Víctor González RumayorJefe de Proyectos

Althia Health SL

FORO DE TRANSFERENCIA TECNOLÓGICA

BIOTRANSFER

Precise Pathology – Personalized Medicine

Granada, octubre 2014

INVESTIGACION EN DIAGNOSTICOINVESTIGACION EN DIAGNOSTICO

• Althia está dedicada a la investigación traslacional y al diagnóstico clínico del cáncer, lesiones pre-cancerosas y enfermedades inflamatorias.

• Soluciones para la investigación de la firma molecular especifica del tumor, estudios de diagnóstico no-invasivo (exosomas y CTC) y uso de técnicas moleculares que definan la mejor terapia

2

Medicina Personalizada

3

La transición de la Medicina Molecular a la Medicina Personalizada pasa por tener un conocimiento profundo de la biología de la

enfermedad y por la incorporación de nuevos retos y tecnologías

• Herramientas para la integración y consolidación de la información clínica

• Soluciones Bioinformáticas

Conveniencia

• Procesamiento automático de datos para diagnóstico y tratamiento

• Algoritmos de Inteligencia Artificial

Objetividad

• Abordaje multidisciplinar y multicéntrico de la oncología

• Redes Colaborativas de Especialistas

Universalidad

DATOS INFORMACION CONOCIMIENTO ACCIÓN

Proyectos en medicina personalizada

4

Mejor estratificación del paciente oncológico a terapias más específicas

Ayudar a la mejor selección de las técnicas de diagnóstico, reduciendo gastos al sistema

Organización estructurada de la información clínica y molecular

Generar modelos predictores de seguimiento y de tratamientos con la mejor elección de la terapéutica

INVESTIGADORES CLINICOS

INVESTIGADORES BASICOS

TECNICOS EN SISTEMAS

DE INFORMACION

ESPECIALISTAS EN MODELOS MATEMATICOS

PROYECTOS

TITLE PARTICIPANTS OBJECTIVES AND RESEARCH AREA PATENT SITUATION

GliomasALTHIA, IDIBELL

Patient stratification through the

applications of molecular and precise

pathology

FINAL REPORT USFINAL REPORT CANOFFICIAL ACTIONS EU

Lymphoma

(DLBCL)ALTHIA, H Clinic

Patient stratification through the

applications of molecular and precise

pathology

OFFICIAL WRITING PROPOSAL (WO)

TradionPALTHIA, INDRA

Lorgen

Prototype expert system for diagnosis

and personalized treatment in cancer

patients

UNDER DEVELOPMENT

Proyectos I+D

5

• ESTUDIO BASADO EN MEDICINA PERSONALIZADA

• MUESTRAS DE CÁNCER DE MAMA, COLORRECTAL Y PULMON

• DOS REGIMENES TERAPEUTICOS•QUIMIO & RADIOTERAPIA•TERAPIA BIOLOGICA

Base de datos

• 451 cáncer de mama (298 biopsias tumor)

• 330 cáncer Colorrectal (250 biopsias tumor)

• 150 cáncer pulmón

PROYECTO TRADIONP PROYECTO TRADIONP

Clínical Data,

Images... (+15,000)

Metilation(+400,000)

Genotyping(+200,000)

PROYECTO TRADIONP

� PROTOTIPO DE SISTEMA EXPERTO

� ALGORTIMOS DE COMBINACION E

INFORMACION

� BBDD CON DATOS CLINICOS Y

MOLECULARES ENTRELAZADOS

DatosInformes

mutaciones

marcadores

Terapias Imágenes

biopsias

pruebas

ESTUDIO RETROSPECTIVO

DATOS CLINICOS CLAVES

INFORMACION MOLECULAR

SELECCIÓN DE PACIENTES

DISEÑO DE ALGORITMOS

COMITÉ CIENTÍFICO

BASE DATOS MULTIMODAL

BBDDSDATOS CLINICOS >15,000

GENOTIPAJE (SNPs)

HISTOLOGIA PRECISA

FISH

MULTIPLEX

SECUENCIASGENES

METILACION

PROYECTO TRADIONPPROYECTO TRADIONP

9

08 Resultados

Muestra

Histología Funcional

Multiplex

FISH

ADN Firma molecular del tumor

Análisis histológico

Mutaciones de baja frecuencia en genes relevantes

Identificación de mutaciones puntuales en secuenciación

Presencia redundante de polimorfismos -SNPs

Posiciones hipo/hipermetiladas en el ADN tumoral

BBDD

Analíticas

10

SISTEMAEXPERTO

??

MINERIA DATOS

¿SURVIVAL?

¿RELAPSED?

¿2, 5, 10 YEARS?

DATOS CLINICOS

DATOSEXPERIMENTALES

HELP DESK

COMBINATORIAL DATA

PROYECTO TRADIONPPROYECTO TRADIONP

PTEN ProbeCEN10 Probe

PROYECTO GLIOMAS

PTEN MEASUREMENT BY FISH

• Cirugia• Radioterapia (RT)

− 3-4 w• Quimioterapia

− temozolomide (TMZ)

• Cirugia• Radioterapia (RT)

− 3-4 w• Quimioterapia

− temozolomide (TMZ)

SELECCIÓN DE PACIENTES QUE RESPONDEN AL FARMACO, Y DE PACIENTES QUE DEBEN USAR TERAPIAS ALTERNATIVAS

LA MEDICINA PERSONALIZADA NOS PERMITEN UNA MEJOR ESTRATIFICACION DE PACIENTES USANDO TÉCNICAS SIMPLES

− 230 pacientes astrocitoma (GBM, AA, y otros)

− Base de datos con informacion clinica & patologica

− IF (EGFR, PTEN, Ki67) + FISH (EGFR, PTEN)

− Supervivenvia & recidiva (estudio retrospectivo)

12

PROYECTO GLIOMAS

0 1000 2000 3000 4000

0.0

0.2

0.4

0.6

0.8

1.0

Days from surgery

Sur

viva

l

OTHER (n=25)AMP & LOH<0.4 (n=10)

p-value (log-rank): 0.001

AMP.LOH.combAA

0 500 1000 1500 2000

0.0

0.2

0.4

0.6

0.8

1.0

Days from surgery

Sur

viva

l

OTHER (n=73)AMP & LOH<0.4 (n=40)

p-value (log-rank): 0.002

AMP.LOH.combGBM

0 1000 2000 3000 4000

0.0

0.2

0.4

0.6

0.8

1.0

Days from surgery

Sur

viva

l

OTHER (n=98)AMP & LOH<0.4 (n=50)

p-value (log-rank): <0.001

AMP.LOH.combALL

PTEN/EGFR (FISH)

GBM/AA patientsEGFR AMP/HPPTEN LOH 10%

Diagnostico y pronostico integral para el Linfoma Difuso de Celulas B grandes(DLBCL) usando patología de precisión

Objetivos • Combinar técnicas de diagnostico IF Mplex y FISH para identificar un fenotipo sólido y asociado a la supervivencia

PROYECTO LINFOMA

235 pacientes diagnosticado y tratados de Diffuse large B cell lymphoma (DLBCL)

• Datos clínicos de 153 pacientes tratados con rituximab CHOP, y seguidos durante 3 años. Análisis con 26 variables

• 3 Hospitales

• VEGF y BCL6 son marcadores predictivos de respuesta a las terapias en uso (R-CHOP)

• CMYC, MUM1 y posiblemente CD68, pueden ser relevantes basados en el estado de la variable IPI (international prognostic index)

PROJECT LYMPHOMA

LA MEDICINA PERSONALIZADA NOS PERMITE ASOCIAR MARCADORES PARTICULARES A LA RESPUESTA ESPECIFICA DEL PACIENTE A LA TERAPIA EN USO.

PROYECTOS EN DESARROLLO

TITLE PARTICIPANTS OBJECTIVES AND RESEARCH AREASTART

ONCOEXPERTINDRA, ALTHIA,

LORGEN, MASTER, ERA7

System for better diagnosis and treatment

April 2013

ADELIS

ROVI, ALTHIA, VAXDYN BIOMEDAL BIONATURIS

Pharmacogenomics to aromatase inhibitor response in

breast cancer

April 2013

Prostate Predict

ALTHIA,

Amadix, H Clinic, H. Valld’Hebron, H 12Oct

Combination of protein markers and miRNA

October 2012

PRECISESADSPROG&SALUD

ALTHIA 22+ Tissue connective pathology Feb 2014

ANXARECUALTHIA, Vall

d´́́́Hebron, IRB Lleida, Formune

Anexine: predictor biomarker for recurrent endometrial cancer

iDOCTUSeDoctores,

ALTHIA, Blueliv

Plataforma ayuda deteccióntemparana enfermedades

infecciosas

R&D Translational Projects

15

Pacientes ProstatectomizadosBúsqueda de marcadores predictores microRNA+proteinas

PROYECTO PROSTATE PREDICTPROYECTO PROSTATE PREDICT

16

� Desarrollo de nuevos algoritmos de respuesta a recidivas. � Identificación de nuevos marcadores “in situ” utilizando patología de sistemas o precisa.� Modelos Predictivos que incluyan miRNA y proteínas de potencial interés.

STARTING Nov 2013--- FINISH 2015

Validación de Anexina 2 como biomarcador para recidiva decáncer de endometrio.

PROYECTO ANXARECUPROYECTO ANXARECU

17

� Validación proteica y transcriptómica (mRNA) en biopsia y aspirado. � Desarrollo de sistema predictivo no o mínimamente invasivo� Desarrollo de algoritmos de integración� Desarrollo de un dispositivo de microfluidica para aislamiento de CTCs y exosomas� Exploración del potencial de Anxa 2 como diana terapéutica

Sistema de detección temprana de enfermedades infecciosas.

PROYECTO iDOCTUSPROYECTO iDOCTUS

18

� Desarrollo de un modelo de análisis de datos microbiológicos basados en técnicas de Big Data� Basado en un sistema de geolocalización de eventos de diagnóstico de enfermedades infecciosas � Desarrollo de un nuevo sistema de recogida de datos basado en hacking ético� Sistema de ayuda a la toma de decisiones mediante aplicaciones móviles con información on-line/ of-line .

MOLECULAR RECLASSIFICATION TO FIND CLINICAL USEFUL BIOMARKERS FOR SYSTEMIC AUTOIMMUNE DISEASES.(lupus, artritis reumatoide, sindrome …etc)

PROYECTO PRECISESADS : IMI. EU-FP7PROYECTO PRECISESADS : IMI. EU-FP7

19

� Coordinador Marta Alarcón-Riquelme, Genyo Granada� 24 partners de 6 diferentes países Europeos y 14 Hospitales� Althia participa en “Tissue based taxonomy and exosomes”.

Nilo1 and Nilo2 antibodiesNilo1 and Nilo2 are hamster monoclonal antibodies directed against

cell surface mouse neural stem cells.

A: neuroblast

B: radial glia

GFAPSOX2 Vimentin

βIII Tub PSA-NCAM DCX

NILO1

NILO2

DCX, PSA-NCAM, MUSH1, NG2, Tuj1

Nestin, GFAP VimentinEGFRSox2

Neurosphere cell growth inhibition

13,5dembryo

Olfactory bulb

neurospheres (passage 5-6)

IP immunization

hamster

Balb/cmyelomaX63.Ag8

hamsterspleen cells X

HAT selection

Flow cytometer

Nilo1 identify human GBM-

derived neurosphere

s

Nilo2 as a marker of brain damage

• Nilo2 identify neuroblast cells in the brain niches. This cells could be followed inside the brain moving into damaged areas

TEM

Nilo1 a somatic stem biomarker

Nilo1+ cells

oligodendrocytes

astrocytes

neurons

NSCneurosphere

NSCNilo1+, Sox2+Neural tissue1

adipocyteschondriocytes

osteocytes

Early MSC progenitors

Nilo1+, Sox2+, CD29+, CD45-

mature MSC

Nilo1-, Sox2-, CD29+, CD45-

Bone marrow tissue

2

3 asymmetric division

Nilo1 labeled f=1/10

5

frac

tion

of n

on

resp

ondi

ng c

ultu

res 1

100 2000

0,1

Cells/well

4 Intestinal crypt

El futuro en I+D: áreas de interés

• Desarrollo de nuevos marcadores de diagnóstico

dirigidos a la medicina personalizada

• Combinación e integración de ómicas para el

desarrollo de algoritmos con capacidad predictiva

• Desarrollo de biosensores robustos que permitan la

automatización de procesos diagnósticos

• Aplicación de TIC al desarrollo de sistemas expertos

de soporte a la toma de decisiones

• Uso de marcadores de células stem somáticas en

diagnóstico y terapia23

El futuro en I+D

24

�Compartir información�Cooperar�Alianzas estratégicas

25

26

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