL) y termoestable (TE) Adherencia acortamiento microvellosidades Plsmido (genes codifican protenas de invasin) Fimbrias, citotoxinas (VT-1 o VT-2) Fimbria, enterotoxina (EAST-1) otras toxinas? Plsmido de invasin, citotoxinas (VT-1 o VT2)* Invasin, enterotoxinas (similar TL de ECET) Invasin, enterotoxinas (similar TE de ECET) Invasin, enterotoxinas (similar TE de ECET) Fimbrias, toxina termolbil (TL) Citotoxina Destruccin mucosa Irritacin mucosa Invasin mucosa

ECEA Shigella Salmonella Campylobacter Y. enterocolitica V. cholerae C. difficile Rotavirus Giardia lamblia Entamoeba histolyticaa

ECET: E. coli enterotoxignica; ECEP: E. coli enteropatgena; ECEI: E. coli enteroinvasiva; ECEH: E. coli enterohemorrgica; ECEA: E. coli enteroagregativa. * Slo presenta las citotoxinas la especie S. dysenteriae Diarrea invasiva o disentera. La disentera comienza con evacuaciones intestinales frecuentes, pero las heces son de menor volumen que en la diarrea acuosa y contienen sangre, moco y pus. La fiebre, el dolor abdominal y el tenesmo son sntomas habituales. En la disentera, la patologa se centra en el colon. Los microorganismos (Tabla 1) que causan disentera pueden provocar cambios inflamatorios y destructivos en la mucosa del colon, por invasin directa o mediante la produccin de citotoxinas. Este dao es responsable del pus y la sangre observados en las heces, pero no origina una prdida importante de fluido, debido a que la capacidad de absorcin y secrecin del colon es mucho menor que la del intestino delgado. Los sntomas y los signos pueden variar de modo significativo de unos pacientes a2

otros, e incluso, en momentos distintos durante la evolucin de la misma enfermedad. Por ejemplo las infecciones por Shigella pasan con frecuencia por un estadio inicial breve de diarrea acuosa antes de localizarse en el colon y ocasionar una disentera. Ante la sospecha de un cuadro de gastroenteritis debe hacerse una detallada historia clnica y un correcto estudio microbiolgico. Los antecedentes epidemiolgicos (edad, historia reciente de viajes, fundamentalmente a pases subtropicales y tropicales, aparicin espordica o como parte de un brote, tipo de alimento sospechoso, periodo de incubacin), la existencia de factores predisponentes (inmunosupresin), la presencia de signos y sntomas clnicos (fiebre, dolor abdominal, nauseas y

vmitos) y el tipo de diarrea (acuosa o disentrica) pueden orientar acerca del microorganismo implicado. No obstante, el diagnstico definitivo solo se puede obtener mediante pruebas de laboratorio. Diarrea del viajero. Las personas que viajan desde pases desarrollados a otros en vas de desarrollo, pueden experimentar una gastroenteritis durante el viaje o al regreso al pas de origen. La ingestin de alimentos crudos o poco cocinados o bien el agua contaminada es la fuente ms probable de infeccin. Los microorganismos que con mayor frecuencia causan diarrea del viajero se mencionan en la Tabla 2. Entre ellos cabe destacar las E. coli enterotoxignicas y enteroagregativas.

Tabla 2. Etiologa de las gastroenteritis en diversos grupos de poblacin Microorganismo Nios (0-5 aos) Pases desarrollados Nios (0-5 aos) Pases en vas de desarrollo 37% 10% 1,5% 3%