Estructura de proteínas

Jerarquías estructurales

Estructura primaria

Experimento de Anfinsen

Variabilidad Secuencial

Enlace peptídico

Diagrama de Ramachandran

Estructura Secundaria: hélice alfa

Momento dipolar

NH2 terminal

COOH terminal

Estructura Secundaria: hoja beta plegada

Período: 7 A

Período: 6.5 A

Conexiones entre elementos de estructura secundaria

Loops

Bends

(beta turns, reverse turns or hairpin)

Estructura terciaria

Motivos estructurales

Dominios

Estructura cuaternaria

Alfa globina

Beta globina

Hemoglobina

Mioglobina: MB + O2 MBO2

Superficies y cavidades

Superficies

O2 ?

Superficie

(amarillo)

Surcos

(fucsia)

Los surcos conducen a cavidades...

Plegamiento de proteínas

Para describir la posición de un átomo en el espacio uno necesitadefinir 3 coordenadas

Para una proteína de 100 aminoácidos necesitamos 6000 coordenadas (consideramos que un AA contiene en promedio 20

átomos)

Si cada una de esas coordendas puede tomar al menos 2 valoresdistintos tendríamos que el espacio conformacional de la proteína

sería de 26000

Si cada transición entre cada una de éstas conformaciones distintasrequiere de un tiempo de por ejemplo 110-13 segundos….

…plegar una proteína requeriría

25987 segundos!!!

Relación Estructura Función

E. Fischer, 1894

D. Koshland, 1958

Mirsky and Pauling 1936

C. Anfinsen (1960-)

Relación Estructura Función

Monod, Wyman and Changeux, 1965

Fred Karush, 1950

Proteínas desestructuradas