Algoritmo para Estimar la Edad Ósea, Diapositivas Exposición.
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ALGORITMO PARA ESTIMAR LA EDAD ÓSEA EN NIÑOS DE LA PRIMERA INFANCIA MEDIANTE PROCESAMIENTO DE
IMÁGENES RADIOLÓGICAS DE MANO Y MUÑECA
AUTORES ANDRÉS ROBERTO DÍAZ PASCUAS
DAVID LEONARDO TORRES RODRÍGUEZ
DIRECTOR ING ASTRID RUBIANO FONSECA
GRUPO DE INVESTIGACIÓN TIGUM PROGRAMA DE INGENIERÍA EN TELECOMUNICACIONES
UNIVERSIDAD MILITAR NUEVA GRANADA BOGOTÁ D.C
24/11/2011
AGENDA
PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA 1
2
OBJETIVOS 2
JUSTIFICACIÓN 3
ANTECEDENTES 4
MARCO TEORICO 5
CONCLUSIONES 7
DESARROLLO DEL PROYECTO 6
PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA
3
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
TRANSTORNOS DEL CRECIMIENTO ESTIMACIÓN DE EDAD
ÓSEA DEMANDA COMPLEJIDAD
EN EL PROCESO
¿Qué algoritmo permite la estimación de la edad ósea mediante procesamiento de
imágenes radiológicas de mano y muñeca facilitando el diagnóstico del profesional
en el área?
OBJETIVO GENERAL
4
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Desarrollar un algoritmo que logre estimar la edad ósea en niños de la primera infancia comprendida entre los cero y seis años, mediante el procesamiento de imágenes radiológicas de mano y muñeca.
OBJETIVOS ESPECÍFICOS
5
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Realizar una recopilación de imágenes radiológicas de mano y muñeca con el fin de elaborar una base de datos.
Identificar las técnicas a emplear en el procesamiento de imágenes radiológicas.
Definir el algoritmo a emplear para la estimación de edad ósea.
Validar el algoritmo definido, mediante la experimentación con imágenes radiológicas de mano y muñeca de niños de la primera infancia, evaluando los resultados obtenidos con los métodos de diagnóstico tradicionales.
JUSTIFICACIÓN
6
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
ASPECTO TECNOLÓGICO
• Asistencia tecnológica en estimación de edad ósea
ASPECTO SOCIAL
• Agilizar el proceso de cálculo de la estimación de edad ósea
ANTECEDENTES
7
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
2007 2008 2009 2010 2001
MARCO TEÓRICO
8
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
ANATOMIA ÓSEA DE LA MANO Y MUÑECA
METODOS DE ESTIMACIÓN DE LA EDAD ÓSEA
9
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
METODO DE TANNER AND WHITEHOUSE
METODO DE GREULICH PYLE
OPERACIONES CON HISTOGRAMA
10
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
ECUALIZACIÓN
El histograma de una imagen es una función discreta que representa el número de pixeles en la imagen en función de los niveles de intensidad
OPERACIONES CON HISTOGRAMA
11
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
MATCHING
Imagen e histograma original
Imagen e histograma de referencia
Histograma resultante
DETECCIÓN DE BORDES
12
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Borde: Transición o frontera con niveles de intensidad significativamente distintos
Detección de bordes usando el algoritmo de Canny
OPERACIONES MORFOLÓGICAS
13
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
DILATACIÓN
El objeto original (a) es dilatado por un elemento estructural (b) y
genera un nuevo objeto expandido (c)
OPERACIONES MORFOLÓGICAS
14
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
EROSIÓN
El objeto original (a) es erosionado por un elemento estructural (b) y
genera un nuevo objeto con elementos eliminados (c)
COMPONENTES CONECTADOS
15
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
IMAGEN BINARIZADA IMAGEN CON COMPONENTES
CONECTADOS
DESARROLLO DEL PROYECTO
16
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Documentación
Análisis de las técnicas de
procesamiento de imágenes médicas
Recopilación de carpogramas
Almacenamiento y Clasificación de los
carpogramas
Diseño del algoritmo
Implementación del algoritmo
Evaluación del algoritmo
Análisis y validación de los
resultados
DESARROLLO DEL PROYECTO
17
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Documentación
Análisis de las técnicas de
procesamiento de imágenes médicas
Recopilación de carpogramas
Almacenamiento y Clasificación de los
carpogramas
Diseño del algoritmo
Implementación del algoritmo
Evaluación del algoritmo
Análisis y validación de los
resultados
DOCUMENTACIÓN
18
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
FUENTES PRIMARIAS
Dr. Danilo Cifuentes B. Médico Radiólogo del Hospital Militar Central
Ing. Cesar Leonardo Niño Barrera: Profesor Asociado del Departamento de Electrónica de la Universidad Javeriana
FUENTES SECUNDARIAS
Buscadores específicos como Google Scholar, Pubmed y Scirus
Bases de datos en línea como: IEEE Xplore, ScienceDirect, Redalyc e Image Sciences Institute
Libros de referencia citados en varios artículos los cuales se ubicaron principalmente en Google Books.
Encontrándose un total de 83 artículos y 3 tesis relacionadas directamente con el tema, de las cuales 54 se citan en un documento de revisión desarrollado por los autores.
DESARROLLO DEL PROYECTO
19
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Documentación
Análisis de las técnicas de
procesamiento de imágenes médicas
Recopilación de carpogramas
Almacenamiento y Clasificación de los
carpogramas
Diseño del algoritmo
Implementación del algoritmo
Evaluación del algoritmo
Análisis y validación de los
resultados
ANÁLISIS DE LAS TÉCNICAS
20
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
EXTRACCIÓN DE LA REGIÓN DE INTERÉS
PRE-PROCESAMIENTO
SEGMENTACIÓN
EXTRACCIÓN DE CARACTERÍSTICAS
CLASIFICACIÓN Y ESTIMACIÓN EDAD ÓSEA
ANÁLISIS DE LAS TÉCNICAS
21
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
EXTRACCIÓN DE LA REGIÓN DE INTERÉS
(a) Extracción manual de la (b) Región de interés
ANÁLISIS DE LAS TÉCNICAS
22
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
PRE - PROCESAMIENTO
a) Filtro de mediana
b) Ajuste de la imagen
c) Ecualización de histograma
d) Matching
ANÁLISIS DE LAS TÉCNICAS
23
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
SEGMENTACIÓN
a) Detección de bordes usando el algoritmo de Canny
b) Operación morfológica de llenado
c) Operación morfológica de apertura
ANÁLISIS DE LAS TÉCNICAS
24
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
EXTRACCIÓN DE
CARACTERÍSTICAS
1068 pixeles
𝑝𝑖𝑥𝑒𝑙𝑒𝑠
1𝑚𝑚=
1068 𝑝𝑖𝑥𝑒𝑙𝑒𝑠
153.2 𝑚𝑚
𝑝𝑖𝑥𝑒𝑙𝑒𝑠
1𝑚𝑚= 6,97
𝑝𝑖𝑥𝑒𝑙𝑒𝑠𝑚𝑚
153.2mm
𝑝𝑖𝑥𝑒𝑙𝑒𝑠
1𝑚𝑚=
𝐴𝑛𝑐ℎ𝑜 𝑑𝑒 𝑙𝑎 𝑖𝑚𝑎𝑔𝑒𝑛 𝑑𝑖𝑔𝑖𝑡𝑎𝑙 𝑒𝑛 𝑝𝑖𝑥𝑒𝑙𝑒𝑠
𝐴𝑛𝑐ℎ𝑜 𝑟𝑒𝑎𝑙 𝑑𝑒 𝑙𝑎 𝑖𝑚𝑎𝑔𝑒𝑛 𝑒𝑛 𝑚𝑖𝑙í𝑚𝑒𝑡𝑟𝑜𝑠
ANÁLISIS DE LAS TÉCNICAS
25
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
CLASIFICACIÓN Y ESTIMACIÓN EDAD ÓSEA
Longitud del eje mayor y área
DESARROLLO DEL PROYECTO
26
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Documentación
Análisis de las técnicas de
procesamiento de imágenes médicas
Recopilación de carpogramas
Almacenamiento y Clasificación de los
carpogramas
Diseño del algoritmo
Implementación del algoritmo
Evaluación del algoritmo
Análisis y validación de los
resultados
RECOPILACIÓN DE CARPOGRAMAS
27
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
se recopilaron 283 imágenes de
las cuales 62 corresponden a
niños colombianos
DESARROLLO DEL PROYECTO
28
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Documentación
Análisis de las técnicas de
procesamiento de imágenes médicas
Recopilación de carpogramas
Almacenamiento y Clasificación de los
carpogramas
Diseño del algoritmo
Implementación del algoritmo
Evaluación del algoritmo
Análisis y validación de los
resultados
ALMACENAMIENTO DE CARPOGRAMAS
29
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
ALMACENAMIENTO DE CARPOGRAMAS
30
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
BASE DE DATOS
RECOPILACIÓN DE CARPOGRAMAS
31
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
FORMULARIO DE INGRESO A LA BASE DE DATOS
MEDIANTE USUARIO Y CONTRASEÑA
ALMACENAMIENTO DE CARPOGRAMAS
32
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
FORMULARIO DE INGRESO DE INFORMACIÓN DE LA IMAGEN
ALMACENAMIENTO DE CARPOGRAMAS
33
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
FORMULARIO DE INGRESO DE LA IMAGEN
RECOPILACIÓN DE CARPOGRAMAS
34
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
FORMULARIO DE CONSULTA
DESARROLLO DEL PROYECTO
35
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Documentación
Análisis de las técnicas de
procesamiento de imágenes médicas
Recopilación de carpogramas
Almacenamiento y Clasificación de los
carpogramas
Diseño del algoritmo
Implementación del algoritmo
Evaluación del algoritmo
Análisis y validación de los
resultados
DESARROLLO DEL PROYECTO
36
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Documentación
Análisis de las técnicas de
procesamiento de imágenes médicas
Recopilación de carpogramas
Almacenamiento y Clasificación de los
carpogramas
Diseño del algoritmo
Implementación del algoritmo
Evaluación del algoritmo
Análisis y validación de los
resultados
IMPLEMENTACIÓN DEL ALGORITMO
37
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
IMPLEMENTACIÓN DEL ALGORITMO
38
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
IMPLEMENTACIÓN DEL ALGORITMO
39
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
DESARROLLO DEL PROYECTO
40
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Documentación
Análisis de las técnicas de
procesamiento de imágenes médicas
Recopilación de carpogramas
Almacenamiento y Clasificación de los
carpogramas
Diseño del algoritmo
Implementación del algoritmo
Evaluación del algoritmo
Análisis y validación de los
resultados
EVALUACIÓN DEL ALGORITMO
41
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Constantes
• Resolución de la imagen
• Escala de la imagen
Independientes
• Longitud del eje mayor
• Áreas
Dependientes
• Edad ósea
DISEÑO DEL EXPERIMENTO – VARIABLES DE INGENIERIA
DISEÑO DEL EXPERIMENTO
42
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
TAMAÑO MUESTRAL IDEAL
Población Total: 3’062.311
Nivel de confianza: 95%
Precisión: 3%
Proporción: 5%
Tamaño Muestral: 203
DISEÑO DEL EXPERIMENTO
43
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Edad Biológica
Peso y talla adecuado
según tablas de crecimiento
OMS
Primera estimación
Dr. Miguel Hernando
Ángel (IDIME).
Método Greulich y
Pyle
Segunda estimación
Dr. Danilo Cifuentes del
(Hospital Militar)
método de Greulich y
Pyle,
procedimiento doble ciego
Tercera estimación
Mediante la aplicación en
Matlab usando criterios de longitud de eje mayor y
área
DISEÑO DEL EXPERIMENTO
44
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
EXTRACCIÓN DE CARACTERÍSTICAS DE POBLACIÓN BASE
(14 Imágenes de niños con peso y talla adecuado)
Rango de Valores
Sumatoria de Longitud del
Eje Mayor (mm)
Sumatoria de Áreas
(mm^2)
Menor a 1 Año y 6
Meses x≤13,9 x’≤460
2 Años 13,9<x≤16 460<x’≤564
2 Años 6 Meses 16<x≤19 564<x’≤700
3 Años 19<x≤29 700<x’≤1150
3 Años 6 Meses 29<x≤37 1150<x’≤1250
4 Años 37<x≤42 1250<x’≤1700
5 Años 42<x≤53 1700<x’≤1900
6 Años 53<x≤62 1900<x’≤2300
DISEÑO DEL EXPERIMENTO
45
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
DISTRIBUCIÓN DE INDIVIDUOS DE PRUEBA
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
1A-2A 2A-3A 3A-4A 4A-5A >5
Nú
mero d
e i
nd
ivid
uos
Rango de Edades
Número de Individuos por Edad
Número de Ind
DISEÑO DEL EXPERIMENTO
46
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
PRUEBAS
(29 Imágenes de niños con peso y talla adecuado)
• Dr. Danilo Cifuentes del (Hospital Militar)
método de Greulich y Pyle,
Primera estimación
• Mediante la aplicación en Matlab usando criterios de longitud de eje mayor.
Segunda estimación
• Mediante la aplicación en Matlab usando criterios del área.
Tercera Estimación
DESARROLLO DEL PROYECTO
47
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Documentación
Análisis de las técnicas de
procesamiento de imágenes médicas
Recopilación de carpogramas
Almacenamiento y Clasificación de los
carpogramas
Diseño del algoritmo
Implementación del algoritmo
Evaluación del algoritmo
Análisis y validación de los
resultados
ANÁLISIS Y VALIDACIÓN DE RESULTADOS
48
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
84%
16%
SEGMENTACIÓN PARA IMÁGENES
ANALOGICAS DIGITALIZADAS
CORRECTA
INCORRECTA
82%
18%
SEGMENTACIÓN PARA IMÁGENES
DIGITALES
CORRECTA
INCORRECTA
RESULTADOS
PRE-PROCESAMIENTO Y SEGMENTACIÓN
ANÁLISIS Y VALIDACIÓN DE RESULTADOS
49
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
0
0,2
0,4
0,6
0,8
1
1,2
1,4
1,6
1,8
Cifuentes LEM Área
Relación entre Varianza
Varianza
ANÁLISIS Y VALIDACIÓN DE RESULTADOS
50
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Región de
aceptación
Región de
rechazo 3,105 F= 0,0798
P=0,92 α = 0,05
(Valor critico)
PRUEBA DE HIPÓTESIS
𝐻0: µ𝑐 = µ𝑙 = µ𝑎
𝐻1: µ𝑐 ≠ µ𝑙 ó µ𝑎 ≠ µ𝑙 ó µ𝑎 ≠ µ𝑙
ANÁLISIS Y VALIDACIÓN DE RESULTADOS
51
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0,4
1A-2A 2A-3A 3A-4A 4A-5A >5
Rango de edades
Relación de Varianza
Varianza
CONCLUSIONES
52
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Se validó el algoritmo mediante un análisis de
varianza en el cual la hipótesis nula fue verdadera, determinando que la relación entre promedios no muestra diferencias estadísticamente significativas.
Se obtuvo una base de datos con un total de 283 imágenes las cuales validaron los procesos de pre-procesamiento y segmentación, sin embargo únicamente 43 contaban con una escala referente a su tamaño real, la cual permitía realizar una relación de pixeles contra milímetros, que se requería para estimar la edad.
El proyecto se perfila con el fin de plantear una base de apoyo social en el diagnóstico de desnutrición y problemas de crecimiento mediante la estimación de edad ósea.
CONCLUSIONES
53
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Se implemento una técnica de corte de la región de
interés que puede permitir al radiólogo verificar la correcta segmentación del carpo, que es escalable a otras regiones, disminuyendo la complejidad en las fases de pre - procesamiento y segmentación al
eliminar niveles de intensidad e grises no relevantes.
RECOMENDACIONES
54
Planteamiento del Problema
Objetivos Justificación Antecedentes Marco Teórico
Desarrollo del
proyecto Conclusiones
Para poder generar un estándar y obtener resultados más precisos se recomienda ampliar la muestra estadística y así generar un referente a nivel nacional.
Se recomienda Incluir el sexo femenino e implementar el algoritmo en edades mayores a 6 años.
Como trabajo futuro es fundamental desarrollar un software que implemente el algoritmo el cual pueda ser integrable a los sistemas de información radiológica disponibles en los equipos médicos de toma de imágenes.
Para la estimación más precisa de la edad de un ser humano se pueden usar técnicas de radiografía panorámica dental para determinación de maduración de los terceros molares inferiores, radiografía del pie y radiografía cervical y poder incluir para exámenes de resonancia magnética.