BIOINFORMÁTICA

BIOTECNOLOGÍABAC – Spinoza 2014

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EJERCITACIÓNNCBI

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EJERCICIO 1PubMed

La Fenilcetonuria es una enfermedad metabólica causada por la deficiencia de la enzima Fenilalanina hidroxilasa (PAH). En 1985, Kwok et al. lograron generar un cADN de este gen (el cADN es un ADN que se sintetiza a partir del ARNm del gen, mediante técnicas moleculares) y publicaron su hallazgo en la revista Biochemistry.

Actividad: Encuentre el Abstract del artículo a partir de la referencia: Biochemistry. 1985 Jan 29;24(3):556-61.

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Desde el Abstract en PubMed haga clic en el vínculo Links, que se encuentra arriba a la derecha, justo al lado de Related articles, en la misma línea que la referencia del artículo. De ahí seleccione Nucleotide.

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Responda:

¿A qué organismo pertenece?

¿Quiénes son los autores de los trabajos?

¿Cuál es el número de referencia en Pubmed?

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EJERCICIO 2 GenBank

Actividad: Desde GenBank acceda a la secuencia X01714.

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Responda: ¿A qué tipo de molécula corresponde?

¿Cuántos nucleótidos contiene?

¿En qué fecha se modificó el registro por última vez?

¿De qué organismo procede?

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EJERCICIO 3 BLAST

Actividad: Ingresar la siguiente secuencia en BLAST.

ATGGCGTCGAAGGAGGAGGTGGCCGTGGAGACGGTGGAGGGCGGAG

CGGCGGCGGCGAAGGCGCCGTACTGGACCCGCCGCCGGCGCCGCTG

CTGGACACGAGCGAGCTGGGTAAGTGGTCGCTGTACCGTGCCCTCAT

CGCGGAGTTCATGGCGACGCTCATCTTCCTCTACGTGAGCATCGCCAC

CGTGATCGGGTACAAGAACCAGAGGGCCACCGTCGACGCGTGCACCG

GCGTCGGCTACCTCGGCGTGGCGTGGTCGTTCGGTGCCACCATAT

TCGTCCTCGTCTACTGCACCGGCGGCGTCTCCGGCGGGCACATCAACC

CGGCGGTGACGCTGGGCCTCTTCTTCGGGCGGAAGCTGTCGCTCGTC

CGCACCGTGCTGTACGTCGTGGCGCAGTGCCTCGGCGCCATCGCC

GGCGCCGGCATCGTCGGCACGTTCATCCTCGTCTACACCGTCTTCTCC

GCCACCGACCCCAAGCGCACCGCCCGCGACTCCTTCATCCCCGTACTC

GTGCCGCTGCCGATCGGGTTCGCGGTGTTCGTCGTGCACCTGGC

GACGATTCCGATCACCGGCACGGGCATCAACCCGGCGAGGAGCCTCG

GCGCCGCCGTGCTGTACAACCAGCACGCAGCTTGGAAAGACCACTGGA

TCTTCTGGGTGGGGCCGGTGATCGGGGCGTTCTTGGCGGCGGCGT

ACCACAAGCTGGTGCTGCGCGGCGAGGCCGCCAAGGCGCTCAGCTCG

TTCAGGAGCACCAGCGTGACGGCGTGA

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Responda:

¿Qué organismos comparten dicha secuencia?