ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

22
Informe final* del Proyecto L226 Variabilidad genética en las poblaciones naturales de la almeja catarina Argopecten ventricosus-circularis (Sowerby II, 1842) Responsable: Dr. Alfonso N Maeda Martínez Institución: Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste SC División de Biología Experimental Unidad de Patología Marina Laboratorio de Biología Molécular Dirección: Apartado Postal 128, La Paz, BCS, 23000 , México Km 0.5 carretera a la telefónica terrenos El Conchalito, La Paz, BCS, 23000 , México Correo electrónico: [email protected] Teléfono/Fax: 01(112)5 36 33 ext 126, 01(112)5 36 26, 01(112)5 36 67 Fax: 01(112)5 47 15 Fecha de inicio: Diciembre 15, 1997 Fecha de término: Noviembre 29, 1999 Principales resultados: Cartografía, Informe final, Hoja de cálculo Forma de citar** el informe final y otros resultados: Maeda Martínez, A. N., 2000. Variabilidad genética en las poblaciones naturales de la almeja catarina Argopecten ventricosus-circularis (Sowerby II, 1842). Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste SC, Informe final SNIB-CONABIO proyecto No. L226. México D. F. Forma de citar hoja de cálculo Maeda Martínez, A. N., 2000. Variabilidad genética en las poblaciones naturales de la almeja catarina Argopecten ventricosus-circularis (Sowerby II, 1842). Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste SC, Hoja de cálculo SNIB-CONABIO proyecto No. L226. México D. F. Resumen: El presente proyecto pretende confirmar la hipótesis de que los grandes bancos de almeja catarina que ocasionalmente se forman en Bahía Magdalena, provienen de progenitores que se distribuyen en zonas muy profundas no accesibles a la pesca, a lo largo de la plataforma continental de Baja California. Esto tiene una gran relevancia para la conservación de especie ya que de confirmarse la hipótesis, la preservación de la especie estaría asegurada independientemente de los niveles de explotación a los que sea sometida dentro de la Bahía Magdalena. La primera etapa del proyecto pretende conocer el grado de variabilidad genética que existe en las poblaciones naturales de almeja catarina en la costa de Baja California Sur. La información obtenida permitirá hacer las recomendaciones pertinentes al caso, de manera que se asegure la permanencia de diversidad genética en las poblaciones de esta importante especie de moluscos bivalvo. Para el muestreo de las poblaciones de la plataforma continental, se utilizará el barco de investigación BIP II propiedad del CIBNOR, y simultáneamente se colectarán almejas dentro de las Bahías Magdalena en el Pacífico de Baja California (zona 03) y Bahía Concepción en el Golfo de Baja California (zona 04). Las almejas de la plataforma se colectarán por medio de redes de arrastre para camarón y las de las Bahías por buceo autónomo. Con las muestras primeramente se realizarán comparaciones bioquímicas, buscando alelos de enzimas que pudiesen ser utilizados como marcadores de diversidad para la población bajo estudio. Para ello se realizarán corrimientos electroforéticos de extractos de las almejas colectadas en geles de almidón en presencia de inhibidores de proteasas. Posteriormente a la separación de las proteínas se revelarán con mezclas de reactivos específicos para detectar la presencia de ciertas enzimas. La siguiente etapa consiste en hacer comparaciones más finas mediante el uso de enzimas de restricción (RFLP). Para ello se utilizará como primera opción ADN genómico. Como segunda opción, se propone como estrategia la amplificación mediante el uso de sondas específicas utilizando para ello, ADN genómico proveniente de las diversas poblaciones de almejas, como templado base, y como primeras secuencias consenso de las subunidades grande

Transcript of ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

Page 1: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

Informe final* del Proyecto L226 Variabilidad genética en las poblaciones naturales de la almeja catarina Argopecten

ventricosus-circularis (Sowerby II, 1842) Responsable: Dr. Alfonso N Maeda Martínez Institución: Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste SC

División de Biología Experimental Unidad de Patología Marina Laboratorio de Biología Molécular

Dirección: Apartado Postal 128, La Paz, BCS, 23000 , México Km 0.5 carretera a la telefónica terrenos El Conchalito, La Paz, BCS, 23000 , México

Correo electrónico: [email protected]

Teléfono/Fax: 01(112)5 36 33 ext 126, 01(112)5 36 26, 01(112)5 36 67 Fax: 01(112)5 47 15

Fecha de inicio: Diciembre 15, 1997 Fecha de término: Noviembre 29, 1999 Principales resultados: Cartografía, Informe final, Hoja de cálculo

Forma de citar** el informe final y otros resultados:

Maeda Martínez, A. N., 2000. Variabilidad genética en las poblaciones naturales de la almeja catarina Argopecten ventricosus-circularis (Sowerby II, 1842). Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste SC, Informe final SNIB-CONABIO proyecto No. L226. México D. F.

Forma de citar hoja de cálculo

Maeda Martínez, A. N., 2000. Variabilidad genética en las poblaciones naturales de la almeja catarina Argopecten ventricosus-circularis (Sowerby II, 1842). Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste SC, Hoja de cálculo SNIB-CONABIO proyecto No. L226. México D. F.

Resumen: El presente proyecto pretende confirmar la hipótesis de que los grandes bancos de almeja catarina que ocasionalmente se forman en Bahía Magdalena, provienen de progenitores que se distribuyen en zonas muy profundas no accesibles a la pesca, a lo largo de la plataforma continental de Baja California. Esto tiene una gran relevancia para la conservación de especie ya que de confirmarse la hipótesis, la preservación de la especie estaría asegurada independientemente de los niveles de explotación a los que sea sometida dentro de la Bahía Magdalena. La primera etapa del proyecto pretende conocer el grado de variabilidad genética que existe en las poblaciones naturales de almeja catarina en la costa de Baja California Sur. La información obtenida permitirá hacer las recomendaciones pertinentes al caso, de manera que se asegure la permanencia de diversidad genética en las poblaciones de esta importante especie de moluscos bivalvo. Para el muestreo de las poblaciones de la plataforma continental, se utilizará el barco de investigación BIP II propiedad del CIBNOR, y simultáneamente se colectarán almejas dentro de las Bahías Magdalena en el Pacífico de Baja California (zona 03) y Bahía Concepción en el Golfo de Baja California (zona 04). Las almejas de la plataforma se colectarán por medio de redes de arrastre para camarón y las de las Bahías por buceo autónomo. Con las muestras primeramente se realizarán comparaciones bioquímicas, buscando alelos de enzimas que pudiesen ser utilizados como marcadores de diversidad para la población bajo estudio. Para ello se realizarán corrimientos electroforéticos de extractos de las almejas colectadas en geles de almidón en presencia de inhibidores de proteasas. Posteriormente a la separación de las proteínas se revelarán con mezclas de reactivos específicos para detectar la presencia de ciertas enzimas. La siguiente etapa consiste en hacer comparaciones más finas mediante el uso de enzimas de restricción (RFLP). Para ello se utilizará como primera opción ADN genómico. Como segunda opción, se propone como estrategia la amplificación mediante el uso de sondas específicas utilizando para ello, ADN genómico proveniente de las diversas poblaciones de almejas, como templado base, y como primeras secuencias consenso de las subunidades grande

Page 2: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

(LS) y/o pequeña (SS) de ARN ribosomal. Las amplificaciones obtenidas serían analizadas en su patrón de restricción con diferentes enzimas con la finalidad de realizar comparaciones. La información obtenida se utilizará para: la formulación de modelos de las relaciones genéticas intra e interpoblaciones, mediante la utilización de programas estadísticos computacionales (STATISTICA), en particular, mediante el uso de análisis de conglomerados (cluster). _____________________________________________________________________________________________

• * El presente documento no necesariamente contiene los principales resultados del proyecto correspondiente o la descripción de los mismos. Los proyectos apoyados por la CONABIO así como información adicional sobre ellos, pueden consultarse en www.conabio.gob.mx

• ** El usuario tiene la obligación, de conformidad con el artículo 57 de la LFDA, de citar a los autores de obras individuales, así como a los compiladores. De manera que deberán citarse todos los responsables de los proyectos, que proveyeron datos, así como a la CONABIO como depositaria, compiladora y proveedora de la información. En su caso, el usuario deberá obtener del proveedor la información complementaria sobre la autoría específica de los datos.

Page 3: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

CCEENNTTRROO DDEE IINNVVEESSTTIIGGAACCIIOONNEESS BBIIOOLLOOGGIICCAASS DDEELL NNOORROOEESSTTEE SS..CC..

PPRROOYYEECCTTOO CCOONNAABBIIOO LL222266

VVAARRIIAABBIILLIIDDAADD GGEENNEETTIICCAA DDEE LLAASS PPOOBBLLAACCIIOONNEESS NNAATTUURRAALLEESS DDEEAALLMMEEJJAA CCAATTAARRIINNAA ((AArrggooppeecctteenn vveennttrriiccoossuuss==cciirrccuullaarriiss ((SSOOWWEERRBBYY IIII,, 11884422))..

IINNFFOORRMMEE FFIINNAALL

GGrruuppoo PPaarrttiicciippaannttee::

DDRR.. AALLFFOONNSSOO NN.. MMAAEEDDAA MMAARRTTIINNEEZZDDRRAA.. NNOORRMMAA HHEERRNNAANNDDEEZZ SSAAAAVVEEDDRRAA

MM..CC.. EEDDUUAARRDDOO BBAALLAARRTT PPAAEEZZBBIIOOLL.... EEDDGGAARR AAMMAADDOORR SSIILLVVAA

TTEECC.. AARRTTUURROO SSIIEERRRRAA BBEELLTTRRAANNppBBIIOOLL.. DDEELLIIAA RROOJJAASS

AAsseessoorr ddeell pprrooyyeeccttoo::

DDRR.. AALLBBEERRTTOO AABBRREEUU GGRROOBBOOIISS

SSEEPPTTIIEEMMBBRREE DDEE 11999999

Page 4: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

IINNTTRROODDUUCCCCIIOONN

DDaaddoo qquuee eenn MMééxxiiccoo eexxiissttee uunn ssiisstteemmaa ddee ccoonnttrrooll ooffiicciiaall ddeellaapprroovveecchhaammiieennttoo ddee llaass ppoobbllaacciioonneess nnaattuurraalleess ddee llooss rreeccuurrssooss mmaarriinnooss mmeeddiiaanntteeeell eessttaabblleecciimmiieennttoo ddee uunnaa ccuuoottaa ddee ccaappttuurraa.. EEnn eell ccaassoo ddee llooss mmoolluussccooss bbiivvaallvvooss,,eessttee ssee bbaassaa eenn pprroossppeecccciioonneess ddee llooss bbaannccooss nnaattuurraalleess,, rreessuullttaannddoo eenn eelleessttaabblleecciimmiieennttoo ddee vveeddaass tteemmppoorraalleess yy ddee ttaallllaass yy vvoolluummeenneess ddee ccaappttuurraa.. UUnnccaassoo ppaarrttiiccuullaarr eess llaa eessccaallooppaa ccoonnoocciiddaa eenn MMééxxiiccoo ccoommoo aallmmeejjaa ccaattaarriinnaaAArrggooppeecctteenn vveennttrriiccoossuuss==cciirrccuullaarriiss..

LLaass ccaappttuurraass ddee eessttaa eessppeecciiee ssoonn mmuuyy vvaarriiaabblleess,, ppeerroo hhaann aallccaannzzaaddoovvoollúúmmeenneess rrééccoorrdd ddee mmááss ddee 22550000 ttoonneellaaddaass mmééttrriiccaass ddee ccaallllooss ppoorr aaññoo eenn 11998899 yy11999900 eenn BBaahhííaa MMaaggddaalleennaa,, eenn llaa ccoossttaa PPaaccííffiiccoo ddee BBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa.. LLaa eexxpplloottaacciióónnddee eessooss bbaannccooss ddeejjóó eenn eessooss aaññooss uunnaa ddeerrrraammaa mmuuyy iimmppoorrttaannttee ddee rreeccuurrssoosseeccoonnóómmiiccooss,, bbeenneeffiicciiáánnddoossee aallrrrreeddeeddoorr ddee 1100 000000 ppeerrssoonnaass.. SSee hhaa pprrooppuueessttoo((MMaaeeddaa--MMaarrttíínneezz eett aall..,, 11999933)) qquuee llooss ggrraannddeess bbaannccooss ddee aallmmeejjaa qquuee ssee ffoorrmmaanneenn BBaahhííaa MMaaggddaalleennaa,, nnoo ssee hhaann oorriiggiinnaaddoo ddee pprrooggeenniittoorreess llooccaalleess,, ssiinnoo qquuee ssoonneell pprroodduuccttoo ddeell ddeessoovvee ddee ggrraannddeess bbaannccooss nnaattuurraalleess llooccaalliizzaaddooss eenn llaa PPllaattaaffoorrmmaaCCoonnttiinneennttaall ddee llaa PPeenníínnssuullaa ddee BBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa ,, ffuueerraa ddee BBaahhííaa MMaaggddaalleennaa.. EEssttaassppoobbllaacciioonneess,, iinnaacccceessiibblleess ppaarraa llaa ppeessccaa ccoommeerrcciiaall ddeebbiiddoo aall ffoonnddoo rrooccoossoo ddoonnddeessee eenneeccuueennttrraann,, ffuueerroonn llooccaalliizzaaddaass ppoorr iinnvveessttiiggaaddoorreess ddeell CCIIBBNNOORR eenn uunn ccrruucceerrooddee iinnvveessttiiggaacciióónn,, aa bboorrddoo ddeell BB//OO ""EEll PPuummaa"",, eemmpplleeaannddoo ddrraaggaass llaannzzaaddaass hhaassttaallooss 118800 mm ddee pprrooffuunnddiiddaadd.. SSee ccoonnooccee llaa llooccaalliizzaacciióónn eexxaaccttaa ddee ddiicchhooss bbaannccooss..CCoonn bbaassee eenn ddeettaallllaaddaass oobbsseerrvvaacciioonneess rreellaacciioonnaaddaass aa llaass ddeennssiiddaaddeess ddee llaasssseemmiillllaa ccoolleeccttaaddaa eenn pprreesseenncciiaa oo aauusseenncciiaa ddee bbaannccooss ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa eenn llaaBBaahhííaa,, ssee ccoonnssttrruuyyóó uunn mmooddeelloo qquuee pprrooppoonnee qquuee dduurraannttee llooss aaññooss ffrrííooss,, ggrraannddeessnnúúmmeerrooss ddee llaarrvvaass ddee AA.. vveennttrriiccoossuuss ssoonn ttrraannssppoorrttaaddaass aall iinntteerriioorr ddee llaa BBaahhííaaffoorrmmaannddoo llooss ggrraannddeess bbaannccooss qquuee ssee ddeeppoossiittaann eenn eell ffoonnddoo ssii llaass ccoonnddiiccoonneesscclliimmááttiiccaass ssoonn aaddeeccuuaaddaass ((MMaaeeddaa--MMaarrttíínneezz eell aall,, 11999933))..

EEnn eell pprreesseennttee pprrooyyeeccttoo,, pprreetteennddeemmooss ddeemmoossttrraarr llaass pprreeddiicccciioonneess ddeellmmooddeelloo eess ddeecciirr,, qquuee eexxiissttee uunnaa rreellaacciióónn ffiillooggeennééttiiccaa mmuuyy eessttrreecchhaa eennttrree llaassppoobbllaacciioonneess ddee llaa PPllaattaaffoorrmmaa CCoonnttiinneennttaall ccoonn llaass ddee BBaahhííaa MMaaggddaalleennaa.. EEssttoottrraaeerrííaa ccoommoo bbeenneeffiicciioo eell ppooddeerr eexxpplloottaarr llaass ppoobbllaacciioonneess ddee BBaahhííaa MMaaggddaalleennaahhaassttaa ssuu aaggoottaammiieennttoo ssiinn eell mmeennoorr rriieessggoo ddee eexxttiinngguuiirr llaa eessppeecciiee ddee eessee ssiittiiooppoorrqquuee eell ggeerrmmooppllaassmmaa eessttaarrííaa aasseegguurraaddoo eenn llaa PPllaattaaffoorrmmaa CCoonnttiinneennttaall.. PPoorr oottrraappaarrttee,, eenn ccaassoo ddee qquuee nnoo ssee iiddeennttiiffiiccaarraann ddiiffeerreenncciiaass ggeennééttiiccaass eennttrree ppoobbllaacciioonneess,,sseerrííaa ppoossiibbllee lllleevvaarr aa ccaabboo aacccciioonneess ddee rreeppoobbllaammiieennttoo ddee zzoonnaass ssoobbrreeeexxpplloottaaddaass ooiinnttrroodduucccciioonneess eenn aaqquueellllaass zzoonnaass ddoonnddee eexxiissttaa eell ppootteenncciiaall ddee ccuullttiivvoo,, eemmpplleeaannddooeejjeemmppllaarreess ccuuaarreenntteennaaddooss ppaarraa eevviittaarr iinnttrroodduucccciioonn ddee eennffeerrmmeeddaaddeess,, ppeerroo ssiinn eellrriieessggoo ddee aalltteerraarr ggeennééttiiccaammeennttee aa llaass ppoobbllaacciioonneess llooccaalleess..

PPaarraa ppoonneerr aa pprruueebbaa llaa hhiippóótteessiiss aanntteerriioorr,, eenn eessttee pprrooyyeeccttoo ssee ppllaanntteeaarroonnllooss ssiigguuiieenntteess oobbjjeettiivvooss::

Page 5: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

OOBBJJEETTIIVVOO GGEENNEERRAALL::

CCoonnffiirrmmaarr llaass rreellaacciioonneess ggeennééttiiccaass eexxiisstteenntteess eennttrree llaass ppoobbllaacciioonneess nnaattuurraalleess ddeeaallmmeejjaa ccaattaarriinnaa ddee llaa ppllaattaaffoorrmmaa ccoonnttiinneennttaall ddee BBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa yy ddee llaass BBaahhííaassMMaaggddaalleennaa yy CCoonncceeppcciióónn..

OOBBJJEETTIIVVOOSS PPAARRTTIICCUULLAARREESS::

11..-- EEssttaabblleecceerr lliinnaajjeess oo ppaattrroonneess ggeennééttiiccooss ffaammiilliiaarreess eenn llaass ppoobbllaacciioonneess nnaattuurraalleessddee llaa eessppeecciiee eenn BBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa SSuurr..22..-- CCoonnffiirrmmaarr llaa hhiippóótteessiiss ddee qquuee llaass ppoobbllaacciioonneess ddee llaa ppllaattaaffoorrmmaa ccoonnttiinneennttaall ddeeBBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa ssoonn llooss pprrooggeenniittoorreess ddee llaass aallmmeejjaass qquuee ffoorrmmaann llooss bbaannccoossnnaattuurraalleess ddee aallmmeejjaass ddeennttrroo ddee llaa BBaahhííaa MMaaggddaalleennaa..33..-- EEllaabboorraarr rreeccoommeennddaacciioonneess ppaarraa uunn pprrooggrraammaa ddee mmaanneejjoo ddee eessppeecciieess..

PPaarraa llooggrraarr eessttooss oobbjjeettiivvooss,, eenn eell pprreesseennttee eessttuuddiioo ssee aapplliiccaarroonn ttrreessttééccnniiccaass ddee ggeennééttiiccaa mmoolleeccuullaarr eenn tteejjiiddooss ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa ddee ddiivveerrssaassppoobbllaacciioonneess:: aannáálliissiiss ddee aallooeennzziimmaass,, aannáálliissiiss ddee ppoolliimmoorrffiissmmoo ddee llaa lloonnggiittuudd ddeeffrraaggmmeennttooss ddee rreessttrriicccciióónn ((RRFFPPLL)) ccoonn AADDNN ggeennóómmiiccoo yy aammpplliiffiiccaacciióónn aalleeaattoorriiaa ddeeAADDNN ggeennóómmiiccoo ppoolliimmóórrffiiccoo ((RRAAPPDDSS)) EEssttaass ttééccnniiccaass hhaann ssiiddoo eemmpplleeaaddaasseexxiittoossaammeennttee ppoorr oottrrooss iinnvveessttiiggaaddoorreess ppaarraa ddiiffeerreenncciiaarr ppoobbllaacciioonneess eenn mmoolluussccoossppeeccttiinniiddooss ((MMaatthheerrss,, 11997755,, SSkkiibbiinnsskkyy eett aall..,, 11997788;; BBeeaauummoonntt,, 11998822;; KKooeehhnn eett aall..,,11998844;; HHuueellvvaann,, 11998855;; VVaarrvviioo,, eett aall..,, 11998888;; RRííooss eett aall..,, 11999999))..

MMAATTEERRIIAALLEESS YY MMEETTOODDOOSS

MMUUEESSTTRREEOO DDEE EEJJEEMMPPLLAARREESS DDEE AALLMMEEJJAA CCAATTAARRIINNAA..

IInniicciiaallmmeennttee,, eell pprrooyyeeccttoo ccoonntteemmppllaabbaa ssoollaammeennttee eell mmuueessttrreeoo ddee oorrggaanniissmmoosspprroovveenniieenntteess ddee llaass ppoobbllaacciioonneess ddee llaa ppllaattaaffoorrmmaa ccoonnttiinneennttaall yy ddee BBaahhííaaMMaaggddaalleennaa eenn llaa ccoossttaa oocccciiddeennttaall ddee llaa ppeenníínnssuullaa ddee BBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa.. PPaarraaccoonnttrraassttaarr llooss rreessuullttaaddooss,, ssee ccoonnssiiddeerróó eessttuuddiiaarr llaa ppoobbllaacciióónn ddee BBaahhííaaCCoonncceeppcciióónn,, llaa ccuuaall ssee eennccuueennttrraa ggeeooggrrááffiiccaammeennttee ddiissttaannttee aall eessttaarr uubbiiccaaddaaddeennttrroo ddeell GGoollffoo ddee CCaalliiffoorrnniiaa.. CCoonnffoorrmmee aavvaannzzóó eell pprrooyyeeccttoo,, ssee eennccoonnttrróóccoonnvveenniieennttee aammpplliiaarr eell nnúúmmeerroo ddee ppoobbllaacciioonneess ppaarraa ccuubbrriirr ccaassii llaa ttoottaalliiddaadd ddeellaarreeaa ddee ddiissttrriibbuucciióónn ddee llaa eessppeecciiee rreeppoorrttaaddaa ppoorr KKeeeenn,, 11997711)),, qquuee vvaa ddeessddee BBaajjaaCCaalliiffoorrnniiaa hhaassttaa PPeerrúú.. DDee eessttaa ffoorrmmaa,, ssee oobbtteennddrrííaa eell eessppeeccttrroo ccaassii ccoommpplleettoo ddeevvaarriiaabbiilliiddaadd ggeennééttiiccaa ddee llaa eessppeecciiee.. LLooss eejjeemmppllaarreess ffuueerroonn ccoolleeccttaaddooss ddeeppoobbllaacciioonneess nnaattuurraalleess mmeeddiiaannttee bbuucceeoo aauuttóónnoommoo oo eemmpplleeaannddoo rreeddeess ddee aarrrraassttrreettiippoo ccaammaarroonneerraass ddeeppeennddiieennddoo ddee llaa pprrooffuunnddiiddaadd yy ddee llaass ccaarraacctteerrííssttiiccaass ddee llaallooccaalliiddaadd.. EEnn ccaaddaa ssiittiioo ssee rreeggiissttrraarroonn llaass ccoooorrddeennaaddaass ddee llooccaalliizzaacciióónn..

Page 6: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

PPoosstteerriioorrmmeennttee,, llooss oorrggaanniissmmooss ffuueerroonn ccoonnggeellaaddooss eenn nniittrróóggeennoo llííqquuiiddoo yy lluueeggoo sseettrraassllaaddaarroonn aall llaabboorraattoorriioo eenn ddoonnddee ssee lleess ttoommaarroonn llaass ssiigguuiieenntteess mmeeddiiddaass ;; aallttoo,,aanncchhoo yy ggrruueessoo ddee llaa ccoonncchhaa,, ppeessoo hhúúmmeeddoo ttoottaall,, ppeessoo hhúúmmeeddoo ddeell tteejjiiddoo,, ppeessoohhúúmmeeddoo ddeell mmúússccuulloo yy eell ppeessoo hhúúmmeeddoo ddeell rreessttoo ddee llooss tteejjiiddooss..

PPRREEPPAARRAACCIIÓÓNN DDEE MMUUEESSTTRRAASS

PPaarraa uunniiffiiccaarr ccrriitteerriiooss rreessppeeccttoo aa llaa ppoorrcciióónn ddeell aanniimmaall aa sseerr eemmpplleeaaddoo ppaarraa eelleessttuuddiioo,, ssee rreeaalliizzaarroonn eennssaayyooss pprreelliimmiinnaarreess ddee eexxttrraacccciióónn ddee DDNNAA ccoonn ddiiffeerreenntteessppoorrcciioonneess ccoorrppoorraalleess:: mmaannttooss,, ggóónnaaddaass yy mmúússccuulloo aadduuccttoorr,, lllleeggaannddoo aa llaaccoonncclluussiióónn ddee qquuee eell mmúússccuulloo pprreesseennttaabbaa mmeejjoorreess ccaarraacctteerrííssttiiccaass ppoorrqquuee pprroovveeííaassuuffiicciieenntteess tteejjiiddooss ppaarraa llooss mmúúllttiipplleess aannáálliissiiss,, ppeerrmmiittííaa uunnaa mmaanniippuullaacciióónn mmaassssiimmppllee ddee llaa mmuueessttrraa ppoorr ssuu mmaayyoorr rriiggiiddeezz,, eettcc.. EEnn eell llaabboorraattoorriioo,, llooss oorrggaanniissmmoossffuueerroonn ddeessccoonncchhaaddooss yy ppoosstteerriioorrmmeennttee ssee ddiisseeccttóó eell mmúússccuulloo ccoonn bbiissttuurríí.. UUnnaavveezz oobbtteenniiddoo eell mmúússccuulloo,, ssee ccoorrttaarroonn sseecccciioonneess ccúúbbiiccaass ddeell tteejjiiddoo ddee 33 mmmm ccoonn eellbbiissttuurríí yy ffiinnaallmmeennttee ssee rreeaalliizzaarroonn llaass eexxttrraacccciioonneess ddee pprrootteeíínnaass ssoolluubblleess yy áácciiddoossnnuucclleeiiccooss aapplliiccaannddoo llaa ttééccnniiccaa eessttaannddaarriizzaaddaa eenn eell llaabboorraattoorriioo sseeggúúnn ccaaddaa ccaassoo..

AANNÁÁLLIISSIISS DDEE AALLOOEENNZZIIMMAASS

PPaarraa lloo aannáálliissiiss eennzziimmááttiiccooss,, llaass sseecccciioonneess ddee tteejjiiddoo ssee hhoommooggeenniizzaarroonn eennbbuuffffeerr ddee ffoossffaattooss TTrriiss 5500MMmm,, ppHH 88..00 mmeeddiiaannttee uunn hhoommooggeenniizzaaddoorr KKoonntteess ((PPeelllleettPPeessttllee MMoottoorr)) eenn uunn bbaaññoo ddee hhiieelloo.. LLooss hhoommooggeenniizzaaddooss ssee cceennttrriiffuuggaarroonn aa 88994444 xxgg ((ppaarraa eelliimmiinnaarr llooss rreessttooss cceelluullaarreess)) dduurraannttee 1100 mmiinnuuttooss aa 44°°CC.. LLoossssoobbrreennaaddaanntteess oobbtteenniiddooss ssee ttrraannssffiirriieerroonn aa ttuubbooss nnuueevvooss.. AA eessttooss ssoobbrreennaaddaanntteessssee lleess ddeetteerrmmiinnoo llaa ccoonncceennttrraacciióónn ddee pprrootteeiinnaass mmeeddiiaannttee eell mmeettooddoo ddee LLoowwrryy((11995511)),, ppaarraa eessttaannddaarriizzaarr eell ccoonntteenniiddoo ddee pprrootteeiinnaass ddee llaass mmuueessttrraass aa 00..66 mmgg//mmll..

DDee eessttooss ssttoocckkss ((00..66 mmgg//mmll)) ssee pprreeppaarraarroonn llaass ddiilluucciioonneess ccoorrrreessppoonnddiieenntteessppaarraa ccaarrggaarr eenn llooss ggeelleess ddee ppoolliiaaccrriillaammiiddaa ((pprreeppaarraaddooss aall 77..55 %% ddee aaccuueerrddoo aallmmééttooddoo ddeessccrriittoo ppoorr DDaavviiss,, 11996644)),, 44 µµgg ddee pprrootteeiinnaa eenn ccaaddaa lliinneeaa.. LLaasseelleeccttrrooffoorreessiiss ssee lllleevvaarroonn aa ccaabboo eenn uunnaa ccáámmaarraa MMiinniipprrootteeaann IIII ((BBiioorraadd)),, llaa ccuuaallccoonntteennííaa eell bbuuffffeerr ddee ccoorrrriimmiieennttoo ((TTrriiss--GGlliicciinnaa)) pprreeeennffrriiaaddoo aa 44°°CC,, aapplliiccaannddoo uunnaaccoorrrriieennttee ddee 4400 VV aall ggeell ddee eemmppaaqquueettaammiieennttoo yy ddee 7700 VV aall ggeell ddee sseeppaarraacciióónn..FFiinnaallmmeennttee,, llooss ggeelleess ssee ttiiññiieerroonn ppaarraa eevviiddeenncciiaarr llaass aaccttiivviiddaadd aallgguunnaass eennzziimmaass((TTaabbllaa 11))..

Page 7: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

AANNAALLIISSIISS DDEELL PPOOLLIIMMOORRFFOOSSMMOO DDEE LLAA LLOONNGGIITTUUDD DDEE FFRRAAGGMMEENNTTOOSS DDEERREESSTTRRIICCCCIIÓÓNN ((RRFFPPLL))..

PPaarraa lllleevvaarr aa ccaabboo llooss aannáálliissiiss ddee RRFFPPLL pprriimmeerraammeennttee ssee eessttaannddaarriizzóó llaaccoonncceennttrraacciióónn ddee llooss ssttoocckkss ddee AADDNN ggeennóómmiiccoo aa uunnaa ccoonncceennttrraacciióónn ffiinnaall ddee 110000nngg//µµll ((110000 µµgg//mmll)) .. DDiieezz mmiiccrroolliittrrooss ddeell ssttoocckk ddee AADDNN ((11µµgg)),, ssee mmeezzccaarroonn ccoonn 22..55µµll ddee bbuuffffeerr1100XX ((sseeggúúnn llaa eennzziimmaa eennssaayyaaddaa)) yy uunnaa uunniiddaadd ddee llaa eennzziimmaa ddeerreessttrriicccciióónn ((TTaabbllaa 22)),, yy ffiinnaallmmeennttee ssee aaffoorróó aa 2255 µµll ccoonn aagguuaa ddeessttiillaaddaa eesstteerriill.. LLoossccoommppoonneenntteess ddee llaa mmeezzccllaa ddee rreeaacccciióónn ssee mmeezzccllaarroonn mmeeddiiaannttee uunn ppuullssoo ddeecceennttrriiffuuggaa,, yy llooss ttuubbooss ssee iinnccuubbaarroonn eenn uunn bbaaññoo mmaarrííaa aa 3377°°CC dduurraannttee uunnaa hhoorraa..PPoosstteerriioorrmmeennttee ssee rreeaalliizzoo uunnaa eelleeccttrrooffoorreessiiss eenn ggeelleess ddee aaggaarroossaa aall 00..88%% eennbbuuffffeerr TTBBEE,, aapplliiccaannddoo uunnaa ccoorrrriieennttee ddee 7700 VV aa tteemmppeerraattuurraa aammbbiieennttee dduurraannttee 5500mmiinn.. DDeessppuueess ddee llaa eelleeccttrrooffoorreessiiss llooss ggeelleess pprreetteeññiiddooss ccoonn EEttRRrr ssee aannaalliizzaarroonn bbaajjoolluuzz UUVV yy ssee rreeggiissttrraarroonn mmeeddiiaannttee uunn ffoottooddooccuummeennttaaddoorr ddiiggiittaall..

TTaabbllaa 22.. EEnnzziimmaass ddee rreessttrriicccciioonn uuttiilliizzaaddaass eenn llooss aannáálliissiiss RRFFPPLL..

NNúúmmeerroo EEnnzziimmaa BBuuffffeerr rreeqquueerriiddooaa SSeeccuueenncciiaa ddeerreeccoonnoocciimmiieennttoo

11.. AAlluu II AA AAGG�CT22.. BBaamm HHII BB GG��GGAATTCCCC33.. BBsspp 114433 BB ��GGAATTCC44.. BBsstt XXII HH CCCCAA((NN55))��NNTTGGGG55.. EEccoo RRII HH GG��AAAATTCC66.. HHaaee IIIIII MM GG��CCCC77.. HHiinndd IIIIII BB AA��AAGGCCTTTT88.. HHiinnff II HH CC��AANNTTCC99.. KKppnn II LL GGGGTTAACC��CC1100.. SSaacc II AA GGAAGGCCTT��CC1111.. SSaall II HH GG��TTCCGGAACC1122.. PPsstt II HH CCTTGGCCAA��GG1133.. XXbbaa II HH TT��CCTTAAGGAA

aa SSeeggúúnn eessppeecciiffiiccaacciioonneess ddeell ffaabbrriiccaannttee ((BBoohheerriinnggeerr MMaannnnhheeiimm))

AAMMPPLLIIFFIICCAACCIIÓÓNN AALLEEAATTOORRIIAA DDEE AADDNN PPOOLLIIMMÓÓRRFFIICCOO ((RRAAPPDDSS))

AAll iigguuaall qquuee eenn llooss aannáálliissiiss ddee RRFFPPLL ,, ppaarraa lllleevvaarr aa ccaabboo llaa ttééccnniiccaa ddeeRRAAPPDDSS pprriimmeerraammeennttee ssee pprroocceeddiióó aa eessttaannddaarriizzaarr llaa ccoonncceennttrraacciióónn ddee llooss ssttoocckkssddee AADDNN ggeennóómmiiccoo aa uunnaa ccoonncceennttrraacciióónn ffiinnaall ddee 110000 nngg//µµll ((110000 µµgg//mmll)) .. CCiieennnnaannooggrraammooss ddee AADDNN ((11 µµLL ddeell ssttoocckk 110000 µµgg//mmll)) ffuueerroonn ccoollooccaaddooss eenn uunn ttuubbooEEppppeennddoorrff ddee 00..6655 mmll qquuee ccoonntteennííaa 11 µµll ddee llaa sseeccuueenncciiaa rraannddoomm aa pprroobbaarr ((TTaabbllaa

Page 8: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

33)) ddeell oolliiggoo ((1100 nnMM)),, 22..55 µµll ddee PPCCRR bbuuffffeerr 1100XX,, 11 µµLL ddee ddNNTTPPss 1100 mmMM,, 1199..33 µµll ddeeaagguuaa mmiillii--QQ ddeessttiillaaddaa eessttéérriill yy 00..22 µµll ddee TTaaqq ppoolliimmeerraassaa ((ddee uunn ssttoocckk ddee 55 UU//µµll))..

TTaabbllaa 33.. SSeeccuueenncciiaa ddee llooss oolliiggooss rraannddoomm uuttiilliizzaaddooss eenn eessttee eessttuuddiioo..

NNúúmmeerroo OOlliiggoo SSeeccuueenncciiaa11 SSVV1199 AAGGAA GGTTTT TTGGAA TT22 SSVV2200 GGGGTT TTAACC CCTTTT GG33 SSVV2211 AAGGGG GGTTTT CCTTTT GG44 SSVV2222 TTCCAA CCGGGG TTGGCC AA55 SSVV2233 GGTTCC GGCCCC GGAACC TT66 SSVV2244 GGTTAA GGAACC GGAAGG CC77 SSVV2255 AAAAAA CCGGTT CCGGGG GG88 SSVV2266 AACCTT GGAACC TTGGCC CC99 SSVV2277 GGAACC TTTTTT GGCCGG AA1100 SSVV2288 CCGGCC GGAAAA GGAAAA TT1111 SSVV2299 CCCCGG AAAAAA AACCGG CC1122 SSVV3300 CCGGAA CCCCAA GGAAGG CC1133 SSVV3311 AATTCC TTGGGG CCAAGG CC1144 SSVV3322 TTTTCC CCGGGG TTTTGG AA1155 SSVV3333 AATTGG GGAACC AACCCC AA1166 XXLL--22 GGGGGG TTAAAA CCGGCC CC1177 XXLL--33 GGTTGG AATTCC GGCCAA GG1188 XXLL--44 GGTTTT GGCCGG AATTCC CC1199 XXLL66 GGTTAA GGAACC CCCCGG TT2200 XXLL--77 TTCCCC GGCCTT CCTTGG GG

LLooss ccoommppoonneenntteess ssee mmeezzccllaarroonn mmeeddiiaannttee uunn ppuullssoo ddee cceennttrriiffuuggaa yy ssee ccoollooccaarroonneenn uunn tteerrmmoocciiccllaaddoorr ((TTeecchhnnee CCyyccllooggeennee)) ccoonn eell pprrooggrraammaa ddeeffiinniiddoo eenn llaa TTaabbllaa 44..

TTaabbllaa 44.. PPrrooggrraammaa ddee aammpplliiffiiccaacciióónn RRAAPPDD ddee AADDNN ggeennóómmiiccoo ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa..

NNúúmmeerroo PPaassoo TTeemmppeerraattuurraa TTiieemmppoo NNuummeerroo ddee cciiccllooss11.. DDeessnnaattuurraalliizzaacciióónn 9955°°CC 22 mmiinn 1122.. DDeessnnaattuurraalliizzaacciióónn 9955°°CC 11 mmiinn

AAlliinneeaammiieennttoo 3355°°CC 11..55 mmiinn 4400EExxtteennssiioonn 7722°°CC 11 mmiinn

33.. EExxtteennssiioonn ffiinnaall 7722°°CC 33 mmiinn 1144.. AAccoonnddiicciioonnaammiieennttoo 44°°CC 1100 mmiinn 11

LLooss pprroodduuccttooss oobbtteenniiddooss ddee llaa aammpplliiffiiccaacciióónn mmeeddiiaannttee llaa rreeaacccciióónn eennccaaddeennaa ddee llaa ppoolliimmeerraassaa ((PPCCRR)),, ffuueerroonn aannaalliizzaaddooss mmeeddiiaannttee eelleeccttrrooffoorreessiiss eennggeelleess ddee aaggaarroossaa aall 11..22%% eenn TTBBEE.. DDee ccaaddaa rreeaacccciióónn ddee PPCCRR,, ssee ttoommaarroonn 1100 µµll yyssee mmeezzccllaarroonn ccoonn 22 µµll ddee bbuuffffeerr ddee ccaarrggaa.. CCoommoo eessttaannddaarr yy ppaarraa ddeetteerrmmiinnaarr eellttaammaaññoo ddee llooss pprroodduuccttooss ggeenneerraaddooss,, ssee uuttiilliizzóó eell 11KKbb DDNNAA llaaddddeerr ((LLiiffeeTTeecchhnnoollooggiieess)).. LLooss ggeelleess ssee ddeejjaarroonn ccoorrrreerr dduurraannttee 6600 mmiinnuuttooss aapplliiccaannddoo uunnvvoollttaajjee ccoonnssttaannttee ddee 7700 VV yy ppoosstteerriioorrmmeennttee,, llooss ggeelleess ssee aannaalliizzaarroonn bbaajjoo lluuzz

Page 9: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

uullttrraavviioolleettaa,, ddooccuummeennttáánnddoossee llooss ppaattrroonneess ddee bbaannddeeoo mmeeddiiaannttee eell uussoo ddeell ssiisstteemmaaddee ffoottooddooccuummeennttaacciióónn UUVVIITTEECC.. EEll ttaammaaññoo ddee llooss ffrraaggmmeennttooss yy eell rreeggiissttrroo ddiiggiittaallddee llaass iimmáággeenneess ddee ssee lllleevvoo aa ccaabboo mmeeddiiaannttee eell uussoo ddeell ssiisstteemmaa UUVVIITTEECC yy ddeellssooffttwwaarree UUVVIIDDOOCC..

RREESSUULLTTAADDOOSSMMUUEESSTTRREEOO DDEE OORRGGAANNIISSMMOOSS

EEnn eell pprreesseennttee ttrraabbaajjoo,, ssee ccoolleeccttaarroonn 114400 eejjeemmppllaarreess ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa((AArrggooppeecctteenn vveennttrriiccoossuuss)) pprroovveenniieenntteess ddee ssiieettee ppoobbllaacciioonneess nnaattuurraalleess ddee aallmmeejjaaccaattaarriinnaa,, iinnccuuyyeennddoo uunnaa ddee GGuuaayyaaqquuiill,, EEccuuaaddoorr ((TTaabbllaa 55)).. EEll nnúúmmeerroo bbuussccaaddoo ddeeeejjeemmppllaarreess ppoorr ssiittiioo ddee ccoolleeccttaa ffuuee ddee 1100 oo mmááss iinnddiivviidduuooss.. SSiinn eemmbbaarrggoo,, aa ppeessaarrddee llooss eessffuueerrzzooss eeffeeccttuuaaddooss ppaarraa ccoolleeccttaarr llooss oorrggaanniissmmooss ddee llaa ppllaattaaffoorrmmaaccoonnttiinneennttaall ddee BBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa,, ssoollaammeennttee ssee llooggrróó ccaappttuurraarr ccuuaattrroo eejjeemmppllaarreess eennddooss ccrruucceerrooss oocceeaannooggrrááffiiccooss aa eessttee ssiittiioo,, aa bboorrddoo ddeell BBaarrccoo BBIIPP IIII.. LLaa llooccaalliizzaacciióónnddee llooss ssiittiiooss ddee mmuueessttrreeoo eenn MMééxxiiccoo ssee mmuueessttrraann eenn llaa FFiigguurraa 11.. LLooss rreeggiissttrrooss ddeeaallttuurraa yy aanncchhuurraa ddee llaass ccoonncchhaass ddee llooss eejjeemmppllaarreess ccoolleeccttaaddooss,, ssee aanneexxaann eennddiisskkeettttee eenn eell aarrcchhiivvoo MMoorrffoommeettrrííaass..xxllss eenn EExxcceellll 55..00

TTaabbllaa 55.. SSiittiiooss ddee mmuueessttrreeoo,, nnúúmmeerroo yy mmééttooddoo ddee ccoolleeccttaa ddee eejjeemmppllaarreess ddee aallmmeejjaaccaattaarriinnaa ((AArrggooppeecctteenn vveennttrriiccoossuuss))..

SSiittiioo ddee mmuueessttrreeoo NNoo.. TToottaall ddeeoorrggaanniissmmoossccoolleeccttaaddooss

MMééttooddoo ddeeccoolleeccttaa

BBaahhííaa MMaaggddaalleennaa 88 BBuucceeooBBaahhííaa ddee LLaa PPaazz 2288 BBuucceeooBBaahhííaa CCoonncceeppcciióónn 1100 BBuucceeooPPllaattaaffoorrnnaa CCoonnttiinneennttaall 44 AArrrraassttrreeGGuuaayymmaass 3300 BBuucceeooGGuuaayyaaqquuiill,, EEccuuaaddoorr 3300 AArrrraassttrreeLLaagguunnaa ddee SSaann IIggnnaacciioo 3300 BBuucceeooTToottaall 114400

Page 10: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

FFiigguurraa 11.. LLooccaalliizzaacciióónn ddee llaass ppoobbllaacciioonneess ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa((AArrggooppeecctteenn vveennttrriiccoossuuss)),, mmuueessttrreeaaddaass eenn MMééxxiiccoo,,

AANNAALLIISSIISS EENNZZIIMMAATTIICCOOSS

LLooss rreessuullttaaddooss ddee llooss ddiiffeerreenntteess ppaattrroonneess eelleeccttrrooffoorrééttiiccooss eenn ggeelleess ddeeppoolliiaaccrriillaammiiddaa,, ssee ccaappttuurraarroonn eenn eell aarrcchhiivvoo aanneexxoo AAllooeennzziimmaass..xxllss.. EEnn llaa FFiigguurraa 22

Page 11: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

ssee mmuueessttrraa eell aannáálliissiiss ddee ccoonngglloommeerraaddooss ((ffeennooggrraammaa)) ddoonnddee ssee eemmpplleeóó eell UUPPGGAAccoommoo rreeggllaa ddee aammaallggaammiieennttoo yy llaa ddiissttaanncciiaa EEuucclliiddiiaannaa ccoommoo uunniiddaadd ddee lliiggaammiieennttoo..EEnn eell ffeennooggrraammaa rreessuullttaannttee ssee ppuueeddee oobbsseerrvvaarr qquuee llaa uunniiccaa ppoobbllaacciioonn qquuee sseemmuueessttrraa ccoommppaaccttaa eess llaa pprroovveenniieennttee ddee GGuuaayymmaass.. EEll rreessttoo ddee llooss iinnddiivviidduuoossaannaalliizzaaddooss ssee mmuueessttrraann ddiissppeerrssooss ,, lloo ccuuaall nnoo ppeerrmmiittee aaggrruuppaarrllooss eenn ppoobbllaacciioonneessggeennééttiiccaammeennttee sseeppaarraaddaass..

AANNAALLIISSIISS DDEELL PPOOLLIIMMOORRFFIISSMMOO DDEE LLAA LLOONNGGIITTUUDD DDEE FFRRAAGGMMEENNTTOOSS DDEERREESSTTRRIICCCCIIÓÓNN ((RRFFPPLL))..

LLooss rreessuullttaaddooss ddee llooss ppaattrroonneess eelleeccttrrooffoorrééttiiccooss ddee llaass 1111 eennzziimmaass ddeerreessttrriicccciióónn pprroobbaaddaass iinnddiiccaann qquuee nnoo ssee oobbttuuvviieerroonn ppaattrroonneess eelleeccttrrooffoorrééttiiccooss ccllaarroossyy aannaalliizzaabblleess yy ppoorr lloo ttaannttoo,, nnoo ffuuee ppoossiibbllee iinnccoorrppoorraarr eessttooss ddaattooss aa llaa bbaassee ddeeddaattooss.. LLaass ddiiggeessttiioonneess nnoo ggeenneerraarroonn ppaattrroonneess ddee bbaannddeeoo,, yy ssoollaammeennttee sseeoobbttuuvviieerroonn iimmáággeenneess nnoo ddiiggeerriiddaass oo ssoobbrree ddiiggeerriiddaass ddee llaass mmuueessttrraass ddee AADDNN.. PPoorrlloo ttaannttoo,, ssee pprroocceeddiióó aa hhaacceerr eell aannaalliissiiss ddeell ggeennoommaa ddee llaa aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa ((AA..vveennttrriiccoossuuss)),, aa ttrraavvééss ddee llaa aammpplliiffiiccaacciióónn aalleeaattoorriiaa ddee AADDNN ppoolliimmóórrffiiccoo ((RRAAPPDDSS)) ..

AAMMPPLLIIFFIICCAACCIIÓÓNN AALLEEAATTOORRIIAA DDEE AADDNN PPOOLLIIMMÓÓRRFFIICCOO ((RRAAPPDDSS))

DDee llaass 2200 sseeccuueenncciiaass aalleeaattoorriiaass pprroobbaaddaass ((TTaabbllaa 33)),, ssoolloo ddooss ddee eellllaass ((llaa 2288yy llaa 3300)) rriinnddiieerroonn ppaattrroonneess eelleeccttrrooffoorrééttiiccooss eenn ttooddaass llaass mmuueessttrraass,, ssiieennddoo eessttoossccllaarrooss yy aannaalliizzaabblleess ((FFiigguurraass 33 yy 44)).. EEnn ccoonnsseeccuueenncciiaa,, llooss rreessuullttaaddooss ddee lloossddiiffeerreenntteess ppaattrroonneess eelleeccttrrooffoorrééttiiccooss oobbtteenniiddooss ffiiuueerroonn aannaalliizzaaddooss mmeeddiiaannttee eell uussooddeell pprrooggrraammaa SSttaattiissttiiccaa ffoorr WWiinnddoowwss,, aapplliiccaannddoo uunn aannáálliissiiss ddee ccoonngglloommeerraaddoossuuttiilliizzaannddoo ccoommoo rreeggllaa ddee aammaallggaammaammiieennttoo UUPPGGAA yy ccoommoo uunniiddaadd ddee lliiggaammiieennttoo llaaEEuucclliiddiiaannaa .. LLooss ffeennooggrraammaass rreessuullttaanntteess ssee mmuueessttrraann eenn llaass FFiigguurraass 55,, 66 yy 77.. LLaabbaassee ddee ddaattooss ssee ggrraabbóó eenn uunn ddiisskkeettttee ((aanneexxoo)) bbaajjoo eell nnoommbbrree ddee OOlliiggooss..XXLLSS eennhhoojjaa ddee ccáállccuulloo EExxcceellll 55..00.. EEssttooss ffeennooggrraammaass iinnddiiccaann rreessuullttaaddooss ssiimmiillaarreess aa lloossaarrrroojjaaddooss ppoorr eell eessttuuddiioo ddee aallooeennzziimmaass mmaass ssiinn eemmbbaarrggoo,, ssee oobbsseerrvvaa uunn mmeejjoorraaggrruuppaammiieennttoo ccuuaannddoo eess uuttiilliizzaaddoo ccoommoo ““pprriimmeerr”” oo cceebbaaddoorr,, eell oolliiggoo nnúúmmeerroo 2288ppaarraa llaass ppoobbllaacciioonneess ddee GGuuaayymmaass yy BBaahhííaa ddee LLaa PPaazz.. EEnn eessttee ccaassoo,, llaassddiiffeerreenncciiaass ssoonn mmeennooss mmaarrccaaddaass eennttrree ggrruuppooss yy llooss nniivveelleess ddee ddiissiimmiilliittuudd ssoonnmmeennoorreess.. CCuuaannddoo ssee uussaa eell oolliiggoo 3300 ((FFiigguurraa 66)) oo llaa ccoommbbiinnaacciióónn ddee llooss oolliiggooss 2288 yy3300 ((FFiigguurraa 77)),, llooss rreessuullttaaddooss ssoonn ssiimmiillaarreess aa llooss oobbtteenniiddooss ccoonn aallooeennzziimmaass ddoonnddeellooss ggrruuppooss qquuee ssee ffoorrmmaann ssoonn hheetteeggooggéénneeooss yy nnoo ccoorrrreessppoonnddeenn ccoommoo bbllooqquueess aallaass llooccaalliiddaaddeess mmuueessttrreeaaddaass..

Page 12: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

DDIISSCCUUSSIIOONN..

LLooss rreessuullttaaddooss ddeell pprreesseennttee eessttuuddiioo ttaannttoo ddee aallooeennzziimmaass ccoommoo ddee RRAAPPDDSS,,iinnddiiccaann qquuee eexxiissttee uunnaa ggrraann vvaarriiaabbiilliiddaadd ggeennééttiiccaa eennttrree iinnddiivviidduuooss ddee llaa mmiissmmaaeessppeecciiee,, lloo qquuee nnoo ppeerrmmiittee sseeppaarraarr ccllaarraammeennttee ppoobbllaacciioonneess..

AA eexxcceeppcciióónn ddee llooss oorrggaanniissmmooss ddee GGuuaayymmaass ppaarraa aallooeennzziimmaass yy GGuuaayymmaassyy BBaahhííaa ddee LLaa PPaazz,, ppaarraa eell oolliiggoo 2288,, ddoonnddee llooss oorrggaanniissmmooss ssee eennccuueennttrraannaaggrruuppaaddooss,, eell rreessttoo ddee llooss iinnddiivviidduuooss ccoonnssiiddeerraaddooss eenn eessttee eessttuuddiioo aappaarreecceennddiissppeerrssooss eenn ttooddooss llooss ffeennooggrraammaass ssiinn ddeetteeccttaarrssee ddiiffeerreenncciiaass nnii eennttrree ppoobbllaacciioonneesssseeppaarraaddaass ggeeooggrrááffiiccaammeennttee ccoommoo llaass ddeell PPaaccííffiiccoo ddee BBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa ccoonnttrraa llaass ddeellGGoollffoo ddee CCaalliiffoorrnniiaa,, nnii eennttrree ppoobbllaacciioonneess ddiissttaanntteess ccoommoo llaass ddeell PPaaccííffiiccoo ddeeMMééxxiiccoo ccoonn llaass ddee EEccuuaaddoorr..

EExxiisstteenn ddooss ppoossiibblleess eexxpplliiccaacciioonneess aa lloo eennccoonnttrraaddoo.. LLaa pprriimmeerraa eess qquueeeexxiissttaa eeffeeccttiivvaammeennttee uunnaa aallttaa vvaarriiaabbiilliiddaadd ggeennééttiiccaa eennttrree iinnddiivviidduuooss pprroodduucciiddaa ppoorreell fflluujjoo ddee mmaatteerriiaall ggeennééttiiccoo eenn ttooddaa llaa rreeggiióónn,, lloo ccuuaall nnoo ppeerrmmiittee eell aaiissllaammiieennttooggeennééttiiccoo ddee llaass ppoobbllaacciioonneess.. UUnnaa ddee llaass rreeggiioonneess zzooooggeeooggrrááffiiccaass mmeejjoorreessttuuddiiaaddaass ddeell mmuunnddoo eess llaa rreeggiióónn PPaannáámmiiccaa ,, llaa ccuuaall ssee eexxttiieennddee ddeessddee CCaalliiffoorrnniiaaEEssttaaddooss UUnniiddooss ,, hhaassttaa PPeerrúú ((KKeeeenn,, 11997711)).. EEnn eessttaa zzoonnaa,, eess ccoommúúnn eennccoonnttrraarr llaassmmiissmmaass eessppeecciieess ddee llaa ccoossttaa PPaaccííffiiccoo ddee BBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa yy ddeell GGoollffoo ddee CCaalliiffoorrnniiaa,,eenn PPaannaammáá,, CCoossttaa RRiiccaa,, EEccuuaaddoorr yy PPeerrúú.. PPoossiibblleemmeennttee eessttoo ssee ddeebbaa aa llaaeexxiisstteenncciiaa ddee ppaattrroonneess cclliimmááttiiccooss ssiimmiillaarreess,, ppeerroo ssoobbrree ttooddoo aa llaa eexxiisstteenncciiaa ddeeccoorrrriieenntteess qquuee ffaavvoorreecceenn llaa ddeerriivvaa llaarrvvaall aa ggrraannddeess ddiissttaanncciiaass.. EEnn eell ccaassoo ddee llaaaallmmeejjaa ccaattaarriinnaa,, ffuuee ssoorrpprreennddeennttee hhaabbeerr eennccoonnttrraaddoo eejjeemmppllaarreess eenn llaa ppllaattaaffoorrmmaaccoonnttiinneennttaall ddee BBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa vviivviieennddoo aa 118800 mm ddee pprrooffuunnddiiddaadd,, yyaa qquuee eessttaaeessppeecciiee eerraa ccoonnssiiddeerraaddaa ccoommoo uunnaa eessppeecciiee ddee bbaahhííaa aall iigguuaall qquuee llaa eessppeecciieehhoommóóllooggaa ddeell AAttlláánnttiiccoo ddee AAmméérriiccaa llaa ““BBaayy SSccaalllloopp”” AArrggooppeecctteenn iirrrraaddiiaannss.. PPoorr lloottaannttoo,, eess ppoossiibbllee qquuee eessttaa eessppeecciiee ssee eennccuueennttrree ddiissttrriibbuuiiddaa eenn ffoorrmmaa ddee uunnaammeeggaappoobbllaacciióónn,, aa lloo llaarrggoo ddee llaa ccoossttaa ddeell PPaaccííffiiccoo aa ggrraannddeess pprrooffuunnddiiddaaddeess eennbbaannccooss nnoo ddeetteeccttaabblleess,, ffaavvoorreecciieennddoo llaa ddiissppeerrssiióónn ddeell mmaatteerriiaall ggeennééttiiccoo.. UUnnaaeevviiddeenncciiaa ccllaarraa ddee eessttoo aaddeemmááss ddee lloo qquuee ssuucceeddee eenn BBaahhííaa MMaaggddaalleennaa,, eess llaaooccuurrrreenncciiaa ddee jjuuvveenniilleess ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa eenn BBaahhííaa CCoonncceeppcciióónn yy eenn llaa BBaahhííaa ddeeBBaaccoocchhiibbaammppoo eenn GGuuaayymmaass,, ccuuaannddoo nnoo eexxiisstteenn rreepprroodduuccttoorreess nnii eenn llaass ccoossttaass nniiddeennttrroo ddee llaass BBaahhííaass..

LLaa oottrraa eexxpplliiccaacciióónn ppoossiibbllee aa llaa nnoo ddeetteecccciióónn ddee ddiiffeerreenncciiaass eennttrreeppoobbllaacciioonneess,, eess qquuee llaass ttééccnniiccaass eemmpplleeaaddaass eenn eessttee eessttuuddiioo nnoo hhaayyaann tteenniiddoo llaarreessoolluucciióónn ssuuffiicciieennttee ppaarraa ddeemmoossttrraarr llaass ddiiffeerreenncciiaass bbuussccaaddaass.. BBeeaauummoonntt ((11998822))llooggrróó ddiissttiinngguuiirr ccuuaannddoo mmeennooss ccuuaattrroo ppoobbllaacciioonneess ddeell ppeeccttíínniiddoo CChhllaammyyssooppeerrccuullaarriiss aaiissllaaddaass ggeennééttiiccaammeennttee eenn llaass iissllaass BBrriittáánniiccaass,, eemmpplleeaannddooaallooeennzziimmaass ccoommoo mmaarrccaaddoorreess ggeennééttiiccooss.. EEnn ssuu eessttuuddiioo,, ssee pprroobbaarroonn ccuuaattrroo lloocciippeerroo eell llooccuuss LLaapp ((lleeuucciinnee aammiinnooppeeppttiiddaassee)),, rreessuullttóó mmoonnoommoorrffiiccoo yy llaass vvaarriiaacciioonneessddee ffrreeccuueenncciiaa ddee llooss llooccii OOddhh yy PPgghh nnoo ccoonnttrriibbuuyyeerroonn aa llaa ddiiffeerreenncciiaacciióónn ddeeppoobbllaacciioonneess.. SSiinn eemmbbaarrggoo,, llaass ddiiffeerreenncciiaass ffuueerroonn ssoollaammeennttee eennccoonnttrraaddaass eenn llaass

Page 13: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

Tree Diagram for 149 Cases

Unweighted pair-group average

Euclidean distances

ISOENZIMAS

Link

age

Dis

tanc

e

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

S

I3

SI3

6

SI3

4

SI8

S

I5

SI4

S

I24

S

I23

S

I17

S

I10

S

I16

S

I9

SI2

1

SI7

S

I6

SI2

6

SI2

E

C2

E

C1

P

C4

G

U15

G

U8

G

U12

G

U11

G

U10

G

U7

G

U4

S

I27

G

U1

S

I19

G

U6

G

U3

G

U17

G

U2

G

U13

G

U18

G

U16

G

U22

G

U21

G

U28

G

U19

G

U26

G

U27

G

U24

G

U23

G

U20

G

U14

G

U29

G

U25

G

U9

G

U30

G

U5

S

I20

E

C8

B

P5

BP3

B

P4

BP2

B

P1

SI4

0

SI3

9

SI3

0

SI3

7

SI2

9

SI2

2

EC

6

PC

3

PC

2

SI2

8

PC

1

BC

8

BC

4

SI3

5

SI3

3

SI3

1

BM

5

BM

4

BC

9

SI1

4

SI1

5

SI1

3

SI1

2

SI1

1

SI3

2

SI2

5

EC

9

EC

4

EC

3

SI1

8

EC

18

BP2

6

BP2

1

EC

17

EC

16

EC

10

EC

7

EC

24

EC

11

EC

26

EC

25

EC

23

EC

22

EC

13

EC

12

EC

5

BP9

B

P8

BP2

2

BP7

B

M8

B

M3

B

C7

B

C6

E

C28

E

C21

E

C20

E

C19

E

C15

B

M7

B

M6

E

C30

E

C29

E

C27

E

C14

B

P14

B

P13

B

P12

S

I1

BP1

5

BP6

B

P24

B

P16

B

P19

B

M2

B

P20

B

C10

B

C5

B

C2

B

M1

B

P11

B

P28

B

P10

B

P23

B

P18

B

P17

B

C3

B

P27

B

P25

B

C1

Figura 2. Fenograma generado al realizar el análisis de conglomerados (CLUSTER) de todos los individuos analizados de almeja catarina(Argopecten ventricosus), en base a la actividad enzimatica. BM = Bahía Magdalena; BP = Bahía de La Paz; BC = Bahía Concepción; EC =Ecuador; GU = Guaymas; PC = Plataforma continental; SI = San Ignacio.

Page 14: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

TTaabbllaa 11.. EEnnzziimmaass sseelleecccciioonnaaddaass ppaarraa eell pprreesseennttee eessttuuddiioo yy ssuuss ssiisstteemmaass ddee ttiinncciióónn..

EEnnzziimmaa AAbbrreevviiaattuurraa NNúúmmeerroo EECC NNúúmmeerroo ddeelloocciisseeppaarraaddooss

SSiisstteemmaa ddee TTiinncciióónnaa

SSuuppeerróóxxiiddoo ddiissmmuuttaassaa SSOODD 11..1155..11..11 11 NNBBTT//rriibbooffllaavviinnEEsstteerraassaa EESSTT 33..11..11..33 44 NNaapphhttyyll aacceettaattee//FFaasstt

BBlluuee RRRRFFoossffoogglluuccoommuuttaassaa FFGGMM 55..44..22..22.. 11 GG11PP//GG66PPDDHH// MMTTTTFFoossffaattaassaa aallccaalliinnaa AALLPP 33..11..33..11 22 AAMMPP//pphheennooll rreeddLLaaccttaattoo ddeesshhiiddrrooggeennaassaa LLDDHH 11..11..11..2277 22 LLaaccttaattee//NNAADD//NNBBTTGGlluuccoossaa--66--ffoossffaattooddeesshhiiddrrooggeennaassaa

GG66PPDDHH 11..11..11..4499 11 GG66PP//NNAADDPP//MMTTTT

aa MMaanncchheennkkoo ((11999944))..

EEssttaass eennzziimmaass ssee sseelleecccciioonnaarroonn ppoorr sseerr llaass mmaass ffrreeccuueenntteemmeennttee uussaaddaass eenneessttuuddiiooss ppoobbllaacciioonnaalleess eenn mmoolluussccooss ppoorr oottrrooss aauuttoorreess..

UUnnaa vveezz tteeññiiddooss,, llooss ggeelleess ssee sseeccaarroonn dduurraannttee 2244 hhoorraass eenn mmeeddiioo ddee ddoosshhoojjaass ddee ppaappeell cceellooffaann.. PPoosstteerriioorrmmeennttee,, ssee oobbsseerrvvaarroonn llooss ggeelleess ssoobbrree uunnttrraannssiilluummiinnaaddoorr ddee lluuzz vviissiibbllee,, ssee ddeetteerrmmiinnoo eell nnúúmmeerroo yy ppoossiicciioonn ddee llaass bbaannddaasspprreesseenntteess ((aalleellooss)),, yy ssee lleess aassiiggnnóó uunn nnúúmmeerroo yy uunnaa lleettrraa aa ccaaddaa uunnaa ddee eellllaass..PPoosstteerriioorrmmeennttee,, llaa bbaassee ddee ddaattooss ddee eennzziimmaass,, ffuuee aannaalliizzaaddaa mmeeddiiaannttee eell pprrooggrraammaaSSttaattiissttiiccaa ppaarraa WWiinnddoowwss,, aapplliiccaannddoo uunn aannáálliissiiss ddee ccoonngglloommeerraaddooss ddoonnddee ssee uuttiilliizzóóeell ““UUnnwweeiigghhtteedd PPaaiirr--GGrroouupp AAvveerrggaaee”” ((UUPPGGAA)) ccoommoo rreeggllaa ddee aammaallggaammaammiieennttoo yy llaaddiissttaanncciiaa EEuucclliiddiiaannaa ccoommoo uunniiddaadd ddee lliiggaammiieennttoo..

AAIISSLLAAMMIIEENNTTOO DDEE AADDNN GGEENNÓÓMMIICCOO..

LLaass sseecccciioonneess ddee tteejjiiddoo ddee mmúússccuulloo aadduuccttoorr ssee ddiiggiirriieerroonn ccoonn uunn pprroonnaassaa aa4455°°CC eenn uunn bbaaññoo MMaarrííaa,, dduurraannttee ddooss hhoorraass,, aaggiittaannddoo eenn vvoorrtteexx ccaaddaa mmeeddiiaa hhoorraa..PPoosstteerriioorrmmeennttee ssee rreeaalliizzaarroonn ddooss eexxttrraacccciioonneess ccoonnsseeccuuttiivvaass ccoonn cclloorrooffoorrmmoo--aallccoohhooll iissooaammíílliiccoo ((2244::11)),, ppaarraa ppoosstteerriioorrmmeennttee pprreecciippiittaarr eell ssoobbrreennaaddaannttee ccoonn 22vvoollúúmmeenneess ddee eettaannooll aabbssoolluuttoo.. DDeessppuuééss ddee rreehhiiddrraattaarr llooss ppeelllleettss yy ssoommeetteerrllooss aa uunnttrraattaammiieennttoo ccoonn AARRNNaassaa,, ssee vvoollvviieerroonn aa rreeaalliizzaarr ddooss eexxttrraacccciioonneess ccoonnsseeccuuttiivvaassccoonn cclloorrooffoorrmmoo--aallccoohhooll iissooaammíílliiccoo ((2244::11)) yy ppoosstteerriioorrmmeennttee ssee llooggrróó ssuupprreecciippiittaacciióónn ccoonn ddooss vvoollúúmmeenneess ddee eettaannooll aabbssoolluuttoo.. EEll ppeelllleett oobbtteenniiddoo ssee llaavvóóddooss vveecceess ccoonn eettaannooll aall 7700 %%,, ppaarraa ffiinnaallmmeennttee rreessuussppeennddeerrlloo eenn bbuuffffeerr TTEE.. SSeeddeetteerrmmiinnoo llaa ccoonncceennttrraacciióónn yy ppuurreezzaa ddeell AADDNN mmeeddiiaannttee aannáálliissiisseessppeeccttrrooffoottoommééttrriiccoo aa 226600//228800 nnmm sseegguunn eell mmééttooddoo ddee WWaarrbbuurrgg--CChhrriissttiiaann ((11995522)),,ttoommaannddoo ccoommoo rreeffeerreenncciiaa 226600//228800 == 11..88 ccoommoo vvaalloorr ppaarraa uunn AADDNN ppuurroo.. VVaalloorreessssuuppeerriioorreess aa ééssttee,, ssuuggiirriieerroonn llaa pprreesseenncciiaa ddee AARRNN,, yy llooss iinnffeerriioorreess,, llaa pprreesseenncciiaaddee pprrootteeiinnaass.. AAddiicciioonnaallmmeennttee,, ssee rreeaalliizzóó uunn aannáálliissiiss ddeell AADDNN mmeeddiiaanntteeeelleeccttrrooffoorreessiiss eenn ggeelleess ddee aaggaarroossaa aall 00..88%%// TTBBEE aa ccaaddaa pprreeppaarraacciióónn.. LLaaeelleeccttrrooffoorreessiiss ssee lllleevvoo aa ccaabboo aa tteemmppeerraattuurraa aammbbiieennttee yy aa uunn vvoollttaajjee ccoonnssttaannttee ddee7700 VV.. LLooss ggeelleess rreessuullttaanntteess ffuueerroonn pprreetteeññiiddooss ccoonn EEttRRrr yy ppoosstteerriioorrmmeennttee ffuueerroonnaannaalliizzaaddooss bbaajjoo lluuzz uullttaavviioolleettaa eenn uunn ttrraannssiilluummiinnaaddoorr.. FFiinnaallmmeennttee,, ééssttooss sseeffoottooggrraaffiiaarroonn ddiiggiillttaallmmeennttee mmeeddiiaannttee uunn ssiisstteemmaa ddee ffoottooddooccuummeennttaacciióónn UUVVIITTEECC..

Page 15: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

Figura 3. Patrones electroforéticos de un gel obtenido con la técnicade RAPDS, al utilizar el oligo 28 como “primer”.

Page 16: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

Figura 4. Patrones electroforéticos de un gel obtenido con la técnicade RAPDS, al utilizar el oligo 30 como “primer”.

Page 17: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

Tree Diagram for 149 Cases

Unweighted pair-group average

Euclidean distances

Primer 28

Link

age

Dis

tanc

e

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

E

C24

E

C25

E

C28

E

C22

E

C23

E

C21

E

C20

E

C19

E

C30

E

C29

G

U8

E

C12

E

C1

S

I16

B

M8

E

C26

E

C3

B

M3

G

U20

G

U19

G

U18

G

U17

E

C6

S

I27

S

I30

E

C7

S

I12

S

I29

S

I24

S

I21

B

C2

G

U3

S

I25

E

C27

E

C5

B

M4

B

C1

G

U11

B

C6

B

C3

B

M2

S

I26

G

U16

G

U15

G

U13

S

I23

G

U12

G

U25

G

U14

G

U10

G

U28

S

I11

G

U30

G

U23

G

U29

G

U27

G

U26

G

U24

G

U22

S

I28

S

I22

G

U6

S

I6

SI3

S

I2

EC

16

EC

9

EC

8

EC

11

EC

4

EC

2

SI1

4

SI7

G

U4

B

P24

B

P20

S

I15

G

U5

S

I13

S

I10

S

I8

SI5

B

M7

B

M6

B

M5

E

C14

G

U21

G

U2

P

C4

P

C3

P

C2

P

C1

G

U9

G

U7

G

U1

B

P28

B

P27

B

P26

B

P25

B

P23

B

P22

B

P21

B

P19

B

P18

B

P17

B

P16

B

P15

B

P14

B

P13

B

P12

B

P11

P

B10

B

P9

BP8

B

P7

BP6

B

P5

BP4

B

P3

BP2

B

P1

SI2

0

SI1

9

SI1

8

SI1

7

SI9

S

I1

BC

10

BC

9

BC

8

BC

7

BC

5

BC

4

SI4

E

C18

E

C17

E

C15

E

C13

E

C10

B

M1

Figura 5. Fenograma generado al realizar el análisis de conglomerados (CLUSTER) de todos los individuos de almeja catarina (Argopectenventricosus) analizados, utilizando como “primer” el oligo 28 con la técnica de RAPDS. BM = Bahía Magdalena; BP = Bahía de La Paz; BC =Bahía Concepción; EC = Ecuador; GU = Guaymas; PC = Plataforma continental; SI = San Ignacio.

Page 18: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

Tree Diagram for 140 Cases

Unweighted pair-group average

Euclidean distances

PRIMER 30

Link

age

Dis

tanc

e

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

E

C29

E

C21

G

U10

G

U8

S

I19

E

C17

G

U12

E

C30

G

U11

E

C19

E

C20

E

C15

G

U23

G

U16

E

C25

S

I23

E

C24

E

C18

S

I28

S

I24

S

I4

BC

4

EC

22

EC

10

EC

4

EC

23

EC

7

EC

6

EC

9

EC

5

GU

13

BM

6

BP2

2

EC

26

BM

7

BM

5

GU

4

GU

3

GU

7

BP1

5

GU

1

GU

15

GU

2

GU

19

SI2

0

SI1

3

BP2

4

BP2

1

GU

26

BP1

9

BP1

7

BP2

5

BP1

8

BP1

4

SI1

6

SI1

2

SI1

4

SI1

1

BC

1

SI2

2

SI1

7

SI2

1

SI1

5

SI1

0

SI8

B

P20

G

U20

E

C28

E

C1

G

U5

G

U18

E

C14

E

C13

G

U27

B

P26

E

C12

E

C11

P

C4

P

C3

P

C2

P

C1

G

U30

G

U29

G

U28

G

U25

G

U24

B

P28

B

P27

B

P23

B

P13

B

P12

B

P11

P

B10

B

P9

BP8

B

P7

BP6

B

P5

BP4

B

P3

BP2

B

P1

SI1

8

SI9

S

I7

SI3

S

I2

SI1

B

C10

B

C9

B

C8

B

C7

B

C6

B

C5

B

C3

B

C2

B

M8

B

M4

B

M3

E

C8

E

C3

E

C2

G

U17

S

I5

GU

6

SI6

E

C27

G

U14

G

U22

G

U21

B

P16

S

I30

S

I29

S

I26

S

I27

S

I25

B

M2

G

U9

E

C16

B

M1

Figura 6. Fenograma generado al realizar el análisis de conglomerados (CLUSTER) de todos los individuos de almeja catarina (Argopectenventricosus) analizados, utilizando como primer el oligo 30 con la técnica de RAPDS. BM = Bahía Magdalena; BP = Bahía de La Paz; BC =Bahía Concepción; EC = Ecuador; GU = Guaymas; PC = Plataforma continental; SI = San Ignacio.

Page 19: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

Tree Diagram for 140 Cases

Unweighted pair-group average

Euclidean distances

PRIMER 28 Y 30

Link

age

Dis

tanc

e

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

E

C29

E

C25

E

C21

E

C30

G

U11

E

C20

E

C19

G

U12

G

U10

G

U8

S

I19

E

C17

E

C23

E

C22

E

C24

S

I23

E

C18

E

C10

E

C4

G

U23

G

U16

S

I28

S

I24

S

I4

BC

4

EC

8

EC

7

EC

6

EC

9

EC

5

GU

13

BM

6

GU

7

GU

1

BP2

2

GU

4

GU

3

EC

26

BM

7

BM

5

EC

28

GU

2

BP1

5

GU

15

GU

19

SI2

0

SI1

3

EC

15

BC

1

GU

26

BP2

4

BP2

1

BP1

9

BP1

7

BP2

5

BP1

8

BP1

4

SI1

6

SI1

2

SI1

4

SI1

1

SI2

2

SI1

7

SI2

1

SI1

5

SI1

0

SI8

B

P20

G

U20

E

C1

G

U18

G

U5

E

C14

E

C13

E

C12

G

U27

B

P26

E

C11

G

U28

G

U25

G

U30

G

U29

G

U24

S

I3

SI2

S

I7

PC

4

PC

3

PC

2

PC

1

BP2

8

BP2

7

BP2

3

BP1

3

BP1

2

BP1

1

PB1

0

BP9

B

P8

BP7

B

P6

BP5

B

P4

BP3

B

P2

BP1

S

I18

S

I9

SI1

B

C10

B

C9

B

C8

B

C7

B

C5

B

C2

B

C6

B

C3

B

M4

B

M8

B

M3

E

C3

E

C2

G

U14

G

U22

G

U21

B

P16

S

I30

S

I29

S

I26

G

U17

S

I5

GU

6

SI6

E

C27

S

I27

S

I25

B

M2

G

U9

E

C16

B

M1

Figura 7. Fenograma generado al realizar el análisis de conglomerados (CLUSTER) de todos los individuos de almeja catarina (Argopectenventricosus) analizados, utilizando como primers los oligos 28 y 30 con la técnica de RAPDS. BM = Bahía Magdalena; BP = Bahía de La Paz; BC= Bahía Concepción; EC = Ecuador; GU = Guaymas; PC = Plataforma continental; SI = San Ignacio.

Page 20: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

ffrreeccuueenncciiaass ddee ttrreess aalleellooss eenn eell llooccuuss pprrootteeiiccoo PPtt--AA.. EEll aalleelloo PPtt--AA 33 ffuuee eell mmaassffrreeccuueennttee eenn eell mmaarr ddee IIrrllaannddaa yy eenn aallgguunnaass ppoobbllaacciioonneess ddeell ccaannaall ddee llaa MMaanncchhaa..PPtt--AA2 ffuuee eell mmaass ccoommuunn eenn eell nnoorrttee,, yy eell llooccuuss PPtt--AA1 eenn llaa ccoossttaa ooeessttee ddee FFrraanncciiaaee IIrrllaannddaa.. SSiinn eemmbbaarrggoo eenn PPeecctteenn mmaaxxiimmuuss qquuee ssee ddiissttrriibbuuyyee eenn llaa mmiissmmaa rreeggiióónnqquuee CC.. ooppeerrccuullaarriiss,, nnoo ssee eennccoonnttrróó ddiiffeerreenncciiaacciióónn ggeennééttiiccaa eenn mmuueessttrraassccoolleeccttaaddaass aa lloo llaarrggoo ddee EEssccoocciiaa,, IIrrllaannddaa yy BBrreettaaññaa ,, uussaannddoo 99 llooccii ppoolliimmoorrffiiccooss((HHuueellvvaann,, 11998855)).. EEssttoo iilluussttrraa uunnoo ddee llooss pprroobblleemmaass iinnhheerreenntteess aa llooss eessttuuddiiooss ddeeggeennééttiiccaa ppoobbllaacciioonnaall.. PP.. mmaaxxiimmuuss yy CC.. ooppeerrccuullaarriiss ttiieenneenn uunnaa vviiddaa llaarrvvaall ppeelláággiiccaa yyhháábbiittaattss ssiimmiillaarreess eenn llaa ffaassee aadduullttaa yy eenn ccoonnsseeccuueenncciiaa ssee eessppeerraarrííaa qquuee PP..mmaaxxiimmuuss eessttuuvviieessee ttaammbbiiéénn aaiissllaaddaa ggeeooggrrááffiiccaammeennttee.. PPoorr lloo ttaannttoo,, eell nnoo hhaabbeerrppooddiiddoo ddeemmoossttrraarr llaa ddiiffeerreenncciiaacciióónn ppoobbllaacciioonnaall eenn llooss llooccii pprroobbaaddooss,, nnooddeemmuueessttrraa qquuee llaass ppoobbllaacciioonneess nnoo eessttáánn aaiissllaaddaass.. LLaa iinncclluussiióónn aall aazzaarr ddeessoollaammeennttee uunn llooccuuss,, ccoommoo PPtt--AA eenn CC.. ooppeerrccuullaarriiss,, ddoonnddee llaa ddiiffeerreenncciiaacciióónnppoobbllaacciioonnaall eess eevviiddeennttee,, mmooddiiffiiccaarráá iinnmmeeddiiaattaammeennttee llaass ccoonncclluussiioonneess.. PPoorr lloo ttaannttoo,,eess nneecceessaarriioo oobbtteenneerr mmaass ddaattooss ppaarraa tteenneerr rreessuullttaaddooss ccoonncclluuyyeenntteess..

2 1

LLaa úúnniiccaa eevviiddeenncciiaa ddee qquuee eexxiissttaann ppoobbllaacciioonneess sseeppaarraaddaass ddee aallmmeejjaaccaattaarriinnaa ssee eennccuueennttrraa eenn uunn eessttuuddiioo ccoommppaarraattiivvoo ddee ccrreecciimmiieennttoo yy ssuuppeerrvviivveenncciiaaddee eessttaa eessppeecciiee pprroodduucciiddaa eenn eell llaabboorraattoorriioo,, aa ppaarrttiirr ddee pprrooggeenniittoorreess ddee BBaahhííaaMMaaggddaalleennaa ((ccoossttaa ddeell PPaaccííffiiccoo)),, BBaahhííaa CCoonncceeppcciióónn ((GGoollffoo ddee CCaalliiffoorrnniiaa)) yy ddee ssuussccrruuzzaass rreeccíípprrooccaass ((CCrruuzz,, 11999977)).. EEssttee aauuttoorr,, ddeemmoossttrróó qquuee llaass aallmmeejjaass ddeepprrooggeenniittoorreess ddee BBaahhííaa CCoonncceeppcciióónn yy ddee llaass ccrruuzzaass rreeccíípprrooccaass,, ttuuvviieerroonn eell mmiissmmooccrreecciimmiieennttoo yy ssuuppeerrvviivveenncciiaa qquuee llaass ddee pprrooggeenniittoorreess ddee BBaahhííaa MMaaggddaalleennaa ccuuaannddoossee ccuullttiivvaarroonn eenn eessee ssiittiioo.. SSiinn eemmbbaarrggoo,, eell ccrreecciimmiieennttoo yy llaa ssuuppeerrvviivveenncciiaa ddeeaallmmeejjaass ccuullttiivvaaddaass eenn BBaahhííaa CCoonncceeppcciióónn ddee pprrooggeenniittoorreess ddee BBaahhííaa MMaaggaaddaalleennaa yyllaass ccrruuzzaass rreeccíípprrooccaass,, ffuueerroonn ssiiggnniiffiiccaattiivvaammeennttee mmeennoorreess aa llooss rreeggiissttrraaddooss eennaallmmeejjaass ddee pprrooggeenniittoorreess ddee BBaahhííaa CCoonncceeppcciióónn,, lloo ccuuaall iinnddiiccaa qquuee eexxiisstteennddiiffeerreenncciiaass eenn llaa tteerrmmoottoolleerraanncciiaa ddee aammbbaass ppoobbllaacciioonneess ddeebbiiddoo ppoossiibblleemmeennttee aaffaaccttoorreess hheerreeddaaddooss..

CCoonn eessttooss aanntteecceeddeenntteess,, sseerrííaa ccoonnvveenniieennttee pprroobbaarr eenn llaa aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa,, eellmmaayyoorr nnúúmmeerroo ddee eennzziimmaass ppoossiibbllee iinncclluuyyeennddoo llaa PPtt--AA yy//oo eemmpplleeaarr oottrraammeettooddoollooggííaa mmaass eessppeecciiffiiccaa ccoommoo sseerrííaa llaa sseeccuueenncciiaacciióónn ddee AADDNN..

CCoonn llooss rreessuullttaaddooss aanntteerriioorreess nnoo rreessuullttaa ccoonnvveenniieennttee eemmiittiirr aallgguunnaarreeccoommeennddaacciióónn ssoobbrree eell mmaanneejjoo ddee llaa eessppeecciiee eenn BBaahhííaa MMaaggddaalleennaa,, ttooddaa vveezz qquueennoo ffuuee ppoossiibbllee ddeemmoossttrraarr ssuu cceerrccaannííaa ffiillooggeennééttiiccaa ccoonn llaass ppoobbllaacciioonneess ddee llaaPPllaattaaffoorrmmaa CCoonnttiinneennttaall..

Page 21: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

CCOONNCCLLUUSSIIOONNEESS..

11..-- EExxiissttee uunnaa ggrraann vvaarriiaabbiilliiddaadd ggeennééttiiccaa eennttrree iinnddiivviidduuooss ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaapprroovveenniieenntteess ddee llaass ddiissttiinnttaass ppoobbllaacciioonneess ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa ddiissttrriibbuuííddaass ddeessddee eellPPaaccííffiiccoo ddee BBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa hhaassttaa EEccuuaaddoorr..

22..-- LLooss iinnddiivviidduuooss ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa ddee GGuuaayymmaass yy LLaa PPaazz ffuueerroonn llooss úúnniiccoosseejjeemmppllaarreess qquuee aall ppaarreecceerr eessttáánn aaggrruuppaaddooss eenn uunnaa ppoobbllaacciioonn ggeennééttiiccaammeenntteeddiissttiinnttaa..

33..-- CCoonn eell mmaarrccoo ddee rreeffeerreenncciiaa ppllaanntteeaaddoo eenn eessttee eessttuuddiioo,, nnoo eess ppoossiibblleerreeccoommeennddaarr aacccciioonneess ddee aaddmmiinnssiittrraacciióónn ddee llaa ppeessqquueerrííaa ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa eennBBaahhííaa MMaaggddaalleennaa ,, ddaaddoo qquuee nnoo ffuuéé ppoossiibbllee ddeemmoossttrraarr llaa cceerrccaannííaa ffiillooggeennééttiiccaaeennttrree ppoobbllaacciioonneess ddee eessttaa BBaahhííaa ccoonn llaass ddee llaa PPllaattaaffoorrmmaa CCoonnttiinneennttaall..

RREEFFEERREENNCCIIAASS

BBeeaauummoonntt,, AA..RR..,, 11998822,, GGeeooggrraapphhiicc vvaarriiaattiioonn iinn aalllleellee ffrreeqquueenncciieess aatt tthhrreeee llooccii iinnCChhllaammyyss ooppeerrccuullaarriiss ffrroomm NNoorrwwaayy ttoo tthhee BBrriittttaannyy ccooaasstt.. JJ..MMaarr.. BBiiooll.. AAssss.. UUKK..,, 6622::224433--226611

CCrruuzz--HHeerrnnaannddeezz,, PP..,, 11999977.. AAnnáálliissiiss ccoommppaarraattiivvoo ddeell ccrreecciimmiieennttoo yy ssuuppeerrvviivveenncciiaaddee ddooss ppoobbllaacciioonneess ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa AArrggooppeecctteenn vveennttrriiccoossuuss ((SSoowweerrbbyy IIII,, 11884422))yy ssuuss ccrruuzzaass rreeccíípprrooccaass eenn BBaajjaa CCaalliiffoorrnniiaa SSuurr.. TTeessiiss ddee MMaaeessttrrííaa,, CCIICCIIMMAARR,, IIPPNN,,MMeexx.. 8855 pppp..

DDaavviiss,, ((11996644))

HHuueellvvaann,, SS..,, 11998855.. VVaarriiaabbiilliittéé ggéénnééttiiqquuee ddee ppooppuullaattiioonnss ddee PPeecctteenn mmaaxxiimmuuss LL.. EEnnBBrreettaaggnnee.. TThhééssee dduu DDooccttoorraatt ddee 33eme CCyyccllee UUnniivveerrssiittéé ddee BBrreettaaggnnee OOcccciiddeennttaallee,,BBrreesstt,, FFrraannccee.. 119966pppp..

eme

KKeeeenn,, MM..,, 11997711.. SSeeaa sshheellllss ooff ttrrooppiiccaall wweesstt AAmmeerriiccaa.. 22nndd.. eedd.. SSttaannffoorrddxx UUnniivveerrssiittyyPPrreessss.. SSttaannffoorrdd,, CCaalliiffoorrnniiaa,, 11006644 pppp..

KKooeehhnn ,, RR..KK..,, HHaallll,, JJ..GG..,, IInnnneess,, DD..JJ.. yy ZZeerraa,, AA..JJ..,, 11998844.. GGeenneettiicc ddiiffffeerreenncciiaattiioonn ooffMMyyttiilluuss eedduulliiss iinn eeaasstteerrnn NNoorrtthh AAmmeerriiccaa.. MMaarriinnee BBiioollooggyy,, 7799::111177--112266..

LLoowwrryy ((11995511)),,

MMaaeeddaa--MMaarrttíínneezz,, AA..NN..,, RReeyynnoossoo,, TT..,, SSoollííss,, FF..,, LLeeiijjaa,, AA..,, AAuurriioolleess,, DD..,, LLlluucchh,, DD..,,SSaalliinnaass,, CC..,, OOrrmmaarrtt,, PP.. yy FFéélliixx.. EE..,, 11999933.. AA mmooddeell ttoo eexxppllaaiinn tthhee ffoorrmmaattiioonn ooff

Page 22: ALMEJA CATARINA - Gobierno | gob.mx

ccaattaarriinnaa ssccaalllloopp ((AArrggooppeecctteenn cciirrccuullaarriiss)) bbeeddss iinn MMaaggddaalleennaa BBaayy,, MMeexxiiccoo.. AAqquuaacc.. &&FFiisshh.. MMaannaaggeemmeenntt.. 2244,, 332233--333399..

MMaanncchheennkkoo,, GG..PP.. 11999944.. HHaannddbbooookk ooff ddeetteeccttiioonn ooff eennzzyymmeess oonn eelleeccrroopphhoorreettiicc ggeellss..CCRRCC PPrreessss BBooccaa RRaattoonn,, FFLL..,, 334411pppp

MMaatthheerrss,, NN..FF..,, 11997755.. EEnnvviirroonnmmeennttaall vvaarriiaabbiilliittyy aatt tthhee pphhoosspphhoogglluuccoossee iissoommeerraasseellooccuuss iinn tthhee ggeennuuss CChhllaammyyss.. BBiioocchheemm.. SSyysstt.. EEccooll..,, 33:: 112233--112277..

RRííooss,, CC..,, SSaannzz,, SS.. yy PPeeññaa,, JJ..BB..,, 11999999.. GGeenneettiicc rreellaattiioonnsshhiippss bbeettwweeeenn ppooppuullaattiioonnssooff PPeecctteenn jjaaccoobbaaeeuuss aanndd PPeecctteenn mmaaxxiimmuuss.. 1122tthh IInntteerrnnaattiioonnaall PPeeccttiinniidd WWoorrkksshhoopp..55--1111 MMaayy 11999999,, bbeerrggeenn NNoorrwwaayy.. ((AAbbssttrraacctt)) 11pppp..

SSkkiibbiinnsskkyy,, DD..OO..FF..,, BBeeaarrddmmoorree,, JJ..AA.. yy AAhhmmaadd,, MM..,, 11997788.. GGeenneettiicc aaiiddss ttoo tthhee ssttuuddyyooff cclloosseellyy rreellaatteedd ttaaxxaa ooff tthhee ggeennuuss MMyyttiilluuss.. IInn:: BBaattttaagglliiaa,, BB.. aanndd BBeeaarrddmmoorree,, JJ..AA..((EEddiittoorrss)),, MMaarriinnee OOrrggaanniissmmss,, GGeenneettiiccss,, EEccoollooggyy aanndd EEvvoolluuttiioonn,, PPlleennuumm PPrreessss,,NNeeww YYoorrkk,, 446699--448866..

VVaarrvviioo,, SS..LL..,, KKooeehhnn,, RR..KK..,, yy VVääiinnööllää ,, RR..,, 11998888.. EEvvoolluuttiioonnaarryy ggeenneettiiccss ooff tthhee MMyyttiilluusseedduulliiss ccoommpplleexx iinn tthhee NNoorrtthh AAttllaannttiicc rreeggiioonn.. MMaarr.. BBiiooll..,, 9988:: 5511--6600..

WWaarrbbuurrgg--CChhrriissttiiaann ((11995522))..

AAGGRRAADDEECCIIMMIIEENNTTOOSS::LLooss aauuttoorreess ddee eessttee ttrraabbaajjoo aaggrraaddeecceenn aall CCeennttrroo NNaacciioonnaall ddee AAccuuiiccuullttuurraa eeIInnvveessttiiggaacciioonneess MMaarriinnaass ((CCEENNAAIIMM--EESSPPOOLL)) ddee EEccuuaaddoorr,, yy eenn ppaarrttiiccuullaarr aall AAccuuiicc..PPaabblloo LLoommbbeeiiddaa ppoorr llaa ddoonnaacciióónn ddee llaass mmuueessttrraass ddee aallmmeejjaa ccaattaarriinnaa pprroovveenniieenntteessddee GGuuaayyaaqquuiill EEccuuaaddoorr..