Ferran Sánchez-ReusServei de MicrobiologiaHospital de Sant Pau

Infeccions per fongsInfeccions per altres fongs: experiència

Barcelona, 18 de Gener de 2018

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

• Experiència en l’Hospital de Sant Pau

• Altres fongs d'importància clínica

• Importància clínica dels altres fongs

• Conclusions

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

EXPERIÈNCIA en SANT PAU

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

EXPERIÈNCIA en SANT PAU

• Període de l’estudi– Gener 2004 a desembre 2017

• Nombre d’aïllats i episodis– Nombre total d’aïllats: 35.761– 17.388 episodis amb 22.087 aïllats diferents

• Mostres clíniques i criteris microbiològics• Tècniques d’identificació

– Llevats: CHROMagar candida, API ID32C, MALDI-TOF– Filamentosos: morfologia macro i microscòpica– Seqüenciació ITS

Experiència en Sant PauDades analitzades

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

Hospital de Sant Pau 2004-17Nombre total d’aïllats

19.593

1437 1057

22.087 aïllats / 17.388 episodis

Candida spp.Aspergillus spp.No Candida-Aspergillus

EXPERIÈNCIA en SANT PAU

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

EXPERIÈNCIA en SANT PAU

Aspergillus i Candida

A. fumigatusA. niger

A. flavusA. terreus

A. nidulansA. versicolor

Altres

1.437 Aspergillus spp.

19.593 Candida spp.

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

Hospital de Sant Pau 2004-17Nombre total d’aïllats

0

100

200

300

400

500

600

700

800

900

1000

22.087 aïllats / 17.388 episodis

1.437

207

463

20 54

19.593

24

214

273

Aspergillus spp.Altres hialinsDermatòfitsMucoralsDematiacisCandida spp.C. neoformansAltres llevatsEndèmicsP. jirovecii

EXPERIÈNCIA en SANT PAU

>

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

EXPERIÈNCIA en SANT PAU

45%

19%

11%

10%9% 4%

Fusarium (93)

Scedosporium (39)

Paecilomyces (23)

Penicillium (20)

Scopulariopsis (18)

Acremonium (8)

Trichoderma (5)

Chrysosporium (1)

Altres filamentosos hialins

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

EXPERIÈNCIA en SANT PAU

0

50

100

150

200

250

300261

96

39

8 519 17 7 4 2 1 4

T. rubrumT. mentagrophytesT. tonsuransT. violaceumT. soudanenseTrichophyton sppM. canisM. gypseumM. audouiniiM. persicolorE. floccosumNeoscytalidium

Fongs dermatòfits

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

EXPERIÈNCIA en SANT PAU

35%

25%

20%

15% 5%Rhizopus (7)Mucor (5)Syncephalastrum (4)Rhyzomucor (3)Cunninghamella (1)

Fongs mucorals

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

EXPERIÈNCIA en SANT PAU

37%

20%9%

5%

Alternaria (20)Exophiala (11)Cladosporiun (5)Phoma (3)Phialophora (2)Acrophialophora (2)Cladophialophora (2)Hormonema (2)Aureobasidium (2)Hortaea (1)Veronea (1)Allophoma (1)Chaetomium (1)Sporothrix schenckii

Fongs dematiacis

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

EXPERIÈNCIA en SANT PAU

36%

20%11%8%8%

7% 7%

Saccharomyces (78)Trichosporon (42)Blastoschizomyces (24)Rhodotorula (18)Malassezia (17)Geotrichum (15)Pichia (14)Cryptococcus (3)

Kodamoea (2)

Loderomyces (1)

Altres levaduriformes

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

Hospital de Sant Pau 2004-17Micosis invasives

0

2

4

6

8

10

12 FusariumAcremoniumScedosporiumBastoschizomycesMucoralesTrichosporonTrichodermaDematiacisRhodothorulaSaccharomycesMalassezia

EXPERIÈNCIA en SANT PAU

DiseminadesSubcutànies

FungèmiesEndoftalmitis Peritonitis

Sinusitis

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

ALTRES FONGS d’IMPORTÀNCIA

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

MUCORALS

Rhizopus spp.Mucor spp.Lichtheimia spp.Cunninghamella spp.Rhizomucor spp.Apophysomyces spp.Saksenaea spp.

ALTRES FILAMENTOSOSHIALINS

Fusarium spp.Scedosporium spp.Acremonium spp.Scopulariopsis spp.Purpureocillium spp.Paecilomyces spp.

ALTRES LLEVATS

Geotrichum candidumKodamaea ohmeriMalassezia spp.Pseudozyma spp.Rhodotorula spp.Saccharomyces spp.Saprochaeta spp.Sporobolomyces spp.Trichosporon spp.

Altres fongs d’importànciaRevisió bibliogràfica ESCMID / ECMM

ALTRES FONGS d’IMPORTÀNCIA CLÍNICA

Clin Microbiol Infect 2014, 20 (supl 3)

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

ALTRES FONGS d’IMPORTÀNCIA CLÍNICA

MICETOMA EUMICOTICO

Exophiala jeanselmeiLeptosphaeria senegalensisMadurella griseaMadurella mycetomatis Pyrenochaeta romeroi

CHROMOBLASTOMICOSIS

Cladophialophora carrioniiFonsecaea compactaFonsecaea pedrosoiPhialophora verrucosa

Ochroconis spp.Phaeoacremonium spp.Phoma spp.Pyrenochaeta spp.Rinocladiella spp.Veronaea spp.

FEOHIFOMICOSIS

Alternaria spp.Acrophialophora spp.Aureobasidium spp.Bipolaris spp.Chaetomium spp.Cladophialophora spp.

Curvularia spp.Exophiala spp.Exserohilum spp.Fonsecaea spp.Hortaea werneckiiNeoscytalidium dimidiatum

Altres fongs d’importànciaRevisió bibliogràfica ESCMID / ECMM

Clin Microbiol Infect 2014, 20 (supl 3)

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

ALTRES FONGS d’IMPORTÀNCIA CLÍNICA

Altres fongs d’importànciaFongs endèmics

FONGS ENDÈMICS

Histoplasma capsulatumH. duboisiiCoccidioides immitisC. posadasiiParacoccidioides brasiliensisP. lutziiBlastomyces dermatitidisTalaromyces marneffei

Enferm Infecc Microbiol Clin 2012, 30: 407-13

• Drogues contaminades (3)• Contagi en laboratori (2)• Transplantament òrgan (1)

Histoplasmosis Paracoccidioidomicosis

España 1980 - 2010

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

ALTRES FONGS d’IMPORTÀNCIA CLÍNICA

Altres fongs d’importànciaFongs rars i pseudofongs

PSEUDOFONGS

Chlorella spp.Prototheca wickerhamiiP. zopfiiPythium insidiosumRhinosporidium seeberi

FONGS RARS

Emmonsia crescensE. parvaConidiobolus coronatusC. incongruousBasidiobolus ranarumLacazia loboi

Encephalitozoon cuniculiE. hellemE. intestinalisEnterocytozoon bieneusiTrachipleistophora hominisT. AnthropoptheraPleistophora spp.

Annacaliia algeraeA. connoriNosema ocularumVittaforma corneaeTubulinosema accridophagusMicrosporidium africanusM. ceylonensis

MICROSPORIDIS

Gastroenterol Clin Biol 2010, 34: 450-64; J Clin Microbiol 2005, 43_1495-504

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

IMPORTÀNCIA dels ALTRES FONGS

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

Agents d’IFI a necròpsiesPacients amb leucèmia

Clin Infect Dis 2010, 50(3): 405-15

IMPORTÀNCIA dels ALTRES FONGS

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

Càlcul estimat de les IFICàlcul estimat en UK: 241525-662987/any

J Infect 2017, 74: 60-71

IMPORTÀNCIA dels ALTRES FONGS

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

IMPORTÀNCIA dels ALTRES FONGS

La lluita contra les micosispoc estudiades, poc diagnosticades

Science 2012; 336: 647

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

El micobioma humàConvivint amb els fongs

Chemical ¬Engineering News 2016, 94: 24-7

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

CONCLUSIONS

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

CONCLUSIONS

• Candida es, amb diferencia, el gènere més comunament aïllat enmostres clíniques. En segon lloc Aspergillus.

• Els fongs no pertanyents al gèneres Candida o Aspergillusrepresenten < 5% del total dels aïllats a l’hospital de Sant Pau.

• Desprès de Candida i Aspergillus, els dermatòfits son els fongsaïllats amb més freqüència, especialment T. rubrum.

• L'escàs nombre de neumocistosi i criptococcosi es justificable p• el període d’estudi analitzat (era post TARGA).• Els fongs endèmics han estat anecdòtics en el període estudiat.• Fusarium i Scedosporium son el “altres” fongs filamentosos

aïllats amb major freqüència.• Entre els llevats predominen Saccharomyces, Trichosporon i

Blastoschizomyces.• La incidència de micosis invasives causades pels fongs no

pertanyents als generes Candida o Aspergillus, es baixa.

Conclusions

INFE

CCIO

NS

PER

FON

GS.

Infe

ccio

nspe

r altr

esfo

ngs:

exp

eriè

ncia

CONCLUSIONS

• La importància dels fongs es molt mes gran del quegeneralment es creu.

• No només les micosis invasives son un problema de salut, ino només Candida i Aspergillus donen lloc a micosis.

• Conèixer l’epidemiologia local de les micosis es bàsic perinstaurar terapèutiques empíriques adequades.

• Millorar el diagnòstic es clau per conèixer millorl'epidemiologia i millorar el pronòstic de les micosis.

Per recordar

Moltes gràcies