Etiopatogenia de la Diabetes Mellitus Tipo 2 y del Mal de Alzheimer a través del Estudio de Redes Moleculares 18 de setiembre al 6 de octubre (3 semanas) Teóricos de 8-13 hs (primeras dos semanas) y Talleres en horario de la mañana o de

la tarde (ultima semana)

Facultad de Medicina, UdelaR

Docentes:

MD PhD Horacio Botti (Responsable)

PhD Álvaro Cavana, PhD. Celia Quijano, PhD. Florencia Irigoín, MD PhD Marcelo Hill, PhD Ricardo Ehrlich,

MD PhD Gonzalo Ferreira, Lic. Verónica Sosa, PhD. Lucía Spangenberg, PhD. Felipe Trajtenberg, MD. Laura

Rosa*, MD. Ana Lujambio* (Docentes Participantes, *= a confirmar)

Actividad Optativa:

Redes Moleculares y Etiopatogenia

Título: Etiopatogenia de la Diabetes Mellitus Tipo 2 y del Mal de Alzheimer a través del Estudio de

Redes Moleculares (ReMo#1)

Objetivo

Introducir a los estudiantes a la biomedicina molecular de redes y a la biomedicina integrativa tomando

como foco de interrogación una entidad nosológica propuesta llamada Diabetes tipo 3, entendida como la

enfermedad de Alzheimer causada por la resistencia insulínica en ciertas regiones del Sistema Nervioso

Central.

Formato del Curso:

El curso constará de tres tipos de actividades: teóricas (presencial), tutoriales (presencial) y taller (presencial

y a distancia).

En los teóricos se presentarán aspectos generales e introductorios sobre teoría de redes, genómica humana,

cómo se originan distintas informaciones ómicas, acoplamiento y coordinación de la expresión génica así

cómo descripciones actuales específicas de vías moleculares relacionadas con las enefermedades humanas

en general y específicamente aquellas vinculadas a la Diabetes Mellitus Tipo 2, la enfermedad de Alzheimer y

se presentarán las propuestas actuales que consideran a una nueva entidad nosológica que algunos autores

denominan Diabetes Mellitus tipo 3. Entre las actividades teóricas, docentes de los Departamentos de

Endocrinología y Metabolismo y de Neurología realizarán presentaciones sobre aspectos médicos de estas

enfermedades con énfasis en sus etiopatogenias. Las actividades teóricas se complementarán cuando sea

posible con la presentación de trabajos de investigación en curso. Contaremos con varios docentes para

apoyar estas actividades.

En los tutoriales los estudiantes serán iniciados al uso de R y de programas de análisis, visualización y

extensión de redes. En los talleres los estudiantes realizarán modelos de redes de las vías estudiadas,

mapearán moléculas implicadas en la DMT2, la EA y la DMT3. Finalmente integrarán los modelos en uno solo

para un análisis global. Para realizar los talleres y tutoriales los estudiantes deberán contar con computadores

personales, donde se instalarán programas gratuitos y de libre acceso. Esto tiene la enorme ventaja de

facilitar el trabajo posterior al curso. Siempre que sea posible los estudiantes serán enfrentados al

procesamiento de los datos, de no ser posible (muy ineficiente) por problemas de hardware, los estudiantes

compartirán tareas o se les serán entregados archivos de salida adecuados.

La evaluación del curso constará de la elaboración de un informe donde el estudiante se centra en la vía que

estudió presentando uno o más modelos de red al respecto. Se requiere tener acceso a una computadora con

recursos actualmente corrientes, de preferencia una uínica laptop que pueda traer a la clase y usar fuera de

ella.

Lugar y horario de las actividades:

Los teóricos serán abiertos y se realizarán en el Anfiteatro Farabeuf o en el Salón de Seminarios de Fisiología

de la Facultad de Medicina. Los tutoriales y Talleres presenciales tendrán lugar en el Anfiteatro Farabeuf o en

el Salón de Seminarios de Fisiología, o en la Sala de Computación de la Facultad, o en última instancia, en el

Piso 2 (Departamento de Biofísica).

Disciplinas, cátedras, organizaciones involucradas

Departamento de Biofísica

Centro de Investigaciones Biomédicas (CEINBIO)

Unidad de Bioinformática, Institut Pasteur de Montevideo

Cátedra de Endocrinología y Metabolismo

Cátedra de Neurología

Instituto de Fundamentos y Métodos Facultad de Psicología

Fundamentación

La cantidad de información actualmente disponible sobre las bases moleculares de las enfermedades es

enorme pero difícil de interpretar. Dicha interpretación debe realizarse en conjunto, siendo este el foco de la

Medicina de Sistemas. El progreso futuro de la Medicina depende en parte del desarrollo de métodos de

integración y análisis sistémico. La construcción de redes a partir de resultados acumulados a partir de

experimentos clásicos o de resultados de experiencias ómicas (proteómica cuantitativa, transcriptómica,

genómica) es un enfoque válido y cada vez más usado para representar la información molecular. Este tipo de

enfoque puede ser esencial para el desarrollo de la Medicina de Precisión, que busca personalizar

diagnósticos, tratamientos y pronósticos en base a caracterizaciones moleculares abarcativas de cada

paciente.

El interés en la Biomedicina Integrativa puede verse reflejado en la reciente creación de centros o grupos,

cursos y revistas que están orientados a esta actividad integradora de disciplinas (Tabla I, no exhaustiva). La

Biofísica, la Bioquímica y la Biología Computacional son componentes centrales de la Biomedicina

Integrativa. La Biomedicina Integrativa puede ser vista como una respuesta a la necesidad de investigar

procesos complejos como las enfermedades crónicas y la función normal y alterada de sistemas de órganos

humanos. Uno de los objetivos del curso es servir de primera instancia para la integración de temas y

métodos de Biomedicina Integrativa al curriculum optativo y eventualmente básico de los estudiantes de

Medicina de grado y posgrado.

Tabla I. Ejemplos de esfuerzos académicos enmarcados en la Biomedicina Integrativa

Centro o Grupo, enlace Institución, región Temas, Divisiones, Proyectos Financiados o

Publicaciones

Centre for Integrative

Biomedicine,

http://www.kcl.ac.uk/health/re

search/specialistcentres/cib/ind

ex.aspx

King's College

London, UK.

Cardiovascular

Cardiovascular and inflammatory activities of

vasoactive mediators · Chronic leg ulcer healing ·

Aneurysm growth and repair

· Novel mechanisms for suppressing cardiac

arrhythmias · Endothelial dysfunction and oxidative

stress · Left ventricular

hypertrophy & heart failure · Nutrition and vascular

function · Vascular gene therapy · Transgenic mouse

models of

cardiovascular disease

Neuroscience

Molecular basis of Huntington’s disease · Novel

treatments for Parkinson's disease and other

neurodegenerative movement

disorders · Contributory mechanisms to chronic pain

states, pain processing, inflammation & sensory nerve

activation ·

Cerebral ischemia (stroke) and spinal cord injury · The

enteric nervous system and neuroendocrine systems

Respiratory

Respiratory pharmacology · Platelets and leukocyte

interaction · Bronchial hyper-responsiveness · Blood-

vessel wall

interactions · Biology of glycosaminoglycans ·

Phosphodiesterase inhibitors · Airway

neurotransmission · Pharmacology of

smooth muscle · Murine models of inflammation

Blood-brain barrier

Drug delivery across the blood-brain, blood-CSF barrier

· Glia and ionic homeostasis · Endothelial cell function ·

Ischaemia

and cytokine-induced regulation of cerebral

microvascular permeability · Leukocyte transmigration

across the blood-brain

barrier

Reproduction

Integrative neuroscience · Neurobiology of

reproduction & sociality · Nutritional influences on

reproductive physiology ·

Early life programming for obesity · Circadian biology

Endocrinology

Molecular biological approaches to stress, infertility

and hot flushes · Quantitative gene expression of

melatonin and

melanopsin · Foetal origins of adulthood diabetes,

hypertension and cardiovascular disease

Inflammation & Transplantation

Inflammatory hyperalgesia, vascular hyperpermeability

& swelling · Role of nitric oxide, carbon monoxide and

hydrogen

sulphide in inflammation & cardiovascular disease ·

The relationship between innate immunity, epithelial

immunobiology

and progressive kidney injury · Immunology and

Infection · Role of natural killer cells in transplantation

·

Microencapsulation of islets of langerhans · Islet

transplantation

Integrative Biomedicine

Laboratory

http://cedoc.unl.pt/integrative-

biomedicine-laboratory/

CEDOC - CHRONIC

DISEASES RESEARCH

CENTER, Portugal, EU.

Developmental Biology, Physiology and Metabolism,

Neurodegenerative Disease and Ageing, Neuroendocrinology, Drosophila genetics, Cancer Biology, Molecular and Cell Biology, Molecular Evolution, Biotechnology/Genetic Engineering

Integrative Biomedical Sciences

(IBMS)

http://www.health.uct.ac.za/fh

s/departments/IBMS

University of Cape

Town, Faculty of

Health Sciences, Sud

África, África.

Chemical and Systems Biology Computational Biology Medical Biochemistry and Structural Biology

Integrative Biomedical Imaging Informatics at Stanford (IBIIS)

http://ibiis.stanford.edu/

Stanford Medicine,

Stanford University,

USA

Recently Awarded Grants Computing, Optimizing, and Evaluating Quantitative Cancer Imaging Biomarkers PI(s): Napel, Rubin (NIH/NCI: 1U01CA187947-01A1)

Qualification and Deployment of Imaging Biomarkers of Cancer Treatment Response PI: Rubin (NIH/NCI: 1U01CA190214-01, 06/2015)

Informatics Tools for Optimized Imaging Biomarkers for Cancer Research & Discovery Subcontract PI: Napel (MGH prime) (NIH/NCI: U24 CA180927, 09/2014)

Data and Terminology Standards in Imaging Development and Evaluation PI: Rubin (FDA 1R24FD004757, 08/2013)

Tools for Linking and Mining Image and Genomic Data in Non-Small Cell Lung Cancer co-PIs: Sandy Napel, Sylvia Plevritis (NIH: 1R01CA16025101, 09/2011)

Clinically Relevant Regulatory Networks in the Lung Tumor Microenvironment PI: Sylvia Plevritis (NIH: 1U01CA154960-01, 09/2011)

Integrated Biomedicine

http://research.utsa.edu/texas-

university-research/advanced-

research/biomedical/

Research Area of

Excellence at The

University of Texas at

San Antonio (UTSA),

USA.

Human immunology and infectious disease,

regenerative and molecular medicine, and

neuroscienceare all part of Integrative Biomedicine at

UTSA

Virtual Physiological Human Institute for Integrative Biomedical Research (VPH Institute)

http://www.itfom.eu/partners/

project-partners/11-

participants/398-virtual-

physiological-human-institute-

for-integrative-biomedical-

research-vph-belgium

Europa Five recent publications relevant to the project Viceconti, M., Taddei, F., Cristofolini, L., Martelli, S., Falcinelli, C., Schileo, E., 2012. Are spontaneous fractures possible? An example of clinical application for personalised, multiscale neuro musculo skeletal modelling. J Biomech 45(3), 421-426. Viceconti, M., McCulloch, A. D., 2011. Policy needs and options for a common approach towards modelling and simulation of human physiology and diseases with a focus on the Virtual Physiological Human. Stud Health Technol Inform 170, 49 82. Viceconti, M., 2011. A tentative taxonomy for predictive models in relation to their falsifiability. Philos Transact A Math Phys Eng Sci 369(1954), 4149 61. Viceconti, M., Kohl, P., 2010. The virtual physiological human: computer simulation for integrative biomedicine I. Philos Transact A Math Phys Eng Sci 368(1920), 2591 4. Viceconti, M., Clapworthy, G., Van Sint Jan, S., 2008. The Virtual Physiological Human–A European Initiative for In silico Human Modelling. J Physiol Sci,

Dec;58(7):441 6.

http://www.londonmedicine.ac.

uk/school/bbsrc-centre-for-

integrative-biomedicine/

Europa

http://ccib.mgh.harvard.edu/

Cursos Región

http://catalog.oakland.edu/pre

view_course_nopop.php?catoid

=15&coid=12942

USA

http://www.gu.se/digitalAssets

/730/730180_cns.pdf

Europa

https://graduate.med.uky.edu/i

ntegrated-biomedical-sciences

USA

https://ibms.nd.edu/ USA

https://www.bcm.edu/educatio

n/schools/graduate-school-of-

biomedical-

sciences/programs/integrative-

molecular-and-biomedical-

sciences/

USA

http://www.flpolycatalog.com/preview_course_nopop.php?catoid=7&coid=2957

USA

Revistas

http://www.gratisoa.org/journa

ls/index.php/GJBS

https://www.journals.elsevier.com/journal-of-computational-science/virtual-special-issues/computational-science-in-biomedicine-2010-2016

http://www.gratisoa.org/journa

ls/index.php/GJBS

Como se puede apreciar en la Tabla I, los tópicos cubiertos en cursos más completos de Biomedicina

Integrativa incluyen Biofísica y Biología Estructural, Genómica y Proteómica, Biología del Cáncer,

Inmunología y Enfermedades Infecciosas, Biología Química y Farmacología Molecular, Biología

Computacional y Bioinformática y Biología Molecular, Celular y del Desarrollo. Los grupos/centros suelen

contener a uno o más matemáticos. Los tópicos de investigación son muy variados pero intentan cubrir

problemas médicos de relevancia, generalmente complejos.

Durante los años 90 en países del mundo desarrollado se caracterizaron los detalles moleculares de

enfermedades genéticas de herencia mendeliana (enfermedades raras monogénicas), como por ejemplo la

fibrosis quística y otras canalopatías, distrofias musculares, etc, y la implementación de métodos

diagnósticos moleculares llevados al nivel de tamizaje poblacional1. El cambio de siglo se culminó con la

anotación de más de 20.000 genes humanos . La cantidad de información ya disponible y proyectada en ésta

la llamada “era posgenómica” y de las “tecnologías de la información” sobre las bases moleculares de las

enfermedades y las actividades humanas (incluídos los eventos médicos) es enorme 2-4. Sin embargo, el

trabajo de interpretación es complejo y por el momento no hay estándares. Por un lado las enfermedades

más prevalentes en países desarrollados y en “vías de desarrollo” no se explican sencillamente, se desarrollan

durante largos períodos de tiempo bajo la influencia de múltiples factores genéticos, ambientales y

nutricionales y del envejecimiento de las poblaciones. China nos brinda un ejemplo de cómo afectan la salud

los cambios alimentarios, culturales y su sustento económico en un determinado fondo genético: Este país

realizó una significativa transición alimentario sanitaria en un tiempo muy breve (aproximadamente 20 años,

una generación) gracias a la apertura de su economía y la occidentalización de la producción y el comercio

5,6. Esta gran brecha entre información y conocimiento es uno de los mayores obstáculos para el desarrollo

de las ciencias médicas. La interpretación de la información ómica (genómica, proteómica, transcriptómica,

etc.) debe realizarse en conjunto y teniendo en cuenta el significado y la solidez científica de las evidencias.

Así, el progreso futuro de la Medicina depende en parte del desarrollo de métodos de integración y análisis

sistémico así como de la transferencia educacional y tecnológica. El análisis sistémico y el análisis de grandes

cantidades de datos son el foco de distintas disciplinas como la Ciencia de Datos, la Matemática Aplicada, la

Biología de Sistemas y la Bioinformática. La conjugación de estas disciplinas en la llamada Biomedicina

Integrativa puede ser esencial en el citado camino 7-12. En este trabajo estudiamos la relación entre dos

enfermedades muy prevalentes a través de un enfoque de Biomedicina Integrativa con una perspectiva

Biofísica y Computacional.

La inferencia de redes a partir de resultados acumulados de experimentos clásicos o de resultados de

experiencias ómicas (proteómica, transcriptómica, genómica) es un enfoque válido y cada vez más usado

para representar y analizar la información molecular vasta y compleja asociada a enfermedades 13-15. La

validez práctica de este enfoque en particular deriva de la eficacia de los métodos así como de la potencia y

fácil acceso de las implementaciones computacionales hoy existentes. Utilizaremos diversas alternativas

disponibles para inferir redes moleculares en relación con dos enfermedades, el mal de Alzheimer y la

Diabetes Mellitus tipo 2.

La Diabetes es un grupo de enfermedades metabólicas de etiología múltiple y compleja

caracterizadas por hiperglucemia crónica causada por disminución en la producción de la hormona con

sensibilidad conservada o por resistencia a la acción de la insulina16.

De acuerdo con la Asociación de Diabetes Americana, la actual clasificación para este grupo nosológico es la

siguiente17:

1. Diabetes tipo 1 (DMT1): debida a la destrucción autoinmune de células beta pancreáticas, que usualmente

lleva a una deficiencia absoluta de insulina.

2. Diabetes tipo 2 (DMT2): Debida a una pérdida progresiva de la secreción de insulina por las células

beta del páncreas en el contexto de resistencia a la insulina.

3. Diabetes Mellitus Gestacional (DMG): diabetes diagnosticada en el segundo o tercer trimestre del

embarazo que no era diabetes reconocida antes de la gestación.

4. Tipos específicos de diabetes debidos a otras causas, por ejemplo síndromes diabéticos monogénicos

como diabetes neonatal y diabetes del joven de comienzo en la madurez (“MODY”), enfermedades del

páncreas exócrino (como la fibrosis quística), diabetes inducida por drogas (como por el uso de corticoides) o

químicos.

El diagnóstico de diabetes se realiza de acuerdo con la Tabla 2.

Tabla 2. Criterios diagnósticos de Diabetes Mellitus (ADA, 2017)

Por otra parte, la Enfermedad de Alzheimer (EA) es una enfermedad neurodegenerativa de lento

progreso que se manifiesta por demencia (síndrome caracterizado por dificultades con la memoria, el

lenguaje, la resolución de problemas y otras habilidades cognitivas que afectan la vida cotidiana) y es

causada por la destrucción o disfunción de neuronas en áreas cerebrales a cargo de funciones cognitivas,

aunque otros grupos neuronales son también comprometidos durante la progresión de la enfermedad. El

diagnóstico de EA suele realizarse con el diagnóstico de Demencia de Alzheimer (cuando la enfermedad ha

alcanzado la fase clínica). El deterioro cognitivo mínimo, una categoría de diagnóstico exclusivamente

clínico, suele preceder en 4-5 años al diagnóstico de Demencia de Alzheimer u otra demencia. Las guías

actuales americanas para el diagnóstico de Demencia de Alzheimer fueron publicadas en 2011 y expresan lo

que se muestra en la Tabla 3.

Tabla 3. criterios diagnósticos para Demencia causada por Enfermedad de Alzheimer

Se han identificado variantes génicas responsables de formas familiares (enfermedades monogénicas) de EA

y DMT2. Además, estudios de asociación génica de amplitud genómica (por ejemplo a través de la

determinación completa de exomas) y otros estudios de análisis de secuencias expresadas han posibilitado la

identificación de múltiples genes con variantes alélicas (incluyendo polimorfismos de un único nucleótido)

asociadas a DMT2 18-43 y EA 44-61 en muestras de diversas poblaciones, haciendo énfasis en distintos

grupos étnicos. Recientemente se ha investigado los nexos moleculares entre ambas enfermedades, como

posible explicación para su reconocida interacción.62-78 Estas informaciones están hoy depositadas y

libremente disponibles en múltiples bases de datos.

Además, se ha propuesto que la resistencia a la insulina en ciertas regiones del SNC son una causa

importante en la EA esporádica (de comienzo tardío), lo que algunos autores llaman Diabetes Mellitus Tipo 3 79-90.

Requisitos de Conocimientos Previos y Materiales

Ser estudiante de Medicina con primer año aprobado, Docente de la Facultad de Medicina en formación

(G1 o G2) o Estudiante de PEDECIBA/PROINBIO o Postdoc. Se requiere computadora portátil/laptop con

Windows 7/8/10.

Objetivos del Curso

Objetivo General: Servir de introducción al estudio de redes moleculares en Medicina desde el punto de

vista de conocimientos teóricos y habilidades prácticas, en un marco Biomédico Integrativo.

Objetivos Específicos:

1) Mejorar la valoración y el entendimiento de las Redes Moleculares como formas de descripción y modelado

de enfermedades de importancia médica

2) Introducir al uso de herramientas y bases de datos bioinformáticas disponibles para la creación, registro,

visualización y análisis de redes moleculares

3) Fomentar y facilitar la integración transdiciplinaria de conocimientos de distintas fuentes y tipos en

Medicina

4) Introducir y discutir la relevancia de la coordinación e integración de procesos a nivel celular

Metodología

Apertura: En la apertura se presentará el curso, su estructura, objetivos y las formas de evaluación. Se

dictarán dos teóricos el día 1 presentando desde el punto de vista médico básico los mecanismos moleculares

implicados en la DMT2. El segundo dia se enfocará en la Enfermedad de Alzheimer (EA). Estos teóricos

estarán a cargo de docentes clínicos de la Facultad de Medicina y de parte del docente responsable.

Desarrollo: En los siguientes 9 días se realizarán dos actividades téoricas de 45-60 min cada una a cargo de

investigadores invitados y del responsable del curso para cubrir un conjunto de vías de señalización, vías

metabólicas y procesos biológicos relacionados con la DMT2 y la EA. El día se completará con actividades

tipo tutorial que permitirán al estudiante instalar y correr R y gephi, así como aprender a realizar tareas

necesarias para concretar la entrega que permitirá ganar los créditos. Así transcurrirán dos semanas. En la

tercera semana, los estudiantes y el docente responsable se reunirán para trabajar en taller de acuerdo a las

necesidades de los estudiantes, posiblemente por espacio de 3 hs diarias. El horario del taller será en la

mañana y en la tarde para cada hemigrupo de acuerdo a restricciones horarias de los estudiantes. Luego del

segundo día de taller los estudiantes en forma individual realizaran la entrega de un archivo .gephi en versión

1, la cual será corregida en los dos días de taller siguientes. Los teóricos/temas hasta el momento definidos

son los que se señalan más adelante.

Cierre del Curso: El curso tendrá un cierre durante la cuarte semana en el que los estudiantes presentarán

frente al docente responsable, docentes invitados y compañeros los resultados finales del trabajo. Para ello

los estudiantes deberán analizar en grupo un par de archivos .gephi que serán entregados por el docente

responsable que resultarán de integrar las distintas vías y procesos estudiados.

Mantenimiento: Se mantendrá un intercambio a través de la plataforma EVA.

Temario y Cronograma Preliminar:

A continuación se presenta el temario y cronograma de actividades. El título y contenido exacto de cada

presentación puede variar ligeramente.

Duración y horario: 18 de setiembre al 6 de octubre de 8-13 hs

Día 1, lunes 18/9

1) Presentación del curso e informaciones organizativas (HBotti)

2) Diabetes Mellitus tipo 2: Regulación de la Glucemia y Etiopatogenia (ALujambio)

3) Vías de señalización y procesos celulares relacionados con la etiopatogenia molecular de la DMT2 (HB)

Día 2, martes 19/9

4) Enfermedad de Alzheimer: Funciones Cognitivas y Etiopatogenia (LRosa)

5) Vías de señalización y procesos celulares relacionados con la etiopatogenia molecular de la EA (HBotti)

6) Informaciones organizativas (HBotti)

Día 3, miércoles 20/9

7) DMT3 y relevamiento de vías y procesos de relevancia en DMT2 y la EA (HBotti)

8) Vía 1: vía de la insulina (HBotti)

9) Vía 2: vía del APP (HBotti)

Día 4, jueves 21/9

10) Vía 3: La mitocondria y vías de comunicación y regulación celular (CQuijano)

11) Vía 8: Rol de canales ionicos y calcio intracelular en la etiopatogenia y posibilidades terapeuticas de la

enfermedad de Alzheimer (GFerreira)

12) Tutorial 1. Instalación de programas, bases de datos y fuentes de información (requiere que los

estudiantes traigan computadoras, HBotti)

Día 5, viernes 22/9

13) Vía 4: Regulación y coordinación de la síntesis de proteínas (REhrlich)

14) Vía 5: Cilias primarias y su participación en la señalización y regulación celular (FIrigoin)

15) Tutorial 2. Creación de redes usando R (HBotti).

Día 6, lunes 25/9

16) Vía 6: Respuesta al daño en el DNA y control del ciclo celular (VSosa)

17) Vía 7: Expresión Génica y su Regulación (AParodi)

18) Primera consigna de trabajo e informaciones organizativas (HBotti)

Día 7, martes 26/9

19) Teoría de redes y métodos/herramientas de estudio (ACabana)

20) Vía 9: Formación, reacciones y efectos biológicos del óxido nítrico y el anión superóxido (HBotti)

21) Consultas y ajustes al trabajo en ejecución (HBotti)

Día 8, miércoles 27/9

22) Vía 10: Vías de señalización y regulación de respuestas inmunes innatas (MHill)

23) Vía 11: Sistema ubiquitina proteasoma y el control de procesos biológicos (HBotti)

24) Consultas y ajustes al trabajo en ejecución (HBotti)

Día 9, jueves 28/9

25) Vía 12: Vía de NOTCH (CBolatto)

26) Genómica, Transcriptómica y Bioinformática (L. Spangenberg)

27) Tutorial 3: Análisis, visualización y extensión de redes usando Gephi y Cytoscape (HBotti)

Día 10, viernes 29/9

28) Diálogo cruzado en la señalización celular ó variantes genéticas y funcionalidad proteica (FTrajtenberg)

29) Acoplamiento en procesos biológicos (HBotti)

30) Segunda consigna de trabajo (HBotti)

Días 11-15, lunes 2 a viernes 6 de octubre

31) Lunes 2 al jueves 5 de octubre: Taller con computadoras personales (HBotti)

32) Cierre del curso con presentación de resultados y discusión (HBotti, todos los docentes están Invitados)

Lugar y Horario de la Actividad Optativa

Los teóricos se realizarán en el salón Farabeuf o en el salón de Seminarios de Fisiología (Planta alta del

edificio central de la Facultad de Medicina. Los talleres posiblemente se realicen en el mismo lugar. El horario

será en mañana, a convenir con un subgrupo que prefiera la tarde.

Carga Horaria

Total cuatro semanas, 34 hs:

Teóricos: 45 min x 20: 15 hs

Tutoriales: 5 x 45 min: 4 hs

Talleres Presencial: 5 x 1h: 5 hs

Cierre del curso: 2 hs

Actividades no presenciales: 8 hs

Créditos:

La asistencia al 80% de los Teóricos, Tutoriales y Talleres más la entrega de los archivos de redes

corregidos tendrá un total de 5 créditos. Se entregará un certificado de asistencia al cierre del curso.

Evaluación

La evaluación de la actividad optativa consistirá en la entrega de un archivo .gephi para la vía/proceso

correspondiente al estudiante, que requerirá trabajo de correcciones y perfeccionamiento durante el curso. El

plazo máximo para la entrega es el miércoles 11 de octubre.

Cupo para Estudiantes de Medicina

15

La selección de estudiantes se hará por sorteo a través de Bedelía.

Cupo para Estudiantes de PROINBIO/PEDECIBA

10

Cupo para Docentes de la Facultad de Medicina Gdos 1 y 2

10

Cupo para Estudiantes del grupo 33 del CMC

6

Responsable: Dr. Horacio Botti

Prof. Adjunto. Departamento de Biofísica

Departamento de Biofísica

Contacto: hbottialsina@gmail.com

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