2da Clase

35
Química Bioinorgánica Angel R, Higuera-Padilla Laboratorio de química bioinorgánica Postgrado en Química Complejos metálicos en medicina

description

El N-terminal de una cadena polipéptídica, con su grupo amino libre es convensionalmente conocido como el comienzo de la cadena, mientras que el ultimo aminoácido con su grupo carbóxilo libre, es el final de la cadena.

Transcript of 2da Clase

Page 1: 2da Clase

Química Bioinorgánica

Angel R, Higuera-PadillaLaboratorio de química bioinorgánica

Postgrado en Química

Complejos metálicos en medicina

Page 2: 2da Clase

2

Química Bioinorgánica

Química bioinorgánica

Estudio de la función bioquímica

Elementos inorgánicos

Sistemas biológicos

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

Page 3: 2da Clase

3

Química Bioinorgánica

Bioquímica InorgánicaQuímica Inorgánica

Medicinal

Química Bioinorgánica

Page 4: 2da Clase

4

Tener conocimiento Química inorgánica

Para el entendimiento Tópicos de química bioinorgánica

Bioquímica

R. Crichton. Biological inorganic chemistry. An introduction. First edition, 2008. Pp. 241-255

Química Bioinorgánica

Page 5: 2da Clase

5

Complejos metálicos en medicina

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

Fundamentos de bioquímica

BioquímicaSe ocupa del estudio de la vida

A nivel molecular

El área abarca un enorme cuerpo de información

Que crece y cambia rápidamente en las manos de miles de profesores capaces, investigadores y escritores.

Page 7: 2da Clase

7

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Metalo-drogas y sus mecanismos de acción

Introducción de metalo-drogas en el cuerpo los expone a la

reacción con muchas sustancias en el sistema biológico.

El cuerpo humano tiene decenas de miles de diferentes proteínas

Funciones catalíticas, de transporte y

estructurales

Page 8: 2da Clase

8

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

¿Qué ocurre cuando un ión metálico es introducido en el cuerpo en forma de un metalo-fármaco y se enlaza a una

proteína en una parte crítica para la función de esta?

Muerte celularPérdida de la capacidad de la proteína

para realizar su función biológica

Page 9: 2da Clase

9

Complejos metálicos en medicina

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

Los 20 aminoácidos que se conocen naturalmente. Los 10 esenciales para los humanos.

Page 11: 2da Clase

11

Complejos metálicos en medicina

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

Estructuras de las proteínas

Todas las proteínas tienen al menos tres niveles de estructura: primaria, secundaria y terciaria.

Formación de un enlace péptidico.

El N-terminal de una cadena polipéptídica, con su grupo amino

libre es convensionalmente conocido como el comienzo de la cadena, mientras que el ultimo

aminoácido con su grupo carbóxilo libre, es el final de la

cadena.

Page 12: 2da Clase

12

Complejos metálicos en medicina

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

Ilustración del ángulo Ca – N φ (phi) y del ángulo de enlace Ca – C ψ (psi) en

un peptido.

Estructuras secundarias de las proteínas. Hélices a y láminas b.

Page 13: 2da Clase

13

Complejos metálicos en medicina

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

La estructura terciaria de las proteínas surge de las interacciones de los diferentes grupos R a lo largo de la cadena polipeptídica. Algunas de las fuerzas responsables de las estructuras terciarias son fuerzas de van der Waals, los enlaces iónicos, los enlaces

hidrofóbicos y puentes de hidrógeno.

Page 14: 2da Clase

14

Complejos metálicos en medicina

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

Modos de unión común de los iones de metales a las

cadenas de aminoácidos en las proteínas.

Page 15: 2da Clase

15

Complejos metálicos en medicina

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

Ácidos nucleicos

Son macromoléculas, polímeros formados por la repetición de monómeros llamados nucleótidos, unidos mediante enlaces fosfodiéster.

El ADN está compuesto de unidades repetidas de las bases nitrogenadas adenina y guanina (purinas) y timina y citosina

(pirimidinas) vinculadas al carbono-β de la azúcar cíclica de cinco miembros desoxirribosa. A su vez, los azúcares están conectados

por enlaces fosfodiéster 3 '- 5' para formar los enlaces en la cadena del ADN

Numeración en los ácidos nucleicos, las posiciones en el anillo de azúcar llevan un prima

(') para distinguirlos de la numeración de las posiciones de base nitrogenada

Page 16: 2da Clase

16

Complejos metálicos en medicina

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

A la base nitrogenada, el azúcar, y la unidad de fosfato se le llama

nucleótido. A la base nitrogenada más el azúcar se le llama

nucleósido. El ácido ribonucleico (ARN) se diferencia del ADN en

que el azúcar es ribosa y la pirimidina uracilo es sustituida por

timina.

Page 17: 2da Clase

17

Complejos metálicos en medicina

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

Las cadenas de ADN forman la bien conocida doble hélice a

través de enlaces de hidrógeno de la adenina a la timina (par A-T) y citosina, guanina (par G-C)

Page 18: 2da Clase

18

Complejos metálicos en medicina

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

Enlaces de hidrógeno entre las bases nitrogenadas.

El ADN presenta complementariedad en la formación de la doble hélice. Las secuencias

complementarias tienen polaridad opuesta, es decir, las dos cadenas corren en direcciones

opuestas

Page 19: 2da Clase

19

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Page 20: 2da Clase

20

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Page 21: 2da Clase

21

Complejos metálicos en medicina

Rosette M. Roat-Malone. Bioinorganic Chemistry. 2da Edición. John Wiley & Sons, New Jersey. 2007. Pp: 1-28

Se encuentra en soluciones con alta

salinidad ó con alcohol añadido.

Encontrado a bajas soluciones de sal, y se

cree es la conformación del ADN nativo.

Aparece fundamentalmente en

zonas ricas en el par G-C, con alta concentración de

sal ó alcohol añadido.

Page 22: 2da Clase

22

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

(a) Diagrama que muestra algunos de los posibles productos de adición que se pueden formar entre un ion metálico (círculo negro) y las bases nitrogenadas del ADN. (b) La

intercalación de una molécula de fármaco entre los pares de bases del ADN

Page 23: 2da Clase

23

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Reacciones de los complejos metálicos en un medio biológico

A diferencia de las drogas puramente orgánicas, los complejos metálicos que se utilizan para el tratamiento y diagnóstico de enfermedades están expuestos a diferentes ambientes fisiológicos en el cuerpo que podrían

causar cambios en su composición química a medida que viajan desde el sitio de administración a las moléculas blanco en las células.

Concentración de cloruro en la sangre ~ 104 mMConcentración de cloruro en la célula 4 – 20 mMConcentración de drogas 10-6 a 10-9 M¿Cuál es el orden de la reacción de intercambio Cl- con H2O?

Concentración de fosfato en la sangre y el citosol ~ 5 y 80 mMDebido a que los átomos de oxígeno en cada especie son bases duras (todos son equivalentes por tautomería y resonancia), los complejos de fosfato más estables se forman con iones metálicos que son ácidos duros.

Reacción con cloruro

Cl-

Reacción con fosfato

H3PO4, H2PO4-,

HPO42-, PO4

3-

Reacción con carbonato

CO2 (ac), H2CO3, HCO3

-, CO32-

Concentración de carbonato en la sangre y el citosol ~ 24 y 12 mMLa anhidrasa carbónica cataliza la hidratación del CO2, es una enzima que contiene Zn.Son bases duras.

Page 24: 2da Clase

24

Complejos metálicos en medicina

Evaluación de los efectos farmacológicos de los agentesAdemás de destacar algunos de los aspectos químicos y bioquímicos de las

metalo-drogas en los sistemas biológicos, es importante discutir brevemente cómo se miden los efectos farmacológicos de estos agentes.

Medición de la citotoxicidad de un fármaco

Ensayo de cultivo celular

Por lo general contienen sales simples e iones, como NaCl, Na2HPO4, NaHCO3, los

aminoácidos comunes, varias vitaminas, glucosa,

GSH y otros aditivos.

La composición del medio de cultivo se aproxima a la composición de la sangre, aunque varía un

poco con el tipo de célula en estudio

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Placas de 96 pozos • Se preparan soluciones de los compuestos a diferentes concentraciones, y se exponen las células a estos en el medio de cultivo por un periodo de 1 a 2 horas.• Se extrae el medio que contiene la droga y se reemplaza por un medio libre de droga y se dejan crecer por un tiempo de 24-48 horas.• Se determina el número de células vivas y muertas y se compara con el número de células presentes en pozos que no fueron expuestos.

Page 25: 2da Clase

25

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Medición de la absorción del fármaco

Además de medir los efectos tóxicos de los compuestos sobre

las células, es importante medir la absorción en las células.

Exposición de las células a un agente durante un tiempo

Análisis de resultados luego de lavar las células Absorción atómica y Espectrometría de

masas de plasma acoplado inductivamente

Page 26: 2da Clase

26

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Estudios en animales

Principalmente ratones y ratas, han sido la base de los estudios de los

efectos de las drogas en seres vivos.

Es cada vez más evidente que los resultados obtenidos con los

animales a menudo no se traducen bien a los seres humanos

Se promueve el uso de ensayos in vitro.

La mayoría de las agencias reguladoras requieren que los compuestos se prueben

en al menos un roedor y un no roedor.

Problemas éticos, de seguridad y de manejo. Supervisión desde el nivel

institucional hasta nivel federal.

Page 27: 2da Clase

27

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Del descubrimiento al mercado

Mesa de laboratorio donde se descubren nuevos medicamentos

Clínica, donde se utilizan para el tratamiento de los pacientes

Está marcado con muchas dificultades Sólo una pequeña fracción de nuevos

compuestos logran convertirse en agentes farmacéuticos aprobados

Page 28: 2da Clase

28

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Resumen general de lo que es necesario para obtener la aprobación de la FDA de

un medicamento contra el cáncer

Page 29: 2da Clase

29

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Fase preclínica

Un compuesto único se prueba en ratones con xenoinjertos

• La mejor formulación para usar• La dosis más eficaz de aplicar, y• La frecuencia y método de administración

Se determina:

Si el candidatro disminuye el crecimiento del tumor con un mínimo

de toxicidad para el huésped…

Tres líneas celulares humanas de cáncer

60 líneas de diferentes tipos de cáncer humanos

Page 30: 2da Clase

30

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Investigación del nuevo fármaco, aplicación

Farmacéutica, institución

académica ó el NCI

• Se proporciona la estructura química del agente,• Cómo se cree que actúa en el cuerpo, • Efectos tóxicos en los animales, • Dónde y cómo se llevarán a cabo los ensayos en humanos, llamados ensayos clínicos.• Instituciones involucradas, • El número de personas a participar en el estudio, • Exámenes médicos.

solicitud ante la FDAPatrocinador del fármaco candidato

Esto debe ser aprobado por las juntas de revisión institucional, de cada uno de los sitios

en los que se llevarán a cabo los ensayos

Page 31: 2da Clase

31

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Los ensayos clínicos con el fármaco candidato se llevan a cabo en tres fases.

Fase I

Fase II

Fase III

Se les suministra el candidato de droga a un pequeño número de voluntarios

sanos (20-80), y a veces también a algunos pacientes con cáncer.

Se determinan: la dosis, el metabolismo, efectos secundarios y

otras propiedades básicas del fármaco

Un número limitado de pacientes, algunos de los cuales tienen un tipo específico de cáncer, son tratados con el agente. Esta fase normalmente

implica un mayor número de sujetos que en la fase I

La pobre farmacocinética, Mala absorción, Metabolismo rápido y/o eliminación, Muerte inducida por fármacos

En esta fase están involucrados cientos de miles de personas en las

clínicas, centros oncológicos, consultorios médicos, etc, ubicados a

nivel nacional.

La mayoría de los sujetos en fase III tienen algún tipo de cáncer, pero también se incluyen los voluntarios sanos.

Tasa de fracaso de los nuevos

candidatos a fármacos en fase III

~ 50 % .

Page 32: 2da Clase

32

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Aplicación del nuevo fármaco

2da solicitud ante la FDA

El patrocinador debe proporcionar toda la información sobre la eficacia y la seguridad del agente.

• Beneficios de su uso son mayores que los riesgos, • Apropiada información de la etiqueta,• Métodos de fabricación utilizados son adecuados para asegurar la pureza y la integridad del fármaco candidato.

La aprobación por la FDA demora entre 6-12 meses

¿Cuánto creen que dura el proceso desde el

descubrimiento hasta su aprobación final?

Puede variar considerablemente pero se pueden esperar entre 8-15 años

Page 33: 2da Clase

33

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Fase 0 de ensayos clínicos

No se correlacionan muy bien animales y humanos

Los ensayos de fase I son caros y lentos

Se propone instituir la fase 0 con dosis bajas, ineficaces

terapéuticamente

Reduce el riesgo de toxicidadSería menos costoso de llevar a cabo y

reduciría el período de tiempo total para el desarrollo de fármacos

Page 34: 2da Clase

34

Complejos metálicos en medicina

James C. Dabrowiak. Metals in Medicine. 2009 John Wiley & Sons, Ltd

Ganancias

Alrededor de mil millones de dólares

Una droga exitosa necesita recuperar no sólo el dinero gastado en su desarrollo, sino también un beneficio para el patrocinador

Por eso a menudo los nuevos medicamentos son muy caros

para el consumidor

Los costos de desarrollo de un nuevo medicamento son enormemente altos

Page 35: 2da Clase

Complejos metálicos en medicina

El material mostrado en estas diapositivas fue escogido para suministrar y recordar información que será estudiada en el resto de materia.

El conocimiento de la composición de proteínas y ácidos nucleicos será asumido como parte de nuestro conocimiento en las siguientes clases.

Aprenderemos interacciones en los sistemas biológicos de los diferentes metales y sus complejos en los siguientes seminarios, no sólo estructuras, sino las funciones en bioinorgánica.