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Fundación Centro de Supercomputación de Castilla y León

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FORO UNIVERSIDADESNuevas tendencias, retos y oportunidades en el desarrollo de productos en el

sector biotecnológico

Salamanca, 26 de mayo de 2011

Nuevos retos en el avance tecnológico: la innovación a través de la BioinformáticaFundación Centro de Supercomputación de Castilla y LeónCarlos Redondo GilPaula Vega

Foro Universidades: Nuevas tendencias, retos y oportunidades en el desarrollo de productos en el sector biotecnológico

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1. Presentación corporativa2. Proyecto de infraestructura3. Proyecto Red de Ciencia y Tecnología4. Proyectos y colaboraciones en el Sector biotecnológico

Índice de contenidos


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Sector, actividad principal

• La Fundación FCSCL es una entidad pública creada en 2008 que tiene por objeto la mejora de las tareas de la investigación de la Universidad, de los Centros de Investigación y de las empresas de Castilla y León– promoviendo acciones de innovación:

• en el mundo de la Sociedad del Conocimiento• en el área de cálculo intensivo, • las comunicaciones, y • los servicios avanzados,

– contribuyendo mediante el perfeccionamiento tecnológico aldesarrollo económico de la Comunidad y a la mejora de lacompetitividad de las empresas.


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Líneas de actuación

• Promoción de la I+D+i en la Comunidad de Castilla y León – Dirigida a instituciones públicas y empresas privadas. – Papel proactivo en la captación de fondos dedicados a la realización de proyectos

• Prestación de servicios de cálculo intensivo a los proyectos de investigación y desarrollo

• Cursos de formación y eventos dirigidos a investigadores que les permitan aprovechar las infraestructuras disponibles en el Centro.

• Difusión y divulgación de los aspectos relacionados con la aplicación de las tecnologías de la información, y especialmente de la supercomputación, en las actividades de I+D+i de la Comunidad. Esta tarea tiene dos públicos objetivos en la Comunidad:

– La sociedad, a la que se han de hacer accesibles las actividades de la Fundación y el papel que tienen,

– La comunidad científica e investigadora a la que se quiere atraer al Centro de Supercomputación para que incremente su producción científica.

Proyecto de Red Digital de Universidades y Centros Singulares

Middleware

Redes de comunicación. RedIRIS-Nova (España) / Géant (UE)

Recursos de cálculo Recursos de almacenamiento

Recursos de información

Otros recursosRecursos accesibles

Niveles de GridGrid de CálculoGrid de DatosGrid de ServiciosGrid de Conocimiento

e-Ciencia multidisciplinar

Áreas de Investigación DesarrolloInnovaciónUniversidades y OPIs Administración AutonómicaParques Tecnológicos de Castilla y LeónÁreas singulares de I+D+i

Ciencias de la Vida, Ciencias de la Salud, Biotecnología, BioinformáticaBiomedicina

1er nivel

2º nivel

3er nivel

e-Ciencia

1

2

Proyecto de Infraestructura Centro de Supercomputación

5

Cloud computing

4

6

Red Regional de Ciencia y Tecnología vs. Redes permanentes de cooperación tecnológica

Proyecto/s Cloud Computing

Proyecto/s Grid

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Política Científica de la FCSC: Proyectos corporativos

Conocimiento científico aplicado

Conocimiento científico

EnriquecimientoConocimiento tecnológico

Investigación aplicada

Desarrollo tecnológico Innovación

Investigaciónbásica

EnsayosPruebas pilotoPlantas piloto

PatentesModelo de utilidadInvencionesSoluciones prácticas

Hipótesis Teorías

Modelos organizativos

Nuevasorganizaciones

Mejora de procesos

Nuevos productos Nuevos servicios

Fuente: Desarrollo propio

1

2

3

4

1

5

6

7Investigación Industrial

Desarrollo Experimental


Proyectos de Investigación, Desarrollo e Innovación


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P1

Inversión: 4,2 M€Inicio actividad: Sep. 2009. Ampliación 2010

Universidad de León

Almacenamiento y Backup

110 Tbytes

Clúster Cálculo Paralelo272 nodos (2176 cores)

26 Tflops+

Desarrollo - 32 nodos(128 cores)

Clúster Visualización

(9 nodos) Cluster Memoria Compartida16 nodos (256 cores)

Servicios del Centro

Proyecto AECePro Sistema de Ahorro de Energía para HPC

Máxima eficiencia energética 135 kw P.U.E. 1,25 Mínimo requisito de espacio


Proyecto de Infraestructura Centro de Supercomputación


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Almacenamiento y Backup

110 Tbytes

Clúster Cálculo Paralelo304 nodos (2.432 cores)

26 Tflops

Clúster Memoria Compartida

16 nodos (256 cores)RAM: 3 Tbytes

Servicios del Centro(10 nodos)

Clúster GPUs14 TESLAS (3.360 cores)

+7 nodos (56 cores)

16 Tflops

Capacidades tecnológicas


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• La Red Nacional de Ciencia y Tecnología (RedIris) está acometiendo una ambiciosa renovación tecnológica: el proyecto RedIRIS Nova.

• RedIRIS Nova supone, además de un salto importante en prestaciones, un cambio de modelo, pues los nuevos circuitos están basados en fibra oscura en vez de en capacidad.

• Esto tiene dos consecuencias fundamentales:– Administrativas: el concepto IRU permite financiar el proyecto como infraestructuras.– Tecnológicas: La fibra oscura permite una gran flexibilidad operativa, permitiendo a la red ofrecer

servicios en cualquier capa.• Al amparo de RedIris Nova, existe la posibilidad de acometer y financiar acciones de

modernización y mejora en las redes regionales.


Proyecto Red Ciencia y Tecnología de Castilla y LeónP2

RedIRIS-NOVA: red de fibra oscura con restauración en la capa óptica y el equipamiento detransmisión óptico necesario, para incrementar sensiblemente la capacidad y hacer más flexible eldespliegue de nuevos serviciosA medida que avance la tecnología DWDM (dense wavelength division multiplexing), la fibra permitirátodavía mayores velocidadesLa fibra oscura representa mucho más que más ancho de banda: a diferencia de RedIris 10, en quelos servicios son IP y VPN’s sobre IP, la fibra oscura permite la prestación de servicios en capas 1, 2y 3, lo que amplia notablemente el abanico de servicios y posibilidades.La fibra oscura es el gran avance del troncal, pero aunque es altamente deseable en los nodosfinales, no es imprescindible.Consecuencia de máxima relevancia: existencia de tráfico de RedIris dentro de la CA.IP pierde importancia.


Proyecto de Red Ciencia y Tecnología CyL: Entendiendo la Fibra Oscura

Servicios

Equipamiento Servicios

Equipamiento Comunicaciones

Fibra


Proyecto de Red Ciencia y Tecnología CyL: Estructura Piramidal del Proyecto de Red

Servicios de gestión de RedGestiona las incidencias de la red

Controla las métricas

Gestiona los equipos de la red regional.

Controla el inventario y versiones.

Servicios de valor añadidoConsolidación de servidores

Optimización de licencias de sw.

Centros de respaldo

Copias de seguridad remotas

Administración electrónica

Gestión de bibliotecas

Servicios de aulas virtuales

(…)

Lα Eficiencia Energética en entornos HPC: Grupo de Investigación de Eficiencia Energética en entornos HPC(EE CPD/HPCE)Proyecto MonICAProyecto AECePro Sistema de Ahorro de Energía en Grandes Centros de Proceso de DatosSeguridad Informática en entornos HPC-IA

Lβ Ciencias de la Vida – Biotecnología – Bioinformática

Redes permanentes de cooperación tecnológicaLχ


Líneas y Áreas de Investigación de la FCSCL


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1. Presentación corporativa2. Proyecto de infraestructura3. Proyecto Red de Ciencia y Tecnología4. Proyectos y colaboraciones en el sector biotecnológico


• Cloud Computing con Arcimboldo para una solución de estructuras cristalográficas por supercomputación en la FCSCL (IDC-CDTI)

• Secuenciación de genes para la mejora de la producción animal

• Cribado virtual de una quimioteca para el desarrollo de fármacos contra la malaria

• Cribado virtual mediante docking para el descubrimiento de dianas terapéuticas contra el cáncer

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Proyectos en desarrollo o realizados


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Colaboraciones con empresas, centros tecnológicos, grupos de investigación…

Grupos de investigación de Universidades de Castilla y León

Instituto de Investigación de la Viña y el Vino (Universidad de León)

Instituto de Neurociencias de Castilla y León (INCYL)

Instituto de Biotecnología de León (INBIOTEC)

Institut de Biología Molecular de Barcelona (IBMB)

Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)

Cluster Biomedicina y Salud (Universidad de Oviedo)

Genoma España

Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBM)

European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)

Empresas: iCinetic, OncoStem Pharma, RD BIOsolutions, SmartLigsBioinformática,…


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Desarrollo: intereses, objetivos, proyectos futuros

Consolidación de las relaciones establecidas hasta el momento actual yapertura de nuevas colaboraciones.

Colaboración con una spinoff del Consejo Superior de InvestigacionesCientíficas en la puesta en marcha de una plataforma tecnológica de DrugDiscovery para la obtención y mejora de compuestos candidatos afármacos.

Apoyo a la creación de una Empresa de Base Tecnológica / EmpresaAsociada a la FCSCL de ámbito Biotecnológico en Castilla y León.

Participación como socio tecnológico en proyectos de investigación en elárea Biotecnológica – Bioinformática.

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24071 León (España)Tlf.: (+34) 987 29 3160

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