006 anublo bacterial de la panicula del arroz - gustavo prado

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Añublo Bacterial de la Panícula del Arroz (B. glumae) Gustavo Prado Septiembre 21 de 2010 Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza

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Añublo Bacterial de la Panícula del Arroz (B. glumae)( g )

Gustavo Prado

Septiembre  21 de 2010

Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza

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Añublo Bacterial de la Panícula del Arroz

Años 50” en Japón.1995 1996 :China Taiwán Corea India Filipinas y Tailandia1995‐1996 :China, Taiwán, Corea, India, Filipinas y Tailandia. 1996‐2005: Lousiana: y otras regiones arroceras del sur Estados Unidos. 2006  Panamá.1989 Colombia (baja incidencia)1989 Colombia (baja incidencia).2007Montería (Córdoba).2009 (8 departamentos).  

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Monteria - Colombia

35.0

T° MAXIMAS Y MINIMAS 2005 T° MINIMA 2005 E HISTORICO 1993-2005

25,5

27.5

30.0

32.5

°C

T° MAXIMA

T° MINIMA23,0

23,5

24,0

24,5

25,0

°C

2005PROM 1933-2005

20.0

22.5

25.0

Enero Febrero Marzo Abril Mayo Junio Julio Agosto Septiembre Octubre Noviembre Diciembre

MES

22,0

22,5

23,0

Enero

Febrer

o

Marzo

Abril

Mayo

Junio Julio

Agosto

Septie

mbre

Octubre

Noviembre

Diciem

bre

MESMES

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Fuente: FEDEARROZ

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Monteria - Colombia

BRILLO SOLAR 2005 E HISTORICO 1993-2005

8,0

PRECIPITACION 2005

250,0

4,0

5,0

6,0

7,0

HORA

S / D

ÍA

20051993 - 2005 150,0

200,0

mm 2005

2,0

3,0

EneroFebrero

Marzo

Abril

Mayo

Junio

JulioAgosto

Septie/bre

OctubreNovie

mbreDiciembre

0,0

50,0

100,0

ENE FEB MAR ABR MAY JUN JUL AGO SEP OCT NOV DICSep O

No Dic

MES

ENE FEB MAR ABR MAY JUN JUL AGO SEP OCT NOV DIC

MES

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Fuente: FEDEARROZ

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Detección de colonias bacterianas

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Pruebas de patogenicidad

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Estado de Plántula

Decoloración de las hojas Pudrición de la vaina Muerte de la Planta

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Prueba de patogenicidad en Panícula

Espiguillas afectadas color pajizo

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Pigmentación producida porBurkholderia glumae en medio King B (toxoflavin)

Colonias deBurkholderia glumaeen medio King B

King B (toxoflavin)

en medio King B

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Diagnóstico molecular de B. glumae

Sayler et al, Plant Disease 90:603‐610

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Frecuencia de Burkholderia glumae en Colombia

Tipo de síntoma en  semillas  

B. glumae

(%)No muestras analizadas No. de muestras positivas 

Semilla decolorada a 104 92 88

Semilla manchada b 47 7 15

S ill i i 193 68 3 2Semilla asintomaticac 193 68 35.2

Total 344 167

a Síntomas involucrados en la decoloración del grano causado por B. glumae.bSíntomas involucrados en el manchado del grano causado por otras especies (P. fuscovagiane,  A. avenae, etc)CSin ningún tipo de síntoma aparente.

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Frecuencia de especies de Burkholderia en muestras de semillas de arroz

Tipo de síntoma en B. glumae

(%)

B. gladioli

(%)No

No de muestrasNo No. de

muestras de semillas de arroz 

la semillas  (%) (%)

muestras analizadas

No. de muestras positivas 

muestras analizadas

muestras positivas 

Síntoma típico a 89 80 90 85 8 9.4

Síntoma atípico b 45 7 15.5 34 2 5.8p

Sin ningún tipo de síntoma c

347 67 19.3 67 16 23.8

Total 481 154 186 26a Síntomas involucrados en la decoloración del grano causado por especies de Burkholderia sppa Síntomas involucrados en la decoloración del grano causado por especies de Burkholderia spp.bSíntomas involucrados en la decoloración del grano causado otras especies(P. fuscovagiane , A. avenae)CSin ningún tipo de síntoma aparente.

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Inoculación en Panícula(Invernadero)

B. glumaeMayor agresividad

•Grano decolorado con manchas color chocolate definidas•Vaneamiento > 90%

B l di li

Menor agresividad

B. gladioli

•Grano decolorado con manchas color chocolate oscuras que pueden cubrir las glumas

l t t

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completamente•Vaneamiento < 60 %

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Estandarización en la identificación de P. fuscovagianae, mediante PCR

M 1 2 3 4 5 -

Cebadores sintetizados porOnasanya y colaboradores(2010)

Num Reg P fusco

1 3651‐1 Pos

1kb plus (promega)

P fuscovaginaePara confirmar la identidad de las cepas de P. fuscovaginae aisladas de semillas de arroz estas se mandaron

a secuenciar

2 4024‐5 Pos

3 4187‐5T Pos

4 4178‐11 Pos

P. fuscovaginaeespecie involucradas en

el manchado y vaneamiento del grano

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5 Coctel Negvaneamiento del grano

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Especies de Pseudomonas que causan pudrición en la vaina del arroz (Zeigler y Alvarez 1989)

•Se han encontrado 4 especies de Pseudomonas causando:•Pudriciones en la vaina del arroz, grano manchado y esterilidad.

•Pseudomonas fuscovaginae: Pudrición bacterial de la vaina del arroz•Pseudomonas syringae: Rayado bacterial•Pseudomonas avenae: Pudrición bacterial de la vaina•Burkholderia glumae: Pudrición bacterial del grano

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Diagnóstico de bacterias en muestras del Tolima 

Especie

Tejido RegistroNo. de colonias

Acidovorax avenaesub Avenae

Pseudomonas fuscovaginae

Burkholderiaglumae

Burkholderiagladioli

Raíz 3986 7 33990 6 13994 73997 64001 64001 64005 64009 44012 44016 44019 44023 44027 6

13 4038 6T t l 70 3 1 0 0

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Total 70 3 1 0 0

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Diagnóstico de bacterias en muestras del TolimaTolima 

No. de 

Acidovoraxavenae Pv.  Pseudomonas Burkholderia Burkholderia

Tejido Registro colonias Avenae fuscovaginae glumae gladioli

Tallo 3988 64010 8 1 14010 8 1 14013 64017 64020 5

6 4024 5 1Total 36 1 1 1 0

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Diagnóstico de bacterias en muestras del TolimaTolima 

Tejido RegistroNo. de colonias

Acidovorax avenaesub. Avenae

Pseudomonas fuscovaginae

Burkholderiaglumae

Burkholderiagladioli

Vaina 3987 6 23992 6 23996 53999 64003 34003 34004 54011 64014 64018 64021 8 24025 5 1

12 4040 6Total 68 3 0 4 0

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Diagnóstico de bacterias en muestras del Tolima (Semilla) 

No. de  A.avenae P.  B.  B. No. de  A. avenae B.   B.  Registro colon sub. Avenae fuscovaginae glumae gladioli

4065 64069 74073 6 4 2

Registro colon sub. Avenae P. fuscovaginae glumae gladioli

3993 6 23989 8 2 14000 6 2 4073 6 4 2

4077 6 14084 6 14088 6 14092 6 2 1

4000 6 24008 6 34015 7 3 24022 6 24026 7 5 4092 6 2 1

4096 54100 64104 34108 7 1

4026 7 54030 84037 7 54044 5 34048 5 1

4112 44116 64026 8 1 5Total 181 10 3 29 6

4052 84056 74060 7 14061 6

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Estrategias de un programa MIC

∆Capacitación

∆Resistencia genética

∆Buenas prácticas agronómicas

∆Control biológico

∆Control químico ??

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Añublo

Burkholderia glumae

ub obacterialde la Paniculade arroz

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Germoplasma de Arroz de América Latina Tolerante a  B.glumaeCons VARIEDAD Y/O LÍNEA INV. CAMPO‐20081 BAMOA A75 5 32 CULIACAN A82 5 33 INTI 5 74 IR36 4 35 ALTAMIRA 7 4 36 CHETUMAL A86 4 37 ORYZICA LLANOS 5 4 38 ICTA PAZOS 4 39 CR1707 4 310 ICTA MOTAGUA 5 311 INIAP 11 4 312 PANAMA 1048 5 713 PERLA 5 314 SAAVEDRA 5 315 JASMINE 85 5 116 SC 112 5 117 PAITITI (FL00144) 4 118 FEDEARROZ 809(CT9809) 5 319 FL03188‐7P‐5‐3P‐1P‐M 4 ??20 CT8008‐16‐24‐2P‐1X 4 121 FL03186‐1P‐4‐2P‐(P.NAL) 5 322 CR5272 5 1

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23 Salahondita (Oryza latifolia) 4 ??24 NIPPONBARE 4 125 FEDEARROZ 50 5 326 COLOMBIA 21 6 3

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Nipponbare vs Coprosem 2 evaluación de la reacción a Burkholderia glumae

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FLAR

80 materiales con tolerancia a B. glumae Correlación con d d

g

∆45 con calificación 5

datos de Inv.

∆11 con calificación 1  Invernadero con 11 aislamientosrepresentativos de la poblaciónde la bacteria en Colombia

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Nombre Comercial i.a Dosis por ha. 

DESFAN 89 SL Extracto de semillas de cítricos.

333 cc

PHYTON Sulfato de cobre. 0.4 L

AGRYMICIN 16.5 WP Sulfato de estreptomicina y oxitetraciclina. 

333 gr

KILOL DF 100 Extractos de semillas de cítricos.

1.5 a 3.0 L

KASUMIN 2% Kasugamicina 2 a 2,5 L

COBRETHANE 69 WP Mancozeb 50% Oxicloruro de 2 a 3 KgCOBRETHANE 69 WP Mancozeb 50% Oxicloruro de cobre 19% Complejo ferrico 5% Ingredientes inertes 20%

2 a 3 Kg

STARNER WP Acido oxolinico Semilla solución al 5%Plantas solución al 0.1%

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Coprosem 21 3Coprosem 21 3

Acido oxolínico 1g/LAcido oxolínico, 1g/L2 41= Acido oxolínico

2= Oxicloruro de cobre + mancozeb3= Sulfato de estreptomicina + oxitetraciclina4 Acodo oxolínico + Oxicloruro de cobre + mancozeb

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4= Acodo oxolínico + Oxicloruro de cobre + mancozeb

Page 27: 006   anublo bacterial de la panicula del arroz - gustavo prado

Control Químico

B. glumae B. gladioli P. fuscovaginae

A Avenae sub

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A. Avenae sub. avenae

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Tratamiento de semilla

Control A. oxolínicoControl

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Ox. de cobre + mancozeb

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CONCLUSIONES

B. glumae ha adquirido gran importancia en LACg q g p

Es de gran importancia La caracterización de germoplasma y desarrollo de materiales con tolerancia a este patógenode materiales con tolerancia a este patógeno.

Orientar a los productores hacia el uso de buenas prácticas agronómicasque permitan disminuir el impacto de la bacteriaque permitan disminuir el impacto de la bacteria.

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